New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | AE015451 | = 5632227 | 89 (1.030) | 4 (0.050) | 4/330 | NT | 5.6% | coding (1757/3954 nt) | putA | proline dehydrogenase/1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase |
? | AE015451 | = 5632372 | 52 (0.650) | coding (1902/3954 nt) | putA | proline dehydrogenase/1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase |
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CAGTGCCTGCACGGCATGGGCGAACCGCTGTACGAGCAAGTGGTCGGCAAGATTGCCGATGGCAAGCTGAACCGCCCGTGCCGCGTGTATGCACCGGTCGGCACCCATGAAACGCTGCTGGCCTACCTGGTGCGCCGCCTGCTGGAAAACGGCGCGAACACCTCGTTCGTCAACCGCATTGCCGACCACTCGATTTCCATCCAGGAACTGGTCGCCGACCCGGTGGCCAGCATCGAGCGCATGGGTACCCAGGAAGGCAGTATCGGCCTGCCGCACCCACGCATTCCCCTGCCGCGCGACCTGTATGGCACCGAACGGGCCAACTCGGCCGGCATCGACATGGCCAATGAACACCGCCTGGCGTCGCTGTCCTGCGCCATGCTGGCCACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGCCTGCGCCGCCAGCGAGAGCGCTGCCGCACCGGTGCTGA > AE015451/5631995‑5632457 | cAGTGCCTGCACGGCATGGGCGAACCGCTGTACGAGCAAGTGGTCGGCAAGATTGCCGATGGCAAGCTGAACCGCCCGTGCCGCGTGTATGCACCGGTCGGCACCCATGAAACGCTGCTGGCCTACCTGGTGCGCCGCCTGCTGGAAAACGGCGCGAACACCTCGTTCGTCAACCGCATTGCCGACCACTCGATTTCCATCCAGGAACTGGTCGCCGACCCGGTGGCCAGCATCGa < 1:571898/236‑1 (MQ=255) ccTGCACGGCATGGGCGAACCGCTGTACGAGCAAGTGGTCGGCAAGATTGCCGATGGCAAGCTGAACCGCCCGTGCCGCGTGTATGCACCGGTCGGCACCCATGAAACGCTGCTGGCCTACCTGGTGCGCCGCCTGCTGGAAAACGGCGCGAACACCTCGTTCGTCAACCGCATTGCCGACCACTCGATTTCCATCCAGGAACTGGTCGCCGACCCGGTGGCCAGCATCGAGCGCa < 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acCTCGTTCGTCAACCGCATTGCCGCCCACTCGATTTCCATCCAGGAACTGGTCGCCGACCCGGTGGCCAGCATCGAGCGCATGGGTACCCAGGAAGGCAGTATCGGCCTGCCGCACCCACGCATTCCCCTGCCGCGCGACCTGTATGGCACCGAACGGGCCAACTCGGCCGGCATCGACATGGCCAATGAACACCGCCTGGCGTCGCt < 1:313003/209‑1 (MQ=255) cTCGTTCGTCAACCGCATTGCCGACCACTCGATTTCCATCCAGGAACTGGTCGCCGACCCGGTGGCCAGCATCGAGCGCATGGGTACCCAGGAAGGCAGTATCGGCCTGCCGCACCCACGCATTCCCCTGCCGCGCGACCTGTATGGCACCGAACGGGCCAACTCGGCCGGCATc < 1:1020234/175‑1 (MQ=255) cttcgtCAACCGCATTGCCGACCACTCGATTTCCATCCAGGAACTGGTCGCCGACCCGGTGGCCAGCATCGAGCGCATGGGTACCCAGGAAGGCAGTATCGGCCTGCCGCACCCACGCATTCCCCTGCCGCGCGACCTGTATGGCAcc < 2:1243038/147‑1 (MQ=255) ccGCATTGCCGACCACTCGATTTCCATCCAGGAACTGGTCGCCGACCCGGTGGCCAGCATCGAGCGCATGGGTACCCAGGAAGGCAGTATCGGCCTGCCGCACCCACGCATTCCCCTGCCGCGGGACCTGTATGGCAcc < 1:506200/139‑1 (MQ=255) tGCCGACCACTCGATTTCCATCCAGGAACTGGTCGCCGACCCGGTGGCCAGCATCGAGCGCATGGGTACCCAGGAAGGCAGTATCGGCCTGCCGCACCCACGCATTCCCCTGCCGCGCGACCTGTATGGCACCGACCGGGCCCACTcggcccg > 2:118920/1‑151 (MQ=255) 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1:730118/204‑1 (MQ=255) agccaGGAACTGGTCGCCGACCCGGTGGCCAGCATCGAGCGCATGGGTACCCAGGAAGGCAGTATCGGCCTGCCGCACCCACGCATTCCCCTGCCGCGCGACCTGTATGGCACCGAACGGGCCAACTCGGCCGGCATCGACATGGCCAATGAACACCGCCTGGCGTCGCTGTCCt < 1:44935/173‑1 (MQ=255) aGGAACTGGTCGCCGACCCGGTGGCCAGCATggcgcaggacagcgacgccaggcggtgttcattggccatgtcgatgccggccgagttggcccgttcggtgccatacaggtcgcgcggcaggggaatgcgtgggtgcggcaggcagatactgccttcctgggtacccatgcgctcgatgctgg > 1:785362‑M1/1‑31 (MQ=255) aGGAACTGGTCGCCGACCCGGTGGCCAGCATCGAGCGCATTGGCACCCAGGAAGGCAGTATCGGCCTGCCGCACCCACGCATTCCCCTGCCGCGCGCCCTGTATGGCACCGAACGGGCCAACTCGGCCGGCATCgg > 2:234252/1‑135 (MQ=255) aGGAACTGGTCGCCGACCCGGTGGCCAGCATCGAGCGCATGGGTACCCAGGAAGGCAGTATCGGCCTGCCGCACCCACGCATTCCCCTGCCGCGCGACCTGTATGGCACCGAACGGGCCAACTCGGCCGGCATCGa > 2:724668/1‑136 (MQ=255) aGGAACTGGTCGCCGACCCGGTGGCCAGCATCGAGCGCATGGGTACCCAGGAAGGCAGTATCGGCCTGCCGCACCCACGCATTCCCCTGCCGCGCGACCTGTATGGCACCGAACGGGCCAACTCGGCCGGCATCGACATGGCCAATGAACACCGCCTGGCGTCGCTGTCCTGCGCCATGCTGGCCACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGCCTGCGCCGCCAg > 1:929638/1‑235 (MQ=255) gCCGACCCGGTGGCCAGCATCGAGCGCATGGGTACCCAGGAAGGCAGTATCGGCCTGCCGCACCCACGCATTCCCCTGCCGCGCGACCTGTATGGCACCGAACGGGCCAACTCGGCCGGCATCGACATGGCCAATGAACACCGCCTGGCGTCg > 2:1151132/1‑153 (MQ=255) gCCGACCCGGTGGCCAGCATCGAGCGCATGGGTACCCAGGAAGGCAGTATCGGCCTGCCGCACCCACGCATTCCCCTGCCGCGCGACCTGTATGGCACCGAACGGGCCAACTCGGCCGGCATCGACATGGCCAATGAACACCGCCTGGCGTCGCTGTCCTgcgc > 2:1359431/1‑164 (MQ=255) ccGACCCGGTGGCCAGCATCGAGCGCATGGGTACCCAGGAAGGCAGTATCGGCCTGCCGCACCCACGCATTCCCCTGCCGCGCGACCTGTATGGCACCGAACGGGCCAACTc < 2:8940/112‑1 (MQ=255) gtcccGGTGGCCAGCATCGAGCGCATGGGTACCCAGGAAGGCAGTATCGGCCTGCCGCACCCACGCATTCCCCTGCCGCGCGACCTGTATGGCACCGAACGGGCCAACTc < 2:1172687/108‑1 (MQ=255) gACCCGGTGGCCAGCATCGAGCGCATGGGTACCCAGGAAGGCAGTATCGGCCTGCCGCACCCACGCATTCCCCTGCCGCGCGACCTGTATGGCACCGAACGGGCCAACTCGGCCGGCATCGACATGGCCAATGAACACCGCCTGGCGTCGCTGTCCTGCGCCATGCTGGCCACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGCCTGCGCCGCCAGCGAGAGCGCTGCCg < 2:603891/235‑1 (MQ=255) 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ccAGCATggcgcaggacagcgacgccaggcggtgttcattggccatgtcgatgccggccgagttggcccgttcggtgccatacaggtcgcgcggcaggggaatgcgtgggtgcggcaggccgatactgccttcctgggtacccatgcgctcgatgctggccaccgggtcggcgaccagttcctggatggaaatcgagtggtcggcaatgcggttgacgaacgaggtgttcgcgcc > 1:1174347‑M1/1‑7 (MQ=255) ccAGCATCGAGCGCATGGGTACCCAGGAAGGCAGTATCTGCCTGCCGCACCCACGCATTCCCCTGCCGCGCGACCTGTATGGCACCGAACGGGCCAACTCGGCCGGCATCGACATGGCCAATGAACACCGCCTGGCGTCGCTGTCCTGCGCCatgctggccaccgggtcggcgaccagttcct > 1:785362‑M2/1‑152 (MQ=255) cAGCATCGAGCGCATGGGTACCCAGGAAGGCAGTATCGGCCTGCCGCACCCACGCATTCCCCTGCCGCGCGACCTGTATGGCACCGAACGGGCCAACTCGGCCGGCATCGACATGGCCAATGAACACCGCCTGGCGTCGCTGTCCTGCGCCatgctggccaccgggtcggcgaccagttcctggatggaaatcgagtggtcggcaatgcggttgacgaacgaggtg < 2:1132777‑M2/226‑76 (MQ=255) cAGCATCGAGCGCATGGGTACCCAGGAAGGCAGTATCGGCCTGCCGCACCCACGCATTCCCCTGCCGCGCGACCTGTATGGCACCGAACGGGCCAACTCGGCCGGCATCGACATGGCCAATGAACACCGCCTGGCGTCGCTGTCCTGCGCCATGCTGGCCACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGCCTGCGCCGCCAGCGAGAGCGCTGCCGCACCGGTGCTGa < 1:1002988/236‑1 (MQ=255) | CAGTGCCTGCACGGCATGGGCGAACCGCTGTACGAGCAAGTGGTCGGCAAGATTGCCGATGGCAAGCTGAACCGCCCGTGCCGCGTGTATGCACCGGTCGGCACCCATGAAACGCTGCTGGCCTACCTGGTGCGCCGCCTGCTGGAAAACGGCGCGAACACCTCGTTCGTCAACCGCATTGCCGACCACTCGATTTCCATCCAGGAACTGGTCGCCGACCCGGTGGCCAGCATCGAGCGCATGGGTACCCAGGAAGGCAGTATCGGCCTGCCGCACCCACGCATTCCCCTGCCGCGCGACCTGTATGGCACCGAACGGGCCAACTCGGCCGGCATCGACATGGCCAATGAACACCGCCTGGCGTCGCTGTCCTGCGCCATGCTGGCCACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGCCTGCGCCGCCAGCGAGAGCGCTGCCGCACCGGTGCTGA > AE015451/5631995‑5632457 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |