New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 1200130 | 38 (0.870) | 5 (0.120) | 4/324 | NT | 11.6% | coding (985/1203 nt) | gspF | putative protein secretion protein for export |
? | AE015451 | = 1200145 | 40 (0.970) | coding (1000/1203 nt) | gspF | putative protein secretion protein for export |
CAGGTGCTGGAAAGCGCGCGTCTGGCGCGCAGCCTGGCGATTCTCTGTGGCAGTGGCGTGGCCCTGCTCGAAGCCTTGCAAGTGGCCACCGAAACCATCGGCAACCGGCGTATCCGCCTGGCCATGGAGCAGGTGCGCCAACACGTGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGTCGATACCGCCATGGCGCTGTTCGAA‑CCCCTGATGATCCTGGTGATGGGCGCCGTGGTGCTGTTCATCGTGCTGGCGGTGCTGCTGCCGATCATGCAACTCAACCAGGGCCTGCAATTGTGACGACGAG > AE015451/1199926‑1200355 | cAGGTGCTGGAAAGCGCGCGTCTGGCGCGCAGCCTGGCGATTCTCTGTGGCAGTGGCGTGGCCCTGCTCGAAGCCTTGCAAGTGGCCACCGAAACCATCGGCAACCGGCGTATCCGCCTGGCCATGGAGCAGGTGCGCCAACACGTGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGgcagcggcggg < 1:507371‑M2/231‑12 (MQ=255) gTCTGGCGCGCAGCCTGGCGATTCTCTGTGGCAGTGGCGTGGCCCTGCTCGAAGCCTTGCAAGTGGCCACCGAAACCATCGGCAACCGGCGTATCCGCCTGGCCATGGAGCAGGTGCGCCAACACGTGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCg < 1:390174/219‑1 (MQ=255) ccTGGCGATTCTCTGTGGCAGTGGCGTGGCCCTGCTCGAAGCCTTGCAAGTGGCCACCGAAACCATCGGCAACCGGCGTATCCGCCTGGCCATGGAGCAGGTGCGCCAACACGTGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGgcagcgg < 2:390172‑M2/195‑8 (MQ=255) ccTGGCGATTCTCTGTGGCAGTGGCGTGGCCCTGCTCGAAGCCTTGCAAGTGGCCACCGAAACCATCGGCAACCGGCGTATCCGCCTGGCCATGGAGCAGGTGCGCCAACACGTGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTg > 1:320466/1‑235 (MQ=255) ttgcgtggcCCTGCTCGAAGCCTTGCAAGTGGCCACCGAAACCATCGGCAACCGGCGTATCCGCCTGGCCATGGAGCAGGTGCGCCAACACGTGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGctgctg < 2:398058/152‑1 (MQ=255) ggcgtggcCCTGCTCGAAGCCTTGCAAGTGGCCACCGAAACCATCGGCAACCGGCGTATCCGCCTGGCCATGGAGCAGGTGCGCCAACACGTGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGc > 1:371924/1‑215 (MQ=255) gcgtggcCCTGCTCGAAGCCTTGCAAGTGGCCACCGAAACCATCGGCAACCGGCGTATCCGCCTGGCCATGGAGCAGGTGCGCCAACACGTGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCtt > 1:510088/1‑235 (MQ=255) tCGAGGCCTTGCGAGTGGCCACCGAACCCATCGGCAACCGGCGTATCCGCCTGGCCATGGAGCAGGCGCGCCAACACGTGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGgcagcggcgggaattgctggctggcat > 1:321744‑M2/1‑153 (MQ=255) cGAAGCCTTGCAAGTGGCCACCGAAACCATCGGCAACCGGCGTATCCGCCTGGCCATGGAGCAGGTGCGCCAACACGTGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCg > 1:502110/1‑170 (MQ=255) cGAAGCCTTGCAAGTGGCCACCGAAACCATCGGCAACCGGCGTATCCGCCTGGCCATGGAGCAGGTGCGCCAACACGTGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCCGGCGGCCATGCCCGAccg > 2:257064/1‑195 (MQ=255) ccTTGCAAGTGGCCACCGAAACCATCGGCAACCGGCGTATCCGCCTGGCCATGGAGCAGGTGCGCCAACACGTGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCgg < 1:720334/166‑1 (MQ=255) aaGTGGCCACCGAAACCATCGGCAACCGGCGTATCCGCCTGGCCATGGAGCAGGTGCGCCAACACGTGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGTCGATACCGCCATg > 1:458640/1‑236 (MQ=255) gCCACCGAAACCATCGGCAACCGGCGTATCCGCCTGGCCATGGAGCAGGTGCGCCAACACGTGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGc < 2:530745/172‑1 (MQ=255) aCCGAAACCATCGGCAACCGGCGTATCCGCCTGGCCATGGAGCAGGTGCGCCAACACGTGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTgg > 2:388383/1‑160 (MQ=255) aaaCCATCGGCAACCGGCGTATCCGCCTGGCCATGGAGCAGGTGCGCCAACACGTGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGt < 2:297552/211‑1 (MQ=255) cAACCGGCGTATCCGCCTGGCCATGGAGCAGGTGCGCCAACACGTGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGTCGATACCGCCATGgcg > 2:478475/1‑217 (MQ=255) tATCCGCCTGGCCATGGAGCAGGTGCGCCAACACGTGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCg > 2:185563/1‑139 (MQ=255) cATGGAGCAGGTGCCCCAACACGTGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGTCGa < 2:639369/183‑1 (MQ=255) aTGGAGCAGGTGCGCCAACACGTGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGgcagcggcgggaattgc > 1:771215‑M2/1‑97 (MQ=255) gcgcCAACACGTGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCgacgac > 1:89237/1‑142 (MQ=255) gcgcCAACACGTGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGTCGATACCGCCATGGCGCTGTTCGAA‑CCCCTGATGATCCTGGTGAt > 2:425130/1‑213 (MQ=255) gcgcCAACACGTGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGTCGATACCGCCATGGCGCTGTTCGAA‑CCCCTGATGATCCTGGTGAt < 1:425132/213‑1 (MQ=255) ccAACACGTGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGTCGATACCGCCATGGCGCTGTTCGAACCCCCTGATGATCCTGGTGATGGGCGCCGTGGTGCTGTTCATc < 1:275048/233‑1 (MQ=255) cGTGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGTCGATACCGCCATg < 1:620723/172‑1 (MQ=255) tGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGgcagcggcgggaattgctggctggcatccagc > 2:507369‑M2/1‑75 (MQ=255) cAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGTCGATACCGCCATGGCGCTGTTCGAA‑CCCCTGATGATCCTGGTGATGGgcg < 1:737018/205‑1 (MQ=255) gcACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGTCGATACCGCCATGGCGCTGTTCGAA‑CCCCTGATGATCCTGGTGATGGGCGCCGTGGTGCTGTTCATc < 2:775694/215‑1 (MQ=255) ccccagCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGgcagcggcgggaattgctggctggcatccagc > 2:562874‑M2/3‑65 (MQ=255) cAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGTCGATACCGCCATGGCGCTGTTCGAA‑CCCCTGATGATCCTGGTGATGGGCGCCGTGGTGCTGTTCATCGTGCTGGCGGTGCTGCTGCCGATCa > 1:338040/1‑236 (MQ=255) ccTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGtt < 2:62151/58‑1 (MQ=255) tGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGTCGATACCGCCATGGCGCTGt > 1:375326/1‑159 (MQ=255) tGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGTCGATACCGCCATGGCGCTGt < 2:375324/159‑1 (MQ=255) gcgcTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGTCGATACCGCCATGGCGCTGTTCGAA‑CCCCtga < 2:340674/163‑1 (MQ=255) gcTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCcaaccatgttcaccagcagcggcgggaattgctggctggcatccagcgcacggtgcaggctggtgccgccctgca > 2:507369‑M1/1‑32 (MQ=255) gcTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCcaaccatgttcaccagcagcggcgggaattgctggctggcatccagcgcacggtgcaggctgggg > 2:562874‑M1/1‑32 (MQ=255) gcTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGc > 2:260703/1‑124 (MQ=255) gcTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGTCGATACCGCCATGGCGCTGTTCGAA‑CCCCTGATGATCCTGGTGATGGGCGCCGTGGTGCTGtt > 1:586402/1‑192 (MQ=255) gcTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGTCGATACCGCCATGGCGCTGTTCGAA‑CCCCTGATGATCCTGGTGATGGGCGCCGTGGTGCTGTTCATCGTGCTGGCggg > 1:190563/1‑206 (MQ=255) gcTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGTCGATACCGCCATGGCGCTGTTCGAA‑CCCCTGATGATCCTGGTGATGGGCGCCGTGGTGCTGTTCATCGTGCTGGCGGTGCTGCTGCCGATCATGCCACTCAACCAgg > 1:466356/1‑236 (MQ=255) gcTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGTCGATACCGCCATGGCGCTGTTCGAA‑CCCCTGATGATCCTGGTGATGGGCGCCGTGGTGCTGTTCATCGTGCTGGCGGTGCTGCTGCCGATCATGCAACTCAACCAgg > 1:648353/1‑236 (MQ=255) cTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGTCGATACCGCCATGGCGCTGTTCGAA‑CCCCTGATGATCCTGGTGATGGGCGCCGTGGTGCTGTTCATCGTGCTGGCGGTGCTGCTGCCGATCATGCAACTCAACCAgg > 1:721728/1‑235 (MQ=255) aTGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCcaaccatgttcaccagcagcggcgggaattgctggctggcatccagcgcacggtgcaggctggtgccgccctgcacgtgttggcgcgcctgctccatggccaggcggatacgccggttgccgatgggttcggtggccactcgcaaggcctcga > 1:321744‑M1/1‑27 (MQ=255) agccagcAATTCCCGCCGCTGCcaaccatgttcaccagcagcggc > 2:390349‑M1/1‑22 (MQ=255) gcAATTCCCGCCGCTGCcaaccatgttcaccagcagcggcgggaattgctggctggcatccagcgcacggtgcaggctggtgccgccctgcacgtgttggcgcacctgctccat > 1:771215‑M1/1‑17 (MQ=255) gcAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGTCGGTACCGCCATGGCGCt > 2:111920/1‑132 (MQ=255) aTTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGTCGATACCGCCATGGCGCTGTTCGAA‑CCCCTGATGATCCTGGTGATGGGCGCCGTGGTGCTGTTCATCGTGCTGGCGGTGCTGCTGCCGATCATGCAACTCAACCAGGGCCTGCAATTGTgacg < 2:510086/234‑1 (MQ=255) tgcccGCCGCTGCTGGGGAACAGGGTGGGCAGCGGCGGGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGTCGATACCGCCATGGCGCTGTTCGAA‑CCCCTGATGATCCTGGTGAt < 2:261857/153‑1 (MQ=255) cccGCCGCTGCcaaccatgttcaccagcagcggcgggaattgctggctggcatccagcgcacggtgcaggctggtgccgccctgcacgtgttggcgcacctgctccatggccaggcggatacgccggttgccgatggtttcggtggccacttgcaaggcttcgagcagggccacgccactgccacagagaatcgccaggctgcgcgccagacgcgcgctttccagcacctg < 1:507371‑M1/231‑221 (MQ=255) tcgccgcTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGTCGATACCGCCATGGCGCTGTTCGAA‑CCCCTGATGATCCTGGTGATGGGCGCCGTGGTGCTGTTCATCGTGCTGGCGGTGCTGCTGCCGATCATGCAACTCAACCAGGGCCTGCAATTGTGACGACgag > 1:596271/2‑235 (MQ=255) ccgccgCTGCTGGTGACCATGGTGGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGTCGATACCGCCATGGCGCTGTTCGAA‑CCCCTGATGATCCTGGTGATGGGCGCCGTGGTGCTGTTCATCGTGCTGGCGGTGCTGCTGCCGATCATGCAACTCAACCAGGGCCTGCAATTGTgacgac < 1:156358/232‑1 (MQ=255) gccgcTGCTGGTGAACATGGTTGgcagcggcgggaattgctggct > 2:390349‑M2/1‑23 (MQ=255) gccgcTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGTCGATACCGCCATGGCGCTGTTCGAA‑CCCCTGATGATCCTGGTGATGGGCGCCGTGGTGCTATTCATCGTGCTGGCGGTGCTGCTGCCGATCATGCAACTCAACCAGGGCCt > 1:433113/1‑216 (MQ=255) ccgcTGCcaaccatgttcaccagcagcggcgggaattgctggctggcatccagcgcacggtgcaggctggtgccgccctgcacgtgttggcgcacctgctccatggccaggcggatacgccggttgccgatggtttcggtggccacttgcaaggcttcgagcagggccacgccactgccacagagaatcgccagg < 2:390172‑M1/195‑189 (MQ=255) | CAGGTGCTGGAAAGCGCGCGTCTGGCGCGCAGCCTGGCGATTCTCTGTGGCAGTGGCGTGGCCCTGCTCGAAGCCTTGCAAGTGGCCACCGAAACCATCGGCAACCGGCGTATCCGCCTGGCCATGGAGCAGGTGCGCCAACACGTGCAGGGCGGCACCAGCCTGCACCGTGCGCTGGATGCCAGCCAGCAATTCCCGCCGCTGCTGGTGAACATGGTTGGCAGCGGCGAGGCCAGCGGCACCCTGGCGGACATGCTCGAGCGCGTGGCCGACGACCAGGAGCGCGGCTTTGCCCGCCAGGTCGATACCGCCATGGCGCTGTTCGAA‑CCCCTGATGATCCTGGTGATGGGCGCCGTGGTGCTGTTCATCGTGCTGGCGGTGCTGCTGCCGATCATGCAACTCAACCAGGGCCTGCAATTGTGACGACGAG > AE015451/1199926‑1200355 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |