New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 1347037 = | 81 (1.180) | 3 (0.050) | 3/292 | NT | 5.0% | intergenic (‑145/+259) | udh/galP‑I | uronate dehydrogenase/porin‑like protein |
? | AE015451 | 1347141 = | 44 (0.740) | intergenic (‑249/+155) | udh/galP‑I | uronate dehydrogenase/porin‑like protein |
CCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCAATGGTGGACACACATCGGAGGTTGGGCGCAGGCCGCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGGCCCTGCTGGCCAGTTTTCACCCGCCGTTCGC > AE015451/1346810‑1347250 | ccTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCg > 1:1242092/1‑236 (MQ=255) ttCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCgg < 1:137423/234‑1 (MQ=255) gcgAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa > 1:1271074/1‑236 (MQ=255) aataacgagttcgatgagaaccggttgatcttcaactatccgctgtcgttgctctgatcaagatctgcgggtttacccgcgaatacggtggtggcggcaacggcgaacggcgggtgaaaactggccagcagggccggcccattcgcgggtaaacccgctcctacacagcggcctgcgcccaacctccgatgtgtgtccaccattgatcaggtGTAGGAGCgg < 1:12816‑M1/10‑1 (MQ=255) cccAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCct > 1:960619/1‑235 (MQ=255) cgccTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCa > 1:1084231/1‑236 (MQ=255) ccTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGCAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCgg > 2:467990/1‑201 (MQ=255) cGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGGGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTGTACCCGCGaag > 2:602138/1‑210 (MQ=255) cGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTcc < 1:984372/236‑1 (MQ=255) 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gCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTaa < 2:1242089/231‑1 (MQ=255) ctctTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTaaa < 1:646235/231‑1 (MQ=255) ctTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTc > 1:464556/1‑236 (MQ=255) ttgttgTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTc > 1:998254/1‑235 (MQ=255) gttgttAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTaaa < 1:462013/226‑1 (MQ=255) ttgttAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTgccgcc < 2:1250938/204‑1 (MQ=255) ttAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGGAGGAGCg > 2:31991/1‑138 (MQ=255) 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< 1:73551/236‑1 (MQ=255) gtAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTaaa < 1:57628/213‑1 (MQ=255) tgggTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTa < 2:1164846/132‑1 (MQ=255) aGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTaa < 2:464553/210‑1 (MQ=255) cGTATGACTTGGGTGATTTTTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTaa < 2:636574/203‑1 (MQ=255) 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tgtCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTAt < 2:943352/154‑1 (MQ=255) tCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCAATGGTGGACACACATCGGAGGTTGGgcg > 2:984826/1‑211 (MQ=255) cAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCgg > 1:905246/1‑157 (MQ=255) cAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCAATGGTGGACACACATCGGAGGTTGGGCGCAGGCCGCTGTGTAGGAGCGGGTTTa > 1:1090753/1‑236 (MQ=255) aGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGAGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCACTTTCCACCCGCCTGTCACCGTTgccgccac > 2:42323/1‑136 (MQ=21) gCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCAATGGTGGACACACATCGGAGGTTGGGCGCAgg < 1:866271/207‑1 (MQ=255) ttGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCAATGGTGGACACACATCGGAGGTTGGGCGCAGGCCGCTgtgt > 1:803104/1‑214 (MQ=255) ttGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACACGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTgcc > 2:446630/1‑129 (MQ=255) ggcggcTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCAATGGTGGacactc > 2:1014208/1‑181 (MQ=255) gccggcTTTTGCGGGCCTTTCGGGGGTAAGAAAGGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGTTTTCCCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCAAtggt < 1:332565/173‑1 (MQ=255) cggcTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCAAt > 2:1237407/1‑170 (MQ=255) gcTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCAATGGTGGa < 2:695076/174‑1 (MQ=255) ttGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGt > 2:138290/1‑139 (MQ=255) ttGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCCCCTACACCTGATCAAtggta > 2:968361/1‑167 (MQ=255) cgcaggCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCAATGGTGGACCCACATCGGAGGTTGGgcg > 2:643818/5‑189 (MQ=255) gCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCAATGGTGGACACACATCGGAGGTTGGgcgc < 1:72183/189‑1 (MQ=255) agcggcctgcgcccaacctccgatgtgtgtccaccattgatcaggtGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTGAACCCgcc < 2:1217925‑M1/99‑2 (MQ=255) aggCCTTTCGCGGGTAAGAAATGGGAAAGGCCTGCGCGGGCGCCCGGAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCCATTTCCCCCCGCCGGTCACCGTTGCCGCCGCCCCCGTAt > 1:461767/2‑127 (MQ=18) cgcgGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGc < 2:234513/65‑1 (MQ=255) gcgGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCAATGGTGGa > 2:772497/1‑157 (MQ=255) cgGGTAAGAAAGGCGAAAGGCCTGAGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 2:121520/55‑1 (MQ=18) tccgatgtgtgtccaccattgatcaggtGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGGAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCCATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTAttccc < 1:1235985‑M1/86‑3 (MQ=255) gCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCAATGGTGGACACACATCGGAg < 2:1238904/156‑1 (MQ=255) cGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCAAtggt < 2:839725/140‑1 (MQ=255) gAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCAATGGTGGACACACATCGGAGGTTGGGCGCAGGCCGCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGGCCCTGCTGGCCAGTTTTCACCcgccgttcgc > 1:524248/1‑235 (MQ=255) ccaccattgatcaggtGTAGGAGCgg < 2:65640‑M1/10‑1 (MQ=255) gcTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCAATGGTGGACACACATCGGAGGTTGGGCGCAGGCCGCTGTGTAGGAGCGGGt < 2:1091217/178‑1 (MQ=255) ccTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCAATGGTGGACACACATCGGAGGTTGGGCGCAGGCCGCtg < 1:970650/166‑1 (MQ=255) cattgatcaggtGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCCCCGTATTCGCGGGAAAACCCGCTCCTACACCTGATCAATGGTGGac < 2:624037‑M1/122‑1 (MQ=255) gcgGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCAATGGTGGCCACACATCGGAGGGTg > 1:383055/1‑147 (MQ=255) gcgGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCAATGGTGGACAGACAt > 2:1180438/1‑138 (MQ=255) tGTAGGAGCGGGTTTACCcgc > 2:211077‑M1/2‑21 (MQ=255) | CCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATCAATGGTGGACACACATCGGAGGTTGGGCGCAGGCCGCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGGGCCGGCCCTGCTGGCCAGTTTTCACCCGCCGTTCGC > AE015451/1346810‑1347250 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |