| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 5644984 | 103 (1.200) | 3 (0.040) | 3/342 | NT | 2.8% | coding (337/2184 nt) | PP_4954 | conserved membrane protein of unknown function |
| ? | AE015451 | = 5645051 | 110 (1.330) | coding (404/2184 nt) | PP_4954 | conserved membrane protein of unknown function | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
GCTGGTACCAGAACGAGATGGCCCTGCTGATTCCGCTGTTCCTCGGCATCATCGCCAGCGCCCTGGCCGAAACCGACGACAGCTGGCAGGGCCGCCTCAGCGCCCTGGCCGTTACCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTTGTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCAGAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCT > AE015451/5644754‑5645219 | gCTGGTACCAGAACGAGATGGCCCTGCTGATTCCGCTGTTCCTCGGCATCATCGCCAGCGCCCTGGCCGAAACCGACGACAGCTGGCAGGGCCGCCTCAGCGCCCTGGCCGTTACCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGc < 1:539558/233‑1 (MQ=255) tGGTACCAGAACGAGATGGCCCTGCTGATTCCGCTGTTCCTCGGCATCATCGCCAGCGCCCTGGCCGAAACCGACGACAGCTGGCAGGGCCGCCTCAGCGCCCTGGCCGTTACCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAgcg > 1:1025860/1‑236 (MQ=255) tGGTACCAGAACGAGATGGCCCTGCTGATTCCGCTGTTCCTCGGCATCATCGCCAGCGCCCTGGCCGAAACCGACGACAGCTGGCAGGGCCGCCTCAGCGCCCTGGCCGTTACCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAgc > 1:1371725/1‑235 (MQ=255) tGGTACCAGAACGAGATGGCCCTGCTGATTCCGCTGTTCCTCGGCATCATCGCCAGCGCCCTGGCCGAAACCGACGACAGCTGGCAGGGCCGCCTCAGCGCCCTGGCCGTTACCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAg > 2:810505/1‑234 (MQ=255) tACCAGACCGAGATGGCCCTGCTGACTCCGCTGTTCCTCGGCATCATCGCCAGCGCCCTGGCCGAAACCGACGACAGCTGGCAGGGCCGCCTCAGCGCCCTGGCCGTTACCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTa < 1:234718/236‑1 (MQ=255) ccAGAACGAGATGGCCCTGCTGATTCCGCTGTTCCTCGGCATCATCGCCAGCGCCCTGGCCGAAACCGACGACAGCTGGCAGGGCCGCCTCAGCGCCCTGGCCGTTACCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGG > 2:1160155‑M1/1‑224 (MQ=255) aCGAGATGGCCCTGCTGATTCCGCTGTTCCTCGGCATCATCGCCAGCGCCCTGGCCGAAACCGACGACAGCTGGCAGGGCCGCCTCAGCGCCCTGGCCGTTACCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGgcgc > 1:1498408/1‑235 (MQ=255) ggCCCTGCTGATTCCGCTGTTCCTCGGCATCATCGCCAGCGCCCTGGCCGAAACCGACGACAGCTGGCAGGGCCGCCTCAGCGCCCTGGCCGTTACCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCCCCATCGCt > 1:689438/1‑235 (MQ=255) gCCCTGCTGATTCCGCTGTTCCTCGGCATCATCGCCAGCGCCCTGGCCGAAACCGACGACAGCTGGCAGGGCCGCCTCAGCGCCCTGGCCGTTACCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCtt < 1:685735/235‑1 (MQ=255) aTTCCGCTGTTCCTCGGCATCATCGCCAGCGCCCTGGCCGAAACCGACGACAGCTGGCAGGGCCGCCTCAGCGCCCTGGCCGTTACCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCt > 1:1336018/1‑235 (MQ=255) cGCTGTTCCTCGGCATCATCGCCAGCGCCCTGGCCGAAACCGACGACAGCTGGCAGGGCCGCCTCAGCGCCCTGGCCGTTACCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATc < 1:921935/236‑1 (MQ=255) cGCTGTTCCTCGGCATCATCGCCAGCGCCCTGGCCGAAACCGACGACAGCTGGCAGGGCCGCCTCAGCGCCCTGGCCGTTACCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATc < 1:342850/236‑1 (MQ=255) gCTGTTCCTCGGCATCATCGCCAGCGCCCTGGCCGAAACCGACGACAGCTGGCAGGGCCGCCTCAGCGCCCTGGCCGTTACCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGa < 1:1066275/233‑1 (MQ=255) ttCCTCGGCATCATCGCCAGCGCCCTGGCCGAAACCGACGACAGCTGGCAGGGCCGCCTCAGCGCCCTGGCCGTTACCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCCATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAgcg > 1:390139/1‑200 (MQ=255) atcGCCAGCGCCCTGGCCGAAACCGACGACAGCTGGCAGGGCCGCCTCAGCGCCCTGGCCGTTACCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCAt < 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< 1:141306/208‑1 (MQ=255) gAAACCGACGACAGCTGGCAGGGACGCCTCAGCGCCCTGGCCGTTACCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCGCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATACCTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGa > 2:1398381/1‑230 (MQ=255) cgacgaCGGCTGGCAGGGCCGCCTCAGCGCCCTGGCCGTTACCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCa < 2:469848/197‑1 (MQ=255) cgacgaCAGCTGGCAGGGCCGCCTCAGCGCCCTGGCCGTTACCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCgcggcg > 1:1031950/1‑236 (MQ=255) gacAGCTGGCAGGGCCGCCTCAGCGCCCTGGCCGTTACCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGcc < 1:987350/235‑1 (MQ=255) acAGCTGGCAGGGCCGCCTCAGCGCCCTGGCCGTTACCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCAt > 2:739501/1‑208 (MQ=255) cTGGCAGGGCCGCCTCAGCGCCCTGGCCGTTACCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCa < 2:1119183/188‑1 (MQ=255) gggCCGCCTCAGCGCCCTGGCCGTTACCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGAc > 1:1279345/1‑235 (MQ=255) 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1:490860/236‑1 (MQ=255) ccGTTACCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCgctg > 2:1077374/1‑233 (MQ=255) ttACCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGCTCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGctgctgctg > 1:183426/1‑236 (MQ=255) ccccTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTCCCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCgg < 2:219116/162‑1 (MQ=255) aCCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCtggt < 1:357942/236‑1 (MQ=255) cTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCtggtg > 2:1404234/1‑234 (MQ=255) gtgtGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAg < 1:810507/235‑1 (MQ=255) tgtgCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAg < 2:1025857/234‑1 (MQ=255) gCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGc < 1:518766/235‑1 (MQ=255) cTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAg < 1:1522439/230‑1 (MQ=255) ttCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCa > 1:130323/1‑193 (MQ=255) ttCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCgctgctgct > 1:236389/1‑221 (MQ=255) 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> 1:1289106‑M1/1‑62 (MQ=255) cTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTTGTc > 2:921126/1‑210 (MQ=255) cTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTTGTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTc < 2:1002422/234‑1 (MQ=255) ggATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTTGTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAAc > 1:975914/1‑236 (MQ=255) ggATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGGGCGGCCTGGCACGGGCTGTTGTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCa > 1:441547/1‑234 (MQ=255) gATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTTGTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAAcc < 1:1326161/236‑1 (MQ=255) tCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCggg > 2:449906/1‑120 (MQ=255) tCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAg > 1:400968/1‑180 (MQ=255) 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ttCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTCGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTTGTCGGTGCTGTGGCAgg < 2:1377042/217‑1 (MQ=255) tcgtcgTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTTGTCGGTGCTGTGGCAgg < 1:163058/216‑1 (MQ=255) gtcgtTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTTGTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGcc < 2:1421984/233‑1 (MQ=255) tcgtTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCAcc > 2:335710/1‑140 (MQ=255) tcgtTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTTGTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCgg > 1:737958/1‑234 (MQ=255) tcgtTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTTGTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTa > 1:752939/1‑236 (MQ=255) cgtTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGccc > 2:250191/1‑181 (MQ=255) ccctggccctggCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCgg < 1:1500906/174‑1 (MQ=255) 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aggCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTTGTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCAGAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTgg < 1:281057/233‑1 (MQ=255) aTGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTTGTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTa > 1:321513/1‑201 (MQ=255) aTGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTTGTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCAGAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCt < 2:752937/233‑1 (MQ=255) tGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTTGTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCAGCGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTg > 2:912678/1‑233 (MQ=255) gCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACGGCGGTCTACGCCATGATCGGGGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGc < 2:364371/141‑1 (MQ=255) cgcTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGa > 2:417154/1‑97 (MQ=255) cgcTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTTGTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTAcagca > 1:1033087/1‑196 (MQ=255) gcTGGtccacgccgatcatggtgtagaccgcagtgatcaaggtggccgaagcgatggcgccgtagcgctcgcccagcgccccgagcatggtcaggccaaaggcagccagggccagggcaacgacgaagatccaggggtag > 2:1189855‑M1/1‑5 (MQ=255) gtgGtccacgccgatcatggtgtagaccgcagtgatcaaggtggccgaagcgatggcgccgtagcgctcgcccagcgccccgagcatggtcaggccaaaggcagccagggccagggcaacgacgaagatccaggggtaggggaatagcaactcgactgccagtgcagcgatggcgaagcacaccagggtaacggccagggcgctgaggcggccctgccagctgtcgtcggtttcg < 2:789958‑M1/234‑232 (MQ=255) ggCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTTGTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCAGAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCt > 1:374053/1‑236 (MQ=255) | GCTGGTACCAGAACGAGATGGCCCTGCTGATTCCGCTGTTCCTCGGCATCATCGCCAGCGCCCTGGCCGAAACCGACGACAGCTGGCAGGGCCGCCTCAGCGCCCTGGCCGTTACCCTGGTGTGCTTCGCCATCGCTGCACTGGCAGTCGAGTTGCTATTCCCCTACCCCTGGATCTTCGTCGTTGCCCTGGCCCTGGCTGCCTTTGGCCTGACCATGCTCGGGGCGCTGGGCGAGCGCTACGGCGCCATCGCTTCGGCCACCTTGATCACTGCGGTCTACACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTTGTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCAGAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCT > AE015451/5644754‑5645219 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |