| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | AE015451 | 5554498 = | 121 (1.500) | coding (398/546 nt) | PP_4886 | conserved protein of unknown function | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
CGGCGTGCTTGGGTCACCCACAATTATCAGCTCGCCAGGGAATACAACAGTGTTGACGACATGCGCATTCAGCACATCAAACTTGGCCCGCTGATTCGCGTTCATGGGCGTATCGGCCTTCAGCGACTCATACGACTGCGCATGCGGATTAATGAAGCTGCGCGCCTCGGACATGGTAGTACCTCACGCATACTTCTTGTTGTTGATGCGGTCCCATCCGCCCGTGACGTTGCCGCCAGCGCTGCCGTCGAGGCGTTTCTGCCGCGTGTAGATTGTCTTGATGCGCCCGTAGTTCAGCTGCACGACTTCCACTGGCACCCCAGCGCTGGCGCTTTGGGCGTAATCGGCAATGATCACTTCTTCCAGGACGACTTCGTAGTACTTGAGCTTGTCGCCACCCGCACGACACAGCACGAGCTTCACTTCCTTCAGGTGCTGCCCGGCACAGCTCGCCTCCAGCAG > AE015451/5554167‑5554628 | cGGCGTGCTTGGGTCACCCACAATTATCAGCTCGCCAGGGAATACAACAGTGTTGACGACATGCGCATTCAGCACATCAAACTTGGCCCGCTGATTCGCGTTCATGGGCGTATCGGCCTTCAGCGACTCATACGACTGCGCATGCGGATTAATGAAGCTGCGCGCCTCGGACATGGTAGTACCTCACGCATACTTCTTGTTGTTGATGCGGTCCCATCCGCCCGTGACGTTgccgc < 1:728787/236‑1 (MQ=255) cacctctgccaccgcaagctccgcgggcggcgcatcatcaggccgcaccacactcaccaacttcaccttcactaagtacctggacagtgccagctgcaagctgctggaggcgagctgtgccgggcagcacctgaaggaagtgaagctcgtgctgtgtcgtgcgggtggcgacaagctcaagtactacgaagtcgtcctggaagaagtgatcattgccgattacgcccaaagCGcc > 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1:638452/62‑1 (MQ=255) gTGACGTTGCCGCCAGCGCTGCCGTCGAGGCGTTTCTGCCGCGTGTAGATTGTCTTGATGCGCCCGTAGTTCAGCTGCACGACTTCCACTGGCACCCCAGCGCTGGCGCTTTGGGCGTAATCGGCAATGATCACTTCTTCCAGGACGACTTCGTAGTACTTGAGCTTGTCGCCACCCGCACGACACAg > 2:322275/1‑188 (MQ=255) tGACGTTGCCGCCAGCGCTGCCGTCGAGGCGTTTCTGCCGCGTGTAGATTGTCTTGATGCGCCCGTAGTTCAGCTGCACGACTTCCACTGGCACCCCAGCGCTGGCGCTTTGGGCGTAATCGGCAATGATCACTTCTTCCAGGACGACTTCGTAGTACTTGAGCTTGTCGCCACCCGCACGACACAGCACGAGCTTCACTTCCTTCAGGTGCTGCCCGGCACAGCCAGCCTCcag > 1:1376322/1‑235 (MQ=255) cGTTGCCGCCAGCGCTGCCGTCGAGGCGTTTCTGCCGCGTGTAGATTGTCTTGATGCGCCCGTAGTTCAGCTGCACGACTTCCACTGGCACCCCAGCGCTGGCGCTTTGGGCGTAATc < 2:335542/118‑1 (MQ=255) cGTTGCCGCCAGCGCTGCCGTCGAGGCGTTTCTGCCGCGTGTAGATTGTCTTGATGCGCCCGTAGTTCAGCTGCACGACTTCCACTGGCACCCCAGCGCTGGCGCTTTGGGCGTAATCGGCAATGATCACTTCTTCCTGGACGACTTTGTAGTACTTGAGCTTGTCGCCACCCGCACGACACAGCACGAGCTTCACTTCCTTCAGGTGCTGCCCGGCACAGCTCGCCTCcagcag < 1:809326/235‑1 (MQ=255) cGTTGCCGCCAGCGCTGCCGTCGAGGCGTTTCTGCCGCGTGTAGATTGTCTTGATGCGCCCGTAGTTCAGCTGCACGACTTCCACTGGCACCCCAGCGCTGGCGCTTTGGGCGTAATCGGCAATGATCACTTCTTCCAGGACGACTTCGTAGTACTTGAGCTTGTCGCCACCCGCACGACACAGCACGAGCTTCACTTCCTTCAGGTGCTGCCCGGCACAGCTCGCCTcc > 2:958931/1‑230 (MQ=255) | CGGCGTGCTTGGGTCACCCACAATTATCAGCTCGCCAGGGAATACAACAGTGTTGACGACATGCGCATTCAGCACATCAAACTTGGCCCGCTGATTCGCGTTCATGGGCGTATCGGCCTTCAGCGACTCATACGACTGCGCATGCGGATTAATGAAGCTGCGCGCCTCGGACATGGTAGTACCTCACGCATACTTCTTGTTGTTGATGCGGTCCCATCCGCCCGTGACGTTGCCGCCAGCGCTGCCGTCGAGGCGTTTCTGCCGCGTGTAGATTGTCTTGATGCGCCCGTAGTTCAGCTGCACGACTTCCACTGGCACCCCAGCGCTGGCGCTTTGGGCGTAATCGGCAATGATCACTTCTTCCAGGACGACTTCGTAGTACTTGAGCTTGTCGCCACCCGCACGACACAGCACGAGCTTCACTTCCTTCAGGTGCTGCCCGGCACAGCTCGCCTCCAGCAG > AE015451/5554167‑5554628 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |