| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 3498263 | 81 (0.940) | 7 (0.090) | 7/334 | NT | 8.2% | intergenic (‑667/+39) | PP_5562/PP_5563 | conserved protein of unknown function/conserved membrane protein of unknown function |
| ? | AE015451 | = 3498264 | 80 (0.990) | intergenic (‑668/+38) | PP_5562/PP_5563 | conserved protein of unknown function/conserved membrane protein of unknown function | |||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
AGCTAGCGCGATGCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCAATATCCTTGATCATTCACCGTCGCAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCATGGCCAATTGTCGTTGATGTAATGATCCGGCTTGAAGCACACCCGTTCATCGTTGACCCAGAACATCTGCCAACCGGAGCCCGAGATCCTGAGCTTCGGGCACGACCAGTAGTCCTTTGCCGAAAGCGTGGCTGTGGTCA > AE015451/3498030‑3498492 | agctagcGCGATGCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCAATATCCTTGATCATTCACCGTCGCAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCCCGGGCAGCc < 1:437005‑M2/236‑2 (MQ=255) cTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCAATATCCTTGATCATTCACCGTCGCAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCctgcccgcgaatgc > 1:593923‑M2/1‑222 (MQ=255) atcGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCAATATCCTTGATCATTCACCGTCGCAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCctgcccgcgaatgc > 2:1042080‑M2/2‑222 (MQ=255) ggAGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCAATATCCTTGATCATTCACCGTCGCAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCctgcccgcga > 1:598982‑M2/1‑216 (MQ=255) aGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCAATATCCTTGATCATTCACCGTCGCAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCctgcccgcgaatgcggt > 2:1105572‑M2/1‑214 (MQ=255) gccggaTAGGCCGGACCTGCCGGCCAATATCCTTGATCATTCACCGTCGCAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGc < 2:688948/197‑1 (MQ=255) cgcgAATAGGCCGGACCTGCCGGCCAATATCCTTGATCATTCACCGTCGCAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCctgc < 1:141740‑M2/206‑5 (MQ=255) cGGACCTGCCGGCCAATATCCTTGATCATTCACCGTCGCAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGAc < 1:977327/236‑1 (MQ=255) cTGCCGGCCAATATCCTTGATCATTCACCGTCGCAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCg < 1:510623/236‑1 (MQ=255) tGCCGGCCAATATCCTTGATCATTCACCGTCGCAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCg > 1:1254746/1‑235 (MQ=255) cGGCCAATATCCTTGATCATTCACCGTCGCAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCctgcccgcgaatgcggtggcggctgtgacggt > 1:444645‑M2/1‑182 (MQ=255) gCCAATATCCTTGATCATTCACCGTCGCAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGttt > 1:1083418/1‑209 (MQ=255) gCCAATATCCTTGATCATTCACCGTCGCAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCaa > 1:873661/1‑216 (MQ=255) ccAATATCCTTGATCATTCACCGTCGCAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTc < 1:1317033/218‑1 (MQ=255) atCCTTGATCATTCACCGTCGCAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCctgcccgcgaatgcggtggcggct > 1:1047894‑M2/1‑174 (MQ=255) cTTGATCATTCACCGTCGCAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAAc < 1:682056/235‑1 (MQ=255) aCCGTCGCAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCa > 2:1358872/1‑195 (MQ=255) cGTCGCAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCgg > 2:690314/1‑175 (MQ=255) cAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGcc > 1:1397593/1‑236 (MQ=255) cAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGGTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCctgcccgcgaa < 1:707377‑M2/164‑12 (MQ=255) gccgccACCGCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCctgcccgcgaatgcggtggcggctgtgacg > 2:1460387‑M2/1‑151 (MQ=255) cGCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCATGGcc < 1:215581/236‑1 (MQ=255) tCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGCGGCCGGTGGTGGCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCctgcccgcgaatgcggtggcggctgtgacggtgaatgaccagggatagtggccggcaggtccggcctattcgcgggt > 1:1272504‑M2/1‑138 (MQ=255) gcgGGCAAGCCCGCTCCTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACt < 2:54798/174‑1 (MQ=255) cgGGCAAGCCCGCTCCTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCATGGCCAATTg < 2:1049379/233‑1 (MQ=255) cTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCctgcccgcgaatgcggtggcggctgtgacggtgaatgaccagggatagtggccggcag > 2:696414‑M2/1‑120 (MQ=255) tACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAACCGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCATGGCCACTTg > 1:95251/1‑217 (MQ=255) gACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCATGGCCAATTGTCGTTGATGTAATGATCCg < 1:365824/230‑1 (MQ=255) aCCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCATGGCCAAt < 2:1073140/208‑1 (MQ=255) aCCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCCGCCCGTGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCATGGCCAATTGTCGTTGATGTAATGATCCGGCTTGaa < 1:812273/236‑1 (MQ=255) ccGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCATGGCCAATTGTCGTTGATGt > 1:1201719/1‑219 (MQ=255) ggtggtGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTc > 1:879474/1‑148 (MQ=255) ggtggtGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCTTg > 1:1260170/1‑195 (MQ=255) 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ttCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTTCCATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCATGGCCAATTGTCGTTGATGTAATCATCCGGCTTGAAGCACACCCGTTCATCGTTGACCCAGAACATCTGCCAACCGGAGCCCGAGATCCTGAGCTTCGGGCACGACCa < 2:932424/233‑1 (MQ=255) tccACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCAt < 2:231200/123‑1 (MQ=255) tCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTG‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAGCGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCATGGCCAATTGTCGTTGATGTaa > 1:879659/1‑145 (MQ=255) aCCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGgctgcccgcgaatgcggtggcggctgtgacggtgaatgaccagggatagtggccggcaggtccggcctattcgcgggtaaaccagctcctacaacgtggcgacaccaccggtcgatgtaggagcgggcttgcccgcgaatgcggtggcggctgcgacggtgaatgatcaaggatattggccg > 1:444645‑M1/1‑32 (MQ=255) aCCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCAt > 2:1372769/1‑108 (MQ=255) aCCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCATGGCCAATTGTCGTTGATg > 2:176565/1‑140 (MQ=255) aCCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCATGGCCAATTGTCGTTGATGTAATGATCCGGCTTGAAGCACACCCGTTCATCGTTGAcc > 2:1253165/1‑179 (MQ=255) aCCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCATGGCCAATTGTCGTTGATGTAATGATCCGGCTTGAAGCACACCCGTTCATCGTTGACCCAg > 1:541336/1‑182 (MQ=255) aCCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCATGGCCAATTGTCGTTGATGTAATGATCCGGCTTGAAGCACACCCGTTCATCGTTGACCCAGAACATCTGCCAAGCGGAGccggt > 1:1116202/1‑202 (MQ=255) aCCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCATGGCCAATTGTCGTTGATGTAATGATCCGGCTTGAAGCACACCCGTTCATCGTTGACCCAGAACATCTGCCAACCg > 1:1042078/1‑197 (MQ=255) aCCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCATGGCCAATTGTCGTTGATGTAATGATCCGGCTTGAAGCACACCCGTTCATCGTTGACCCAGAACATCTGCCAACCGGAGCCCGAGATCCTGAGCTTCGGGCACGACCAGTAGTc > 1:1471109/1‑235 (MQ=255) cGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGgctgcccgcgaatgcggtggcggctgtgacggtgaatgaccagggatagtggccggcaggtccggcctattcgcgggtaaaccagctcctacaacgtggcgacaccaccggtcgatgtaggagcgggcttgcccgcgaatgcggtggcggc > 2:1460387‑M1/1‑30 (MQ=255) acaGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCATGGCCAATTGTCGTTGATGTAATGATCCGGCTTGAAGCACACCCGTTCATCGTTGACCCAGAACATCTGCCAACCGGAGCCCGAGATCCTGAGCTTCGGGCACGACCAGTAGTCCTTTGc > 1:910312/1‑235 (MQ=255) acaGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCATGGCCAATTGTCGTTGATGTAATGATCCGGCTTGAAGCACACCCGTTCATCGTTGACCCAGAACATCTGCCAACCGGAGCCCGAGATCCTGAGCTTCGGGCACGACCAGTAGTCCTTTGc < 1:1211642/235‑1 (MQ=255) caGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCATGGCCAATTGTCGTTGATGTAATGATCCGGCTTGAAGCACACCCGTTCATCGTTGACCCAGAACATCTGCCACCCGTAGCCCGAGATCCTGAGCTTc > 2:474090/1‑211 (MQ=255) aGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGgctgcccgcgaatgcggtggcggctgtgacggtgaatgaccagggatagtggccggcaggtccggcctattcgcgggtaaaccagctcctacaacgtggcgacaccaccggtcgatgtaggagcgggcttgcccgcgaatgcggtggcggctgcgacggtgaatgatcaaggat > 1:1047894‑M1/1‑24 (MQ=255) cgccACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCATGGCCAATTGTCGTTGATGTAATGATCCGGCTTGAAGCACACCCGTTCATCGTTGACCCAGAACATCTGCCAACCGGAGCCCGAGATCCTGAGCTTCGGGCACGACCAGTAGTCCTTTGCCGaaa < 1:153683/235‑1 (MQ=255) 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ttCGCGGGCAGgctgcccgcgaatgcggtggcggctgtgacggtgaatgaccagggatagtggccggcaggtccggcctattcgcgggtaaaccagctcctacaacgtggcgacaccaccggtcgatgtaggagcgggcttgcccgcgaatgcggtggcggctgcgacggtgaatgatcaaggatattggc < 1:236471‑M1/191‑181 (MQ=255) ttCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCATGGCCAATTGTCGTTGATGTAATGATCCGGCTTGAAGCACACCCGTTCATCGTTGACCCAGAACATCTGCCAACCGGAGCCCGAGATCCTGAGCTTCGGGc < 2:1482263/201‑1 (MQ=255) tCGCGGGCAGgctgcccgcgaatgcggtggcggctgtgacggtgaatgaccagggatagtggccggcaggtccggcctattcgcgggtaaaccagctcctacaacgtggcgacaccaccggtcgatgtaggagcgggcttgcccgcgaatgcggtggcggctgcgacggtgaatgatcaaggatattggccggcaggtccggcctattcgcgggtaaacccgctcc > 1:598982‑M1/1‑10 (MQ=255) tCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCATGGCCAATTGTCGTTGATGTAATGATCCGGCTTGAAGCACACCCGTTCATCGTTGACCCAGAACATCTGCCAACCGGAGCCCGAGATCCTGAGCTTCGGGCACGACCAGTAGTCCTTTGCCGAAAGCGTGGCTGTgg > 1:557475/1‑236 (MQ=255) 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gggCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCATGGCCAATTGTCGTTGATGTAATGATCCGGCTTGAAGCACACCCGTTCATCGTTGACCCAGAACATCTGCTAACCGGAGCCCGAGATCCTGAGCTTCGGGCACGACCag > 1:339665/1‑204 (MQ=255) ggCAGgctgcccgcgaatgcggtggcggctgtgacggtgaatgaccagggatagtggccggcaggtccggcctattcgcgggtaaaccagctcctacaacgtggcgacaccaccggtcgatgtaggagcgggctttcccgcgaatgcggtggcggctgcgacggtgaa > 1:1062046‑M1/1‑5 (MQ=255) gcggCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CGTCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCATGGCCAATTGTCGTTGATGTAATGATCCGGCTTGAAGCACACCCGTTCATCGTTg < 1:1261334/145‑1 (MQ=255) gCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACTCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCATGCATGGCCAATTGTCGTTGATGTAATGATCCGGCTTGAAGCACACCCGTTCATCGTTGACCCAGAACATCTGCCAACCGGAGCCCGAGATCCTGAGCTTCGGGCACGACCAGTAGTCCTTTGCCGAAAGCGTGGCTGTGGTCa < 2:1463863/233‑1 (MQ=255) aGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCATGGCCAATTGTCGTTGATGTAATGATCCGGCTTGAAGCACACCCGTTCATCGTTGACCCAGAACATCTGCCAACCGGAGCCCgaga > 1:963079/1‑177 (MQ=255) ggctgcccgcgaatgcggtggcggctgtgacggtgaatgaccagggatagtggccggcaggtccggcctattcgcgggtaaaccagctcctacaacgtggcgacaccaccggtcgatgtaggagcgggcttgcccgcgaatgcggtggcggctgcgacggggcatgatcaaggatattggccggca > 2:1473684‑M1/1‑1 (MQ=255) | AGCTAGCGCGATGCTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCAATATCCTTGATCATTCACCGTCGCAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACATCGACCGGTGGTGTCGCCACGTTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAATAGGCCGGACCTGCCGGCCACTATCCCTGGTCATTCACCGTCACAGCCGCCACCGCATTCGCGGGCAGCCTGCCCGCGAACACCGGCGCAGCCGGTTT‑CATCCAACTCAACGACCATCGACCTGTACGCAAACGTCTCTGCCATCGATTGCCTTGCATGGCCAATTGTCGTTGATGTAATGATCCGGCTTGAAGCACACCCGTTCATCGTTGACCCAGAACATCTGCCAACCGGAGCCCGAGATCCTGAGCTTCGGGCACGACCAGTAGTCCTTTGCCGAAAGCGTGGCTGTGGTCA > AE015451/3498030‑3498492 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |