| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 5681387 | 14 (0.160) | 5 (0.060) +G |
4/354 | NT | 41.8% | intergenic (‑105/+99) | PP_4986/PP_4987 | Channel protein, hemolysin III family/putative Chemotaxis protein |
| ? | AE015451 | = 5681415 | 0 (0.000) | intergenic (‑133/+71) | PP_4986/PP_4987 | Channel protein, hemolysin III family/putative Chemotaxis protein | |||||
GCCTTGCAGGCCCGCGGCCACGATCAGCCAGATGGCACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCAC > AE015451/5681181‑5681642 | gCCTTGCAGGCCCGCGGCCACGATCAGCCAGATGGCACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCc > 1:250624‑M1/1‑235 (MQ=255) ccACGATCAGCCAGATGGCACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATTCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGTGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCc > 2:771305‑M1/1‑218 (MQ=255) cGATCAGCCAGATGGCACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagcccta < 1:938628‑M1/236‑22 (MQ=255) gATCAGCCAGATGGCACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagcccta < 1:1102174‑M1/235‑22 (MQ=255) aTCAGCCAGATGGCACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctg < 1:446409‑M1/224‑12 (MQ=255) gCACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGACGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacacggc > 1:106731‑M1/1‑201 (MQ=255) cagcaatAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGCCCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgac < 1:589621‑M1/225‑29 (MQ=255) cagcGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagcccta < 2:713568‑M1/212‑22 (MQ=255) gACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagacc < 1:909650‑M1/236‑53 (MQ=255) gCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACCCAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactcc < 2:760737‑M1/227‑48 (MQ=255) ccAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCGGTTGTGATGCTGATGGCGTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACcgc < 2:49269/173‑1 (MQ=255) ccAGGTGGGTCCAGGCGTGGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgct < 2:400509‑M1/183‑11 (MQ=255) cAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaa < 1:161021‑M1/204‑33 (MQ=255) gTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagaccaccaggccctgcgc < 1:808237‑M1/235‑67 (MQ=255) ggTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagaccaccaggcc < 1:957894‑M1/226‑61 (MQ=255) ggTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagaccaccaggcc > 2:957892‑M1/1‑166 (MQ=255) ggTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactc > 2:687389‑M1/1‑166 (MQ=255) tCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagaccaccaggccctgcgcctcaca < 1:388425‑M1/236‑73 (MQ=255) aGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggct > 2:1511406‑M1/1‑161 (MQ=255) aGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaa > 2:286642‑M1/1‑152 (MQ=255) cACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccacgccagaccaccaggccctgcgcccca > 2:1335481‑M1/1‑146 (MQ=255) cGTAATACATGCACACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTTGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccg < 1:441266‑M1/180‑38 (MQ=255) aaTACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcca > 2:141235‑M1/1‑140 (MQ=255) tGCAAACACAGCCCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagacc < 1:598175‑M1/186‑53 (MQ=255) cAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACcgc > 1:710370/1‑132 (MQ=255) aaCACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagaccaccaggccctgcgcctcacatcctaaccaaggtccggttgcagatccgcggca > 1:173513‑M1/1‑130 (MQ=255) aaCACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagaccaccaggccctgcgcctcacatcctaaccaaggtcaggttgcagatccgcgtca > 1:173115‑M1/1‑130 (MQ=255) aaCACAGACCTCCTGAGGAGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatc > 1:167576‑M1/1‑130 (MQ=255) acacAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagaccaccaggccctgcgcctcacatcctaaccaaggtcaggttgcagatccgcgtcac < 1:1210359‑M1/235‑107 (MQ=255) cacaGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagaccaccaggccctgcccctcacat > 2:505066‑M1/1‑128 (MQ=255) ctcctGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccg > 2:598173‑M1/1‑121 (MQ=255) tcctGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagaccaccaggccctgcgcctcacatcctaaccaaggtcaggttgcagatccgcgtcacgcaccagccc > 1:1486592‑M1/1‑120 (MQ=255) tcctGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagaccaccaggccctgcgcctcacatcctaaccaaggtcaggttgcagatccgcgtcacgc < 1:1152654‑M1/228‑109 (MQ=255) tGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagaccaccaggccctgcgcctcacatcctaaccaaggtcaggttgcagatccgcgtcacgcacc < 2:964614‑M1/228‑112 (MQ=255) gAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagaccaccaggccctgcgcctcacatcctaaccaag > 2:663994‑M1/1‑116 (MQ=255) gAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccaga > 2:463526‑M1/1‑116 (MQ=255) 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tCGCGAAAGGGGCGCGAAGCTGCCCGAGGCTTGCAGTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcaggcctagcgcgacacaa < 2:33721‑M1/86‑33 (MQ=255) tCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactcccgacccc > 2:483906‑M1/1‑54 (MQ=255) cgcgAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacatggccgctcccactccagaccaccaggccctgcgcc > 2:797620‑M1/1‑53 (MQ=255) cgcgAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagaccaccaggccctgcgcctcacatcctaaccaaggtcaggttgcagatccgcgtcacgcaccagcctttccaatgcgaccaggtccggtacccgcgccacctgctcacccacctgcaccgctgcca < 1:1511409‑M1/228‑176 (MQ=255) cgcgAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagaccaccaggccctgcgcctcacatcctaaccaaggtcaggttgcagatccgcgtcacgcaccagcctttccaatgcgaccaggtccggtacccgcgccacctgctcacccacctgcaccgctg > 2:507788‑M1/1‑53 (MQ=255) cgcgAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagaccaccaggccctgcgcctcacatcctaaccaaggtcaggttgcagatccgcgtcacgcaccagcctttccaatgcgaccaggtccggt < 2:1491864‑M1/191‑139 (MQ=255) cgcgAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagaccaccaggccctgcgcctcacatcctaaccaaggtcaggttgcagatccgcgtcacgcaccagcctttccaatgcgaccaggtccggt > 1:1491867‑M1/1‑53 (MQ=255) cgcgAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagaccaccaggccctgcgcc < 1:797622‑M1/120‑68 (MQ=255) cgAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCGGGTTTTCATTGCCACTGCATGACCCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaa < 2:1394981‑M1/83‑33 (MQ=255) aaaGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagaccaccaggccctgcgcctcacatcctaaccaaggtcaggttgcagatccgcgtcacgcaccagcctttccaatgcgaccaggtccggtacccgcgccacctgctcacccacctgcaccgctgccagctccaacctg < 1:988748‑M1/235‑187 (MQ=255) aaGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagaccaccaggccctgcgcctcacatcctaaccaaggtccggttgcagatcc > 2:227855‑M1/1‑48 (MQ=255) aaGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagaccaccaggccctgcgcctcacatcctaaccaaggtcaggttgcagatccgcgtcacgcaccagcctttccaatgcgaccaggtccggtacccgcgccacctgctcacccacctgcaccgctgccagctccaacctgcc > 1:1225298‑M1/1‑48 (MQ=255) aaGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagaccaccaggccctgcgcctcacatcctaaccaaggtcaggttgcagatccgcgtcacgcaccagcctttccaatgcgaccaggtccggtacccgcgccacctgctcacccacctgcaccgctgccagctccaacctg > 2:1271642‑M1/1‑48 (MQ=255) aaGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagaccaccaggccctgcgcctcacatcctaaccaaggtcaggttgcagatccgcgtcacgcaccagccttt > 2:946395‑M1/1‑48 (MQ=255) 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(MQ=255) gccgcggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagaccaccaggccctgcgcctcacatcctaaccaaggtcaggttgcagatccgcgtcacgcaccagcctttccaatgcgaccaggtccggtacccgcgccacctgc < 2:745972‑M1/155‑154 (MQ=255) | GCCTTGCAGGCCCGCGGCCACGATCAGCCAGATGGCACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGCAC > AE015451/5681181‑5681642 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |