New junction evidence | |||||||||||
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? | AE015451 | 5292821 = | 85 (1.090) | coding (29/888 nt) | mmsB | 3‑hydroxyisobutyrate dehydrogenase |
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
GAATACCGGCCAGTACGCCGTCCTCGTTCAAGTACACGCTACGCACATGGGCTGCGGCCGGCAGCATGGTGATCACCAGCTCGCTGTTGGCCGCCGCGTCCTTGGGCGAGGGGCTGATCTGCCCGCCCAGTTCTGCCAGCTCGGCCAGCACGGCCTTGTTCAGGTCGAACAGGTTCAGCTGATGCCCGGCCTTGATCAGGTTGCGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTGAAGAACGGTACGGGTACCGGGATCGGGATGTTGATGC > AE015451/5292597‑5293053 | gAATACCGGCCAGTACGCCGTCCTCGTTCAAGTACACGCTACGCACATGGGCTGCGGCCGGCATCATGGTGATCACCAGCTCGCTGTTGGCCGCCGCGTCCTTGGGCGAGGGGCTGATCTGCCCGCCCAGTTCTGCCAGCTCGGCCAGCACGGCCTTGTTCAGGTCGAACAGGTTCAGCTGATGCCCGGCCTTGATCAGGTTGCGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGcc < 1:1431558/235‑1 (MQ=255) ccGGCCAGTACGCCGTCCTCGTTCAAGTACACGCTACGCACATGGGCTGCGGCCGGCAGCATGGTGATCACCAGCTCGCTGTTGGCCGCCGCGTCCTTGGGCGAGGGGCTGATCTGCCCGCCCAGTTCTGCCAGCTCGGCCAGCACGGCCTTGTTCAGGTCGAACAGGTTCAGCTGATGCCCGGCCTTGATCAGGTTGCGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGa > 2:1317127/1‑232 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cAGTACGCCGTCCTCGTTCAAGTACACGCTACGCACATGGGCTGCGGCCGGCAGCATGGTGATCACCAGCTCGCTGTTGGCCGCCGCGTCCTTGGGCGAGGGGCTGATCTGCCCGCCCAGTTCTGCCAGCTCGGCCAGCACGGCCTTGTTCAGGTCGAACAGGTTCAGCTGATGCCCGGCCTTGATCAGGTTGCGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGa < 1:92657/236‑1 (MQ=255) aGTACGCCGTCCTCGTTCAAGTACACGCTACGCACATGGGCTGCGGCCGGCAGCATGGTGATCACCAGCTCGCTGTTGGCCGCCGCGTCCTTGGGCGAGGGGCTGATCTGCCCGGCCAGTTCTGCCAGCTCGGCCAGCACGGCCTTGTTCAGGTCGAACAGGTTCAGCTGATGCCCGGCCTTGATCAGGTTGCGGGCCATGGGGGCGCCCATGTTGccc > 1:1348513/1‑219 (MQ=255) ccTCGTTCAAGTACACGCTACGCACATGGGCTGCGGCCGGCAGCATGGTGATCACCAGCTCGCTGTTGGCCGCCGCGTCCTTGGGCGAGGGGCTGATCTGCCCGCCCAGTTCTGCCAGCTCGGCCAGCACGGCCTTGTTCAGGTCGAACAGGTTCAGCTGATGCCCGGCCTTGATCAGGTTGCGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGc > 1:257182/1‑207 (MQ=255) ggctcgcggggttccaaactcggtgacctggggccgtacggcaagcaagtggtgcagttctacactcagaccaagaccgtcactgctcgctggttcgatgacgacagcgtcaacgacggtgtgaacaccaccattagcctgcgctaaggagtacgtcatgcgtatcgcattcatcggcctgggcaacatgggcgcgcccatgTTGCCCAGGc > 1:838706‑M2/203‑212 (MQ=255) 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cgcatccatatgcctgggcaacatgggcgcgcccatgTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATg < 2:660356‑M2/30‑1 (MQ=255) cTTGATCAGGTTGCGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTgaagaa < 1:541812/235‑1 (MQ=255) ttGATCAGGTTGCGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAAt < 2:1463544/51‑1 (MQ=255) ttGATCAGGTTGCGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAAt > 1:1463547/1‑51 (MQ=255) ttGATCAGGTTGCGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGcc > 2:647614/1‑219 (MQ=255) ggATCAGGTTGCGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGACCCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCcg < 1:233884/211‑1 (MQ=255) aGGTTGCGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTgg < 2:1086773/143‑1 (MQ=255) aGGTTGCGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTgg > 1:1086776/1‑143 (MQ=255) aGGTTGCGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAg > 2:938636/1‑195 (MQ=255) gcctgggcaaCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGcc > 1:838706‑M1/11‑212 (MQ=255) gTTGCGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTGAAGAACGGTACggg < 1:587026/235‑1 (MQ=255) gggcaacatgggcgcgcccatgTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTGAAGAACGGTACGGGTAcc > 1:1476648‑M2/23‑236 (MQ=255) gCGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGCACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCat > 2:363847/1‑180 (MQ=255) cGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTgaa < 2:507850/219‑1 (MQ=255) gCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCgg > 1:1136709/1‑206 (MQ=255) aaCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGcc < 1:448042‑M1/163‑1 (MQ=255) ccATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTCCGGCCCCCGGTCACCGAGTGTGGAAc > 1:287996/1‑193 (MQ=255) CATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGGACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTGAAGAACGGTACGGGTACcgggatc < 1:1477263‑M1/236‑1 (MQ=255) GGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTGAAGAACGGTACgggtaccgggcgcggg < 1:287253‑M1/235‑7 (MQ=255) GGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTGAAGAACGGTACGGGTACcgggatcggg < 1:1456171‑M1/235‑1 (MQ=255) GGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTGAAGAACGGTACGGGTACcggga < 1:1206558‑M1/230‑1 (MQ=255) GGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGACGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCa < 2:1025941‑M1/175‑1 (MQ=255) gcgcgcccatgTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTc < 1:853164‑M2/118‑1 (MQ=255) gcgcgcccatgTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTc > 2:853162‑M2/12‑129 (MQ=255) gcgcgcccatgTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTGAAGAACGGTACGGGTACcgggatcggga > 1:1125444‑M2/12‑235 (MQ=255) cgcccatgTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTGAAGAACGGTACGGGTACCGGGATCGGGATGt > 1:73070‑M2/9‑235 (MQ=255) GCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTgg > 2:381576‑M1/1‑123 (MQ=255) ccatgTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGcc > 1:198286‑M2/6‑152 (MQ=255) CCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGcc > 2:198285‑M1/1‑152 (MQ=255) cgtGTTGCGCACACCGATGATGGCGATAAGCATGACGTAGTCCTTAGCGCAGGCTAAtggt < 2:780571/59‑1 (MQ=255) atgTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTGAAGAACGGTACGGGTACCGGGATCGGGATGTTGATGc > 1:869736‑M2/4‑236 (MQ=255) | GAATACCGGCCAGTACGCCGTCCTCGTTCAAGTACACGCTACGCACATGGGCTGCGGCCGGCAGCATGGTGATCACCAGCTCGCTGTTGGCCGCCGCGTCCTTGGGCGAGGGGCTGATCTGCCCGCCCAGTTCTGCCAGCTCGGCCAGCACGGCCTTGTTCAGGTCGAACAGGTTCAGCTGATGCCCGGCCTTGATCAGGTTGCGGGCCATGGGCGCGCCCATGTTGCCCAGGCCGATGAATGCGATACGCATGACGTACTCCTTAGCGCAGGCTAATGGTGGTGTTCACACCGTCGTTGACGCTGTCGTCATCGAACCAGCGAGCAGTGACGGTCTTGGTCTGAGTGTAGAACTGCACCACTTGCTTGCCGTACGGCCCCAGGTCACCGAGTTTGGAACCCCGCGAGCCGGTGAAGCTGAAGAACGGTACGGGTACCGGGATCGGGATGTTGATGC > AE015451/5292597‑5293053 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |