| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 4189269 | 75 (1.090) | 4 (0.060) | 4/322 | NT | 5.1% | coding (532/819 nt) | PP_5611 | putative transcriptional regulator |
| ? | AE015451 | = 4189277 | 76 (1.160) | coding (540/819 nt) | PP_5611 | putative transcriptional regulator | |||||
ATCACGAAAGTTGGATGCGGAGGTCGTGGGATTGGTTTTACAGTCGATTCGCAGCTACCAGTCGATCAAGGTGACTTATAGATCCTTGGATAACCCCGAGGGTGATGAGATTGAGGTTACACCTCATTCGCTCACTCAAGATGGCACTCGATGGCTTGTCAGGTGTTGGTGCTGTACTCGAGGCAACTTTGAAACCTATGATCTCTCGCGCATCGTTCGGGCCGAGCATCTGCGGCCCGACCTTGATCGGAGCGGTTTGGACAAAGCTTGGGAGCGGATGGTTAGCGTGGTCTTTATCCCTCACCCTGAGCTTACCGCAGCACAACGACGATTGATCGAGGACGACTATGGCATGGTTGACGGTGAGATGCAGTTGAAGTGTCGTCGTGCCCTGCTCTCTTCCATGCTGCGACAGTTGAACCTACACGGTGAACGCTGCAGCCCAAGCAGCGAGTT > AE015451/4189046‑4189501 | aTCACGAAAGTTGGATGCGGAGGTCGTGGGATTGGTTTTACAGTCGATTCGCAGCTACCAGTCGATCAAGGTGACTTATAGATCCTTGGATAACCCCGAGGGTGATGAGATTGAGGTTACACCTCATTCGCTCACTCAAGATGGCACTCGATGGCTTGTCAGGTGTTGGTGCTGTACTCGAGGCAACTTTGAAACCTATGATCTCTCGCGCATCGTTCGGGCCGAGCATCTGcg > 1:977551‑M2/1‑232 (MQ=255) cGAAAGTTGGATGCGGAGGTCGTGGGATTGGTTTTACAGTCGATTCGCAGCTACCAGTCGATCAAGGTGACTTATAGATCCTTGGATAACCCCGAGGGTGATGAGATTGAGGTTACACCTCATTCGCTCACTCAAGATGGCACTCGATGGCTTGTCAGGTGTTGGTGCTGTACTCGAGGCAACTTTGAAACCTATGATCTCTCGCGCATCGTTCGGGCCGAGc > 2:1037955/1‑223 (MQ=255) aaGTTGGATGCGGAGGTCGTGGGATTGGTTTTACAGTCGATTCGCAGCTACCAGTCGATCAAGGTGACTTATAGATCCTTGGATAACCCCGAGGGTGATGAGATTGAGGTTACACCTCATTCGCTCACTCAAGATGGCACTCGATGGCTTGTCAGGTGTTGGTGCTGTACTCGAGGCAACTTTGAAACCTATGATCTCTCGCGCATCGTTCGGGCCGAGCATCTGCGGCCCGACCt > 1:729548/1‑236 (MQ=255) cGTGGGATTGGTTTTACAGTCGATTCGCAGCTACCAGTCGATCAAGGTGACTTATAGATCCTTGGATAACCCCGAGGGTGATGAGATTGAGGTTACACCTCATTCGCTCACTCAAGATGGCACTCGATGGCTTGTCAGGTGTTGGTGCTGTACTCGAGGCAACTTTGAAACCTATGATCTCTCGCGCATCGTTCGGGCCGAGCATCTGCGGCCCGACCTTGATCGGAGCGGttt < 2:614301/234‑1 (MQ=255) gATTGGTTTTACAGTCGATTCGCAGCTACCAGTCGATCAAGGTGACTTATAGATCCTTGGATAACCCCGAGGGTGATGAGATTGAGGTTACACCTCATTCGCTCACTCAAGATGGCACTCGATGGCTTGTCAGGTGTTGGTGCTGTACTCGAGGCAACTTTGAAACCTATGATCTCTCGCGCATCGTTCGGGCCGAGCATCTGCGGCCCGACCTTGATCGGAGc < 1:434410/224‑1 (MQ=255) tttACAGTCGATTCGCAGCTACCAGTCGATCAAGGTGACTTATAGATCCTTGGATAACCCCGAGGGTGATGAGATTGAGGTTACACCTCATTCGCTCACTCAAGATGGCACTCGATGGCTTGTCAGGTGTTGGTGCTGTACTCGAGGCAACTTTGAAACCTATGATCTCTCGCGCATCGTTCGGGCCGAGCATCTGCGGCCCGACCTTGATCGGAGCGGTTTGGACAAAGCTTgg > 1:365961/1‑235 (MQ=255) ttACAGTCGATTCGCAGCTACCAGTCGATCAAGGTGACTTATAGATCCTTGGATAACCCCGAGGGTGATGAGATTGAGGTTACACCTCATTCGCTCACTCAAGATGGCACTCGATGGCTTGTCAGGTGTTGGTGCTGTACTCGAGGCAACTTTGAAACCTATGATCTCTCGCGCATCGTTCGGGCCGAGCATCTGCGGCCCGACCTTGATCGGAGCGGTTTGGACAAAGCTTGGGa < 1:1134385/236‑1 (MQ=255) ttACAGTCGATTCGCAGCTACCAGTCGATCAAGGGGACTTATAGATCCTTGGATAACCCCGAGGGTGATGAGATTGAGGTTACACCTCATTCGCTCACTCAAGATGGCACTCGATGGCTTGTCAGGTGTTGGTGCTGTACTCGAGGCAACTTTGAAACCTATGATCTCTCGCGCATCGTTCGGGCCGAGCACCTGCGGCCCGAc > 2:291929/1‑204 (MQ=255) aCAGTCGATTCGCAGCTACCAGTCGATCAAGGTGACTTATAGATCCTTGGATAACCCCGAGGGTGATGAGATTGAGGTTACACCTCATTCGCTCACTCAAGATGGCACTCGATGGCTTGTCAGGTGTTGGTGCTGTACTCGAGGCAACTTTGAAACCTATGATCTCTCGCGCATCGTTCGGGCCGAGCATCTGCGGCCCGACCTTGATCGGAGCGGTTTGGACAAAGCTTGGGa < 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cTGTACTCGAGGCAACTTTGAAACCTATGATCTCTCGCGCATCGTTCGGGCCGAGCATCTGCGGCCCGACCTTGATCGGAGCGGTTTGGACAAAGCTTGGGAGCGGATGGTTAGCGTGGTCTTTATCCCTCACCCTGAGCTTACCGCAGCACAACGACGATTGATCGAGGACGACTATGGCATGGTTGACGGTGAGATGCAGTTGAAgtg > 1:258204/1‑210 (MQ=255) cTCGAGGCAACTTTGAAACCTATGATCTCTCGCGCATCGTTCGGGCCGAGCATCTGCGGCCCGACCTTGATCGGAGCGGTTTGGACAAAGCTTGGGAGCGGATGGTTAGCGTGGTCTTTATCCCTCACCCTGAGCTTACCGCAGCACAACGACGATTGATCGAGGACGACTATGGCATGGTTGACGGTGAGATGCAGTTGAAGTGTCGTCGTGc > 2:1057566/1‑214 (MQ=255) cTCGAGGCAACTTTGAAACCTATGATCTCTCGCGCATCGTTCGGGCCGAGCATCTGCGGCCCGACCTTGATCGGAGCGGTTTGGACAAAGCTTGGGAGCGGATGGTTAGCGTGGTCTTTATCCCTCACCCTGAGCTTACCGCAGCACAACGACGATTGATCGAGGACGACTATGGCATGGTTGACGGTGAGATGCAGTTGAAGTGTCGTCGTGCCCTGCTCTCTTCCATGCTGCGa > 1:449964/1‑236 (MQ=255) tCGAGGCCACTTTGAACCCTATGATCTCTCGCGCATCGTTCGGGCCGAGCATCTGCGGCCCGACCTTGATCGGAGCGGTTTGGACAAAGCTTGGGCGCGGATGGTTAGCGTGGTCTTTATCCCTccc < 2:372871/127‑3 (MQ=255) tCGAGGCAACTTTGAAACCTATGATCTCTCGCGCATCGTTCGGGCCGcagatgctcggcccgaacgatgcgcgagagatcataggtttcaaagttgcctcgagtacagcaccaacacctgacaagcaatcgagtgccatcttgagtga > 2:1143992‑M1/1‑47 (MQ=255) cGAGGCAACTTTGAAACCTATGATCTCTCGCGCATCGTTCGGGCCGAGCATCTGCGGCCCGACCTTGATCGGAGCGGTTTGGACAAAGCTTGGGAGCGGATGGTTAGCGTGGTCTTTATCCCTCACCCTGAGCTTACCGCAGCACAACGACGATTGATc < 2:31446/159‑1 (MQ=255) gAGGCAACTTTGAAACCTATGATCTCTCGCGCATCGTTCGGGCCGAGCATCTGCGGCCCGACCTTGATCGGAGCGGTTTGGACAAAGCTTGGGAGCGGATGGTTAGCGTGGTCTTTATCCCTCACCCTGAGCTTACCGCAGCACAACGACGATTGATCGAGGACGACTATGGCATGGTTGACGGTGAGATGCAGTTGAAGTGTCGTCGTGCCCTGCTCTCTTCCATGCTGCGAc < 2:635393/234‑1 (MQ=255) aGGTAACTTTGGAACCTAGGATCTCGCGCGCAGCGTTCGGGCCGGGCATCTGCGGCCCGACCTTGTTCGGAGCGGTTTGGACAAAGCTTGGGAGCg < 2:16571/96‑1 (MQ=255) gCAACTTTGAAACCTATGATCTCTCGCGCATCGTTCGGGCCGAGCATCTGcg < 2:510692‑M2/52‑3 (MQ=255) gCAACTTTGAAACCTATGATCTCTCGCGCATCGTTCGGGCCGAGCATCTGcg > 1:510695‑M2/1‑50 (MQ=255) tttGAAACCTATGATCTCTCGCGCATCGTTCGGGCCGAGCATCTGCGGCCCGACCTTGATCGGAGCGGTTTGGACAAAGCTTGGGAGCGGATGGTTAGCGTGGTCTTTATCCCTCACCCTGAGCTTACCGCAGCACAACGACGATTGATCGAGGACGACTATGGCATGGTTGACGGTGAGATGCAGTTGAAGTGTCGTCGTGCCCTGCTCTCTTCCATGCTGCGACAGTTGAAc > 2:518377/1‑234 (MQ=255) gccTATGATCTCTCGCGCATCGTTCGGGCCGAGCATCTGCGGCCCGACCTTGATCGGAGCGGTTTGGACAAAGCTTGGGAGCGGATGGTTAGCGTGGTCTTTATCCCTCACCCTGa < 1:697001/115‑1 (MQ=255) tATGATCTCTCGCGCATCGTTCGGGCCGAGCATCTGCGGCCCGACCTTGATCGGAGCGGTTTGGACAAAGCTTGGGAGCGGATGGTTAGCGTGGTCTTTATCCCTCACCCTGAGCTTACCGCAGCACAACGACGATTGATCGAGGACGACTATGGCATGGTTGACGGTGAGATGCAGTTGAAGTGTCGTCGTGCCCTGCTCTCTTCCAtgctg < 1:1001563/213‑1 (MQ=255) gATCTCTCGCGTGTCGTGCGGGCCGcagatgctcggcccgaacgatgcgcgagagatcataggtttcaaagttgcctcgagtacagcaccaacacctgacaagccatcgagtgccatcttgagtgagcgaatgaggtgtaacctcaatct < 2:325435‑M1/150‑126 (MQ=255) ctctcGCGCATCGTTCGGGCCGAGCATCTGCGGCCCGACCTTGATCGGAGCGGTTTGGACAAAGCTTGGGAGCGGATGGTTAGCGTGGTCTTTATCCCTCACCCTGAGCTTACCGCAGCACAACGACGATTGATCGAGGACGACTATGGCATGGTTGACGGTGAGATGCAGTTGAAGTGTcgtcgt < 2:365958/186‑1 (MQ=255) cgcgCATCGTTCGGGCCGAGCATCTGCGGCCCGACCTTGATCGGAGCGGTTTGGACAAAGCTTGGGAGCGGATGGTTAGCGTGGTCTTTATCCCTCACCCTGAGCTTACCGCAGCACAACGACGATTGATCGAGGACGACTATGGCATGGTTGACGGTGAGATGCAGTTGAAGTgtcgtc < 2:598009/180‑1 (MQ=255) cgcATCGTTCGGGCCGAGCATCTGCGGCCCGACCTTGATCGGAGCGGTTTGGACAAAGCTTGGGAGCGGATGGTTAGCGTGGTCTTTATCCCTCACCCTGAGCTTACCGCAGCACAACGACGATTGATCGAGGACGACTATGGCATGGTTGACGGTGAGATGCAGTTGAAGTGTCGTCGTg > 2:745041/1‑181 (MQ=255) cgcATCGTTCGGGCCGAGCATCTGCGGCCCGACCTTGATCGGAGCGGTTTGGACAAAGCTTGGGAGCGGATGGTTAGCGTGGTCTTTATCCCTCACCCTGAGCTTACCGCAGCACAACGACGATTGATCGAGGACGACTATGGCATGGTTGACGGTGAGATGCAGTTGAAGCGTCGTCGTGCCCTGCTCTCTTccct > 1:307646/1‑195 (MQ=255) gcATCGTTCGGGCCGAGCATCTGCGGCCCGACCTTGATCGGAGCGGTTTGGACAAAGCTTGGGAGCGGATGGTTAGCGTGGTCTTTATCCCTCACCCTGAGCTTACCGCAGCACAACGACGATTGATCGAGGACGACTAt > 1:268928/1‑140 (MQ=255) gcATCGTTCGGGCCGAGCATCTGCGGCCCGACCTTGATCGGAGCGGTTTGGACAAAGCTTGGGAGCGGATGGTTAGCGTGGTCTTTATCCCTCACCCTGAGCTTACCGCAGCACAACGACGATTGATCGAGGACGACTAt < 2:268927/140‑1 (MQ=255) cGGGCCGcagatgctcggcccgaacgatgcgcgagagatcataggtttcaaagttgcctcgagtacagcaccaacacctgacaagccatcgagtgccatcttgagtgagcgaatgaggtgtaacctcaatctcatcaccctcggggttatccaaggatct > 2:922092‑M1/1‑7 (MQ=255) gggCCGcagatgctcggcccgaacgatgcgcgagagatcataggtttcaaagttgcctcgagtacagcaccaacacctgacaagccatcgagtgccatcttgagtgagcgaatgaggtgtaacctcaatctcatcaccctcggggttatccaaggatctataagtcaccttgatcgactggtagctgc > 2:506539‑M1/1‑6 (MQ=255) gggCCGAGCATCTGCGGCCCGACCTTGATCGGAGCGGTTTGGACAAAGCTTGGGAGCGGATGGTTAGCGTGGTCTTTATCCCTCACCCTGAGCTTACCGCAGCACAACGACGATTGATCGAGGACGACTATGGCATGGTTGACGGTGAGATGCAGTTGAAGTGTCGTCGTGCCCTGCTCTCTTCCATGCTGCGACAGTTGAACCTACACGGTGAACGCTGCAGCCCAAGCAGCGAg > 1:693997/1‑236 (MQ=255) cGcagatgctcggcccgaacgatgcgcgagagatcataggtttcaaagttgcctcgagtacagcaccaacacctgacaagccatcgagtgccatcttgagtgagcgaatgaggtgtaacctcaatctcatcaccctcggggttatccaaggatctataagtcaccttgatcgactggtagctgcgaatcgactgtaaaaccaatcccacgacctccgcatccaactttcgtgat > 1:977551‑M1/1‑2 (MQ=255) cGcagatgctcggcccgaacgatgcgcgagagatcataggtttcaaagttgc < 2:510692‑M1/52‑51 (MQ=255) cGcagatgctcggcccgaacgatgcgcgagagatcataggtttcaaagttgc > 1:510695‑M1/1‑2 (MQ=255) | ATCACGAAAGTTGGATGCGGAGGTCGTGGGATTGGTTTTACAGTCGATTCGCAGCTACCAGTCGATCAAGGTGACTTATAGATCCTTGGATAACCCCGAGGGTGATGAGATTGAGGTTACACCTCATTCGCTCACTCAAGATGGCACTCGATGGCTTGTCAGGTGTTGGTGCTGTACTCGAGGCAACTTTGAAACCTATGATCTCTCGCGCATCGTTCGGGCCGAGCATCTGCGGCCCGACCTTGATCGGAGCGGTTTGGACAAAGCTTGGGAGCGGATGGTTAGCGTGGTCTTTATCCCTCACCCTGAGCTTACCGCAGCACAACGACGATTGATCGAGGACGACTATGGCATGGTTGACGGTGAGATGCAGTTGAAGTGTCGTCGTGCCCTGCTCTCTTCCATGCTGCGACAGTTGAACCTACACGGTGAACGCTGCAGCCCAAGCAGCGAGTT > AE015451/4189046‑4189501 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |