| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 3692345 | 78 (0.910) | 4 (0.050) | 4/336 | NT | 5.6% | coding (241/756 nt) | PP_3258 | conserved protein of unknown function |
| ? | AE015451 | = 3692593 | 62 (0.760) | coding (1033/1044 nt) | PP_3259 | Acyl‑CoA dehydrogenase‑related protein | |||||
TGACCGTCACTGCGCCAGGTGGCCATCAGCAGGTCATCGGCGCGCAGTAACTGGGTGAGGTGACGGGTCAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAGGCCGCCAGCCATGAGAATTTCGTCATCCGGATGCGGCGCGATCAATACCAGCCGGCGCCCCGGCGGGCACAGTTGGCGTGAGTCGAGCCAGGTCGCACGCGCCAGGTGCGCGCTTTGCTGCCAGGCTGCCCAAGGCGTGCCGCCCGCGGACTGGATCAGGTTCT > AE015451/3692119‑3692578 | tGACCGTCACTGCGCCAGGTGGCCATCAGCAGGTCATCGGCGCGCAGTAACTGGGTGAGGTGACGGGTCAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCt < 2:1027133/234‑1 (MQ=255) ccGTCACTGCGCCAGGTGGCCATCAGCAGGTCATCGGCGCGCAGTAACTGGGTGAGGTGACGGGTCAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGcc > 1:1029464/1‑236 (MQ=255) cTGCGCCAGGTGGCCATCAGCAGGTCATCGGCGCGCAGTAACTGGGTGAGGTGACGGGTCAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCg > 2:777102/1‑234 (MQ=255) gcgcCAGGTGGCCATCAGCAGGTCATCGGCGCGCAGTAACTGGGTGAGGTGACGGGTCAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGc > 1:1093748/1‑227 (MQ=255) gcgcCAGGTGGCCATCAGCAGGTCATCGGCGCGCAGTAACTGGGTGAGGTGACGGGTCAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGt > 1:929898/1‑234 (MQ=255) ccAGGTGGCCATCAGCAGGTCATCGGCGCGCAGTAACTGGGTGAGGTGACGGGTCAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTg < 2:974428/232‑1 (MQ=255) cAGTTGGCCATCAGCAGGTCATCGGCGCGCAGTAACTGGGTGAGGTGACGGGTCAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTg < 2:1278804/231‑1 (MQ=255) ggCCATCAGCAGGTCATCGGCGCGCAGTAACTGGGTGAGGTGACGGGTCAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCGGTCGGTGGCGGAGATc > 1:780389/1‑235 (MQ=255) aTCGGCGCGCAGTAACTGGGTGAGGTGACGGGTCAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTc > 2:1169810/1‑207 (MQ=255) aTCGGCGCGCAGTAACTGGGTGAGGTGACGGGTCAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGCTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATAAGCACCAGCTCATCCt > 1:1429603/1‑236 (MQ=255) tCGGCGCGCAGTAACTGGGTGAGGTGACGGGTCAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCg > 1:749427/1‑213 (MQ=255) ggCGCGCAGTAACTGGGTGAGGTGACGGGTCAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTc < 2:639884/234‑1 (MQ=255) cgcgcAGTAACTTGGTGAGGTGACGGGTTAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTc < 1:1433473/232‑1 (MQ=255) cgcgcAGTAACTGGGTGAGGTGACGGGTCAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCa > 2:891535/1‑233 (MQ=255) gcgcAGTAACTGGGTGAGGTGACGGGTCAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGcc < 2:1029461/236‑1 (MQ=255) gcAGTAACTGGGTGAGGTGACGGGTCAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGccc > 1:1145561/1‑235 (MQ=255) gcAGGAACTGGGTGAGGTGACGGGTCAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGcccc < 1:35962/236‑1 (MQ=255) gaggtgaCGGGTCAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGcc > 1:565326/1‑235 (MQ=255) ggtgaCGGGTCAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCcag > 1:903796/1‑235 (MQ=255) tgaCGGGTCAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCt > 2:668655/1‑228 (MQ=255) tgaCGGGTCAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCcagcag > 1:1180552/1‑236 (MQ=255) tgaCGGGTCAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCcagcag > 1:263998/1‑236 (MQ=255) cGGGTCAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAg < 1:469867/194‑1 (MQ=255) cGGGTCAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAg > 2:469865/1‑194 (MQ=255) cAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAGGCCgccag > 1:1438940/1‑236 (MQ=255) cttcGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAGgcc > 2:551256/1‑220 (MQ=255) cttcGCCCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAGGCAGCCAGCCATGAGAAtt > 1:914243/1‑236 (MQ=255) ttcGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGgag < 2:446751/172‑1 (MQ=255) gcgcgGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGtggcaactatga < 1:1099772‑M1/156‑13 (MQ=255) gcgGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCATGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCa < 2:20516/188‑1 (MQ=255) ggCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCt < 2:1338603/186‑1 (MQ=255) gAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATcc < 2:1109739/160‑1 (MQ=255) ccTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAGGCCGCCAGCCATGAGAATTTCGTCATCCGGATGCGGCGCGATCaa > 2:827553/1‑228 (MQ=255) 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cAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTc > 1:528038/1‑152 (MQ=255) cAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTc < 2:528036/152‑1 (MQ=255) cAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAGGCCGCCAGCCATGAGAATTTCGTCATCCGGATGCGGCGCGATCAATACCAGCCGGCGccc > 1:776163/1‑236 (MQ=255) cAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAGGCCGCCAGCCATGAAAATTTCGTCATCCGGATGCGGCGCGATCAATACCAGCCGgcgc > 1:978484/1‑234 (MQ=255) 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gCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAGGCCGCCAGCCATGAGAATTTCGTCATCCGGATGCGGCGCGATCAATACCAGCCGgc < 2:486955/185‑1 (MQ=255) tCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAGGCCGCCAGCCATGAGAATTTCGTCATCCGGATGCGGCGCGATCAATACCAGCCGGCGCCCCGGCGGGCACAGTTGGCGTGAGTCGAGCCAGGTCGCGCGCGCCAGGTg < 2:1445959/233‑1 (MQ=255) tCCTGGGGCCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAGGCCGCCAGCCATGAGAATTTCGTCATCCGGATGCGGCGCGATCAATACCAGCCGGCGCCCCGGCGGGCACAGTTg < 1:12952/200‑1 (MQ=255) gggCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAGGCCGCCAGCCATGAGAATTTCGTCATCCGGATGCGGCGCGATCAATACCAGCCGGCGCCCCGGCGGGCACAGTTGGCGTGAGTCGAGCCAGGTCGCACGCGCCAGGTGCGCGCTTtg < 1:891537/236‑1 (MQ=255) gcgcTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAGGCCGCCAGCCATGAGAATTTCGTCATCCGGATGCGGCGCGATCAATACCAGCCGGCGCCCCGGCGGGCACAGTTGGCGTGAGTCGAGCCAGGTCGCACGCGCCAGGTGCGCGCTTtg < 2:776161/234‑1 (MQ=255) cTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCGTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCAGCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAGGCCGCCAGCCATGAGAATTTCGTCATCCGGATGCGGCGCGATCAATACCAGCCGGCGCCCCGGCGGGCACAGTTGGCGTGAGTCGAGCCAGGTCGCACGCGCCAGGTGCGCGCTTTGCTGcc < 1:827028/236‑1 (MQ=255) gcggcgCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAGGCCGCCAGCCATGAGAATTTCGTCATCCGGATGCGGCGCGATCAATACCAGCCGGCGCCCCGGCGGGca > 1:233737/1‑180 (MQ=255) cggcgCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATc < 2:593942/69‑1 (MQ=255) cgcAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAGGCCGCCAGCCATGAGAATTTCGTCATCCGGATGCGGCGCGATCAATACCAGCCGGCGCCCCGGCGGGCACAGTTGGCGTGAGTCGAGCCAGGTCGCACGCGCCAGGTGCGCGCTTTGCTGCCAGGCTg > 2:695718/1‑235 (MQ=255) gATGTTCCGGCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAGGCCGCCAGCCATGAGAATTTCGTCATCCGGATGCGGCGCGATCAATACCCGCCGGCGCCCCGGCGGGCACAGTTGGCGTGAGTCGAGCCAGGTc < 2:1036796/194‑1 (MQ=255) cAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAGGCCGCCAGCCATGAGAATTTCGTCATCCGGATGCGGCGCGATCAATACCAGCCGGCGCCCCGGCGGGCACAGTTGGCGTGAGTCGAGCCAGGTCGCACGCGCCAGGTGCGCGCTTTGCTGCCAGGCTGCCCAAGGCGTGccgcccgc < 1:392061/236‑1 (MQ=255) acaggACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAGGCCGCCAGCCATGAGAATTTCGTCATCCGGATGCGGCGCGATCAATACCAGCCGGCGCCCCGGCGGGCACAGTTGGCGTGAGTCGAGCCAGGTCGCACGCGCCAGGTGCGCGCTTTGCTGCCAGGCTGCCCAAGGCGTGccgcccg < 1:723996/231‑1 (MQ=255) gACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAGGCCGCCAGCCATGAGACTGTCGTCATCCGGATGCGGTGCGATCAATACCAGCCGGCGCCCCGGCGGGCACAGTTGGCGTGAGTCGAGCCAGGTCGCACGCGCCAGGTGCGCGCTATACTGCCAGGCTGCCCAAGGCGTGCCGCCCGCgg < 2:1429600/234‑1 (MQ=255) gACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAGGCCGCCAGCCATGAGAATTTCGTCATCCGGATGCGGCGCGATCAATACCAGCCGGCGCCCCGGCGGGCACAGTTGGCGTGAGTCGAGCCAGGTCGCACGCGCCAGGTGCGCGCTTTGCTGCCAGGCTGCCCAAGGCGTGccgccc > 2:1347698/1‑230 (MQ=255) gACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAGGCCGCCAGCCATGAGAATTTCGTCATCCGGATGCGGCGCGATCAATACCAGCCGGCGCCCCGGCGGGCACAGTTGGCGTGAGTCGAGCCAGGTCGCACGCGCCAGGTGCGCGCTTTGCTGCCAGGCTGCCCAAGGCGTGCCGCCCGCGGa > 1:1175562/1‑235 (MQ=255) acgggAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAGGCCGCCAGCCATGAGAATTTCGTCATCCGGATGCGGCGCGATCAATACCAGCCGGCGccc < 2:344403/141‑1 (MQ=255) 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ccGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAGGCCGCCAGCCATGAGAATCTCGTCATCCGGATGCGGCGCGATCAATACCAGCCGGCGCCCCGGCGGGCACAGTTGGCGTGAGTCGAGCCAGGTCGCACGCGCCAGGTGCGCGCTTTGCTGCCAGGCTGCCCAAGGCGTGCCGCCCGCGGACTGGATCAg < 1:84070/236‑1 (MQ=255) cGGGGTGtggcaactatgagccagaacctgatccagtccgcgggcggcacgccttgggcagcctggcagcaaagcgcgcacctggcgcgtgcgacctggctcgactcacgccaactgtgcccgccggggcgccggctggtattgatcgcgccgcatccggatgacgaaattctcatggctggcggcctgctggcaggcttcaa < 2:704392‑M1/203‑197 (MQ=255) cGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAGGCCGCCAGCCATGAGAATTTCGTCATCCGGATGCGGCGCGATCAATACCAGCCGGCGCCCCGGCGGGCACAGTTGGCGTGAGTCGAGCCAGGTCGCACGCGCCAGGTGCGCGCTTTGCTGCCAGGCTGCCCAAGGCGTGCCGCCCGCGGACTGGATCAgg > 1:939999/1‑236 (MQ=255) ggggTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAgg < 2:251091/76‑1 (MQ=255) gggTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGAGCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAGGCCGCCCGCCATGAGAATTTCGTCCTCCg > 2:481495/1‑103 (MQ=255) 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TGACCGTCACTGCGCCAGGTGGCCATCAGCAGGTCATCGGCGCGCAGTAACTGGGTGAGGTGACGGGTCAGAAACGCTTCTTCGCGCGGCAACTGGCCGTCCTTCAGGTGGAGCCTGCGCCAGTCCAGGCGTTCAAGGTCCAGGTCGAGCTGTTGCAGGGCCAGTCGGCTTTCCTGGGGGCGCTGGCGGCGCAATCGATGTTCGGTCCAGTGACTGGAGCCGGGGTGGCTGCCTTCGCCGTCGGTGGCGGAGATCAGCACCAGCTCATCCTCACGCCCCTTGAAGCCTGCCAGCAGGCCGCCAGCCATGAGAATTTCGTCATCCGGATGCGGCGCGATCAATACCAGCCGGCGCCCCGGCGGGCACAGTTGGCGTGAGTCGAGCCAGGTCGCACGCGCCAGGTGCGCGCTTTGCTGCCAGGCTGCCCAAGGCGTGCCGCCCGCGGACTGGATCAGGTTCT > AE015451/3692119‑3692578 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |