| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 1737987 = | 59 (1.350) | 9 (0.230) | 9/308 | NT | 15.2% | coding (32/348 nt) | yffB | putative glutathione‑dependent thiol reductase |
| ? | AE015451 | = 1777401 | 47 (1.200) | intergenic (+135/+157) | PP_5476/PP_1585 | conserved protein of unknown function/putative Antidote protein | |||||
GGATCTCGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCGATGATCTCATCGCCGTGTTGCTGTTCGGCTGTGCGCAGATCGAAGGCCG > AE015451/1777173‑1777634 | ggATCTCGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggct > 1:501311‑M2/1‑229 (MQ=255)ggATCTCGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggct > 1:505899‑M2/1‑229 (MQ=255) gATCTCGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggcttt > 1:376364‑M2/1‑228 (MQ=255) gttgttTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccg < 1:603499‑M2/235‑16 (MQ=255) tgttTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgt > 2:611378‑M2/1‑218 (MQ=255) gTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCgtgt < 1:349284/236‑1 (MQ=255) agaATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtc > 2:232703‑M2/1‑206 (MQ=255) tttCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCAtt < 1:669306/233‑1 (MQ=255) aagatcaCGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTagag < 1:566660/211‑1 (MQ=255) caCGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCAt > 2:345909/1‑218 (MQ=255) acggacggATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAAGTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcagg > 1:176887‑M2/1‑185 (MQ=255) aTCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTggg < 2:382518/222‑1 (MQ=255) ttGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTgg < 1:417556/218‑1 (MQ=255) tCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAAGCTTCCCCAAAATGCATGCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCAt < 2:435145/202‑1 (MQ=255) gCAGAACACCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCGATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgt > 2:412763‑M2/1‑167 (MQ=255) aCGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGc < 1:431796/212‑1 (MQ=255) cTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCAATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGa < 1:718860/236‑1 (MQ=255) cGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggctgggattactccccaaaacctccccaatatctcccaaaaattag < 1:16967‑M2/236‑92 (MQ=255) gCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggct > 2:650513‑M2/1‑141 (MQ=255) tAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGc < 1:627845/236‑1 (MQ=255) aaaTCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCg > 1:332554/1‑236 (MQ=255) cAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATCTTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGcc > 2:359944/1‑185 (MQ=255) cAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCACTCTCTCCGTTTTTCGATg > 2:495948/1‑207 (MQ=255) cAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATcc > 1:353250/1‑236 (MQ=255) gCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCgcgg < 1:212483/236‑1 (MQ=255) 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cGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCa > 2:215403/1‑79 (MQ=255) cGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATgtgt < 2:739541/174‑1 (MQ=255) ggTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATc < 2:618436/164‑1 (MQ=255) aaCTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCgat > 2:4478/1‑198 (MQ=255) aaCTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGAGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGTCCAGACGCTGGACCGACCCgat > 2:413126/1‑198 (MQ=255) gCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCGATGATCTCATCGCCGTGTTGCTGTTCGGCTGTGCGCAGATCGa < 2:332552/233‑1 (MQ=255) cGTCCCAGGCTGTGATGCCGTAGAGCTTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCGATGATCTCATCGCCGTGTTGCt < 2:584401/211‑1 (MQ=255) cccAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCGATGATCTCATCGCCGTGTTGCTGTTCGGCTGTGCGCAGATCGAAGGCCg > 1:772926/1‑235 (MQ=255) ccAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCGATGATCTCATCGCCGTGTTGCTGTTCGGCTGTGCGCAGAt < 2:396651/225‑1 (MQ=255) | GGATCTCGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCGATGATCTCATCGCCGTGTTGCTGTTCGGCTGTGCGCAGATCGAAGGCCG > AE015451/1777173‑1777634 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |