| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 106235 | 64 (0.740) | 7 (0.090) | 7/338 | NT | 10.0% | coding (102/1518 nt) | PP_0101 | putative sulfate transporter |
| ? | AE015451 | = 106261 | 65 (0.800) | coding (128/1518 nt) | PP_0101 | putative sulfate transporter | |||||
GCGCCTGCGCGCTTGTCAGGGGCAAACGTGCCCACGGCCAGGGGAATGGCCGTGCGACTAGAGAAAGGAGAAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGTTGCAGTTGCTGGCCGGTCGCTTGCGCCTGGGCTGCTGGTTCCGCGTGACCGCGCCGGCGGTGGTTTACGGCATGCT > AE015451/106042‑106480 | gcgcCTGCGCGCTTGTCAGGGGCAAACGTGCCCACGGCCAGGGGAATGGCCGTGCGACTAGAGAAAGGAGAAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTgtcgtc < 1:1455435/236‑1 (MQ=255) cTGCGCGCTTGTCAGGGGCAAACGTGCCCACGGCCAGGGGAATGGCCGTGCGACTAGAGAAAGGAGAAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCgg < 2:1484454/234‑1 (MQ=255) tGTCAGGGGCAAACGTGCCCACGGCCAGGGGAATGGCCGTGCGACTAGCGAAAGGAGAACCACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATcggcggcatgccagaagcgatcgcaatgc > 1:1043053‑M2/1‑207 (MQ=255) aaCGTGCCCACGGCCAGGGGAATGGCCGTGCGACTAGAGAAAGGAGAAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTGGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATcggcg > 2:638966‑M2/1‑196 (MQ=255) aCGTGCCCACGGCCAGGGGAATGGCCGTGCGACTAGAGAAAGGAGAAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTAACGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTa > 1:635786/1‑235 (MQ=255) gTGCCCACGGCCAGGGGAATGGCCGTGCGACTAGAGAAAGGAGAAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAg > 1:848883/1‑236 (MQ=255) tGCCAACGGCCAGGGGAATGGCCGTGCGACTAGAGAAAGGAGAAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTgtc < 2:585197/205‑1 (MQ=255) aCGGCCAGGGGAATGGCCGTGCGACTAGAGAAAGGAGAAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGc > 1:968357/1‑236 (MQ=255) ccAGGGGAATGGCCGTGCGACTAGAGAAAGGAGAAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCgg > 2:1044997/1‑234 (MQ=255) gAATGGCCGTGCGACTAGAGAAAGGAGAAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATcgccg > 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(MQ=255) aaaCACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGc < 1:240625/236‑1 (MQ=255) aaaCACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGGGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTgtcgtc > 1:404653/1‑166 (MQ=255) cacGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTAt > 2:1027334/1‑147 (MQ=255) cacGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTAt < 1:1027337/147‑1 (MQ=255) cacGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATcggcggcatgccagaagcgatcgcaatgcccatgcacaacggcaaggccaccag < 1:1210547‑M2/201‑55 (MQ=255) aaCATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCgg > 2:719697/1‑158 (MQ=255) aaCATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCgg < 1:719699/158‑1 (MQ=255) tACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACg < 1:753175/236‑1 (MQ=255) acacAGTTGAAAGCGGCCGTGCCGCGTGAGGTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATcggc > 2:344184‑M2/1‑134 (MQ=255) cacaGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATcggcggcatgccagaagc > 2:1444144‑M2/1‑133 (MQ=255) aGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCtgctgc < 1:1393256/190‑1 (MQ=255) tGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGa > 2:496242/1‑211 (MQ=255) 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tGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGgt < 1:972469/181‑1 (MQ=255) tGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGt > 1:203425/1‑145 (MQ=255) tGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGCGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGcc > 1:482105/1‑236 (MQ=255) gCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATcgg > 2:112635‑M2/1‑98 (MQ=255) cGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCGTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATcgccgc < 2:306076/132‑1 (MQ=255) 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ccgGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCGATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGTTGCCGTTGCTGGCCGGTCGCTTGTGCCTGGGCTGCTGGTTcc > 2:812635/1‑214 (MQ=255) ccgGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCggc > 2:576089/1‑167 (MQ=255) ccgGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGt > 2:1394500/1‑172 (MQ=255) ccgGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGTTGCAGTTGCTGGCCGGt > 2:1471709/1‑189 (MQ=255) ccgGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGTTGCAGTTGCTGGCCGGTCGCTTGCGCCTGGGCTGCTGGTTCCGCGTGACCGCGCCGGCggtgg > 1:916127/1‑235 (MQ=255) ccgGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGCCTGTTGCAGTTGCTGGCCGGTCGCTTGCGCCTGGGCTGCTGGTTCCGCGTGACCGCGCcgg > 1:1175279/1‑229 (MQ=255) gCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATcggcggcatgccagaagcgatcgcaatgcccatgcacaacggcaaggccaccaggaagaccaccaccgacgccagcaactcacgcggcagggccgctttcaactgtgtaatgttcaccgtgtttctcctttctctagtcgcacggccattcccctggccgtgggcacgtttgcccct > 2:171287‑M2/1‑26 (MQ=255) gCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATcggcggcatgccagaagcgatcgcaatgcccatgcacaacggcaaggccaccaggaagaccaccaccgacgccagcaactcacgcggcagggccgctttcaactgtgtaatgttcaccgtgtttctcctttctctagtcgcacggccattcccctggccgtgggcacgtttgcccct < 1:171288‑M2/203‑178 (MQ=255) aaaaGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGTTGCAGTTGCTGGCCg > 1:808874/1‑182 (MQ=255) aaaGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGTTGCAGTTGCTGGCCGGTCGCTTGCGcc < 1:578552/193‑1 (MQ=255) ggCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGGTCGGGCCAAt > 2:859614/1‑143 (MQ=255) ccTGATTACTGGGTTTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGCGCTGGTACGCGAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTg < 2:598414/160‑1 (MQ=255) tGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGTTGCAGTTGCTGGCCGGTCGCTTGCGCCTGGGCTGCTGGTTCCGCGTGACCGCGCCGGCGGTGGTTTACGGCATGCt < 1:1045000/235‑1 (MQ=255) aTTCCTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGTTGCAGTTGCTGGCCGGTCGCTTGCGCCTGGGCTGCTGGTTCCGCGTGACCGCGCcg < 2:1057007/213‑1 (MQ=255) aCTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGGCTGTTGCAGTTGCTGGCCGGTCGCt > 1:44671/1‑175 (MQ=255) tCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGTTGCAGTTGCTGGCCGGTCGCTTGCGCCTGGGCTGCTGGTTCCGCGTGACCGCGCCGGCGGTGGtt > 1:785294/1‑209 (MQ=255) | GCGCCTGCGCGCTTGTCAGGGGCAAACGTGCCCACGGCCAGGGGAATGGCCGTGCGACTAGAGAAAGGAGAAACACGGTGAACATTACACAGTTGAAAGCGGCCCTGCCGCGTGAGTTGCTGGCGTCGGTGGTGGTCTTCCTGGTGGCCTTGCCGTTGTGCATGGGCATTGCGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGTTGCAGTTGCTGGCCGGTCGCTTGCGCCTGGGCTGCTGGTTCCGCGTGACCGCGCCGGCGGTGGTTTACGGCATGCT > AE015451/106042‑106480 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |