New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 1346844 = | 43 (0.980) | 3 (0.070) | 3/328 | NT | 7.3% | coding (49/807 nt) | udh | uronate dehydrogenase |
? | AE015451 | 1346872 = | 35 (0.840) | coding (21/807 nt) | udh | uronate dehydrogenase |
GCCGCAGATATTGGGGCCGAGAATCTCTTCGAAGGCGTGTTCGGTAGAAACCCCGCCAAAGTGGATGATGGCGTCTACGCCCTCGACCAGGGTATGCACCGCAGCCTTGTCGGCCAGGTCACAGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTAC > AE015451/1346611‑1347052 | gccgcAGATATTGGGGCCGAGAATCTCTTCGAAGGCGTGTTCGGTAGAAACCCCGCCAAAGTGGATGATGGCGTCTACGCCCTCGACCAGGGTATGCACCGCAGCCTTGTCGGCCAGGTCACAGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGgccgc < 1:61304/236‑1 (MQ=255) gggCCGAGAATCTCTTCGAAGGCGTGTTCGGTAGAAACCCCGCCAAAGTGGATGATGGCGTCTACGCCCTCGACCAGGGTATGCACCGCAGCCTTGTCGGCCAGGTCACAGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGt < 1:623095/236‑1 (MQ=255) gagaATCTCTTCGAAGGCGTGTTCGGTAGAAACCCCGCCAAAGTGGATGATGGCGTCTACGCCCTCGACCAGGGTATGCACCGCAGCCTTGTCGGCCAGGTCACAGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGagc > 1:511648/1‑235 (MQ=255) gagaATCTCTTCGAAGGCGTGTTCGGTAGAAACCCCGCCAAAGTGGATGATGGCGTCTACGCCCTCGACCAGGGTATGCACCGCAGCCTTGTCGGCCAGGTCACAGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCGTGACCAGgccg > 1:265156/1‑217 (MQ=255) ttCGAAGGCGTGTTCGGTAGAAACCCCGCCAAAGTGGATGATGGCGTCTACGCCCTCGACCAGGGTATGCACCGCAGCCTTGTCGGCCAGGTCACAGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTg < 2:734429/212‑1 (MQ=255) gtTCGGTAGAAACCCCGCCAAAGTGGATGATGGCGTCTACGCCCTCGACCAGGGTATGCACCGCAGCCTTGTCGGCCAGGTCACAGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTa > 1:272386/1‑236 (MQ=255) tCGGTAGAAACCCCGCCAAAGTGGATGATGGCGTCTACGCCCTCGACCAGGGTATGCACCGCAGCCTTGTCGGCCAGGTCACAGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGt > 1:145193/1‑236 (MQ=255) cccGCCAAAGTGGATGATGGCGTCTACGCCCTCGACCAGGGTATGCACCGCAGCCTTGTCGGCCAGGTCACAGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCg < 1:192689/236‑1 (MQ=255) aaaGTGGATGATGGCGTCTACGCCCTCGACCAGGGTATGCACCGCAGCCTTGTCGGCCAGGTCACAGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGc > 1:131549/1‑203 (MQ=255) aaaGTGGATGATGGCGTCTACGCCCTCGACCAGGGTATGCACCGCAGCCTTGTCGGCCAGGTCACAGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGctct > 1:677003/1‑235 (MQ=255) aaaGTGGATGATGGCGTCTACGCCCTCGACCAGGGTATGCACCGCAGCCTTGTCGGCCAGGTCACAGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGGAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCGGGCGGTTGACggggggggtg > 2:186988/1‑215 (MQ=255) ggATGATGGCGTCTACGCCCTCGACCAGGGTATGCACCGCAGCCTTGTCGGCCAGGTCACAGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTtgttgt > 1:137780/1‑236 (MQ=255) tCTACGCCCTCGACCAGGGTATGCACCGCAGCCTTGTCGGCCAGGTCACAGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTtgttgt < 1:370738/235‑1 (MQ=255) cTACGCCCTCGACCAGGGTATGCACCGCAGCCTTGTCGGCCAGGTCACAGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTa < 1:69856/235‑1 (MQ=255) aCGCCCTCGACCAGGGTATGCACCGCAGCCTTGTCGGCCAGGTCACAGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAgttgt < 2:751317/229‑1 (MQ=255) aCCAGGGTATGCACCGCAGCCTTGTCGGCCAGGTCACAGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATg < 1:691813/236‑1 (MQ=255) gTATGCCCCGCAGCCTGGTCGGACAGGTCACAGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGagca < 1:126039/163‑1 (MQ=255) ccGCAGCCTTGTCGGCCAGGTCACAGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGag < 2:404463/154‑1 (MQ=255) cGCAGCCTTGTCGGCCAGGTCACAGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTgg < 1:186990/228‑1 (MQ=255) gCCTTGTCGGCCAGGTCACAGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGCCATGGCCGGCTCttggt > 2:644461/1‑191 (MQ=255) cctgggcGGCCCGGTCACAGGTACTGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAggggg < 2:167372/162‑1 (MQ=255) ccTTGTCGGCCAGGTCACAGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAgcagca < 1:318296/153‑1 (MQ=255) ccTTGTCGGCCAGGTCACAGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAgcagca > 2:318294/1‑153 (MQ=255) ccTTGTCGGCCAGGTCACAGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCg > 1:280000/1‑236 (MQ=255) gTCGGCCAGGTCACAGGTAATGCCTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTgg < 1:86642/219‑1 (MQ=255) ggCCAGGTCACAGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTAt > 1:185292/1‑209 (MQ=255) caGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTg < 1:282249/144‑1 (MQ=255) gTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCaa < 1:135988/236‑1 (MQ=255) cccaagcctcatcgacaacacacggaaccaccgccaataatcacccaagtcatacgacaacctacaactaacaacaagagccggccatgaccactacccccttcaatCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTtgttgt > 2:306796‑M1/108‑172 (MQ=255) aTGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGa < 1:291207/236‑1 (MQ=255) aCTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAggg > 2:789405/1‑140 (MQ=255) cttcttCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCt > 1:486582/1‑236 (MQ=255) cATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCg > 2:177704/1‑110 (MQ=255) cATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCgg > 2:215476/1‑151 (MQ=255) aTGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACtt < 2:137778/187‑1 (MQ=255) tGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGGAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTGATGGAAGGGTGTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGtt > 2:146332/1‑174 (MQ=255) cGGGCCCGCGGCCGTGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCtgtg < 2:673626/210‑1 (MQ=255) acacagaaccaccgccaataatcacccaagtcatacgacaacctacaacaactaacaacaagagccggccatgaccactacccccttcaatCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGGAGGGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTg < 1:186795‑M1/81‑1 (MQ=255) gcgGCCGGGGCCAGGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGGCCTCGGCGTAGCCGTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCggtgg < 2:236611/196‑1 (MQ=255) accaccgccaataatcacccaagtcatacgacaacctacaacaactaacaacaagagccggccatgaccactacccccttcaatCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCt > 1:202341‑M1/85‑199 (MQ=255) gCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCg < 1:767718/189‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTc < 2:145191/187‑1 (MQ=255) aGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCggtgg < 2:311400/170‑1 (MQ=255) cAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTTGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTaa < 1:28433/221‑1 (MQ=255) tCGGCGTGGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCGTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATg < 2:221116/131‑1 (MQ=255) ggCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTAc > 1:293148/1‑236 (MQ=255) ttCGCGAAGGACCTTGCCCAGACCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTg < 2:714665/104‑1 (MQ=255) cgAAGGGCCTTGCCCAGGACGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGAGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCttgttg < 1:164737/83‑1 (MQ=255) | GCCGCAGATATTGGGGCCGAGAATCTCTTCGAAGGCGTGTTCGGTAGAAACCCCGCCAAAGTGGATGATGGCGTCTACGCCCTCGACCAGGGTATGCACCGCAGCCTTGTCGGCCAGGTCACAGGTAATGACTTCTTCATGCGGGCCCGCGGCCGGGGCCATGGGGCTGATGTCAGACAGGCGCAGGACCTCGGCGTAGCCTTTCAGGCGTTCGCGAAGGACCTTGCCCAGGCCGCCTGCGGCTCCGGTGAGCAGCAGGCGATTGAAGGGGGTAGTGGTCATGGCCGGCTCTTGTTGTTAGTTGTTGTAGGTTGTCGTATGACTTGGGTGATTATTGGCGGTGGTTCTGTGTGTTGTCAATGAGGCTTGGGCGGCTTTTGCCGGCCTTTCGCGGGTAAGAAATGCGAAAGGCCTGCGCGGTCGCCCGTAGGAGCGGGTTTAC > AE015451/1346611‑1347052 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |