New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | AE015451 | = 5790883 | 84 (0.980) | 3 (0.040) | 3/340 | NT | 3.6% | coding (835/1065 nt) | hemE | Uroporphyrinogen decarboxylase |
? | AE015451 | = 5790885 | 79 (0.960) | coding (833/1065 nt) | hemE | Uroporphyrinogen decarboxylase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
GTCACTGGTGGTACTGCGCCGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGAACACATGGCCAGTGCCGTGGCCATAGCTGGCCAGGATGCGCGCCACTTCCTTGCGAATGGCCTCGGGCTTGGCATACAGCACGGTCGGGTCCATGTTGCCTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGCGTCGCCGATCTCGCAGGTCCAGTCCAGGCCCAGCGCGTCGGCGCCGGCTTCGGCAATGCTTTCCAGCCACAAGCCACCATTCTTGGTGAACAGGATCACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGC > AE015451/5790652‑5791117 | gTCACTGGTGGTACTGCGCCGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGAACACATGGCCAGTGCCGTGGCCATAGCTGGCCAGGATGCGCGCCACTTCCTTGCGAATGGCCTCGGGCTTGGCATACAGCACGGTCGGGTCCATGTTGCCTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACgg > 2:568006/1‑233 (MQ=255) gTCACTGGTGGTACTGCGCCGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGAACACATGGCCAGTGCCGTGGCCATAGCTGGCCAGGATGCGCGCCACTTCCTTGCGAATGGCCTCGGGCTTGGCATACAGCACGGTCGGGTCCATGTTGCCTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGc < 1:767941‑M2/235‑2 (MQ=255) gTCACTGGTGGTACTGCGCCGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGAACACATGGCCAGTGCCGTGGCCATAGCTGGCCAGGATGCGCGCCACTTCCTTGCGAATGGCCTCGGGCTTGGCATACAGCACGGTCGGGTCCATGTTGCCTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGc < 1:577022‑M2/235‑2 (MQ=255) tggtggTACTGCGCCGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGAACACATGGCCAGTGCCGTGGCCATAGCTGGCCAGGATGCGCGCCACTTCCTTGCGAATGGCCTCGGGCTTGGCATACAGCACGGTCGGGTCCATGTTGCCTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGcgtcgcc < 1:300122‑M2/236‑8 (MQ=255) tggtggTACTGCGCCGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGAACACATGGCCAGTGCCGTGGCCATAGCTGGCCAGGATGCGCGCCACTTCCTTGCGAATGGCCTCGGGCTTGGCATACAGCACGGTCGGGTCCATGTTGCCTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGcgtcgcc < 1:1155769‑M2/236‑8 (MQ=255) gtACCGCGCCGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGAACACATGGCCAGTGCCGTGGCCATAGCTGGCCAGGATGCGCGCCACTTCCTTGCGAATGGCCTCGGGCTTGGCATACAGCACGGTCGGGTCCATGTTGCCTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGCGTCGCCGAtc > 1:978784/1‑235 (MQ=255) cTGCGCCGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGAACACATGGCCAGTGCCGTGGCCATAGCTGGCCAGGATGCGCGCCACTTCCTTGCGAATGGCCTCGGGCTTGGCATACAGCACGGTCGGGTCCATGTTGCCTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGcgt < 2:632222‑M2/224‑4 (MQ=255) tGCGCCGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGAACACATGGCCAGTGCCGTGGCCATAGCTGGCCAGGATGCGCGCCACTTCCTTGCGAATGGCCTCGGGCTTGGCATACAGCACGGTCGGGTCCATGTTGCCTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGCGTCGCCGATCTCGc > 1:382946/1‑235 (MQ=255) ccGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGAACACATGGCCAGTGCCGTGGCCATAGCTGGCCAGGATGCGCGCCACTTCCTTGCGAATGGCCTCGGGCTTGGCATACAGCACGGTCGGGTCCATGTTGCCTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACgg > 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2:1075476‑M2/1‑74 (MQ=255) cTCGGGCTTGGCATACAGCACGGTCGGGTCCATGTTGCCTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGCGTCGCCGATCTCGCAGGTCCAGTCCAGGCCCAGCGCGTCGGCGCCGGCTTCGGCAATGCTTTCCAGCCACAAGCCACCATTCTTGGTGAACAGGATCACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCt < 2:633284/221‑1 (MQ=255) tCGGGCTTGGCATACAGCACGGTCGGGTCCATGTTGCCTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGCGTCGCCGATCTCGCAGGTCCAGTCCAGGCCCAGCGCGTCGGCGCCGGCTTCGGCAATGCTTTCCAGCCACAAGCCACCATTCTTGGTGAACAGGATCACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAgg < 2:1086649/232‑1 (MQ=255) tCGGGCTTGGCATACAGCACGGTCGGGTCCATGTTGCCTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGCGTCGCCGATCTCGCAGGTCCAGTCCAGGCCCAGCGCGTCGGCGCCGGCTTCGGCAATGCTTTCCAGCCACAAGCCACCATTCTTGGTGAACAGGATCACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAg < 1:568008/236‑1 (MQ=255) aTACAGCACGGTCGGGTCCATGTTGCCTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGCGTCGCCGATCTCGCAGGTCCAGTCCAGGCCCAGCGCGTCGGCGCCGGCTTCGGCCATGCTTGCCAg > 2:1004713/1‑129 (MQ=255) 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ccGGTCGGGTCCATGTTGCCTTGCAGCGCCCCCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGCGTCGCCGATCTCGCAGGTCCAGTCCAGGCCCAGCGCGTCGGCGCCGGCTTCGGCAATGCTTTCCAGCCACAAGCCACCATTCTTGGTGAACAGGATCACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGgag < 1:246793/221‑1 (MQ=255) ccgTCGGGTCCATGTTGCCATGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGCGTCGCCGATCTCGCAGGTCCAGTCCAGGCCCAGCGCGTCGGCGCCGGCTTCGGCAATGCTTTCCAGCCACAAGCCACCATTCTTGGTGAACAGGATCACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACACCTGATAGgcc > 1:789188/3‑236 (MQ=255) cGGTCGGGTCCATGTTGCCTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGCGTCGCCGATCTCGCAGGTCCAGTCCAGGCCCAGCGCGTCGGCGCCGGCTTCGGCAATGCTTTCCAGCCACAAGCCACCATTCTTGGTGAACAGGATCACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGCGAACTCCTg > 2:249208/1‑229 (MQ=255) ggTCGGGTCCATGTTGCCTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGCGTCGCCGATCTCGCAGGTCCAGTCCAGGCCCAGCGCGTCGGCGCCGGCTTCGGCAATGCTTTCCAGCCACAAGCCACCATTCTTGGTGAACAGGATCACCTGCACCTTg > 2:777105/1‑163 (MQ=255) tCGGGTCCATGTTGCCTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGcccgtcgccgcgtgggtgacaaggtggcgctgcaaggcaacatggacccgaccgtgctgtatgccaagcccgaggccattcgcaaggaagtggcgcgcatcctggccagctatgg < 1:439784‑M1/164‑116 (MQ=255) tCGGGTCCATGTTGCCTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGcccgtcgccgcgtgggtgacaaggtggcgctgcaaggcaacatggacccgaccgtgctgtatgccaagcccgaggccat > 2:841636‑M1/1‑49 (MQ=255) tCGGGTCCATGTTGCCTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGCGTCGCCGATCTCGCAg < 1:925139/68‑1 (MQ=255) tCGGGTCCATGTTGCCTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGCGTCGCCGATCTCGCAGGTCCAGTCCAGGCCCAGCGCGTCGGCGCCGGCTTCGGCAATGCTTTCCAGCCACAAGccacc > 2:242042/1‑130 (MQ=255) tCGGGTCCATGTTGCCTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGCGTCGCCGATCTCGCAGGTCCAGTCCAGGCCCAGCGCGTCGGCGCCGGCTTCGGCAATGCTTTCCAGCCACAAGCCACCATTCTTGGTGAACAGGATCACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGgccgc > 1:1288313/1‑235 (MQ=255) tCGGGTCCATGTTGCCTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGCGTCGCCGATCTCGCAGGTCCAGTCCAGGCCCAGCGCGGCGGCGCCGGCGTCGGCAATGCTGTCCAGCCACAAGCCACCATTCTTGGTGAACAGGATCACCGGCACCTTgc > 2:246023/1‑162 (MQ=255) ggTCCATGTTGCCTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGCGTCGCCGATCTCGCAGGTCCAGTCCAGGCCCAGCGCGTCGGCGCCGGCTTCGGCAATGCTTTCCAGCCACAAGCCACCATTCTTGGTGAACAGGATCACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGgccgccgcc > 1:823221/1‑236 (MQ=255) ggTCCATGTTGCCTTGCAGCGCCACCTTGGCACCCACGCGGCGACGGGCGTCGCCGATCTCGCAGGTCCAGTCCAGGCCCAGCGCGTCGGCGCCGGCTTCGGCAATGCTTTCCAGCCACAAGCCACCATTCTTGGTGAACAGGATCACCGGCACCtt < 2:1297198/157‑1 (MQ=255) ttGCCTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGCGTCGCCGATCTCGCAGGTCCAGTCCAGGCCCAGCGCGTCGGCGCCGGCTTCGGCAATGCTTTCCAGCCACAAGCCACCATTCTTGGTGAACAGGATCACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGt < 2:658353/235‑1 (MQ=255) gCCTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGcccgtcgccgcgtgggtgacaaggtggcgctgcaaggcaacatggacccgcccgtgctgtatgccaagcccgaggc > 2:439782‑M1/1‑36 (MQ=255) cTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGCGTCGCCGATCTCGCAGGTCCAGTCCAGGCCCAGCGCGTCGGCGCCGGCTTCGGCAATGCTTTCCAGCCACAAGCCACCATTCTTGGTGAACAGGATCACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTgcc < 1:632224/235‑1 (MQ=255) gcgcCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGCGTCGCCGATCTCGCAGGTCCAGTCCAGGCCCAGCGCGTCGGCGCCGGCTTCGGCAATGCTTTCCAGCCACAAGCCACCATTCTTGGTGAACAGGATCACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGtt < 1:1509066/226‑1 (MQ=255) cACCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGCGTCGCCGATCTCGCAGGTCCAGTCCAGGCCCAGCGCGTCGGCGCCGGCTTCGGCAATGCTTTCCAGCCACAAGCCACCATTCTTGGTGAACAGGATCACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGgtgt < 1:543675/236‑1 (MQ=255) aCCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGCGTCGCCGATCTCGCAGGTCCAGTCCAGGCCCAGCGCGTCGGCGCCGGCTTCGGCAATGCTTTCCAGCCACAAGCCACCATTCTTGGTGAACAGGATCACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGgtg < 2:823219/234‑1 (MQ=255) ccTTGTCACCCACGCGGCGACGGGCGTCGCCGATCTCGCAGGTCCAGTCCAGGCCCAGCGCGTCGGCGCCGGCTTCGGCAATGCTTTCCAGCCACAAGCCACCATTCTTGGTGAACAGGATCACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGgccgc > 1:542150/1‑208 (MQ=255) cgTCACCCACGCGGCGACGGGCGTCGCCGATCTCGCAGGTCCAGTCCAGGCCCAGCGCGTCGGCGCCGGCTTCGGCAATGCTTTCCAGCCACAAGCCACCATTCTTGGTGAACAGGATCACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAg < 2:121396/183‑1 (MQ=255) ccACGCGGCGACGGGCGTCGCCGATCTCGCAGGTCCAGTCCAGGCCCAGCGCGTCGGCGCCGGCTTCGGCAATGCTTTCCAGCCACAAGCCACCATTCTTGGTGAACAGGATCACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAg < 2:1374604/208‑1 (MQ=255) cggcgACGcccgtcgccgcgtgggtgacaaggtggcgctgcaaggcaacatggacccgaccgtgctgtatgccaagcccgag > 2:1075476‑M1/1‑8 (MQ=255) cggcgACGcccgtcgccgcgtgggtgacaaggtggcgctgcaaggcaacatggacccgaccgtgctgtatgccaagcccgag < 1:1075479‑M1/82‑75 (MQ=255) cggcgACGGGCGTCGCCGATCTCGCAGGTCCAGTCCAGGCCCAGCGCGTCGGCGCCGGCTTCGGCAATGCTTTCCAGCCACAAGCCACCATTCTTGGTGAACAGGATCACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAggg > 1:700295/1‑175 (MQ=255) ggcgACGcccgtcgccgcgtgggtgacaaggtggcgctgcaaggcaacatggacccgaccgtgctgtatgccaagcccgaggccattcgcaaggaagtggcgcgcatcctggccagctatggccacggcactggccatgtgttcaaccttggccacggcatcacgccggaagttgacccggaacatgcgggtgcattcatcaacgccgtgcacgaactgtcggcgcagtaccacca < 1:1155769‑M1/236‑230 (MQ=255) ggcgACGcccgtcgccgcgtgggtgacaaggtggcgctgcaaggcaacatggacccgaccgtgctgtatgccaagcccgaggccattcgcaaggaagtggcgcgcatcctggccagctatggccacggcactggccatgtgttcaaccttggccacggcatcacgccggaagttgacccggaacatgcgggtgcattcatcaacgccgtgcacgaactgt < 2:922728‑M1/220‑214 (MQ=255) ggcgACGcccgtcgccgcgtgggtgacaaggtggcgctgcaaggcaacatggacccgaccgtgctgtatgccaagcccgaggccattcgcaaggaagtggcgcgcatcctggccagctatggccacggcactggccatgtgttcaaccttgg > 1:1337868‑M1/1‑7 (MQ=255) ggcgACGcccgtcgccgcgtgggtgacaaggtggcgctgcaaggcaacatggacccgaccgtgctgtatgccaagcccgaggccattcgcaaggaagtggcgcgcatcctggccagctatggccacggcactggccatgtgttcaaccttgg < 2:1337865‑M1/152‑146 (MQ=255) ggcgACGcccgtcgccgcgtgggtgacaaggtcgcgctgcaaggcaacatggacccgaccgtgctgtatgccaagcccgaggccattcgcaaggaagtggcgcgcatcctggccagctatggccacggcactggccatgtgttcaaccttggccacggcatcacgccggaagttgacccggaacatgcgggtgcattcatcaacgccgtgca < 1:418019‑M1/212‑206 (MQ=255) gcgACGcccgtcgccgcgtgggtgacaaggtggcgctgcaaggcaacatggacccgaccgtgctgtatgccaagcccgaggccattcgcaaggaagtggcgcgcatcctggccagctatggccacggcactgg < 2:1228648‑M1/133‑128 (MQ=255) aCGcccgtcgccgcgtgggtgacaaggtggcgctgcaaggcaacatggacccgaccgtgctgtatgccaagcccgaggccattcgcaaggaagtggcgcgcatcctggccagctatggccacggcactggccatgtgttcaaccttggccacggcatcacgccggaagttgacccggaacatgcgggtgcattcatcaacgccgtgcacgaactgtcggcgcag < 2:632222‑M1/224‑222 (MQ=255) gcccgtcgccgcgtgggtgacaaggtggcgctgcaaggcaacatggacccgaccgtgctgtatgccaagcccgaggccattcgcaaggaagtggcgcgcatcctggccagctatggccacggcactggccatgtgttcaaccttggccacggcatcacgccggaagttgacccggaacatgcgggtgcattcatcaacgccgtgcacgaactgtcggcgcagtaccaccagtgac < 1:1305647‑M1/235‑235 (MQ=255) gcccgtcgccgcgtgggtgacaaggtggcgctgcaaggcaacatggacccgaccgtgctgtatgccaagcccgaggccattcgcaaggaagtggcgcgcatcctggccagctatggccacggcactggccatgtgttcaaccttggccacggcatcacgccggaagttgacccggaacatgcgggtgcattcatcaacgccgtgcacgaactgtcggcgcagtaccaccagtgac < 1:577022‑M1/235‑235 (MQ=255) | GTCACTGGTGGTACTGCGCCGACAGTTCGTGCACGGCGTTGATGAATGCACCCGCATGTTCCGGGTCAACTTCCGGCGTGATGCCGTGGCCAAGGTTGAACACATGGCCAGTGCCGTGGCCATAGCTGGCCAGGATGCGCGCCACTTCCTTGCGAATGGCCTCGGGCTTGGCATACAGCACGGTCGGGTCCATGTTGCCTTGCAGCGCCACCTTGTCACCCACGCGGCGACGGGCGTCGCCGATCTCGCAGGTCCAGTCCAGGCCCAGCGCGTCGGCGCCGGCTTCGGCAATGCTTTCCAGCCACAAGCCACCATTCTTGGTGAACAGGATCACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGC > AE015451/5790652‑5791117 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |