| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 5463139 = | 61 (0.710) | 3 (0.040) | 3/334 | NT | 5.3% | coding (211/939 nt) | PP_4799 | putative Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase |
| ? | AE015451 | 5463189 = | 49 (0.610) | coding (161/939 nt) | PP_4799 | putative Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase | |||||
TTGGCCCCCAACAGGTCGGCATTGAGCATCCCCCCATGGAAGGTCACCAGCCCGGCATGCCGGTAGATCGCCGTATGCAACGCGGTGATGTCGCTGTAGCCGATCAGCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGCTGGCAGGGTGGGTTGGAAGGTTTTGGCGCAGTACATCGCGGCTCCTTGCAGCGCATTGGA > AE015451/5462910‑5463373 | tgggCCCCCAACAGGTCGGCATTGAGCAGCCCCCCATGGAAGGTCACCAGCCCGGCATGCCGGTAGATCGCCGTATGCAACGCGGTGATGTCGCTGTAGCCGATCAGCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGc < 1:426219/232‑1 (MQ=255) catcggcatttttgtttgtgtccaatgcgctgcaaggagccgcgatgtactgcgccaaaaccttccaccccaccctgccagccgcgctgccggccaacgcatgttttgccattgtcgccccggcgggcgcggcgcggcttgatgcgcacaaggttagccagtggttcgttgaccgcggctaccgttgccgtatctacccgggtgcCCTGCAg > 1:403802‑M1/206‑212 (MQ=255) aGCATCCCCCCATGGAAGGTCACCAGCCCGGCATGCCGGTAGATCGCCGTATGCAACGCGGTGATGTCGCTGTAGCCGATCAGCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGc < 1:253881/210‑1 (MQ=255) cATGGAAGGTCACCAGCCCGGCATGCCGGTAGATCGCCGGATGCAACGCGGTGATGTCGCTGTAGCCGATCAGCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTgc < 1:416740/236‑1 (MQ=255) ggAAGGTCACCAGCCCGGCATGCCGGTAGATCGCCGTATGCAACGCGGTGATGTCGCTGTAGCCGATCAGCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTgcgc > 1:1164455/1‑235 (MQ=255) ggccACCAGCCCGGCATGCCGGTAGATCGCCGTATGCAACGCGGTGATGTCGCTGTAGCCGATCAGCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGcc < 2:634951/209‑1 (MQ=255) ccaatgcgctgcaaggagccgcgatgtactgcgccaaaaccttccaacccaccctgccagccgcgctgccggccaacgcatgttttgccattgtcgccccggcgggcgcggcgcggcttgatgcgcacaaggttagccagtggttcgttgaccgcggctaccgttgccgtatctacccgggtgcCCTGCa > 2:635166‑M1/185‑190 (MQ=255) aCCAGCCCGGCATGCCGGTAGATCGCCGTATGCAACGCGGTGATGTCGCTGTAGCCGATCAGCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAg < 1:1122691/219‑1 (MQ=255) aCCAGCCCGGCATGCCGGTAGATCGCCGTATGCAACGCGGTGATGTCGCTGTAGCCGATCAGCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAg > 2:1122688/1‑219 (MQ=255) aCCAGCCCGGCATGCCGGTAGATCGCCGTATGCAACGCGGTGATGTCGCTGTAGCCGATCAGCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAggg < 1:624875/235‑1 (MQ=255) aCCAGCCCGGCATGCCGGTAGATCGCCGTATGCAACGCGGTGATGTCGCTGTAGCCGATCAGCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAgg < 2:1402903/234‑1 (MQ=255) ccGGCATGCCGGTAGATCGCCGTATGCAACGCGGTGATGTCGCTGTAGCCGATCAGCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCg < 1:755881/235‑1 (MQ=255) cGGCATGCCGGTAGATCGCCGTATGCAACGCGGTGATGTCGCTGTAGCCGATCAGCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAggacttgc < 2:1404200/233‑7 (MQ=255) 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1:785042/236‑1 (MQ=255) tGTCGCTGTAGCCGATCAGCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAAc > 2:767422/1‑213 (MQ=255) gCCGATCAGCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCCCCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAAcc > 1:864796/1‑235 (MQ=255) cAGCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCCTGCAAGTCCTGCAGgcgcaggg < 2:212726/140‑5 (MQ=255) aGCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTgc > 1:881522/1‑234 (MQ=255) 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ggCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCt < 2:220415/143‑1 (MQ=255) ggCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCt > 1:220416/1‑143 (MQ=255) ggCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGCTGGCAGGGTGGGTTGGAAGGttt > 1:686068/1‑236 (MQ=255) gCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATAGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGCTGGCAGGGTGGGTTGGAAGGtttt < 1:813686/236‑1 (MQ=255) gTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCaaaa > 2:33171/1‑187 (MQ=255) gTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCg > 2:942433/1‑200 (MQ=255) gTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGCTGGCAGGGTGGGTTGGAAGGTTTTg > 1:789326/1‑235 (MQ=255) accgcggctaccgttgccgtatctacccgggtgcCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGCTAACGAACCACTGGCTAACCtt < 2:806174‑M1/106‑1 (MQ=255) tGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGgcgc > 2:353799/1‑41 (MQ=255) tGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGgcgc < 1:353801/41‑1 (MQ=255) tGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGc > 1:385528/1‑53 (MQ=255) tGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGc < 2:385526/53‑1 (MQ=255) gCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGCTGGCAGGGTGGGTTGGAAGGtt > 2:989082/1‑225 (MQ=255) gCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGCTGGCAGGGTGGGTTGGAAGGTTTTGGCGCAGTa > 1:854060/1‑236 (MQ=255) caAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGCTGGCAGGGTGGGTTGGAAGGTTTTGGCGCAGTACATCGCGGCTCCTTGCAGCGCAt > 1:660572/1‑236 (MQ=255) cCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGCTGGCAGGGTGGGTTGGAAGGTTTTGGCGCAGTACATCGCGGCTCCTTGCAGCGCATTg < 1:960264‑M1/233‑1 (MQ=255) CCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGCTGGCAGGGGGGGTTGGAAGGTTTTGGCGCAGTACATCGCGGCTCCTTGCAGCGCATTGGa < 1:195588‑M1/235‑1 (MQ=255) | TTGGCCCCCAACAGGTCGGCATTGAGCATCCCCCCATGGAAGGTCACCAGCCCGGCATGCCGGTAGATCGCCGTATGCAACGCGGTGATGTCGCTGTAGCCGATCAGCGGCTTGGGGTTGCGCCGGATCAGTTCAAAGTCGAGCTGGTCAAGCAGGCGCATGCTGCCGTAGCCCCCACGCATGCACAGGATGGCGTCCATGGCCGGATCGGCAAACGCTGCATGCAAGTCCTGCAGGCGCTGCTGGTCCGGCCCCGCCAGGTAGCCCTGCGCCTGCAGGGCACCCGGGTAGATACGGCAACGGTAGCCGCGGTCAACGAACCACTGGCTAACCTTGTGCGCATCAAGCCGCGCCGCGCCCGCCGGGGCGACAATGGCAAAACATGCGTTGGCCGGCAGCGCGGCTGGCAGGGTGGGTTGGAAGGTTTTGGCGCAGTACATCGCGGCTCCTTGCAGCGCATTGGA > AE015451/5462910‑5463373 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |