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ggTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCg < 2:673864/148‑1 (MQ=34) tCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACACGGTGCCGATCGGATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCCGTc > 1:1108000/1‑140 (MQ=255) tCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAACCGCCGGTCATGAtcttc > 2:417970/1‑191 (MQ=18) tCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGt > 2:480225/1‑181 (MQ=33) tCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCa > 1:1481386/1‑235 (MQ=33) tCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAg > 1:1207272/1‑236 (MQ=33) ggTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGaaa < 2:1187401/172‑1 (MQ=33) ccGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGAt > 2:536034/1‑232 (MQ=31) ccGCCACGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCtg < 1:1321704/183‑1 (MQ=14) cGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCgg < 2:1173335/188‑1 (MQ=31) ccATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTTCTTGAACGGGTTGAACg > 2:1387676/1‑99 (MQ=18) aTGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCAtgg > 2:359047/1‑141 (MQ=17) ggCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACcgc > 1:625452/1‑236 (MQ=31) ccGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCt < 2:655132/141‑1 (MQ=32) gggAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCgcgggc > 1:813007/1‑236 (MQ=31) aGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAg > 2:1410306/1‑236 (MQ=31) ccGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCCTTGGGGGAATCAGCAACGCCAGTgagag > 2:175428/1‑211 (MQ=14) cGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCCTTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCg > 1:173221/1‑235 (MQ=14) ggCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGcc < 1:1442299/85‑1 (MQ=35) ggCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGcc > 2:1442296/1‑85 (MQ=35) | GGTGATTCGATAGCGCGCCGCCAGCAACCCCAGCGCTTTCTCGGCATTCGCCTCCCGCGCTGCCAACTGCACCTGCCGCCGCAGGCCATGGCTGGCATCCCATCGGGTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCG > AE015451/2986689‑2987114 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |