| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 1747861 = | 68 (1.560) | 4 (0.100) | 4/326 | NT | 5.8% | intergenic (‑353/+178) | PP_5473/PP_5474 | putative transcriptional regulator, LuxR family/conserved protein of unknown function of phage origin |
| ? | AE015451 | 1747917 = | 65 (1.560) | intergenic (‑409/+122) | PP_5473/PP_5474 | putative transcriptional regulator, LuxR family/conserved protein of unknown function of phage origin | |||||
CATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGTTGCGCGGCACCCATCCGCTGCTGGTCTTCAC > AE015451/1747648‑1748092 | cATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCa < 1:186008/236‑1 (MQ=255) cGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCg > 1:199991/1‑224 (MQ=255) aTAGTGATCGTGCCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCt < 1:32608/236‑1 (MQ=255) aGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGGGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTg > 1:63255/1‑235 (MQ=255) gTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGt > 1:219496/1‑236 (MQ=255) tCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTg < 2:676186/235‑1 (MQ=255) ttcgttggctgcatggtgaagaccagcagcggatgggtgccgcgcaacgaactgcgcacacagcagtagcaccgcgtcagcctgacggaaactgcccggtacacctagctccccatcgccaggctgcatcggtgtgtgatctgaatgcgcagaccgcgcacaactggaagtggtcagcccgtctggcgtatGCCgg > 2:727855‑M1/192‑196 (MQ=255) cATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCCCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTg > 1:138544/1‑233 (MQ=255) ttttGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTa < 1:699081/236‑1 (MQ=255) ggTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGTACGTCCCGACCGATGCACTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCCGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCt < 1:499433/225‑1 (MQ=255) gTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCAt > 2:706404/1‑216 (MQ=255) tGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCtt < 2:374558/184‑1 (MQ=255) cgcaacgaactgcgcacacagcagtagcaccgcgtcagcctgacggaaactgcccggtacacctagctccccatcgccaggctgaatcggtgtgtgatctgaatgcgcagaccgggaacaaatggaagtggtcagcccgtctggcgtatGCCgg < 2:395617‑M1/5‑1 (MQ=255) tcccTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCGGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGc < 2:117170/209‑1 (MQ=255) ggACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCAtt > 1:17320/1‑236 (MQ=255) gACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGgcg < 2:501591/132‑1 (MQ=255) cAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCg < 2:228973/182‑1 (MQ=255) gggAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATcac < 1:236854/236‑1 (MQ=255) gCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACAcc > 1:581494/1‑235 (MQ=255) aaCGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGCCGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCCGt > 2:712681/1‑210 (MQ=255) gACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGa < 2:254605/215‑1 (MQ=255) aCCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCt > 2:91313/1‑178 (MQ=255) aCCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGc > 1:674177/1‑236 (MQ=255) ccGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCCGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGc > 1:259912/1‑230 (MQ=255) gATGCAGTGGGTTTAAGTTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCa < 1:271509/209‑1 (MQ=255) cAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATggg > 1:14510/1‑235 (MQ=255) gcGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCTGACGGGCTGACCACTTCCAGTTCTGCGCGGTCTGCGCAt < 2:446337/198‑1 (MQ=255) tttAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGCTGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAg > 1:176028/1‑235 (MQ=255) aaGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATcac < 1:687428/201‑1 (MQ=255) gTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTAcc < 1:91314/236‑1 (MQ=255) tGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTAcc < 2:482541/234‑1 (MQ=255) gatggggatgggTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCg > 2:294242/1‑234 (MQ=255) ggggatgggTCTTATGGGCTGGAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGc < 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ggTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTgag > 2:63671/1‑171 (MQ=255) gTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATgg < 2:416174/207‑1 (MQ=255) caggctgcatcggtgtgtgatctgaatgcgcagaccgcgcacaactggaagtggtcagcccgtctggcgtatGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCtt < 2:383303‑M1/27‑1 (MQ=255) caggctgcatcggtgtgtgatctgaatgcgcagaccgcgcacaactggaagtggtcagcccgtctggcgtatGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCtt > 1:383305‑M1/73‑99 (MQ=255) gCTGTAAGGTGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGAcg < 1:349248/236‑1 (MQ=255) 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gggTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCg < 1:706406/156‑1 (MQ=255) ggTGTGTGATCTGACCGGCGCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAGCCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGAcg < 2:262997/197‑1 (MQ=255) gtgATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGtt > 2:113069/1‑105 (MQ=255) tgATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTg < 2:581492/188‑1 (MQ=255) gATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTccgc > 2:142659/1‑122 (MQ=255) aTCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTGTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGTTGCGCGGCACCCATCCg < 1:273069/234‑1 (MQ=255) tCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCAt > 2:154223/1‑26 (MQ=255) tCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGTTGCGCGGCACCCATCCgc > 1:793900/1‑234 (MQ=255) aCCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGTTGCGCGGCACCCATCCg < 2:563923/229‑1 (MQ=255) ccGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGTTGCGCGGCACCCATCCGctgctg > 1:206895/1‑234 (MQ=255) cGGCTCGGCGCCGGGTGCATTTTGTCGGCGCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGtt < 2:64596/211‑1 (MQ=255) ggCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGTTGCGCGGCACCCATCCGCTGCTGGTc > 1:57631/1‑235 (MQ=255) cTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCGACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATgg < 2:10151/141‑1 (MQ=255) ggCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGTTgcg < 2:309051/208‑1 (MQ=255) ggCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGTTGCGCGGCACCCATCCGCTGCTGGTCTTCAc > 1:612554/1‑235 (MQ=255) gcgcCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCgg > 2:543114/1‑178 (MQ=255) | CATGCGCCGATAGTGATCGTGTCCATTTTTGATCTCGGTGTGGGCTGCATTGGTCGTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGTTGCGCGGCACCCATCCGCTGCTGGTCTTCAC > AE015451/1747648‑1748092 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |