New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | AE015451 | = 2791228 | 88 (1.070) | coding (320/1212 nt) | sstT | Serine/threonine transporter SstT |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
AGGCCAAAGATGCCCAGCGGGGCGAAGCGGATGACCACGCGTACGATCAGGGTTACACCATTGGACAGGTCTTCGACCACGGTACGGGTCGTTTCGCCGGCGTGGCGCAGGGCCACGCCCAAGCCGATGGCCCATGTCAGCACGCCGATGAAGTTGGCGTTGAGCAGGGCATTGACCGGGTTGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGCTGCGGCAAAGGTGCCCAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTGGGTTTCCTGGCCGTGACGATGGTTGGCGACCGAAGCCATGACCAGGATGAACACCAGCACGGGCGCAACCGCCTTCAGGGCACTGACGAATACCTTGCCA > AE015451/2790967‑2791425 | aGGCCAAAGATGCCCAGCGGGGCGAAGCGGATGACCACGCGTACGATCAGGGTTACACCATTGGACAGGTCTTCGACCACGGTACGGGTCGTTTCGCCGGCGTGGCGCAGGGCCACGCCCAAGCCGATGGCCCATGTCAGCACGCCGATGAAGTTGGCGTTGAGCAGGGCATTGACCGGGTTGTCTACCGCGTTCGGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGC > 1:448470‑M1/1‑236 (MQ=255) aGGCCAAAGATGCCCAGCGGGGCGAAGCGGATGACCACGCGTACGATCAGGGTTACACCATTGGACAGGTCTTCGACCACGGTACGGGTCGTTTCGCCGGCGTGGCGCAGGGCCACGCCCAAGCCGATGGCCCATGTCAGCACGCCGATGAAGTTGGCGTTGAGCAGGGCATTGACCGGGTTGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGC > 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cccAGCGGGGCGAAGCGGATGACCACGCGTACGATCAGGGTTACACCATTGGACAGGTCTTCGACCACGGTACGGGTCGTTTCGCCGGCGTGGCGCAGGGCCACGCCCAAGCCGATGGCCCATGTCAGCACGCCGATGAAGTTGGCGTTGAGCAGGGCATTGACCGGGTTGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTgg < 1:1448842/235‑1 (MQ=255) aGCGGGGCGAAGCGGATGACCACGCGTACGATCAGGGTTACACCATTGGACAGGTCTTCGACCACGGTACGGGTCGTTTCGCCGGCGTGGCGCAGGGCCACGCCCAAGCCGATGGCCCATGTCAGCACGCCGATGAAGTTGGCGTTGAGCAGGGCATTGACCGGGTTGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTgg > 1:1087045/1‑232 (MQ=255) gCGGGGCGAAGCGGATGACCACGCGTACGATCAGGGTTACACCATTGGACAGGTCTTCGACCACGGTACGGGTCGTTTCGCCGGCGTGGCGCAGGGCCACGCCCAAGCCGATGGCCCATGTCAGCACGCCGATGAAGTTGGCGTTGAGCAGGGCATTGACCGGGTTGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTgg < 1:923916/231‑1 (MQ=255) aCCACGCGTACGATCAGGGTTACACCATTGGACAGGTCTTCGACCACGGTACGGGTCGTTTCGCCGGCGTGGCGCAGGGCCACGCCCAAGCCGATGGCCCATGTCAGCACGCCGATGAAGTTGGCGTTGAGCAGGGCATTGACCGGGTTGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGgcgcgc > 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ttGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGCTGCGGCAAAGGTGCCCAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTGGGTTTCCTGGCCGTGACGATGGTTGGCGACCGAAGcc > 2:716360/1‑216 (MQ=255) tGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCa > 1:1086523/1‑113 (MQ=255) tGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCa < 2:1086520/113‑1 (MQ=255) tGTCTACCGCGTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGCTGCGGCAAAGGTGCCCAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTGGGTTTCCTGGCCGTGACGATGGTTGGCGACCGAAGCCATGACCAGGATGAACACCAg > 1:1219376/1‑235 (MQ=255) gcgTTCAGCAACAGGTGCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGCTGCGGCAAAGGTGCCCAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTGGGTTTCCTGGCCGTGACGATGGTTGGCGACCGAAGCCATGACCAGGATGAACACCAGCACGGgcgc < 1:1436743/236‑1 (MQ=255) gTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGCTGCGGCAAAgg > 2:1412052/1‑131 (MQ=255) gTTCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGCTGCGGCAAAGGTGCCCAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTGGGTTTCCTGGCCGTGACGATGGTTGGCGACCGAAGCCATGACCAGGATGAACACCAGCACGGgcgc < 2:773663/234‑1 (MQ=255) ttCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAgcgc < 1:652987‑M2/74‑5 (MQ=255) ttCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAgcgc > 2:652985‑M2/1‑70 (MQ=255) ttCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGCTGCGGCAAAGGTGCCCAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTGGGTTTCCTGGCCGTGACGATGGTTGGCGACCGAAGCCATGACCAGGATGAACAcc > 1:1059752/1‑222 (MQ=255) tCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAGACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGCTGCGGCAAAGGTGCCCAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTGGGTTTCCTGGCCGAGACGATGGTTGGCGACCGAAGCCATGACCAGGATGAACACCAGCACGGGCGCAAc > 1:821874/1‑235 (MQ=255) tCAGCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGCTGCGGCAAAGGTGc > 2:390457/1‑132 (MQ=255) gCAACAGGTTCTGCAGCACTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGCTGCGGCAAAGGTGCCCAGCAGGTAGAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTGGGTTTCCTGGCCGTGACGATGGTTGGCGACCGAAGCCAt > 1:1441561/1‑202 (MQ=255) 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cTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGCTGCGGCAAAGGTGCCCAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTGGGTTTCCTGGCCGTGACGATGGTTGGCGACCGAAGCCATGACCAGGATGAACACCAGCACGGGCGCAACCGCCTTCa < 1:1154935/222‑1 (MQ=255) cTTCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGCTGCGGCAAAGGTGCCCAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTGGGTTTCCTGGCCGTGACGATGGTTGGCGACCGAAGCCATGACCAGGATGAACACCAGCACGGGCGCAACCGCCTTCAGGGCACTGACGaa < 1:1314605/235‑1 (MQ=255) ttCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGGGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGCTGCGGCAAAGGTGCCCAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTGGGTTTCCTGGCCGTGACGATGGTTGGCGACCGAAGCCATGACCAGGATGAACACCAGCACGGGCGCAACCGc < 2:1087042/216‑1 (MQ=255) tCGGCGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGCTGCGGCAAAGGTGCCCAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGGGCGAATGTGGGTTTCCTGGCCGTGACGATGGTTGGCGACCGAAGCCATGACCAGGATGAACACCAGCACGGGCGCAACCGCCTTCAGGGCACTGACGAAt > 2:630543/1‑234 (MQ=255) cGGCGATGCCGCCTGGCGCtaagcaccagcgaggccacgctgagcgcgccaggcggcatcgccgaagtgctgcagaacctgttgctgaacgcggtagacaacccggtcaatgccctgctcaacgccaacttcatcggcgtgctgacatg > 2:1118880‑M1/1‑19 (MQ=255) cGATGCCGCCTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGCTGCGGCAAAGGTGCCCAGCAGGTACAGCCAGAGGAACGGGCGAATGTGGGATTCCTGGCCGTGACGATGGTTTGCGACCGAAGCCa > 2:621422/1‑177 (MQ=255) ccgccTGGCGCtaagcaccagcgaggccacgctgagcgcgccaggcggcatcgccgaagtgctgcagaacctgttgctgaacgcggtagacaacccggtcaatgccctgctcaacgccaacttcatcggcgtgctgacatgggccatcggcttgggcgtggccctgcgccacgccggcgaaacgacccgtaccgtggtcgaagacctgtccaatggtgtaaccctgatcgtacg > 1:851925‑M1/1‑11 (MQ=255) cgccTGGCGCGCTCAGCGTGGCCTCGCTGGTGCTTAGCGCCAGGTGCGACGGAAACAGCATGCTGGCAAACACGGCCACCACTGCTGCGGCAAAGGTGCCCAGCAGGTACAGCCAGAGGATCGCGCGAATGTGGGTTTCCTTGCCGTGACGATGGTTGGCGACCGAAGCCATg < 1:732001/173‑1 (MQ=255) 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> AE015451/2790967‑2791425 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |