| New junction evidence | |||||||||||
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gCTCCTGCCGCCGCCGCCGAGCCCAAGCGTGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGT‑GGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAAcc > 2:1061593/1‑235 (MQ=255) cTCCTGCCGCCGCCGCCGAGCCCAAGCGTGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGT‑GGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAg < 1:885722/236‑1 (MQ=255) cTCCTGCCGCCGCCGCCGAGCCCAAGCGGGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGc < 2:188722/97‑1 (MQ=255) agccgccgccgAGCCCAAGCGTGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCATCGCAGGTATTCGTGCGT‑GGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGcc < 2:1200595/147‑1 (MQ=255) gccgccgccgAGCCCAAGCGTGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGT‑GGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTc > 2:845558/1‑177 (MQ=255) aggcgattgctcagacGCGTGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCAc < 2:1037736‑M1/63‑1 (MQ=255) cgccgccgAGCCCAAGCGTGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGT‑GGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGcc < 2:962032/194‑1 (MQ=255) cgccgccgAGCCCAAGCGTGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGT‑GGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGt < 1:1061596/236‑1 (MQ=255) cgccgAGCCCAAGCGTGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGT‑GGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCaaa > 2:849576/1‑208 (MQ=255) CGTGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGT‑GGCCAGGGCTCGTgg > 2:89844‑M1/1‑105 (MQ=255) tgcggcacgagcaccggcgcgcgcGTCTGGGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAgg < 1:1210445‑M2/53‑1 (MQ=255) ccGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGT‑GGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGa < 2:535090/113‑1 (MQ=255) cGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGGGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTCCAGCGCAGGTGTTCGTCCGT‑GGCCAGGGCGCGTGGGTGCGGGACAACGAAGGGCAt > 1:1135111/1‑119 (MQ=255) aTCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGT‑GGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGt > 1:285054/1‑179 (MQ=255) gcacgcGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGT‑GGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCa > 1:793924‑M2/7‑161 (MQ=255) cGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGT‑GGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCa < 1:515949‑M2/200‑1 (MQ=255) | AGTCTATCGCCGTATTCCAAAGGGTTACAGCGATGATTCGGTCGATTGTTACCCCGGATGAAAAACACTTTTGATAGGCAAGGCAAAATATCGAGTGCAGGCACCAAGACCGCACCGTGGCTGCCCTTTACCGTGATTGGTTGGAGCCCTGATGAACCTGTTCAACCTGCGCCGCTCGGCTCCTGCCGCCGCCGCCGAGCCCAAGCGTGCGCCGGTGATCGTGCCGCACGCGTCTGAGCAGTCGCCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGT‑GGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCA > AE015451/451932‑452362 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |