| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 1747861 = | 68 (1.560) | 4 (0.100) | 4/326 | NT | 5.8% | intergenic (‑353/+178) | PP_5473/PP_5474 | putative transcriptional regulator, LuxR family/conserved protein of unknown function of phage origin |
| ? | AE015451 | 1747917 = | 65 (1.560) | intergenic (‑409/+122) | PP_5473/PP_5474 | putative transcriptional regulator, LuxR family/conserved protein of unknown function of phage origin | |||||
GTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGTTGCGCGGCACCCATCCGCTGCTGGTCTTCACCATGCAGCCAACGAATGCGGCGTAGCGGGTGTCGCGCTCGGTCTGGTGGC > AE015451/1747703‑1748142 | gTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCAt > 2:706404/1‑216 (MQ=255) tcccTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCGGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGc < 2:117170/209‑1 (MQ=255) ggACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCAtt > 1:17320/1‑236 (MQ=255) gggAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATcac < 1:236854/236‑1 (MQ=255) gCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACAcc > 1:581494/1‑235 (MQ=255) aaCGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGCCGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCCGt > 2:712681/1‑210 (MQ=255) gACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGa < 2:254605/215‑1 (MQ=255) aCCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCt > 2:91313/1‑178 (MQ=255) aCCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGc > 1:674177/1‑236 (MQ=255) ccGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCCGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGc > 1:259912/1‑230 (MQ=255) gATGCAGTGGGTTTAAGTTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCa < 1:271509/209‑1 (MQ=255) cAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATggg > 1:14510/1‑235 (MQ=255) gcGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCTGACGGGCTGACCACTTCCAGTTCTGCGCGGTCTGCGCAt < 2:446337/198‑1 (MQ=255) ggtacacctagctccccatcgccaggctgcatcggtgtgtgatctgaatgcgcagaccgcgcacaactggaagtggtcagcccgtctggcgtatgccggggtagcaccagcggttaccaggtaaagctgagccgaaaaaatgaccccggcATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATcacaca > 1:699522‑M2/151‑209 (MQ=255) tttAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGCTGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAg > 1:176028/1‑235 (MQ=255) aaGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATcac < 1:687428/201‑1 (MQ=255) gTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTAcc < 1:91314/236‑1 (MQ=255) tGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTAcc < 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gggatgggTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGGTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGt > 1:263301/1‑236 (MQ=255) gatgggTCGTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGc < 2:632980/207‑1 (MQ=255) ggTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTgag > 2:63671/1‑171 (MQ=255) gTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATgg < 2:416174/207‑1 (MQ=255) gCTGTAAGGTGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGAcg < 1:349248/236‑1 (MQ=255) ggtgtgtgatctgaatgcgcagaccgcgcacaactggaagtggtcagcccgtctggcgtatgccggggtagcaccagcggttaccaggtaaagctgagccgaaaaaatgaccccggcATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCa < 2:699520‑M2/46‑1 (MQ=255) gTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGAcg < 2:674175/233‑1 (MQ=255) tgtgtgatctgaatgcgcagaccgcgcacaactggaagtggtcagcccgtctggcgtatGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTAcc > 1:699522‑M1/60‑209 (MQ=255) tAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCCTTCCGATCACACACCGATGCAGc > 2:111426/1‑184 (MQ=255) tAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGt > 1:205586/1‑236 (MQ=255) ggCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGaa > 1:205763/1‑164 (MQ=255) cGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGc < 1:778488/204‑1 (MQ=255) cGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTActgc > 1:280729/1‑235 (MQ=255) gggCTTGCACCTTAAGGTCTGCCTGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTg < 2:81564/147‑1 (MQ=255) gggCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTcc > 1:152829/1‑210 (MQ=255) gggCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGCGCGCGCCCTgcg > 1:270449/1‑149 (MQ=255) ggCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTc < 2:510397/208‑1 (MQ=255) tgcgcagaccgcgcacaactggaagtggtcagcccgtctggcgtatGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACAcc < 2:699520‑M1/117‑1 (MQ=255) aaGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTg < 2:519761/164‑1 (MQ=255) gTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTGTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGa < 2:17320/204‑1 (MQ=255) cATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGTTGCGCgg < 1:294244/236‑1 (MQ=255) tGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCg < 2:126929/157‑1 (MQ=255) tGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCg > 1:126931/1‑157 (MQ=255) tGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTgcg > 2:309754/1‑219 (MQ=255) 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ggCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGTTGCGCGGCACCCATCCGCTGCTGGTCTTCAc > 1:612554/1‑235 (MQ=255) gcgcCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCgg > 2:543114/1‑178 (MQ=255) CGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGt < 2:772470‑M1/93‑1 (MQ=255) CGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGt > 1:772472‑M1/1‑93 (MQ=255) GGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGC‑TGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGTTGCGCGGCAc < 2:541290‑M1/207‑1 (MQ=255) TCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGTGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCg < 2:67042‑M1/193‑1 (MQ=255) TCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCAt > 2:356330‑M1/1‑96 (MQ=255) TCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCAt < 1:356332‑M1/96‑1 (MQ=255) TCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTAc < 1:299550‑M1/142‑1 (MQ=255) TCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTAc > 2:299548‑M1/1‑142 (MQ=255) cATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTg < 2:721681/162‑1 (MQ=255) tttCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCa < 2:104197/89‑1 (MQ=255) ttccTGGTACCCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGTTGCGCgg < 1:130644/179‑1 (MQ=255) aCCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGTTGCGCGGCACCCATCCGCTGCTGGTCTTCACCATGCAGCCAACGAATGCGGCGTAGCGGgtgt < 1:612512/236‑1 (MQ=255) aagctgagccgaaaaaatgaccccggcATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTg < 2:383303‑M2/72‑1 (MQ=255) aagctgagccgaaaaaatgaccccggcATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTg > 1:383305‑M2/28‑99 (MQ=255) cTGGTATCCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCTCTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGTTGCGCGGCatcgactacg < 2:99985/189‑10 (MQ=255) tGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGa < 2:391783/140‑1 (MQ=255) aaCCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGTTGCGCGGCACCCATCCGCTGCTGGTCTTCACCATGCAGCCAACGAATGCGGCGTAGCGGGTGTCGCGCTc > 1:434628/1‑236 (MQ=255) cGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGTTGCGCGGCACCCATCCgctg < 2:199989/183‑1 (MQ=255) gTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGTTGCGCGGCAccc < 2:152827/170‑1 (MQ=255) gTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGTTGCGCGGCACCCATCCGCTGCTGGTCTTCACCATGCAGcc < 2:63254/198‑1 (MQ=255) gTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGTTGCGCGGCACCCATCCGCTGCTGGTCTTCACCATGCAGCCAACGAATGCGGCGTAGCGGGTGTCGCGCTCGGTCtggt > 1:97367/1‑236 (MQ=255) cTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGTTGCGCGGCACCCATCCGCTGCTGGTCTTCACCATGCAGCCAACGAATGCGGCGTAGCGGGTGTCGCGCTCGGTCTGGTGGc > 1:654055/1‑236 (MQ=255) cTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGTTGCGCGGCACCCATCCGCTGCTGGTCTTCACCATGCAGCCAACGAATGCGGCGTAGCGGGTGTCGCGCTCGGTCTGGTGGc > 1:203045/1‑236 (MQ=255) ccggcATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCATTTGTTCCCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATTCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGTTgcg < 2:395617‑M2/149‑1 (MQ=255) ccggcATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGTTGCGCGGCACCCATCCGCTGCTGGTCTTCACCATGCAGCCAACGaa > 2:727855‑M2/6‑196 (MQ=255) | GTGACGCTCGCTGCCGTCTACCTCCCGGACCAAGGGGAGGGCGAACGTCACGACCGATGCAGTCGGTTTAAGGTTGATGGGGATGGGTCTTATGGGCTGTAAGGCGCACGGGCTTGCACCTTAAGGTCTGCATGGGTGTGTGATCTGACCGGCTCGGCGCCGGGGTCATTTTTTCGGCTCAGCTTTACCTGGTAACCGCTGGTGCTACCCCGGCATACGCCAGACGGGCTGACCACTTCCAGTTGTGCGCGGTCTGCGCATTCAGATCACACACCGATGCAGCCTGGCGATGGGGAGCTAGGTGTACCGGGCAGTTTCCGTCAGGCTGACGCGGTGCTACTGCTGTGTGCGCAGTTCGTTGCGCGGCACCCATCCGCTGCTGGTCTTCACCATGCAGCCAACGAATGCGGCGTAGCGGGTGTCGCGCTCGGTCTGGTGGC > AE015451/1747703‑1748142 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |