New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 1535168 | 71 (1.030) | 6 (0.090) | 6/320 | NT | 8.6% | coding (177/1218 nt) | argJ | Glutamate N‑acetyltransferase/Amino‑acid acetyltransferase |
? | AE015451 | = 1535239 | 61 (0.940) | coding (248/1218 nt) | argJ | Glutamate N‑acetyltransferase/Amino‑acid acetyltransferase |
CGAAGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGCACCGGCGCGCCAGGCCTGGCCGCCGCCGAGCGCACCTGCGCCAAGCTGGCCGAACTGGCTGGCGTACCGGCCGAGTCGGTACTGCCGTTCTCCACCGGCGTGATTGGCGAGCCGCTGCCGGTCGAAAAGATCGAAGGCGCGCTGCAGGCCGCCCTCGACAAC > AE015451/1534944‑1535402 | cGAAGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCa < 1:1264119/235‑1 (MQ=255) aaGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAAc < 1:1109304/236‑1 (MQ=255) cGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTc < 1:1035199/228‑1 (MQ=255) cGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAg < 1:1135788/235‑1 (MQ=255) ggCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTc < 1:34294/227‑1 (MQ=255) ttCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAggg < 1:1194583/236‑1 (MQ=255) agcGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTc < 1:191958/207‑1 (MQ=255) cGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCAcc > 2:454157/1‑229 (MQ=255) ttttttCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAgg < 2:501446/222‑1 (MQ=255) tttCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTc < 1:889510/202‑1 (MQ=255) cgcTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGa < 2:535851/185‑1 (MQ=255) gcTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCaa < 2:775175/233‑1 (MQ=255) tctAATGGGTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTc < 2:382516/189‑1 (MQ=255) 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gCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTgc < 1:42473/188‑1 (MQ=255) cccACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCAGCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGCACCGgcgcgc > 1:474179/1‑235 (MQ=255) ccTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGCACCGGCGCGCCAGGc > 1:787975/1‑235 (MQ=255) ccGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCAcc < 1:1141260/171‑1 (MQ=255) 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aGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGCACCGGCGCGCCAGGCCTGGCCGCCGCCGAGCGCACCTGCGCCAAGCTGGCCGAACTGGCTGGCGTACCGGCCGAGTCGGTACTGCCGTTCCCCACCGGCCTGATTGGCg > 2:1175356/1‑229 (MQ=255) cGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGccggcgttggcgttacccgtgttggtcagcaggtagcgcacggtgccctgtacacgctgtttggacaggatcaccggcgccgcgcagaaggcgttgagggtgaacacgccagccacg > 2:780254‑M1/1‑46 (MQ=255) cGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGcaccggcgccgcgcagaaggcgttgagggtgaacacgccagccacg > 2:780254‑M2/1‑117 (MQ=255) gTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCATGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACCCCGGCACCGGCGCGCCa > 1:687647/1‑129 (MQ=255) tggcGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGCACCGGCGCGCCAGGCCTGGCCGCCGCCGAGCGCACCTGCGCCAAGCTGGCCGAACTGGCTGGCGTACCGGCCGAGTCGGTACTGCCGTTCTCCCCCGGCGTGATTGGCGAGCCGCTGCCGGTc > 1:646482/1‑235 (MQ=255) tggcGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGCACCGGCGCGCCAGGCCTGGCCGCCGCCGAGCGCACCTGCGCCAAGCTGGCCGAACTGGCTGGCGTACCGGCCGAGTCGGTACTGCCGTTCTCCACCGGCGTGATTGGCGAGCCGCTGCCGGTCg < 1:553999/236‑1 (MQ=255) gcGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGCACCGGCGCGCCAGGCCTGGCCGCCGCCGAGCGCACCTGCGCCAAGCTGGCCGAACTGGCTGGCGTACCGGCCGAGTCGGTACTGCCGTTCTCCACCGGCGt > 2:969624/1‑211 (MQ=255) ccTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGccggcgttggcgttacccgtgttggtcagcaggtagcgcacggtgacctgtcaacgctgtttggacaggatcaccggcgccgcgcagaaggc > 2:891499‑M1/1‑28 (MQ=255) 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ccTTCTGCGCGGCGCCGGTGccggcgttggcgttacccgtgttggtcagcaggtagcgcacggtgccctgtacacgctgtttggacaggatcaccggcgccgcgcagaaggcgttgagggtgaacacgccagccacgctggagccttcggcacagcgcatgaccaccacatccttgcgccccgggcgcttgataccggcagaagcgataccgagttcaaaa > 2:414923‑M1/1‑20 (MQ=255) ccTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGCACCGGCGCGCCACGCCTGGCCGCCGCCGAGCGCACCTGCGCCAAGCCGGCCGCACCGGCTGGCGTACCGGCCGCGTCggga > 2:269462/1‑171 (MQ=255) gactggggcgccggtgccggcgttggcgttacccgtgttggtcagcaggtagcgcacggtgccctgtacacgctgtttggacaggatcaccggcgccgcgcagaaggcgttgagggtgaacacgccagccacgctggagccttcg < 1:203405‑M1/139‑130 (MQ=255) tGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGCACCGGCGCGCCAGGCCTGGCCGCCGCCGAGCGCACCTGCGCCAAGCTGGCCGAACTGGCTGGCGTACCGGCCGAGTCGGTACTGCCGTTCTCCACCGGCGTGAt > 1:158537/1‑191 (MQ=255) tGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGCACCGGCGCGCCAGGCCTGGCCGCCGCCGAGCGCACCTGCGCCAAGCTGGCCGAACTGGCTGGCGTACCGGCCGAGTCGGTACTGCCGTTCTCCACCGGCGTGATTGGCGAGCCGCTGCCGGTCGAAAAGATCGAAGGCGCGCTGCAGgc > 1:681580/1‑236 (MQ=255) gcgcCGGTGccggcgttggcgttacccgtgttggtcagcaggtagcgcacggtgccctgtacacgctgtttggacaggatcaccggcgccgcgcagaaggcgttgagggtgaacacgccagccacgctggagccttcggcacagcgcatgaccaccacatccttgcgccccgggcgcttgataccggcagaagcgataccgagt < 2:1241861‑M1/204‑196 (MQ=255) gcgcCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGCACCGGCGCGCCAGGCCTGGCCGCCGCCGAGCGCACCTGCGCCAAGCTGGCCGAACTGGCTGGCGTACCGGCCGAGTCGGTACTGCCGTTCTCCACCGGCGTGATTGGCGAGCCGCTGCCGGTCGAAAAGATCGAAGGCGCGCTGCAGgc < 1:573734/230‑1 (MQ=255) gcCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGCACCGGCGCGCCAGGCCTGGCCGCCGCCGAGCGCACCTGCGCCAAGCTGGCCGAACTGGCTGGCGTACCGGCCGAGTCGGTACTGCCGTTCTCCACCGGCGTGATTGGCGAGCCGCTGCCGGTCGAAAAGATCGAAGGCGCGCTGCAGGCCGCCCt < 2:474176/234‑1 (MQ=255) tGccggcgttggcgttacccgtgttggtcagcaggtagcgcacggtgccctgtacacgctgtttggacaggatcaccggcgccgcgcagaaggcgttgagggtgaacacgccagccacgctggagccttcggcacagcgcatgaccaccacatccttgcgccccgggcgcttgataccggcagaagcgataccgagttcaaaacccggaaccgggtgcagggtgggcaaaggacca > 1:454160‑M1/1‑2 (MQ=255) | CGAAGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGCACCGGCGCGCCAGGCCTGGCCGCCGCCGAGCGCACCTGCGCCAAGCTGGCCGAACTGGCTGGCGTACCGGCCGAGTCGGTACTGCCGTTCTCCACCGGCGTGATTGGCGAGCCGCTGCCGGTCGAAAAGATCGAAGGCGCGCTGCAGGCCGCCCTCGACAAC > AE015451/1534944‑1535402 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |