| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 3704021 | 62 (0.900) | 4 (0.060) | 3/320 | NT | 7.7% | coding (1981/2055 nt) | paaZ | oxepin‑CoA hydrolase/3‑oxo‑5,6‑dehydrosuberyl‑CoA semialdehyde dehydrogenase |
| ? | AE015451 | = 3704222 | 37 (0.570) | coding (1780/2055 nt) | paaZ | oxepin‑CoA hydrolase/3‑oxo‑5,6‑dehydrosuberyl‑CoA semialdehyde dehydrogenase | |||||
GATGCCTGAATTCTTCACTGCAGCCAGGTACGTGCATCGATCCCAAGTGCCTTGAGCACCTACCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGAGGGAGCTGTGCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCTGCCGACAGTACGAAGTAACCGTGGGCAATGCGTTTACCG > AE015451/3703790‑3704250 | gATGCCTGAATTCTTCACTGCAGCCAGGTACGTGCATCGATCCCAAGTGCCTTGAGCACCTACCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGAGGGAGCTGTGCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCcaca < 1:613283/236‑1 (MQ=255) aCTGCAGCCAGGTACGTGCATCGATCCCAAGTGCCTTGAGCACCTACCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGAGGGAGCTGTGCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCAccc > 1:908440/1‑236 (MQ=255) tGCAGCCAGGTACGTGCATCGATCCCAAGTGCCTTGAGCACCTACCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGAGGGAGCTGTGCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCAcccc > 1:647921/1‑235 (MQ=255) tGCAGCCAGGTACGTGCATCGATCCCAAGTGCCTTGAGCACCTACCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGAGGGAGCTGTGCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCAcccc > 1:143792/1‑235 (MQ=255) aGCCAGGGACGTGCATCGATCCCAAGTGCCTTGAGCACCTACCGGCCTCTGCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGAGGGAGCTGTGCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCcaca < 2:89964/215‑1 (MQ=255) ccAGGTACGTGCATCGATCCCAAGTGCCTTGAGCACCTACCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGAGGGAGCTGTGCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCgg < 1:1261867/236‑1 (MQ=255) aGGTACGTGCATCGATCCCAAGTGCCTTGAGCACCTACCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGAGGGAGCTGTGCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCgg < 2:621987/234‑1 (MQ=255) cccAAGTGCCTTGAGCACCTACCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGAGGGAGCTGTGCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCt > 2:784268/1‑233 (MQ=255) gCCTTGAGCACCTACCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGAGGGAGCTGTGCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCcaccac > 2:589446/1‑202 (MQ=255) tGAGCACCTACCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGAGGGAGCTGTGCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCAcccc > 2:554992/1‑201 (MQ=255) aCCTACCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGAGGGAGCTGTGCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGAt > 1:580282/1‑235 (MQ=255) ctctTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGAGGGAGCTGTGCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGGCTTGCCATGGTCGATCTTgcgc > 1:363447/1‑232 (MQ=255) 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aCCCGCTCCTACGAGGGAGCTGTGCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGgcgcg > 1:598734/1‑234 (MQ=255) cccGCTCCTACGAGGGAGCTGTGCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGcc < 1:1239253/235‑1 (MQ=255) gCTCCTACGAGGGAGCTGTGCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCt < 1:1175107/200‑1 (MQ=255) gCTCCTACGAGGGAGCTGTGCAGCGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCt > 2:1175104/1‑200 (MQ=255) ccTACGAGGGAGCTGTGCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCt < 2:1220596/230‑1 (MQ=255) cTACGAGGGAGCTGTGCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCCCCCAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCAACAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGc < 1:357452/180‑1 (MQ=255) tACGAGGGAGCTGTGCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTa > 1:719095/1‑236 (MQ=255) aGCTGTGCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAAt < 1:784271/236‑1 (MQ=255) cggtgCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGACCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGGTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTAACCCAGCTGATTGGTTACGTCCACATCCCACGCCACCAccc > 2:1151413/3‑152 (MQ=255) cTGTGCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGc > 1:870528/1‑236 (MQ=255) gtgCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCCGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATcc > 2:236208/1‑137 (MQ=255) gtgCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCCCCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCt < 2:143792/183‑1 (MQ=255) gtgCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGc < 2:529838/234‑1 (MQ=255) tgCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTg > 1:37526/1‑216 (MQ=255) tgCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGcc < 1:1275879/234‑1 (MQ=255) 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agagACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGcc > 1:67109/1‑221 (MQ=255) agagACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGCGCTGGTCTTGccccg > 2:258509/1‑168 (MQ=255) agaCGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGgcg < 2:186179/195‑1 (MQ=255) gtcgCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGccc < 2:943021/157‑1 (MQ=255) 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1:885937/114‑1 (MQ=255) gCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCcaca < 2:32095/36‑1 (MQ=255) gCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCcaca > 1:32095/1‑36 (MQ=255) ccaATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCTGCCGACAGTACgacgtaa < 1:262308‑M2/236‑8 (MQ=255) caATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGgt < 1:924375/156‑1 (MQ=255) ttCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCTGc < 1:469933/216‑1 (MQ=255) ttCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCTGCCGACAGTACGAAGTAACCg > 1:937362/1‑235 (MQ=255) tccccGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCGCGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGcc < 2:332695/125‑1 (MQ=255) atcTGCTTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGgt < 2:591461/144‑1 (MQ=255) ggATTGTTTACTT‑CACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTc < 1:1086249/88‑1 (MQ=255) tGGTTACTTCCGCATCCCCCGCCTCCCCCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGgt < 2:149879/139‑1 (MQ=255) ttACGTCgtactgtcggcagcggccgggctgttcgtgtcgcccggcgccggaccggtattggccaactatgggctggacaccctgcgcttcatcaacccggtgggcattggcgataccatccaggcgcgcctgacctgcaagcgcaagatcgaccagggcaagaccagcccgctggggcagccgcagggggtggtggcgtgggatgtggaagtaaccaatcagctgggtgaattgg < 1:262308‑M1/236‑230 (MQ=255) cgtactgtcggcagcggccgggctgttcgcgtcgcccggcgccggaccggtattggccaactatgggctg > 2:369411‑M1/1‑1 (MQ=255) cgtactgtcggcagcggccaggctgttcgtgtcgcccggcgccggaccggtattggccaactatgggctggacaccctgcgcttgatcaacccggtgggcattggcgataccatccaggcgcgcctgacctgcaagcgcaagatcga > 2:1204617‑M1/1‑1 (MQ=255) | GATGCCTGAATTCTTCACTGCAGCCAGGTACGTGCATCGATCCCAAGTGCCTTGAGCACCTACCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGAGGGAGCTGTGCAGTGCCGGTCAGAGACGGCTTGCCCGAGAAGAGGCCAGTGGCTTCTACACATCATGCTGGTTTTTTCAGCACCAAGGTCAGGATGTCATAGCTGGCCACCAATTCACCCAGCTGATTGGTTACTTCCACATCCCACGCCACCACCCCCTGCGGCTGCCCCAGCGGGCTGGTCTTGCCCTGGTCGATCTTGCGCTTGCAGGTCAGGCGCGCCTGGATGGTATCGCCAATGCCCACCGGGTTGATGAAGCGCAGGGTGTCCAGCCCATAGTTGGCCAATACCGGTCCGGCGCCGGGCGACACGAACAGCCCGGCCGCTGCCGACAGTACGAAGTAACCGTGGGCAATGCGTTTACCG > AE015451/3703790‑3704250 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |