New junction evidence | |||||||||||
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ccGCCACGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCtg < 1:1321704/183‑1 (MQ=14) cGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCgg < 2:1173335/188‑1 (MQ=31) acgcctggagcaatggctggaccagcacgacagcccgctttacaccgccttggcgccgttcaacccgttcaaggacacagccgattcgatcggcaccttgttCGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGc < 2:589280‑M2/49‑1 (MQ=255) ccATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTTCTTGAACGGGTTGAACg > 2:1387676/1‑99 (MQ=18) aTGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCAtgg > 2:359047/1‑141 (MQ=17) 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gctggaccagcacgacagcccgctttacaccgcctcggcgccgttcaacccgttcaaggaaaaagccgattcgatcggcaccttgttCGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCa < 2:738722‑M2/41‑1 (MQ=255) ccGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCCTTGGGGGAATCAGCAACGCCAGTgagag > 2:175428/1‑211 (MQ=14) cGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCCTTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCg > 1:173221/1‑235 (MQ=14) ggCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGcc < 1:1442299/85‑1 (MQ=35) ggCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGcc > 2:1442296/1‑85 (MQ=35) tttacaccgccttggcgccgttcaacccgttcaaggacaaagccgattcgatcggcaccttgttCGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGc < 2:894745‑M2/97‑1 (MQ=255) aggacaaagccgattcgatcggcaccttgttCGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCGCGGTCGTAACAGGCCAGTGCCGCAGCCAGGCTGTAGGGGTTa > 1:1175369‑M2/32‑236 (MQ=255) ccaccttgttCGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTc < 1:748589‑M2/30‑1 (MQ=255) aCGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCTGGCGGAGGTGCGTTCGTCGCGGTCGTAACAGGCCAGTGCCGCAGCCAGGCTGTAGGGGTTATCAATGTGTTGGGGTTCGGCCGTCgccagc > 1:933010/1‑236 (MQ=14) CGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGCTCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCGCGGTCGTAACAGGCCAGTGCCGCAGCCAgg < 2:654684‑M2/193‑1 (MQ=255) | CGGCATTCGCCTCCCGCGCTGCCAACTGCACCTGCCGCCGCAGGCCATGGCTGGCATCCCATCGGGTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCG‑‑‑AACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGAATCAGCAACGCCAGTGAGATTTCCAGACCGCGGGCGGAGGTGCGTTCGTCGCGGTCGTAACAGGCCAGTGCCGCAGCCAGGCTGTAGGGGTTATCAATGTGTTGGGGTTCGGCCGTCGCCAGC > AE015451/2986730‑2987193 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |