| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 3040551 | 56 (0.650) | 3 (0.040) | 3/342 | NT | 5.6% | coding (154/786 nt) | PP_2652 | putative Hydratase/decarboxylase |
| ? | AE015451 | = 3040582 | 48 (0.580) | coding (185/786 nt) | PP_2652 | putative Hydratase/decarboxylase | |||||
CAATATATTTATCCTTATCAATGTCAGGCCCTAGCATCTGTTGTCCGCCATCGCCTATTTCAATGAGGTCTTGATGAACCGTTCGCTCTTCGTACACCAACGCACTGCAGCCTTGCTACTGCAACACTGGCGCAGCGGTGACCTGCTGACAGAACTGCCCGCCAGCCTCAAGCCCGAGACGTTGAAACAAGGCTATGACAGCCAGGACCAGTTGTTTGCCGCTGCCGCAGGCCAGCGCGCCGGGTGGAAGCTGGGCGTCGGCAGCCCGGCAGGCATGCGTGCCGGCAAGTTGTCGCGGCCCTTGATTGGCCAACTGGAAGCGGGGCGTTGCCATGCCGATGGCGCACATATCCAGCTGCCAGCGGTTACGCCGGTGACCATCGAATGCGAAATTGCCTTCGTGCTGGACCGGGATATTCCTCCGCAAGCCGGGCGCGTACCGGTGAGTGAGGATAT > AE015451/3040325‑3040780 | cAATATATTTATCCTTATCAATGTCAGGCCCTAGCATCTGTTGTCCGCCATCGCCTATTTCAATGAGGTCTTGATGAACCGTTCGCTCTTCGTACACCAACGCACTGCAGCCTTGCTACTGCAACACTGGCGCAGCGGTGACCTGCTGACAGAACTGCCCGCCAGCCTCAAGCCCGAGACGTTGAAACAAGGCTATGACAGCCAGGACCAGTTGTTTGCCGCTGCCGCAGGCCAgc > 1:649039/1‑236 (MQ=255)cAATATATTTATCCTTATCAATGTCAGGCCCTAGCATCTGTTGTCCGCCATCGCCTATTTCAATGAGGTCTTGATGAACCGTTCGCTCTTCGTACACCAACGCACTGCAGCCTTGCTACTGCAACACTGGCGCAGCGGTGACCTGCTGACAGAACTGCCCGCCAGCCTCAAGCCCGAGACGTTGAAACAAGGCTATGACAGCCAGGACCAGTTGTTTGCCGCTGCCGCAGGCCAg > 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ttATCAATGTCAGGCCCTAGCATCTGTTGTCCGCCATCGCCTATTTCAATGAGGTCTTGATGAACCGTTCGCTCTTCGTACACCAACGCACTGCAGCCTTGCTACTGCAACACTGGCGCAGCGGTGACCTGCTGACAGAACTGCCCGCCAGCCTCAAGCCCGAGACGTTGAAACAAGGCTATGACAGCCAGGACCAGTTGTTTGCCGCTGCCGCAGGCCAGCGCGCCGGGTGGAAg > 1:33343/1‑236 (MQ=255) cAATGTCAGGCCCTAGCATCTGTTGTCCGCCATCGCCTATTTCAATGAGGTCTTGATGAACCGTTCGCTCTTCGTACACCAACGCACTGCAGCCTTGCTACTGCAACACTGGCGCAGCGGTGACCTGCTGACAGAACTGCCCGCCAGCCTCAAGCCCGAGACGTTGAAACAAGGCTATGACAGCCAGGACCAGTTGTTTGCCGCTGCCGCAGGCCAGCGCGCCGGGTGGAAGCTgg > 1:1144504/1‑236 (MQ=255) cAATGTCAGGCCCTAGCATCTGTTGTCCGCCATCGCCTATTTCAATGAGGTCTTGATGAACCGTTCGCTCTTCGTACACCAACGCACTGCAGCCTTGCTACTGCAACACTGGCGCAGCGGTGACCTGCTGACAGAACTGCCCGCCAGCCTCAAGCCCGAGACGTTGAAACAAGGCTATGACAGCCAGGACCAGTTGTTTGCCGCTGCCGCAGGCCAGCGCGCCGGGTGGAAGCTgg > 1:818552/1‑236 (MQ=255) 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ttCGCTCTTCGTACACCAACGCACTGCAGCCTTGCTACTGCAACACTGGCGCAGCGGTGACCTGCTGACAGAACTGCCCGCCAGCCTCAAGCCCGAGACGTTGAAACAAGGCTATGACAGCCAGGACCAGTTGTTTGCCGCTGCCGCAGGCCAGCGCGCCGGGTGGAAGCTGGGCGTCGGCAGCCCGGCAGGCATGCGTGCCGGCAAGTTGTCGCGGCCCTTGATTGGCCAACTgg > 1:755868/1‑236 (MQ=255) ttCGCTCTTCGTACACCAACGCACTGCAGCCTTGCTACTGCAACACTGGCGCAGCGGTGACCTGCTGACAGAACTGCCCGCCAGCCTCAAGCCCGAGACGTTGAAACAAGGCTATGACAGCCAGGACCAGTTGTTTGCCGCTGCCGCAGGCCAGCGCGCCGGGTGGAAGCTGGGCGTCGGCAGCCCGGCAGGCATGCGTGCCGGCAAGTTGTCGCGGCCCTTGATTGGCCAACTg > 1:1410290/1‑235 (MQ=255) cGCTCTTCGTACACCAACGCACTGCAGCCTTGCTACTGCAACACTGGCGCAGCGGTGACCTGCTGACAGAACTGCCCGCCAGCCTCAAGCCCGAGACGTTGAAACAAGGCTATGACAGCCAGGACCAGTTGTTTGCCGCTGCCGCAGGCCAGCGCGCCGGGTGGAAGCTGGGCGTCGGCAGCCCGGCAGGCATGCGTGCCGGCAAGTTGTCGCGGCCCTTGATTGGCCAACTGGaa > 1:600503/1‑236 (MQ=255) cGCTCTTCGTACACCAACGCACTGCAGCCTTGCTACTGCAACACTGGCGCAGCGGTGACCTGCTGACAGAACTGCCCGCCAGCCTCAAGCCCGAGACGTTGAAACAAGGCTATGACAGCCAGGACCAGTTGTTTGCCGCTGCCGCAGGCCAGCGCGCCGGGTGGAAGCTGGGCGTCGGCAGCCCGGCAGGCAGGCGTGCCGGCAAg > 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tATGACAGCCAGGACCAGTTGTTTGCCGCTGCCGCAGGCCAGCGCGCCGGGTGGAAGCTGGGCGTCGGCAGCCCGGCAGGCATGCGTGCCGGCAAGTTGTCGCGGCCCTTGATTGGCCAACTGGAAGCGGGGCGTTGCCATGCCGATg > 2:1320417/1‑148 (MQ=255) tATGACAGCCAGGACCAGTTGTTTGCCGCTGCCGCAGGCCAGCGCGCCGGGTGGAAGCTGGGCGTCGGCAGCCCGGCAGGCATGCGTGCCGGCAAGTTGTCGCGGCCCTTGATTGGCCAACTGGAAGCGGGGCGTTGCCATGCCGATGGCGCACATATCCAGCTGCCAGCGGTTACGCCGGTGACCATCGAATGCGAAATTGCCTTCGTGCTGGACCGGGatc > 1:1484419/1‑222 (MQ=255) aTGACAGCCAGGACCAGTTGTTTGCCGCTGCCGCAGGCCAGCGCGCCGGGTGGAAGCTGGGCGTcggcagcggcaaacaactggtcctggctgtcatagccttgtttcaacgtctcgggcttgaggctggcgggcagttctgtcagcaggtcaccgctgcgc > 2:815860‑M2/1‑64 (MQ=255) gACAGCCAGGACCAGTTGTTTGCCGCTGCCGCAGGCCAGCCCGCCGGGTGGAAGCTGGGCGTCGGCAGCCCGGCAGGCATGCGTGCCGGCAAGTTGTCGCGGCCCTTGATTGGCCAACTGGAAGCGGGGCGTTGCCATGCCGATGGCGCACATATCCAGCTGCCAGCg < 1:1302479/168‑1 (MQ=255) cAGCCAGGACAAGTTGTTTGCCGCTGCCGCAGGCCAGCGCGCCGGGTGGAAGCTGGGCGTCGGCAGCCCGGCAGGCATGCGTGCCGGCAAGTTGTCGCGGCCCTTGAGTGGcc > 2:513430/1‑113 (MQ=255) gCCAGGACCAGTTGTTTGCCGCTGCCGCAGGCCAGCGCGCCGGGTGGAAGCTGGGCGTCGGCAGCCCGGCAGGCATGCGTGCCGGCAAGTTGTCGCGGCCCTTGATTGGCCAACTGGAAGCGGGGCGTTGCCATGCCGATGGCGCACATATCCAGCTGCCAGCGGTTACGCCGGTGACCATCGAATGCGAAATTGCCTTCGTGCTGGACCGGGATATTCCTCCGCAAGCCGGgc < 1:1243555/234‑1 (MQ=255) ctggACCAGTTGGTTGCCGCTTCCGCAGGCCAGCGCGCCGGGTGGAAGCTGGGCGTCGGCAGCCCGGCAGGCATGCg < 2:277868/75‑1 (MQ=255) aGGACCAGTTGTTTGCCGCTGCCGCAGGCCAGCGCGCCGGGTGGAAGCTGGGCGTCGGCAGCCCGGCAGGCATGCGTGCCGGCAAGTTGTCGCGGCCCTTGATTGGCCAACTGGAAGCGGGGCGTTGCCATGCCGATGGCGCACATATCCAGCTGCCAGCGGTTACGCCGGTGACCATCGAATGCGAAATTGCCTTCGTGCTGGACCGGGATATTCCTCCGCAAGCCGGgcgc < 2:1410287/233‑1 (MQ=255) ttggtTGCCGCTGCCGCAGGCCAGCGCGCCGGGTGGAAGCTGGGCGTCGGCAGCCCGGCAGGCATGCGTGCCGGCAAGTTGTCGCGGCCCTTGATTGGcc < 2:189841/100‑1 (MQ=255) gctgccgcAGGCCAGCGCGCCGGGTGGAAGCTGGGCGTCGGCAGCCCGGCAGGCATGCGTGCCGGCAAGTTGTCGCGGCCCTTGATTGGCCAACTGGaa < 2:1144501/99‑1 (MQ=255) gCTGCCGacgcccagcttccacccggcgcgctggcctgcggcagcggcaaacaactggtcctggctgtcatagccttgtttcaacgtctcgggcttgaggctggcgggcagttctgtcagcaggtcaccgctgcgccagtgttgcagtagcaaggctgcagtgcgttggtgtacgaagagcgaacggttcatcaagacctcattgaaataggcgatggcggacaacagatgctagg < 1:978657‑M1/236‑230 (MQ=255) ctgccgcAGGCCAGCGCGCCGGGTGGAAGCTGGGCGTCGGCAGCCCGGCAGGCATGCGTGCCGGCAAGTTGTCGCGGCCCTTGATTGGCCAACTGGAAGCGGGGCgg > 2:749179/1‑106 (MQ=255) gCCGacgcccagcttccccccggcgcgctggcctgcggcagcggcaaacaactggtcctggctgtcatagccttgtttcaacgtctcgggcttgaggctggcgggcagttctgtcagcaggtcaccgctgcgccagtgttgcagtagcaaggctgcagt < 2:533275‑M1/159‑156 (MQ=255) | CAATATATTTATCCTTATCAATGTCAGGCCCTAGCATCTGTTGTCCGCCATCGCCTATTTCAATGAGGTCTTGATGAACCGTTCGCTCTTCGTACACCAACGCACTGCAGCCTTGCTACTGCAACACTGGCGCAGCGGTGACCTGCTGACAGAACTGCCCGCCAGCCTCAAGCCCGAGACGTTGAAACAAGGCTATGACAGCCAGGACCAGTTGTTTGCCGCTGCCGCAGGCCAGCGCGCCGGGTGGAAGCTGGGCGTCGGCAGCCCGGCAGGCATGCGTGCCGGCAAGTTGTCGCGGCCCTTGATTGGCCAACTGGAAGCGGGGCGTTGCCATGCCGATGGCGCACATATCCAGCTGCCAGCGGTTACGCCGGTGACCATCGAATGCGAAATTGCCTTCGTGCTGGACCGGGATATTCCTCCGCAAGCCGGGCGCGTACCGGTGAGTGAGGATAT > AE015451/3040325‑3040780 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |