New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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TCTGGTCATCGCCATTTCCCAGCTGCGCCTGCGCCAGCGCCTGACGGCACAGGGCAAGACACTGGGTTATCGCATGTGGCTGTTCCCGTGGCTGACCTGGGGCGTGATCCTGTTCATCAGCGGCGTACTGGTATTGATGCTGTTCCGCCCGGATCATCGCCTGGAAGTGGTCTCGACGATGGTGCTGGCGGTGTTGGTGGTGTGCTCGGGGGTGCTGGTGACCCGGCGCCGGGCGCGCGGCGGGGCCGTGGCTGGCGTAGGGCAGGGCGCCTGATTCGTCCGGCCTGAAGACAGACGAGCAAGTCGCATCAGGCTGTGAGAGGATGTCCGCCAACAAAGCCAGGACCCTGAACGCAGCCTGATGAAGACACCTAAAAGAATCGAACCGTTGATCGAAGACGGCCTTGTCGACGAAGTACTACGGCCGTTGATGAGTGGCAAGGAAGCCGCTGTGTACGTG > AE015451/3311405‑3311864 | tCTGGTCATCGCCATTTCCCAGCTGCGCCTGCGCCAGCGCCTGACGGCACAGGGCAAGACACTGGGTTATCGCATGTGGCTGTTCCCGTGGCTGACCTGGGGCGTGATCCTGTTCATCAGCGGCGTACTGGTATTGATGCTGTTCCGCCCGGATCATCGCCTGGAAGTGGTCTCGACGATGGTGCTGGCGGTGTTGGTGGTGTGCTCGGGGGTGCTGGTGACCCGGCGCCGGgc > 2:1346425/1‑234 (MQ=255) gTCATCGCCATTTCCCAGCTGCGCCTGCGCCAGCGCCTGACGGCACAGGGCAAGACACTGGGTTATCGCATGTGGCTGTTCCCGTGGCTGACCTGGGGCGTGATCCTGTTCATCAGCGGCGTACTGGTATTGATGCTGTTCCGCCCGGATCATCGCCTGGAAGTGGTCTCGACGATGGTGCTGGCGGTGTTGGTGGTGTGCTCGGGGGTGCTGGTGACCCGGCGCCGGGcgcgcg < 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ggtggtGTGCTCGGGGGTGCTGGTGACCCGGCGCCGGGCGCGCGGCGGGGCCGTGGCTGGCGTAGGGCAGGGCGCCTGATTCGTCCGGCCTGAAGACAGACGAGCAAGTCGCATCAGGCTGTGAGAGGATGTCCGCCAACAAAGCCAGGACCCTGAACGCAGCCTGATGAAGACACCTAAAAGAATCGAACCGTTGATCGAAGACGGCCTTGTCGACGAAGTACTACGGCCGTtg > 1:1247862/1‑235 (MQ=255) tgtgCTCGGGGGTGCTGGTGACCCGGCGCCGGGCGCGCGGCGGGGCCGTGGCTGGCGTAGGGCAGGGCGCCTGATTCGTCCGGCCTGAAGACAGACGAGCAAGTCGCATCAGGCTGTGAGAGGATGTCCGCCAACAAAGCCAGGACCCTGAACGCAGCCTGATGAAGACACCTAAAAGAATCGAACCGTTGATCGAAGACGGCCTTGTCGACGAAGTACTACGGCCGTTGATGAg > 1:1067248/1‑235 (MQ=255) tgCTCGGGGGTGCTGGTGACCCGGCGCCGGGCGCGCGGCGGGGCCGTGGCTGGCGTAGGGCAGGGCGCCTGATTCGTCCGGCCTGAAGACAGACGAGCAAGTCGCATCAGGCTGTGAGAGGATGTCCGCCAACAAAGCCAGGACCCTGAACGCAGCCTGACGAAGACACCTAAAAGAATCGAACCGTTGATCGAAGACGGCCTTg < 1:374498/205‑1 (MQ=255) cTCGGGGGTGCTGGTGACCCGGCGCCGGGCGCGCGGCGGGGCCGTGGCTGGCGTAGGGCAGGGCGCCTGATTCGTCCGGCCTGAAGACAGACGAGCAAGTCGCATCAGGCTGTgag > 2:1320904/1‑116 (MQ=255) cTCGGGGGTGCTGGTGACCCGGCGCCGGGCGCGCGGCGGGGCCGTGGCTGGCGTAGGGCAGGGCGCCTGATTCGTCCGGCCTGAAGACAGACGAGCAAGTCGCATCAGGCTGTGAGAGGATGTCCGCCAACAAAGCCAGGACCCTGAACGCAGCCTGATGAAGACACCTAAAAGAATCGAACCGGTGATCGAAGACGGCCTTGTCGACGAAGTACTACGGCCGGTGATGAGTGGCa > 1:123074/1‑236 (MQ=255) cTCGGGGGGGCTGGTGACCCGGCGCCGGGCGCGCGGCGGGGCCGTGGCTGGCGTAGGGCAGGGCGCCTGATTCGTCCGGCCTGAAGACAGACGAGCAAGTCGCATCAGGCTGTGAGAGGATGTCCGCCAACAAAGCCAGGACCCTGAACGCAGCCTGATGAAGACACCTAAAAGAATCGaa < 2:6904/181‑1 (MQ=255) gcGGGGGGGCTGGTGACCCGGCGCCGGGCGCGCGGCGGGGCCGTGGCTGGCGTAGGGCAGGGCGCCTGATTCGTCCGGCCTGAAGACAGACGAGCAAGTCGCATCAGGCTGTGAGAGGATGTCCGCCAACAAAGCCAGGa < 2:291219/139‑1 (MQ=255) ggggTGCTGGTGACCCGGCGCCGGGCGCGCGGCGGGGCCGTGGCTGGCGTAGGGCAGGGCGCCTGATTCGTCCGGCCTGAAGACAGACGAGCAAGTCGCATCAGGCTGTGAGAGGATGTCCGCCAACAAAGCCAGGACCCTGAACGCAGCCTGATGAAGACACCTAAAAGAATCGAACCGTTGATCGAAGACGGCCTTGTCGACGAAGTACTACGGCCGTTGATGAGTGGCAAgg < 1:933123/235‑1 (MQ=255) gggTGCTGGTGACCCGGCGCCGGGCGCGCGGCGGGGCCGTGGCTGGCGTAGGGCAGGGCGCCTGATTCGTCCGGCCTGAAGACAGACGAGCAAGTCGCATCAGGCTGTGAGAGGATGTCCGCCAACAAAGCCAGGACCCTGAACGCAGCCTGATGAAGACACCTAAAAGAATCGAACCGTTGATCGaa > 1:739561/1‑188 (MQ=255) ggTGCTGGTGACCCGGCGCCGGGCGCGCGGCGGGGCCGTGGCTGGCGTAGGGCAGGGCGCCTGATTCGTCCGGCCTGAAGACAGACGAGCAAGTCGCATCAGGCTGTGAGAGGATGTCCGCCAACAAAGCCAGGACCCTGAACGCAGCCTGATGAAGACACCTAAAAGAATCGAACCGTTGATCGAAGACGGCCTTGTCGACGAAGTACTACGGCCGTTGATGAGTGGCAAGGAAg > 1:700613/1‑236 (MQ=255) gTGCTGGTGACCCGGCGCCGGGCGCGCGGCGGGGGCGTGGCTGGCGTAGGGCAGGGCGCCTGATTCGTCCGGCCTGAAGACAGACGAGCAAGTCGCATCAGGCTGTGAGAGGATGTCCGCCAACAAAGCCAGGACCCTGAACGCAGCCTGATGAAGACACCTAAAAGAATCGAACCGTTGATCGAAGACGGCCTTGTCGACGAAGTACTACGGCCGTTGATGAGTGGCAAGGAAGc < 1:898542/236‑1 (MQ=255) tGCTGGTGACCCGGCGCCGGGCGCGCGGCGGGGCCGTGGCTGGCGTAGGGCAGGGCGCCTGATTCGTCCGGCCTGAAGACAGACGAGCAAGTCGCATCAGGCTGTGAGAGGATGTCCGCCAACAAAGCCAGGACCCTGAACGCAGCCt > 1:666750/1‑148 (MQ=255) tGCTGGTGACCCGGCGCCGGGCGCGCGGCGGGGCCGTGGCTGGCGTAGGGCAGGGCGCCTGATTCGTCCGGCCTGAAGACAGACGAGCAAGTCGCATCAGGCTGTGAGAGGATGTCCGCCAACAAAGCCAGGACCCTGAACGCAGCCt < 2:666748/148‑1 (MQ=255) gCTGGTGACCCGGCGCCGGGCGCGCGGCGGGGCCGTGGCTGGCGTAGGGCAGGGCGCCTGATTCGTACGGCCTGAAGACAGACGAGc > 2:121921/1‑87 (MQ=255) tGGTGACCCGGCGCCGGGCGCGCGGCGGGGCCGTGGCTGGCGTAGGGCAGGGCGCCTGATTCGTCCGGCCTGAAGACAGACGAGCAAGTCGCATCAGGCTGTGAGAGGATGTCCGCCAACAAAGCCAGGACCCTGAACGCAGCCTGATGAAGACACCTAAAAGAATCGAACCGTTGa > 1:986441/1‑177 (MQ=255) tGGTGACCCGGCGCCGGGCGCGCGGCGGGGCCGTGGCTGGCGTAGGGCAGGGCGCCTGATTCGTCCGGCCTGAAGACAGACGAGCAAGTCGCATCAGGCTGTGAGAGGATGTCCGCCAACAAAGCCAGGACCCTGAACGCAGCCTGATGAAGACACCTAAAAGAATCGAACCGTTGATCGAAGACGGCCTTGTCGACGAAGTACTACgg > 1:684115/1‑209 (MQ=255) tGACCCGGCGCCGGGCGCGCGGCGGGGCCGTGGCTGGCGTAGGGCAGGGCGCCTGATTCGGCCGGCCTGAAGACAGACGAGCAAGTCGCATCAGGCTGTGAGAGGATGTCCGCCAACAAAGCCAGGACCCTGAACGCAGCCTGATGAAGACACCTAAAAGAATCGAACCGTTGATCGAAGACGGCCTTGTcga < 2:1397529/193‑1 (MQ=255) ccGGCGCCGGGCGCGCGGCGGGGCCGTGGGTGGCGTGGGGCAGGGCGCCTGATTCGTCCGGCCTGAaga > 2:291769/1‑69 (MQ=255) cGGCGCCGGGCGCGCGGCGGGGCCGTGGCTGGCGTAGGGCAGGGCGCCTGATTCGTCCGGCCTGAAGACAGACGAGCAAGTCGCATCAGGCTGTGAGAGGATGTCCGCCAACAAAGCCAGGACCCTGAACGCAGCCTGATGAAGACACCTAAAAGAATCGAACCGTTGATCGAAGACGGCCTTGTCGACGAAGTACTACGGCCGTTGATGAGTGGCAAGGAAGCCGCTGTGTACg < 1:1492643/235‑1 (MQ=255) gcgcCGGGtcaccagcacccccgcgcacaccaccaacaccgccagcaccatcgtcgagaccacttccaggcgatgatccgggcggaacagcatcaataccagtacgccgctgatgaacaggatcacgccccaggtcagccacgggaacagccacatgcgataacccagtgtcttgccctgtgccgtcaggcgctggcgcaggcgcagctgggaaatggtgatgaccagatacacc < 2:650768‑M1/235‑228 (MQ=255) gcCGGGCGCGCGGCGGGGCCGTGGCTGGCGTAGGGCAGGGCGCCTGATTCGTCCGGCCTGAAGACAGACGAGCAAGTCGCATCAGGCTGTGAGAGGATGTCCGCCAACAAAGCCAGGACCCTGAACGCAGCCTGATGAAGACACCTAAAAGAATCGAACCGTTGATCGAAGACg > 1:547767/1‑174 (MQ=255) ccGGGCGCGCGGCGGGGCCGTGGCTGGCGTAGGGCAGGGCGCCTGATTCGTCCGGCCTGAAGACAGACGAGCAAGTCGCATCAGGCTGTGAGAGGATGTCCGCCAACAAAGCCAGGACCCTGAACGCAGCCtgatga < 1:557903/137‑1 (MQ=255) ccGGGCGCGCGGCGGGGCCGTGGCTGGCGTAGGGCAGGGCGCCTGATTCGTCCGGCCTGAAGACAGACGAGCAAGTCGCATCAGGCTGTGAGAGGATGTCCGCCAACAAAGCCAGGACCCTGAACGCAGCCtgatga > 2:557901/1‑137 (MQ=255) | TCTGGTCATCGCCATTTCCCAGCTGCGCCTGCGCCAGCGCCTGACGGCACAGGGCAAGACACTGGGTTATCGCATGTGGCTGTTCCCGTGGCTGACCTGGGGCGTGATCCTGTTCATCAGCGGCGTACTGGTATTGATGCTGTTCCGCCCGGATCATCGCCTGGAAGTGGTCTCGACGATGGTGCTGGCGGTGTTGGTGGTGTGCTCGGGGGTGCTGGTGACCCGGCGCCGGGCGCGCGGCGGGGCCGTGGCTGGCGTAGGGCAGGGCGCCTGATTCGTCCGGCCTGAAGACAGACGAGCAAGTCGCATCAGGCTGTGAGAGGATGTCCGCCAACAAAGCCAGGACCCTGAACGCAGCCTGATGAAGACACCTAAAAGAATCGAACCGTTGATCGAAGACGGCCTTGTCGACGAAGTACTACGGCCGTTGATGAGTGGCAAGGAAGCCGCTGTGTACGTG > AE015451/3311405‑3311864 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |