New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 45668 = | 39 (0.890) | 3 (0.070) | 3/318 | NT | 8.1% | intergenic (‑144/+59) | cadA‑I/PP_0042 | cadmium translocating P‑type ATPase/conserved exported protein of unknown function |
? | AE015451 | 45693 = | 32 (0.790) | intergenic (‑169/+34) | cadA‑I/PP_0042 | cadmium translocating P‑type ATPase/conserved exported protein of unknown function |
GCTCTGTGTTCATTCCAAAAATGCCGCCATGCTCATGGCTATGACCTTCATGCCCGGCTTGGTCATCAGGGCGTTCAAGCAAACTCTTCATAACTCGTCCCTTCTGGGGTCAAGGCTTCCAATTGCCCTCTGCAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACTTGTTGTTGATGCATTGCGAATACATCGAGTAACGAACAGTCTTGAGCGTGCCCTGGGAGTCCTCGAAGGTCATCAACCGTGGATAGACCTGGCAGGTACGGGGGTCCTGCGACTGACGTACGAATTTCGCAACGTCTATCTTCATGCCATATTTGTAATCCTGAA > AE015451/45434‑45896 | cggagaaaaatggcaagccaatgccagagattcaggattacaaatatggcatgaagatagacgttgcgaaattcgtacgtcagtcgcaggacccccgtacctgccaggtctatccacggttgatgaccttcgaggactcccagggcacgctcaagactgttcgttactcgatgtattcgcaatgcatcaacaacaagtagtaaacgatttgaacagaacaattagagaattcataa > 1:414893‑M1/235‑236 (MQ=255) gtTCATTCCAAAAATGCCGCCATGCTCATGGCTATGACCTTCATGCCCGGCTTGGTCATCAGGGCGTTCAAGCAAACTCTTCATAACTCGTCCCTTCTGGGGTCAAGGCTTCCAATTGCCCTCTGCAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAg < 1:241807/236‑1 (MQ=255) gtTCATTCCAAAAATGCCGCCATGCTCATGGCTATGACCTTCATGCCCGGCTTGGTCATCAGGGCGTTCAAGCAAACTCTTCATAACTCGTCCCTTCTGGGGTCAAGGCTTCCAATTGCCCTCTGCAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAg > 1:255249/1‑236 (MQ=255) aaaaaTGCCGCCATGCTCATGGCTATGACCTTCATGCCCGGCTTGGTCATCAGGGCGTTCAAGCAAACTCTTCATAACTCGTCCCTTCTGGGGTCAAGGCTTCCAATTGCCCTCTACAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCt > 1:453097/1‑236 (MQ=255) cTATGACCTTCATGCCCGGCTTGGTCATCAGGGCGTTCAAGCAAACTCTTCATAACTCGTCCCTTCTGGGGTCAAGGCTTCCAATTGCCCTCTACAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGaa < 2:453095/226‑1 (MQ=255) tATGACCTTCATGCCCGGCTTGGTCATCAGGGCGTTCAAGCAAACTCTTCATAACTCGTCCCTTCTGGGGTCAAGGCTTCCAATTGCCCTCTGCAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATtg < 1:386814/236‑1 (MQ=255) aTGACCTTCATGCCCGGCTTGGTCATCAGGGCGTTCAAGCAAACTCTTCATAACTCGTCCCTTCTGGGGTCAAGGCTTCCAATTGCCCTCTGCAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAGAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATtg < 1:17352/235‑1 (MQ=255) ccTTCATGCCCGGCTTGGTCATCAGGGCGTTCAAGCAAACTCTTCATAACTCGTCCCTTCTGGGGTCAAGGCTTCCAATTGCCCTCTGCAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGACTGGCATTTATGAAtt > 2:442401/1‑222 (MQ=255) tCATGCCCGGCTTGGTCATCAGGGCGTTCAAGCAAACTCTTCATAACTCGTCCCTTCTGGGGTCAAGGCTTCCAATTGCCCTCTGCAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATtgttctgttc < 2:673067/236‑1 (MQ=255) ttGGTCATCAGGGCGTTCAAGCAAACTCTTCATAACTCGTCCCTTCTGGGGTCAAGGCTTCCAATTGCCCTCTGCAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCaaa < 2:751129/228‑1 (MQ=255) ttGGTCATCAGGGCGTTCAAGCAAACTCTTCATAACTCGTCCCTTCTGGGGTCAAGGCTTCCAATTGCCCTCTGCAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCaaa > 1:751131/1‑228 (MQ=255) ttGGTCATCAGGGCGTTCAAGCAAACTCTTCATAACTCGTCCCTTCTGGGGTCAAGGCTTCCAATTGCCCTCTGCAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTtac < 2:140626/236‑1 (MQ=255) ggCGTTCAAGCAAACTCTTCATAACTCGTCCCTTCTGGGGTCAAGGCTTCCAATTGCCCTCTGCAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACttgttgtt < 1:796635/236‑1 (MQ=255) tCAAGCAAACTCTTCATAACTCGTCCCTTCTGGGGTCAAGGCTTCCAATTGCCCTCTGCAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCACGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCAAGGCACTGCATGGCAttg > 2:142423/1‑184 (MQ=255) ggcccTGCTGGGGTCAAGGCTTCCAATTGCCCTCTGCAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACTTGTTGTTGa < 2:243012/209‑1 (MQ=255) gTCCCTTCTGGGGTCAGTGCTTCCAATTGCCCTCTGCAGTTGGGGAGACGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGTCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTtacta < 2:181335/200‑1 (MQ=255) ccTTCTGGGGTCAAGGCTTCCAATTGCCCTCTGCAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACTTGTTGTTGATGCATTTCGAATAcct > 2:405161/1‑222 (MQ=255) cTGGGGTCAAGGCTGCCAATTGCCCTCTGCAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTGGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAg < 2:208573/140‑1 (MQ=255) cTGGGGTCAAGGATTCCAATTGCCCTCTGCAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACTTGTTGTTGATGCATTGCg < 1:403028/213‑1 (MQ=255) ggTCAAGGCTTCCAATTGCCCTCTGCAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACTTGTTGTTGATGCATTGCGAATACATCGAGTAACGAACAGTCTTGa < 1:784023/236‑1 (MQ=255) ggCTTCCAATTGCCCTCTGCAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACTTGTTGTTGATGc < 1:630207/197‑1 (MQ=255) gCTTCCAATTTCCCTCTGCAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATCGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACTTGTTGTTGATg < 1:296483/195‑1 (MQ=255) gCTTCCAATTGCCCTCTGCAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACTTGTTGTTGATGCATTGCGAATACATCGAGTAACGAACAGTCTTGAGCGTGcc > 1:103597/1‑236 (MQ=255) cTTCCAATTGCCCTCCGCAGTTGGTGTGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACAGTTTGGCCGAGCCCAGGCGATAACACTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATaaaaaa < 2:574921/122‑1 (MQ=255) cAATTGCCCTCTGCAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAACATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTCCTACTTGTTGTTGATGCATTGCGAATCCCTCGAGTaa > 2:267459/1‑211 (MQ=255) ctGCAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACTTGTTGTTGATGCATTGCGAAt < 1:410600/190‑1 (MQ=255) cAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTAt > 1:303156/1‑129 (MQ=255) cAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTAt < 2:303154/129‑1 (MQ=255) cAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACttgttgtt < 1:259536/173‑1 (MQ=255) cAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACttgttgtt > 2:259534/1‑173 (MQ=255) gcGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGGGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACTTGTTGTTGATGCATTGCGAATACATCGAGTAACGAACAGTCTTGa < 2:29472/199‑1 (MQ=255) ccGTCTCTGGTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCGATGGGGTATCGGGCGTAAGAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACTTGTTGTTGATGCATTGCGAATACATCGAGTAACGa > 2:573230/1‑190 (MQ=255) gttggttgGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACTTGTTGTTGATGCATTGCGAATa > 2:738004/1‑169 (MQ=255) tggttggCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACTTGTTGTTGATGCATTGCGAATACATCGAGTAACGAACAGTCTTGAGCGTGCCCTGGGAGTCCTCGAAGGTCATCAACCGTGGATAGACCt < 1:634423/235‑1 (MQ=255) tggtgggCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACTTGTTGTTGATGCATTGCGAATACATCGAGTAACGAACAGTCTTGAGCGTGCCCTGGGAGTCCTCGAAGGTCATCAACCGTGGATAGACCt < 1:34513/235‑1 (MQ=255) gttggCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACTTGTTGTTGATGCATTGCGAATAc < 1:716261/166‑1 (MQ=255) aGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACTTGTTGTTGATGCATTGCGAATACATCGAGTAACGAACAGTCTTGAGCGTGCCCTGGGAGTCCTCGAAGGTCATCAACCGTGGATAGACCTGGCAGGTACgg < 1:735822/236‑1 (MQ=255) cgcaatgcatcaacaacaagtagtaaacgatttgaacagaacaattagagaattcatAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACTTGTTGTTGATGCATTGCGAATACATCGAGTAACGAACAGTCTTGa > 2:428954‑M1/58‑166 (MQ=255) cgcaatgcatcaacaacaagtagtaaacgatttgaacagaacaattagagaattcatAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATGTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACTTGTTGTTTATGCATTGCGAATACATCGCGTAACGAACAGTCTTGa < 1:428956‑M1/109‑1 (MQ=255) aGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACTTGTTGTTGATGCATTGCGAATACATCGAGTAACGAACAGTCTTGAGCGTGCCCTGGGAGTCCTCGAAGGTCATCAACCGTGGATAGACCTGGCAGGt > 2:710346/1‑204 (MQ=255) gtaaacgatttgaacagaacaattagagtattcatAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACTTGTTGTTGATGCATTGCGAATACATCGAGTAACGAACAGTCTTGAGCGTACCCTGGGAGTCCTCGAAg < 1:193706‑M1/132‑1 (MQ=255) aTCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACTTGTTGTTGATGCATTGCGAATACATCGAGTAACGAACAGTCTTGAGCGTGCCCTGGGAGTCCTCGAAGGTCATCAACCGTGGATAGACCTGGCAGGTACGGGGGTCCTGCGACTGACGTACGAATTTCGCAACGTCTATCt < 2:72717/220‑1 (MQ=255) ggCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACTTGTTGTTGATGCATTGCGAATACATCGAGTAACGAACAGTCTTGAGCGTGCCCTGGGAGTCCTCGAAGGTCATCAACCGTGGATAGACCTGGCAGGTACGGGGGTCCTGCGACTGACGTACGAATTTCGCAACGTCTATCTTCATGCCATATTTGTAATcc > 1:774374/1‑236 (MQ=255) aataaAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACTTGTTGTTGATGCATTGCGAATACATCGAGTAACGAACAGTCTTGAGCGTGCCCTGGGAGTCCTCGAAGGTCATCAACCGTGGATAGACCTGGCAGGTACGGGGGTCCTGCGACTGACGTACGAATTTCGCAACGTCTATCTTCATGCCATATTTGTAATCCTGaa < 1:725517/235‑1 (MQ=255) aaaaaaTGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACTTGTTGTTGATGCATTGCGAATACATCGAGTAACGAACAGTCTTGAGCGTGCCCTGGGAGTCCTAGAAGGTCATCAACCGTGGAt > 1:67554/1‑151 (MQ=255) | GCTCTGTGTTCATTCCAAAAATGCCGCCATGCTCATGGCTATGACCTTCATGCCCGGCTTGGTCATCAGGGCGTTCAAGCAAACTCTTCATAACTCGTCCCTTCTGGGGTCAAGGCTTCCAATTGCCCTCTGCAGTTGGGGAGCCGTCTCTGTTGGTTGGCTAAGATCTATTGCACGGTTTGCCCGAGCCCAGGCGTTAACATTTCGAAGCTATGGGGTATCGGGCGTAATAAAAAATGCCAGGCACTGCCTGGCATTTATGAATTCTCTAATTGTTCTGTTCAAATCGTTTACTACTTGTTGTTGATGCATTGCGAATACATCGAGTAACGAACAGTCTTGAGCGTGCCCTGGGAGTCCTCGAAGGTCATCAACCGTGGATAGACCTGGCAGGTACGGGGGTCCTGCGACTGACGTACGAATTTCGCAACGTCTATCTTCATGCCATATTTGTAATCCTGAA > AE015451/45434‑45896 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |