| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 1737987 = | 59 (1.350) | 9 (0.230) | 9/308 | NT | 15.2% | coding (32/348 nt) | yffB | putative glutathione‑dependent thiol reductase |
| ? | AE015451 | = 1777401 | 47 (1.200) | intergenic (+135/+157) | PP_5476/PP_1585 | conserved protein of unknown function/putative Antidote protein | |||||
CGGCTGGGCCAGCATCAGCTCGACGGCCTTGGCCTGGTCGAGGTCTGCCTTGCTGGCGTCGTCCAGCTTGCGGAAGGTGGTGCCGGCACGGTTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAACGGTGACCCAGCAGTCGCTGTGCATCTCGACCTTCTTCGTCATGTAGCCTGGCCGCCAGGGACCGCT > AE015451/1737758‑1738216 | ggatctcgagttgtttcggtttgagaatttttcagatcaagatcacggacggatcttggtcggcagaacgcctgggaaggatatcgttgcgtaaatcttccccaaaatgcatccgtaaacacctgattctattggggtcgaaacgaacaaaaaaggcgcaattccgatgcgccatatttgctttaaggcattgatttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAGGCt > 1:501311‑M1/230‑235 (MQ=255)ggatctcgagttgtttcggtttgagaatttttcagatcaagatcacggacggatcttggtcggcagaacgcctgggaaggatatcgttgcgtaaatcttccccaaaatgcatccgtaaacacctgattctattggggtcgaaacgaacaaaaaaggcgcaattccgatgcgccatatttgctttaaggcattgatttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAGGCt > 1:505899‑M1/230‑235 (MQ=255) gatctcgagttgtttcggtttgagaatttttcagatcaagatcacggacggatcttggtcggcagaacgcctgggaaggatatcgttgcgtaaatcttccccaaaatgcatccgtaaacacctgattctattggggtcgaaacgaacaaaaaaggcgcaattccgatgcgccatatttgctttaaggcattgatttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAGGCttt > 1:376364‑M1/229‑236 (MQ=255) gcggggCCAGCAGCAGCTCGCCGGCCTTGGCCTGGTCGAGGTCTGCCTTGCTGGCGTCGTCCAGCTTGCGGAAGGTGGTGCCGGCACGGTTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCtt < 1:147248/231‑1 (MQ=255) ggCCAGCATCAGCTCGACGGCCTTGGCCTGGTCGAGGTCTGCCTTGCTGGCGTCGTCCAGCTTGCGGAAGGTGGTGCCGGCACGGTTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGCTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACGGGCTTTGAt > 1:724360/1‑234 (MQ=255) gttgtttcggtttgagaatttttcagatcaagatcacggacggatcttggtcggcagaacgcctgggaaggatatcgttgcgtaaatcttccccaaaatgcatccgtaaacacctgattctattggggtcgaaacgaacaaaaaaggcgcaattccgatgcgccatatttgctttaaggcattgatttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAGGCTTTGATGCCg < 1:603499‑M1/15‑1 (MQ=255) tgtttcggtttgagaatttttcagatcaagatcacggacggatcttggtcggcagaacgcctgggaaggatatcgttgcgtaaatcttccccaaaatgcatccgtaaacacctgattctattggggtcgaaacgaacaaaaaaggcgcaattccgatgcgccatatttgctttaaggcattgatttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAGGCTTTGATGCCGt > 2:611378‑M1/219‑234 (MQ=255) cAGCTCGACGGCCTTGGCCTGGTCGAGGTCTGCCTTGCTGGCGTCGTCCAGCTTGCGGAAGGTGGTGCCGGCACGGTTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAgg > 1:218097/1‑218 (MQ=255) agaatttttcagatcaagatcacggacggatcttggtcggcagaacgcctgggaaggatatcgttgcgtaaatcttccccaaaatgcatccgtaaacacctgattctattggggtcgaaacgaacaaaaaaggcgcaattccgatgcgccatatttgctttaaggcattgatttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTc > 2:232703‑M1/207‑236 (MQ=255) gAGGTCTGCCTTGCTGGCGTCGTCCAGCTTGCGGAAGGTGGTGCCGGCACGGTTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAgtg > 2:280180/1‑214 (MQ=255) gTCTGCCTTGCTGGCGTCGTCCAGCTTGCGGAA‑‑‑GGTGCCGGCACGGTTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGt < 2:581484/200‑1 (MQ=255) acggacggatcttggtcggcagaacgcctgggaaggatatcgttgcgtaaatcttccccaaaatgcatccgtaaacacctgattctattggggtcgaaacgaacaaaaaaggcgcaagtccgatgcgccatatttgctttaaggcattgatttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAgg > 1:176887‑M1/186‑189 (MQ=255) 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tttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAACGGTGACCCAGCAGTCGCTGTGCATCTCGACcttctt < 1:527420‑M1/200‑1 (MQ=255) tCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAACGGTGACCcagc > 2:369889/1‑208 (MQ=255) gcGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAACGGTGAccc < 2:229497/204‑1 (MQ=255) gCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAACGGTGACCCAGCAGTCGCTGTGCATCTCGACCTTCTTCGTCATg > 2:555889/1‑236 (MQ=255) 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1:578844/204‑1 (MQ=255) ccTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAACGGTGACCCAGCAGTCGCTGTGCATCTCGACcttc < 2:550885/215‑1 (MQ=255) gtgtgtCATGGTGTCACGGGCTTTGATGCCGTACAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGTGCTGTGATTACTCCCCAACACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTAGGCGACATCGAt < 2:3651/125‑1 (MQ=255) ttttCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAACGGTGACCca < 1:491089/187‑1 (MQ=255) cATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAACGGTGACCCAGCAGTCGCTGTGCATCTCGACCTTCTTCGTCATGTAGcc > 2:551420/1‑222 (MQ=255) 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CGGCTGGGCCAGCATCAGCTCGACGGCCTTGGCCTGGTCGAGGTCTGCCTTGCTGGCGTCGTCCAGCTTGCGGAAGGTGGTGCCGGCACGGTTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAACGGTGACCCAGCAGTCGCTGTGCATCTCGACCTTCTTCGTCATGTAGCCTGGCCGCCAGGGACCGCT > AE015451/1737758‑1738216 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |