New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | AE015451 | = 2941322 | 64 (0.930) | 4 (0.060) | 4/318 | NT | 6.8% | coding (554/912 nt) | PP_2574 | Transcriptional regulator, LysR family |
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CTGCCGCGCCTGATCGCCGGTTTTCGTCAGCGCTACCCGGGTGTTGACATTCGCCTGCGCGACGGTGAGCAGCAGGACCTGATCCAGGGCCTGACCGCTGGAACATTCGACCTGGCATTTCTCTATGACCACGACCTGGATGGCACTATCGAGGCCGAGCCGCTGATGCCGCCGCAGAAGCCCTATGTGCTGCTACCCGAGAACCACCGCTTTGCCAGCCAGGCCCAGGTCTCGCTGCGCGACCTGTGCCCGGAGCCGATGATCCTGCTGGACGTGGCCCCTAGCCGCACGTACTTTGTCAGCTTGTTCAACGAGATGGGCCTGGCACCGAACATCGTCTTCAGTTCACCGTCGATCGAGATGGTGCGCGGCATGGTCGGTCAGGGTTTCGGTTTTTCGTTGCTGGTAACCCGTCCGCACTCGGAATACACCTATGACGGCCAACGCCTGGCAATG > AE015451/2941096‑2941551 | cTGCCGCGCCTGATCGCCGGTTTTCGTCAGCGCTACCCGGGTGTTGACATTCGCCTGCGCGACGGTGAGCAGCAGGACCTGATCCAGGGCCTGACCGCTGGAACATTCGACCTGGCATTTCTCTATGACCACGACCTGGATGGCACTATCGAGGCCGAGCCGCTGATGCCGCCGCAGAAGCCCTATGTGCTGCTACCCGAGAACCACCGCTTTGCCAGCCAGGCCCAGGTCTCGCt < 1:412478/236‑1 (MQ=255) cgcgCCTGATCGCCGGTTTTCGTCAGCGCTACCCGGGTGTTGACATTCGCCTGCGCGACGGTGAGCAGCAGGACCTGATCCAGGGCCTGACCGCTGGAACATTCGACCTGGCATTTCTCTATGACCACGACCTGGATGGCACTATCGAGGCCGAGCCGCTGATGCCGCCGCAGAAGCCCTATGTGCTGCTACCCGAGAACCACCGCTTTGCCAGCCAGGCCCAGGTCTCGCTgcgc < 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aTCGCCGGTTTTCGTCAGCGCTACCCGGGTGTTGACATTCGCCTGCGCGACGGTGAGCAGCAGGACCTGATCCAGGGCCTGACCGCTGGAACATTCGACCTGGCATTTCTCTATGACCACGACCTGGATGGCACTATCGAGGCCGAGCCGCTGATGCCGCCGCAGAAGCCCTATGTGCTGCTACCCGAGAACCACCGCTTTGCCAGCCAGGCCCAGGTCTCGCTGCGCGACCtgt < 1:802291/235‑1 (MQ=255) cGCCGGTTTTCGTCAGCGCTACCCGGGTGTTGACATTCGCCTGCGCGACGGTGAGCAGCAGGACCTGATCCAGGGCCTGACCGCTGGAACATTCGACCTGGCATTTCTCTATGACCACGACCTGGATGGCACTATCGAGGCCGAGCCGCTGATGCCGCCGCAGAAGCCCTATGTGCTGCTACCCGAGAACCACCGCTTTGCCAGCCAGGCCCAGGTCTCGCTGCGCGACCTGTGc < 1:53518/235‑1 (MQ=255) cGGTTTTCGTCAGCGCTACCCGGGTGTTGACATTCGCCTGCGCGACGGTGAGCAGCAGGACCTGATCCAGGGCCTGACCGCTGGAACATTCGACCTGGCATTTCTCTATGACCACGACCTGGATGGCACTATCGAGGCCGAGCCGCTGATGCCGCCGCAGAAGCCCTATGTGCTGCTACCCGAGAACCACCGCTTTGCCAGCCAGGCCCAGGTCTCGCTGCGCGACCTGTGCCCgg < 1:963519/236‑1 (MQ=255) 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tATGTGCTGCTACCCGAGAACCACCGCTTTGCCAGCCAGGCCCAGGTCTCGCTGCGCGACCTGTGCCCGGAGCCGATGATCCTGCTGGACGTGGCCCCTAGCCGCACGTACTTTGTCAGCTTGTTCAACGAGATGGGCCTGGCACCGAACATCGTCTTCAGTTCACCGTCGATCGAGATGGTGCGCGGCATGGTCGGTCAGGGTTTCGGTTTTTCGTTGCTGGTAACCCGTCCGc < 1:1089534/235‑1 (MQ=255) tgtgCTGCTACCCGAGAACCACCGCTTTGCCAGCCAGGCCCAGGTCTCGCTGCGCGACCTGTGCCCGGAGCCGATGATCCTGCTGGACGTGGCCCCTAGCCGCACGTACTTTGTCAGCTTGTTCAACGAGATGGGCCTGGCACCGAACATCGTCTTCAGTTCACCGTCGATCGAGATGGTGCGCGGCATGGTCGGTCAGGGTTTCGGTTTTTCGTTGCTGGTAACCCggc > 1:57393/1‑228 (MQ=255) tgcggcTACCCGAGAACCACCGCTTTGCCAGCCAGGCCCAGGTCTCGCTGCGCGACCTGTGCCCGGAGCCGATGATCCTGCTGGACGTGGCCCCTAGCCGCACGTACTTTGTCAGCTTGTTCAACga < 2:714170/127‑1 (MQ=255) ctgctACCCGAGAACCACCGCTTGGCCAGCCAGGCCCACGTCTCGCTGCGCGACCGGTGCCCGGAGCTGATGAACCTGCTGGACGTGGCCCCTAGCCGCACGTACTTTGTCAGCTTGTTCAACGAGAtgggcctggctggcaaagcggtggttctcgggtagcagcacatagggcttct > 1:916177‑M2/1‑127 (MQ=255) tgctACCCGAGAACCACCGCTTTGCCAGCCAGGCCCAGGTCTCGCTGCGCGACCTGTGCCCGGAGCCGATGATCCTGCTGGACGTGGCCCCTAGCCGCACGTACTTTGTCAGCTTGTTCAACGAGATGGGCCTGGCACCGAACATCGTCTTCAGTTCACCGTCGATCGAGATGGTGCGCGGCATGGTCGGTCAGGGTTTCGGTTTTTCGTTGCTGGTAACCCGTCCGCACTCg < 2:487928/233‑1 (MQ=255) ggggccacgtccagcaggatcatcggctccgggcaCAGGTCTCGCTGCGCGACCTGTGCCCGGAGCCGATGATCCTGCTGGACGTGGCCCCTAGCCGCACGTACTTTGTCAGCTTGTTCAACGAGATGGGCCTGGCACCGaa < 1:23847‑M1/107‑1 (MQ=255) gggccacgtccagcaggatcatcggctccgggcaCAGGTCTCGCTGCGCGACCTGTGCCCGGAGCCGATGATCCTGCTGGACGTGGCCCCTAGCCGCACGTACTTTGTCAGCTTGTTCAACga > 1:959597‑M1/35‑123 (MQ=255) gggccacgtccagcaggatcatcggctccgggcaCAGGTCTCGCTGCGCGACCTGTGCCCGGAGCCGATGATCCTGCTGGACGTGGCCCCTAGCCGCACGTACTTTGTCAGCTTGTTCAACga < 2:959594‑M1/89‑1 (MQ=255) gagaACCACCGCTTTGCCAGCCAGGCCCAGGTCTCGCTGCGCGACCTGTGCCCGGAGCCGATGATCCTGCTGGACGTGGCCCCTAGCCGCACGTACTTTGTCAGCTTGTTCAACGAGATGGGCCTGGCACCGAACATCGTCTTCAGTTCACCGTCGATCGAGATGGTGcgcg > 1:443450/1‑172 (MQ=255) agaACCACCGCTTTGCCAGCCAGGCCCAGGTCTCGCTGCGGGACCTGTTCCCGGAGCAGATGATCCGGCTGGACGTGGCCCCTAGCCGCACGTACTTTGTCAGCTTGTTCAACGAGATGGGCCTGGCACCGAACATCGTCTTCAGTTCACCGt < 1:288808/153‑1 (MQ=255) ccagcaggatcatcggctccgggccCAGGTCTCGCTGCGCGACCTGTGCCCGGAGCCGATGATCCTGCTGGACGTGGCCCCTAGCCGCACGTACTTTGTCAGCTTGTTCAACGAGATGGGCCTGGCACCGAACATCGTCTTCAGTTCACCGTCGATCGAGATGGTGCGCGGCATGGTCGGTCAGGGTTTCg < 1:1229325‑M1/166‑1 (MQ=255) aaCCACCGCTTTGCCAGCCAGGCCCAGGTCTCGCTGCGCGACCTGTGCCCGGAGCCGATGATCCTGCTGGACGTGGCCCCTAGCCGCACGTACTTTGTCAGCTTGTTCAACGAGATGGGCCTGGCACCGAACATCGTCTTCAGTTCACCGTCGATCGAGATGGTGCGCGGCATGGTCGGTCAGGGTTTCGGTTTTTCGTTGCTGGTAACCCGTCCGCACTCGGa < 1:921658/224‑1 (MQ=255) accaccGCTTTGCCAGCCAGGCCCAGGTCTCGCTGCGCGACCTGTGCCCGGAGACGATGATACTGCTGGACGTGTCCCCTAGCCGCACGTACTTTGTCAGCTTGTTCAACGAGATGGGCCTGGCACCGAACATCg > 2:592769/1‑135 (MQ=255) aggatcatcggctccgggcaCAGGTCTCGCTGCGCGACCTGTGCCCGGAGCCGATGATCCTGCTGGACGTGGCCCCTAGCCGCACGTACTTTGTCAGCTTGTTCAACGAGATGGGCCTGGCACCGAACATCGTCTTCAGTTCACCGTCGATCGAGATGGTGCGCGGCATGGTCGGTCAGGGTTTCGGttt < 2:1006180‑M1/170‑1 (MQ=255) gCTTTGCCAGCCAGGCCCAtctcgttgaacaagctgacaaagtacgtgcggctaggggccacgtccagcaggatcatcggctccgggcacaggtcgcgcagcgagacctgggcctggctggcaaagcggtggttctcgggtagcagcacatagggcttctgcggcggcatcagcggctcggcctcgatagtgccatccaggtcgtggtcatagagaaatgccaggtcgaatgttc > 1:1162008‑M1/1‑19 (MQ=255) tttGCCAGCCAGGCCCAGGTCTCGCTGCGCGACCTGTGCCCGGAGCCGATGATCCTGCTGGACGTGGCCCCTAGCCGCACGTACTTTGTCAGCTTGTTCAACGAGATGGGCCTGGCACCGAACATCGTCTTCAGTTCACCGTCGATCGAGATGGTGCGCGGCATGGTCGGTCAGGGTTTCGGTTTTTCGTTGCTGGTAACCCGTCCGCACTCGGAATACACCTATGACGGCCAAc < 1:879490/235‑1 (MQ=255) tcggctccgggcaCAGGTCTCGCTGCGCGACCTGTGCCCGGAGCCGATGATCCTGCTGGACGTGGCCCCTAGCCGCACGTACTTTGTCAGCTTGTTCAACGAGATGGGCCTGGCACCGAACATCGTCTTCAGTTCACCGTCGATCGAGCTGGTGCGCGGCATGGTCGGGcagggct < 1:220293‑M1/163‑3 (MQ=255) gcgccaggcCCAtctcgttgaacaagctgacaaagtacgtgcggctaggggccacgtccagcaggatcagcggctccgggcacaggtcgcgcagcgagacctgggcctggctggcaaagcggtggttctcgggtagcagcacatagggcttctgcggcggcatcagcg < 2:145402‑M1/166‑157 (MQ=255) ccgccagGCCCAGGTCTCGCTGCGCGACCTGTGCCCGGAGCCGATGATCCTGCTGGACGTGGCCCCTAGCCGCACGTACTTTGTCAGCTTGTTCAACGAGATGGGCCTGGCACCGAACATCGTCTTCAGTTCACCGTCGATCGAGATGGTGCGCGGCATGGTCGGTCAGGGTTTCGGTTTTTCGTTGCTGGTAACCCGTCCGCACTCg < 2:599890/206‑1 (MQ=255) gCCCAtctcgttgaacaagctgacaaagtacgtgcggctaggggccacgtccagcaggatcatcggctccgggcacaggtcgcgcagcgagacctgggcctggctggcaaagcggtggttctcgggtagcagcacatagggcttctgcggcggcatcagcggctcggcctcgatagtgccatccaggtcgtggtcatagagaaatgccaggtcgaatgttccagcggtcaggcc > 2:738300‑M1/1‑5 (MQ=255) | CTGCCGCGCCTGATCGCCGGTTTTCGTCAGCGCTACCCGGGTGTTGACATTCGCCTGCGCGACGGTGAGCAGCAGGACCTGATCCAGGGCCTGACCGCTGGAACATTCGACCTGGCATTTCTCTATGACCACGACCTGGATGGCACTATCGAGGCCGAGCCGCTGATGCCGCCGCAGAAGCCCTATGTGCTGCTACCCGAGAACCACCGCTTTGCCAGCCAGGCCCAGGTCTCGCTGCGCGACCTGTGCCCGGAGCCGATGATCCTGCTGGACGTGGCCCCTAGCCGCACGTACTTTGTCAGCTTGTTCAACGAGATGGGCCTGGCACCGAACATCGTCTTCAGTTCACCGTCGATCGAGATGGTGCGCGGCATGGTCGGTCAGGGTTTCGGTTTTTCGTTGCTGGTAACCCGTCCGCACTCGGAATACACCTATGACGGCCAACGCCTGGCAATG > AE015451/2941096‑2941551 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |