New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 741491 = | NA (NA) | 11 (0.170) | 8/324 | NT | NA | intergenic (+91/‑409) | PP_t12/PP_0635 | tRNA‑Thr/Group II intron‑encoding maturase |
? | AE015451 | 741509 = | NA (NA) | intergenic (+109/‑391) | PP_t12/PP_0635 | tRNA‑Thr/Group II intron‑encoding maturase |
CAGCGGAAACAGGGGTTTGCGTTACGGGTGTGAGCAGTGGTACGTTGCGCTACACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCGGGTGACCGCGAATCTGAAGGAAGCCCGAGGCAAAATGCTGGCCTGACGAACAGGAAGCGGATAGAGGCGGCACAGCGGGGTGAGGT > AE015451/741270‑741689 | cAGCGGAAACAGGGGTTTGCGTTACGGGTGTGAGCAGTGGTACGTTGCGCTACACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAgcgc < 1:459164/236‑1 (MQ=255) gCGGAAACAGGGGTTTGCGTTACGGGTGTGAGCAGTGGTACGTTGCGCTACACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAgcgc < 2:1190181/234‑1 (MQ=255) gggTGTGAGCAGTGGTACGTTGCGCTACACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCaa > 1:1261477/1‑235 (MQ=255) aGCAGTGGTACGTTGCGCTACACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGt > 2:758821/1‑234 (MQ=255) aGCAGTGGTACGTTGCGCTACACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGt < 2:503604/234‑1 (MQ=255) aGCAGTGGTACGTTGCGCTACACGCCGGTGTAGCTCAGCCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGtt > 1:700046/1‑192 (MQ=255) gTACGTTGCGCTACACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGtt < 2:544829/210‑1 (MQ=255) tACGTTGCGCTACACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGa > 2:671718/1‑234 (MQ=255) cGTTGCGCTACACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTg < 1:671721/236‑1 (MQ=255) gcgcTACACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTg < 2:971831/232‑1 (MQ=255) tACACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTa > 1:158139/1‑181 (MQ=255) tACACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTGAgcgc > 1:153587/1‑186 (MQ=255) tACACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTc > 2:717869/1‑234 (MQ=255) tACACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCct < 1:754605/236‑1 (MQ=255) tACACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGGGAAAGTc > 2:1143453/1‑234 (MQ=255) cacGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACt > 1:199527/1‑218 (MQ=255) tgtAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACAccc > 1:1092703/1‑236 (MQ=255) gTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACAccc < 1:923742/227‑1 (MQ=255) tCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTg < 1:911647/197‑1 (MQ=255) tCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCctct < 1:450380/218‑1 (MQ=255) ggTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCTCGTAAGCGCACCCCGCTTGGTTGTGGTGGccga > 2:300332/1‑186 (MQ=255) gTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGaaa > 2:1228853/1‑208 (MQ=255) gTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGa > 1:1157397/1‑233 (MQ=255) gTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAg < 1:529213/235‑1 (MQ=255) cTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGCCTTGGAGGTGa > 2:700812/1‑193 (MQ=255) tCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTa > 2:256704/1‑144 (MQ=255) tCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAgg > 2:794248/1‑234 (MQ=255) aCGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGaa < 1:327782/215‑1 (MQ=255) cgAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTac < 2:417693/195‑1 (MQ=255) cgAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTac > 1:417696/1‑195 (MQ=255) cgAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCg < 2:450749/202‑1 (MQ=255) cgAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCg > 1:450752/1‑202 (MQ=255) gTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAgg < 2:460209/169‑1 (MQ=255) gTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGCTCTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACAGCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCGGGTGACcgc > 1:1207487/1‑236 (MQ=255) aTTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCGGGTGa > 1:864023/1‑227 (MQ=255) tcCGGCACCAGAATCCGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTACGGGCTTTTTTGTGTTCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAg > 2:100678/1‑112 (MQ=255) gCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAg < 1:345909/177‑1 (MQ=255) cAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCt < 1:729531/115‑1 (MQ=255) cAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCt > 2:729528/1‑115 (MQ=255) gAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCGGGTGACCGCGAATCTGAAGGAAGc < 2:440525/227‑1 (MQ=255) tCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGCGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCgg > 2:290361/1‑164 (MQ=255) gTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTac < 2:605071/153‑1 (MQ=255) ttGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGc < 2:860574/184‑1 (MQ=255) tCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCCACCCGCTTGGTTGTGTGGGCCCAGTggcg > 2:66866/1‑122 (MQ=21) tCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGcc < 1:1028891/174‑1 (MQ=255) tCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCGGGTGACCGCGAATCTGAAGGAAGCCCGAGGCAAAATGCTgg > 2:969585/1‑233 (MQ=255) cGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCGGGTGACCGCGAATCTGAAGGAAGCCCGAGGCAAAATGCTGGCCTGACGAAc > 1:785760/1‑236 (MQ=255) ggCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCGGGTGACCGCGAATCTGAAGGAAGCCCGAGGCAAAATGCTGGCCTGACGGACAGGAAGCGGATagag > 1:1188776/1‑235 (MQ=255) aCCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCCACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGAcgt > 2:204943/1‑101 (MQ=255) aCCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAgg > 2:1245448/1‑108 (MQ=255) aCCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAgg < 1:1245451/108‑1 (MQ=255) aCCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAgg < 2:199527/158‑1 (MQ=255) aCCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCGGGTGACCGCGAATCTGAAGGAAGCCCGAGGCAACATGCTGGCCTGACGAACAGGAAGCGGATAGAggcg > 1:1249064/1‑235 (MQ=39) ccTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCGGGTGACCGCGAATCTGAAGGAAGCCCGAGGCAAAATGCTGGCCTGACGAACa < 2:435978/203‑1 (MQ=33) ccTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCGGGTGACCGCGAATCTGAAGGAAGCCCGAGGCAAAATGCTGGCCTGACGAACAGGAAGCGGATAGAGGCGGCACAGCGGGGTGAgg > 1:243603/1‑236 (MQ=33) ccTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCGGGTGACCGCGAATCTGAAGGAAGCCCGAGGCAAAATGCTGGCCTGACGAACAGGAAGCGGATAGAGGCGGCACAGCGGGGTGAg > 1:493343/1‑235 (MQ=33) cTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCGGGTGACCGCGAATCTGAAGGAAGCCCGAGGCAAAATGCTGGCCTGACGAACAGGAAGCGGATAGAgg > 1:1042283/1‑217 (MQ=32) cTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCGGGTGACCGCGAATCTGAAGGAAGCCCGAGGCAAAATGCTGGCCTGACGAACAGGAAGCGGATAGAGGCGGCACAGCGGGGTGAGGt > 1:1075070/1‑236 (MQ=32) tgtgCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAAc > 1:1018892/1‑53 (MQ=38) tgtgCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAAc < 2:1018889/53‑1 (MQ=38) tgtgCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCGGGTGACCGCGAATCTGAAGGAAGCCCGAGGCAAAATGCTGGCCTGACGAACAGGAAGCGGATAGAGGCGGCACAGCGGGGTGa > 2:787220/1‑231 (MQ=32) tgtgCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTATACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCGGGTGACCGCGAATCTgaaggaa > 2:925952/1‑170 (MQ=17) gtgCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCctct > 2:537645/1‑101 (MQ=33) gtgCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCctct < 1:537648/101‑1 (MQ=33) | CAGCGGAAACAGGGGTTTGCGTTACGGGTGTGAGCAGTGGTACGTTGCGCTACACGCCGGTGTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGCACTCGTAACGCGAAGGTCGCAGGTTCGATTCCTGTCTCCGGCACCAGAATCAGTTGGTCTATGGCGATTTCTCGCTACCTGGCACCAATAGAAGCCCGCCTTGTGCGGGCTTTTTTGTGTGCGCCAGGCATGGCGCGTTGCGCGTAAGCGCAACCCGCTTGGTTGTGGTGGCCAAGTGGGTGACTTGGAGGTGAAAGTCCTCTACACACCCGGCAAGGGGAAGTGTTAGCCGGAGGCAAGGGTGTCGCGGGTGACCGCGAATCTGAAGGAAGCCCGAGGCAAAATGCTGGCCTGACGAACAGGAAGCGGATAGAGGCGGCACAGCGGGGTGAGGT > AE015451/741270‑741689 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |