New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 2460050 = | 73 (1.060) | 5 (0.080) | 5/324 | NT | 6.7% | coding (243/717 nt) | ugpQ | glycerophosphoryl diester phosphodiesterase |
? | AE015451 | 2460124 = | 70 (1.060) | coding (169/717 nt) | ugpQ | glycerophosphoryl diester phosphodiesterase |
TGTCCAGCAGGCCATATTGCTGAGCCAGTTCACGGATCGCCAGGACGGTGGTGGCCGCGCGGGTGCGAGAGGCGCTTTTCACCTCCAGTTGCCAGTGTTCGAACGGGCATTTTTCGAACAGCTCTTCCAGTTTCGGGATCGGGCAGGGCTGCACGTGGCCCGGGCCGCCTTTGCGGGCATCGATCTTGACCAGTTCGGCGGCCGGGTGCTCGACCACTTTGCCGCGCCGGCCCGTGGTGCGCTTGAGGGTGGGGTCGTGGATGACCATCAGTTCGTTGTCGGATGACAAGTGCAGGTCCAGCTCGCAGCGGGTCACGCCATGGGACAGGCATTGCTGAAAGCTCTTCAGGGTGTTCTCGGGTGCTTCGCCCTTGGCGCCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCG > AE015451/2459890‑2460333 | tGTCCAGCAGGCCATATTGCTGAGCCAGTTCACGGATCGCCAGGACGGTGGTGGCCGCGCGGGTGCGAGAGGCGCTTTTCACCTCCAGTTGCCAGTGTTCGAACGGGCATTTTTCGAACAGCTCTTCCAGTTTCGGGATCGGGCAGGGCTGCACGTGGCCCGGGCCGCCTTTGCGGGCATCGATCTTGACCAGTTCGGCGGCCGGGTGCTCGACCACTTTGCCGCGCCGGCCCgtg < 1:467653/236‑1 (MQ=255) gCTGAGCCAGTTCACGGATCGCCAGGACGGTGGTGGCCGCGCGGGTGCGAGAGGCGCTTTTCACCTCCAGTTGCCAGTGTTCGAACGGGCATTTTTCGAACAGCTCTTCCAGTTTCGGGATCGGGCAGGGCTGCACGTGGCCCGGGCCGCCTTTGCGGGCATCGATCTTGACCAGTTCGGCGGCCGGGTGCTCGACCACTTTGCCGCGCCGGCCCGTGGTGCGCTTGAGGGTggg > 1:82045/1‑235 (MQ=255) ccAGTTCACGGATCGCCAGGCCGGTGGTGGCCGCGCGGGTGCGAGAGGCGCTTTTCCCCTCCAGTTGCCAGTGTTCGAACGGGCATTTTTCGAACAGCTCTTCCAGTTTCGGGATCGGGCAGGGCTGCACGTGGCCCGGGCCGCCTTTGCGGGCATCGATCTTGACCAGTTCGGCGGCCGGGTGCTCGACCACTTTGCCGCGCCGGCCCGTGGTGCGCTTGAgg < 1:119719/224‑1 (MQ=255) ccAGTTCACGGATCGCCAGGACGGTGGTGGCCGCGCGGGTGCGAGAGGCGCTTTTCACCTCCAGTTGCCAGTGTTCGAACGGGCATTTTTCGAACAGCTCTTCCAGTTTCGGGATCGGGCAGGGCTGCACGTGGCCCGGGCCGCCTTTGCGGGCATCGATCTTGACCAGTTCGGCGGCCGGGTGCTCGACAACTTTGCCGCGCCGGCCCGTGGTGCGCTTGAGGGTgg > 2:391507/1‑228 (MQ=255) cAGTTCACGGATCGCCAGGACGGTGGTGGCCGCGCGGGTGCGAGAGGCGCTTTTCACCTCCAGTTGCCAGTGTTCGAACGGGCATTTTTCGAACAGCTCTTCCAGTTTCGGGATCGGGCAGGGCTGCACGTGGCCCGGGCCGCCTTTGCGGGCATCGATCTTGACCAGTTCGGCGGCCGGGTGCTCGACCACTTTGCCGCGCCGGCCCgtg > 1:384784/1‑211 (MQ=255) ccgagaacaccctgaagagctttcagcaatgcctgtcccatggcgtgacccgctgcgagctggacctgcacttgtcatccgacaacgaactgatggtcatccacgaccccaccctcaagcgcaccacgggccggcgcggcaaagtggtcgagcacccggccgccgaactggtcaagatcgatgcccgcaaaggcggcccgTGGTGCGCTTGAGGGTGGGGTCGTGGATGACCATc < 1:1095584‑M2/35‑1 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1:649467/223‑1 (MQ=255) ggTGCGAGAGGCGCTTTTCACCTCCAGTTGCCAGTGTTCGAACGGGCATTTTTCGAACAGCTCTTCCAGTTTCGGGATCGGGCAGGGCTGCACGTGGCCCGGGCCGCCTTTGCGGGCATCGATCTTGACCAGTTCGGCGGCCGGGTGCTCGCCCACTTTGCCGCGCCGGCCCGTGGTGCGCTTGAGGGTGGGGTCGTGGATGACCATCAGGTCGtt > 1:30572/1‑216 (MQ=255) ggTGCGAGAGGCGCTTTTCACCTCCAGTTGCCAGTGTTCGAACGGGCATTTTTCGAACAGCTCTTCCAGTTTCGGGATCGGGCAGGGCTGCACGTGGCCCGGGCCGCCTTTGCGGGCATCGATCTTGACCAGTTCGGCGGCCGGGTGCTCGACCACTTTGCCGCGCCGGCCCGTGGTGCGCTTGAGGGTGGGGTCGTGGATGACCATCAGTTCGTTGTCgg > 1:316793/1‑221 (MQ=255) ggTGCGAGAGGCGCTTTTCACCTCCAGTTGCCAGTGTTCGAACGGGCATTTTTCGAACAGCTCTTCCAGTTTCGGGATCGGGCAGGGCTGCACGTGGCCCGGGCCGCCTTTGCGGGCATCGATCTTGACCAGTTCGGCGGCCGGGTGCTCGACCACTTTGCCGCGCCGGCCCGTGGTGCGCTTGAGGGTGGGGTCGTGGATGACCATCAGTTCGTTGTCGGATGACAAGTGCAg > 2:887805/1‑234 (MQ=255) gagaGGCGCTTTTCACCTCCAGTTGCCAGTGTTCGAACGGGCATTTTTCGAACAGCTCTTCCAGTTTCGGGATCGGGCAGGGCTGCACGTGGCCCGGGCCGCCTTTGCGGGCATCGATCTTGACCAGTTCGGCGGCCGGGTGCTCGACCACTTTGCCGCGCCGGCCCgt < 2:717636/169‑1 (MQ=255) 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CCGCCTTTGCGGGCATCGATCTTGACCAGTTCGGCGGCCGGGTGCTCGACCACTTTGCCGCGCCGGCCCGTGGTGCGCTTGAGGGTGGGGTCGTGGATGACCATCAGTTCGTTGTCGGATGACAAGTGCAGGTCCAGCTCGCAGCGGGTCACGCCATGGGACAGGCATTGCTGAAAGCTCTTCAGGGTGTTCTCGGGTGCTTCGCCCTTGGCGCCGCGATGGCCGTAGATCAGGGt < 1:339530‑M1/236‑1 (MQ=255) CGCCTTTGCGGGCATCGATCTTGACCAGTTCGGCGGCCGGGTGCTCGACCACTTTGCCGCGCCGGCCCGTGGTGCGCTTGAGGGTGGGGGCGTGGATGACCATTAGTTCGTTGTCGGATGACAAGTGCAGGt < 1:1244783‑M1/132‑1 (MQ=255) ttGCGGGCATCGATCTTGACCAGTTCGGCGGCCGGGTGCTCGACCACTTTGCCGCGCCGGCCCGTGGTGCGCTTGAGGGTGGGGTCGTGGATGACCATCAGTTCGTTGTCGGATGACAAGTGCAGGTCCAGCTCGCAGCGGGTCACGCCATGGGACAGGCATTGCTGAAAGCTCTTCAGGGTGGTCTCg > 2:1262109/1‑189 (MQ=255) tGCGGGCATCGATCTTGACCAGTTCGGCGGCCGGGTGCTCGACCACTTTGCCGCGCCGGCCCGTGGTGCGGTTGAggggg > 1:140476/1‑78 (MQ=255) tGCGGGCATCGATCTTGACCAGTTCGGCGGCCGGGTGCTCGACCACTTTGCCGCGCCGGCCCGTGGTGCGCTTGAGGGTGGGGTCGTGGATGACCATCAGTTCGTTGTCGGATGACAAGTGCAGGTCCAGCTCGCAGCGGGTCACGCCATGGGACAGGCATTGCTGAAAGCTCTTCAGGGTGTTCTCGGGTGCTTCGccc > 1:908300/1‑200 (MQ=255) 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ccAGTTCGGCGGCCGGGTGCTCGACCACTTTGCCGCGCCGGCCCGTGGTGCGCTTGAGGGTGGGGTCGTGGATGACCATCAGTTCGTTGTCGGATGACAAGTGCAGGTCCAGCTCGCAGCGGGTCACGCCATGGGACAGGCATTGCTGAAAGCTCTTCAGGGTGTTCTCGGGTGCTTCGCCCTTGGcgccg > 1:855615/1‑191 (MQ=255) ccAGTTCGGCGGCCGGGTGCTCGACCACTTTGCCGCGCCGGCCCGTGGTGCGCTTGAGGGTGGGGTCGTGGATGACCATCAGTTCGTTGTCGGATGACAAGTGCAGGTCCAGCTCGCAGCGGGTCACGCCATGGGACAGGCATTGCTGAAAGCTCTTCAGGGTGTTCTCGGGTGCTTCGCCCTTGGcgccg < 2:855612/191‑1 (MQ=255) cAGTTCGGCGGCCGGGTGCTCGACCACTTTGCCGCGCCGGCCCGTGGTGCGCTTGAGGGTGGGGTCGTGGATGACCATCAGTTCGTTGTCGGATGACAAGTGCAGGTCCAGCTCGCAGCGGGTCACGCCATGGGACAGGCATTGCTGAAAGCTCTTCAGGGTGTTCTCGGGTGCTTCGCCCTTGGcgccgc < 1:1167987/191‑1 (MQ=255) gTTCGGCGGCCGGGTGCTCGACCACTTTGCCGCGCCGGCCCGTGGTGCGCTTGAGGGTGGGGTCGTGGATGACCATCAGTTCGTTGTCGGATGACAAGTGCAGGTCCAGCTCGCAGCGGGTCACGCCATGGGACAGGCATTGCTGa < 2:817556/146‑1 (MQ=255) ttCGGCGGCCGGGTGCTCGACCACTTTGCCGCGCCGGCCCGTGGTGCGCTTGAGGGTGGGGTCGTGGATGACCATCAGTTCGTTGTCGGATGACAAGTGCAGGTCCAGCTCGCAGCGGGTCACGCCATGGGACAGGCATTGCTGAAAGCTCTTCAGGGTGTTCTCGGGTGCTTCGCCCTTGGCGCCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGaa < 2:581490/233‑1 (MQ=255) gccgaactggtcaagatcgatgcccgcaaaggcggcccgTGGTGCGCTTGAGGGTGGGGTCGTGGATGACCATCAGTTCGTTGTCGGATGACAAGTGCAGGTCCAGCTCGCAGCg < 2:408599‑M2/76‑1 (MQ=255) gccgaactggtcaagatcgatgcccgcaaaggcggcccgTGGTGCGCTTGAGGGTGGGGTCGTGGATGACCATCAGTTCGTTGTCGGATGACAAGTGCAGGTCCAGCTCGCAGCg > 1:408602‑M2/40‑115 (MQ=255) cggcggCCGGGTGCTCGACCACTTTGCCGCGCCGGCCCGTGGTGCGCTTGAGGGTGGGGTCGTGGATGACCATCAGTTCGTTGTCGGATGACAAGTGCAGGTCCAGCTCGCAGCGGGTCACGCCATGGGACAGGCATTGCTGaaa > 1:1089751/1‑145 (MQ=255) ggcggcCGGGTGCTCGACCACTTTGCCGCGCCGGCCCGTGGTGCGCTTGAGGGTGGGGTCGTGGATGACCATCAGTTCGTTGTCGGATGACAAGTGCAGGTCCAGCTCGCAGCGGGTCACGCCATGGGACAGGCATTGCTGAAAGCTCTTCAGGGTGTTCTCGGGTGCtt > 2:481753/1‑170 (MQ=255) 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tCGACCACTTTGCCGCGCCGGCCCGTGGTGCGCTTGAGGGTGGGGTCGTGGATGACCATCAGTTCGTTGTCGGATGACAAGTGCAGGTCCAGCTCGCAGCGGGTCACGCCATGGGACAGGCATTGCTGAAAGCTCTTCAGGGTGTTCTCGGGTGCTTCGCCCTTGGCGCCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAAt < 1:481756/221‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCCGGCCCGTGGTGCGCTTGAGGGTGGGGTCGTGGATGACCATCAGTTCGTTGTCGGATGACAAGTGCAGGTCCAGCTCGCAGCGGGTCACGCCATGGGACAGGCATTGCTGAAAGCTCTTCAGGGTGTTCTCGGGTGCTTCGCCCTTGGcgccgc < 2:30572/163‑1 (MQ=255) ttGCCGCGCCGGCCCGTGGTGCGCTGGAGGGGGGGGTCGTGGATGACCATCAGTTCGTTGTCGGATGACAAGTGCAGGTCCAGCTCGCAGCGGGTCACGCCATGGGACAGGCATTGCTGAAAGCTCTTCAGGGTGTTCTCGGGTGCTTCGCCCTTGGcgccgc < 2:296959/163‑1 (MQ=255) tGCCGCGCCGGCCCGTGGTGCGCTTGAGGGTGGGGTCGTGGATGACCATCAGTTCGTTGTCGGATGACAAGTGCAGGTCCAGCTCGCAGCGGGTCACGCCATGGGACAGGCATTGCTGAAAGCTCTTCAGGGTGTTCTCGGGTGCTTCGCCCTTGGCGCCGCGAGGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGaaa > 1:136418/1‑208 (MQ=255) tGCCGAGCCGGCCCGTGGTGCGCTTGAGGGTGGGGTCGTGGATGACCATCAGTTCGTTGTCGGATg < 2:352616/66‑1 (MQ=255) 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cgTGGTGCGCTTGAGGGTGGGGTCGTGGATGACCATCAGTTCGTTGTCGGATGACAAGTGCAGGTCCAGCTCGCAGCGGGACACGCCATGGGACAGGCATTGCTGAAAGCTCTTCAGGGTGTTCTCGGGTGCt > 1:358569‑M2/3‑133 (MQ=255) | TGTCCAGCAGGCCATATTGCTGAGCCAGTTCACGGATCGCCAGGACGGTGGTGGCCGCGCGGGTGCGAGAGGCGCTTTTCACCTCCAGTTGCCAGTGTTCGAACGGGCATTTTTCGAACAGCTCTTCCAGTTTCGGGATCGGGCAGGGCTGCACGTGGCCCGGGCCGCCTTTGCGGGCATCGATCTTGACCAGTTCGGCGGCCGGGTGCTCGACCACTTTGCCGCGCCGGCCCGTGGTGCGCTTGAGGGTGGGGTCGTGGATGACCATCAGTTCGTTGTCGGATGACAAGTGCAGGTCCAGCTCGCAGCGGGTCACGCCATGGGACAGGCATTGCTGAAAGCTCTTCAGGGTGTTCTCGGGTGCTTCGCCCTTGGCGCCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCG > AE015451/2459890‑2460333 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |