| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | AE015451 | 1132549 = | 76 (0.880) | 5 (0.060) | 5/328 | NT | 6.8% | coding (68/288 nt) | PP_0993 | conserved exported protein of unknown function |
| ? | AE015451 | 1132563 = | 67 (0.850) | coding (54/288 nt) | PP_0993 | conserved exported protein of unknown function | |||||
TCAAGACTTGATAGGTGTCAGCGAGCCCATGCCGGCGGGTGTCTTGATCGATGTGCAGGTGCCGGCGGGGACGTTTTTCCAGTGCATGCCGTCGTAGTCCTTCTTCGCACTGCCAGCGCAGCTGGTGCCGGCGCCGGCCTTGCAATCGTTCTTTCCTGCCATGGCGACGCCGTAGCATTTTTCCATGGCAGCGCCATTGCCTGCGGGTTGCGTGCTGTCGGCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGTTACAGCCTTGGAAGAAATTTTTTCAGGGCGAGTCTTCACGACCTGATGTTGAAGCCAAGGGCATGGCATATTTGCAGCACCTGCGTGCCACACGGCGG > AE015451/1132329‑1132790 | tCAAGCCTTGATAGGTGTCAGCGAGCCCATGCCGGCGGGTGTCTTGATCGATGTGCAGGTGCCGGCGGGGACGTTTTTCCAGTGCATGCCGTCGTAGTCCTTCTTCGCACTGCCAGCGCAGCTGGTGCCGGCGCCGGCCTTGCAATCGTTCTTTCCTGCCATGGCGACGCCGTAGCATTTTTCCATGGCAGCGCCATTGCCTGCGGGTTGCGTGCTGTCGGCCGCCATGGCGgcgc < 1:1233785/236‑1 (MQ=255) cAAGACTTGATAGGTGTCAGCGAGCCCATGCCGGCGGGTGTCTTGATCGATGTGCAGGTGCCGGCGGGGACGTTTTTCCAGTGCATGCCGTCGTAGTCCTTCTTCGCACTGCCAGCGCAGCTGGTGCCGGCGCCGGCCTTGCAATCGTTCTTTCCTGCCATGGCGACGCCGTAGCATTTTTCCATGGCAGCGCCATTGCCTGCGGGTTGCGTGCTGTCGGCCGCCATGGCGgcgc < 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aGCGAGCCCATGCCGGCGGGTGTCTTGATCGATGTGCAGGTGCCGGCGGGGACGTTTTTCCAGTGCATGCCGTCGTAGTCCTTCTTCGCACTGCCAGCGCAGCTGGTGCCGGCGCCGGCCTTGCAATCGTTCTTTCCTGCCATGGCGACGCCGTAGCATTTTTCCATGGCAGCGCCATTGCCTGCGGGTTGCGTGCTGTCGGCCGCCATGGCGGCGCCTGCa > 2:1179144/1‑222 (MQ=255) tgcccttggcttcaacatcaggtcgtgaagactcgccctgaaaaaatttcttccaaggctgtaacccgttttacgcaaggcacgaattactccatgagccgccggtatagaccacggccacactctcaggagattgaccatgaaaaccctcgccctcaccaccgcagcactcgcgcttgccacgcttgcaggcgccgccatggcggcGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGtgctg < 1:565946‑M2/29‑1 (MQ=255) ccGGCGGGTGTCTTGATCGATGTGCAGGTGCCGGCGGGGACGTTTTTCCAGTGCATGCCGTCGTAGTCCTTCTTCGCACTGCCAGCGCAGCTGGTGCCGGCGCCGGCCTTGCAATCGTTCTTTCCTGCCATGGCGACGCCGTAGCATTTTTCCATGGCAGCGCCATTGCCTGCGGGTTGCGTGCTGTCGGCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCggt < 1:28080/236‑1 (MQ=255) cTTGATCGATGTGCAGGTGCCGGCGGGGACGTTTTTCCAGTGCATGCCGTCGTAGTCCTTCTTCGCACTGCCAGCGCAGCTGGTGCCGGCGCCGGCCTTGCAATCGTTCTTTCCTGCCATGGCGACGCCGTAGCATTTTTCCATGGCAGCGCCATTGCCTGCGGGTTGCGTTCTGTCGGCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAgc > 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catgaaaaccctcgccctcaccaccgcagcactcgcgcttgccacgcttgcaggcgccgccatggcggcGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGTTACAGcc > 2:1063306‑M2/70‑206 (MQ=255) cccctcgccctcaccaccgcagcactcgcgcttgccacgcttgcaggcgccgccatggcggcGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTc < 1:741180‑M2/58‑1 (MQ=255) aTTTTTCCATGGCAGCGCCATTGCCTGCGGGTTGCGTGCTGTCGGCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCt > 2:157321/1‑155 (MQ=255) ccATGGCAGCGCCATTGCCTGCGGGTTGCGTGCTGTCGGCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCt > 1:1450665/1‑149 (MQ=255) ccATGGCAGCGCCATTGCCTGCGGGTTGCGTGCTGTCGGCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCt < 2:1450662/149‑1 (MQ=255) aTGGCAGCGCCATTGCCTGCGGGTTGCGTGCTGTCGGCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGTTACAGCCTTGGAAGAAATTTTTTCAGGGCGAGTCTTCACGACCTGATGTTGAAGcc < 1:524428/236‑1 (MQ=255) ccccgcagcactcgcgcttgccacgcttgcaggcGCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTga > 2:415063‑M1/35‑116 (MQ=255) gcgcCAGTGCCTGCGGGTTGCGTGCTGTCGGCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTaa < 2:379329/167‑1 (MQ=255) cagcactcgcgcttgccacgcttgcaggcGCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGTTACAGCCTTGGAAGAAATTTTTTCAGGGCGAGTCTTCACGACCTGATGTTGAAGCCAAGggca < 1:565946‑M1/207‑1 (MQ=255) cATTGCCTGCGGGTTGCGTGCTGTCGGCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGTTACAGCCTTGGAAGAAATTTTTTCAGGGCGa > 1:607449/1‑201 (MQ=255) cATTGCCTGCGGGTTGCGTGCTGTCGGCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGTTACAGCCTTGGAAGAAATTTTTTCAGGGCGAGTCTTCACGACCTGATGTTGAAGCCAAGggcatgg > 1:414892/1‑236 (MQ=255) cATTGCCTGCGGGTTGCGTGCTGTCGGCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGTTACAGCCTTGGAAGAAATTTTTTCAGGGCGAGTCTTCACGACCTGATGTTGAAGCCAAGggcatg > 1:285551/1‑235 (MQ=255) ttGCCTGCGGGTTGCGTGCTGTCGGCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGTTACAGCCTTGGAAGAAATTTTTTCAGGGCGAGTCTTCACGACCTGATGTTGaa < 1:250510/221‑1 (MQ=255) cTGCGGGTTGCGTGCTGTCGGCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGt < 2:622460/91‑1 (MQ=255) tGCGGGTTGCGTGCTGTCGGCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGTTACAGCCTTGGAAGAAATTTTTTCAGGGCGAGTCTTCACGAc < 2:1045623/205‑1 (MQ=255) ggTTGCGTGCTGTCGGCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGTTACAGCCTTGGAAGAAATTTTTTCAGGGCGAGTCTTCACGACCTGATGTTGAAGCCAAGGGCATGGCATATTTgcag < 1:1413229/236‑1 (MQ=255) gTTGCGTGCTGTCGGCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGTTACAGCCTTGGAAGAAATTTTTTCAGGGCg > 2:1463115/1‑188 (MQ=255) gTTGCGTGCTGTCGGCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGTTACAGCCTTGGAAGAAATTTTTTCAGGGCGAGTCTTCACGACCTGATGTTGAAGCCAAGGGCATGGCATATTTgcagc > 1:972184/1‑236 (MQ=255) tGCGTGCTGTCGGCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGTTACAGCCTTGGAAGAAATTTTTTCAGGGCGAGTCTTCACGACCTGATGTTGAAGCCAAGggcatgg < 1:25923/222‑1 (MQ=255) gCGTGCTGTCGGCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGTTACAGCCTTGGAAGAAATTTTTTCAGGGCGAGTCTTCACGACCTGATGTTGAAGCCAAGGGCATGGCATATTTgcagca < 1:699063/234‑1 (MQ=255) gttgcaggcgccgccgtggcggcGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCa < 2:1085544‑M2/59‑1 (MQ=255) gTGCTGTCGGCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGTTACAGCCTTGGAAGAAATTTTTTCAGGGCGAGTCTTCACGACCTGATGTTGAAGCCAAGGGCATGGCATATTTGCAGCACCTg > 1:671593/1‑236 (MQ=255) tGCTGTCGGCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGTTACAGCCTTGGAAGAAATTTTTTCAGGGCGAGTCTTCACGACCTGATGTTGaa < 2:908989/205‑1 (MQ=255) tGCTGTCGGCCGCCATGGCGGCGCCTCCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGTTACAGCCTTGGAAGAAAtttttt > 2:403442/1‑175 (MQ=255) gCTGTCGGCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGTTACAGCCTTGGAAGAAATTTTTTCAGGGc > 2:1375973/1‑180 (MQ=255) cTGTCGGCCGCCATGGCGGCGCGTGCAAGCGTGGCAAGCGCGGGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGACGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACggg < 2:573017/149‑1 (MQ=255) gcgggCGCGATGGCGGCGGCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGTTACAGCCTTGGAAGAAATTTTTTCAGGGCGAGTCTTCACGACCTGATGTTGAAg > 2:398057‑M1/6‑201 (MQ=255) cGGCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGTTACAGCCTTGGAAGAAATTTTTTCAGGGCGAGTCTTCACGACCTGATGTTGAAGCCAAGGGCATGGCATATTTgcagca < 1:633884/225‑1 (MQ=255) ggCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGTTACAGCCTTGGAAGAAATTTTTTCAGGGCGAGTCTTCACGACCTGATGTTGAAGc > 1:734453/1‑200 (MQ=255) ggCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGTTACAGCCTTGGAAGAAATTTTTTCAGGGCGAGTCTTCACGACCTGATGTTGAAGCCAAGGGCATGGCATATTTGCAGCACCTGCGTGCca > 1:1482592/1‑235 (MQ=255) catggcggcGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGTTACAGCCTTGGAAGAAATTTTTTCAGGGCGAGTCTTCACGACCTGATGTTGAAGCCAAGGGCATGGCATATTTGCAGCACCTGCGTGCCACAcggcg < 1:623708‑M2/227‑1 (MQ=255) tggcgggGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGTTACAGCCTTGGAAGAAATTTTTTCAGGGCGAGTCTTCACGACCTGATATTGAAGCCAAGGGCATGGCATATTTGCAGCACCTGCGTGCCACAcggcgg < 1:1391111‑M2/228‑1 (MQ=255) tggcggcGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGtt < 2:450675‑M2/131‑1 (MQ=255) gcGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGTTACAGCCTTGGAAGAAATTTTTTCAGGGCGAGTCTTCACGACCTg > 1:1135476‑M2/3‑177 (MQ=255) | TCAAGACTTGATAGGTGTCAGCGAGCCCATGCCGGCGGGTGTCTTGATCGATGTGCAGGTGCCGGCGGGGACGTTTTTCCAGTGCATGCCGTCGTAGTCCTTCTTCGCACTGCCAGCGCAGCTGGTGCCGGCGCCGGCCTTGCAATCGTTCTTTCCTGCCATGGCGACGCCGTAGCATTTTTCCATGGCAGCGCCATTGCCTGCGGGTTGCGTGCTGTCGGCCGCCATGGCGGCGCCTGCAAGCGTGGCAAGCGCGAGTGCTGCGGTGGTGAGGGCGAGGGTTTTCATGGTCAATCTCCTGAGAGTGTGGCCGTGGTCTATACCGGCGGCTCATGGAGTAATTCGTGCCTTGCGTAAAACGGGTTACAGCCTTGGAAGAAATTTTTTCAGGGCGAGTCTTCACGACCTGATGTTGAAGCCAAGGGCATGGCATATTTGCAGCACCTGCGTGCCACACGGCGG > AE015451/1132329‑1132790 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |