New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 1949290 = | 25 (0.570) | 3 (0.070) | 3/332 | NT | 10.9% | coding (365/1746 nt) | PP_1749 | GNAT family acetyltransferase |
? | AE015451 | 1949333 = | 25 (0.590) | coding (322/1746 nt) | PP_1749 | GNAT family acetyltransferase |
TGTGGGTCCACCGCCAGGCACCACAGGCTGCTGCCATGCTCGGGGTCATCGAACGCCTTGGTGTGGTTCAGGCCCATGACGCTGCCGATAATCGCGCCGCTGTCTTCGTCCTCTGCCAGCCAATACACCGGGCCACCCAAGTGCCGGGGGGTAAGCAGCTCGGCGTCGACGGGGAGCATCCCGCGCGCCTGGTACAGCGTGTTGATCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGCTGCGCCGGGCGGTAGTCGGTGAACCACAGGCGCAGGGTGTCGGACGGGTCGAGGAACAGCTGCTGAGGGGCCTGTGCCAACACCTGCTGCGGTGCGGCCACGTACAGGGCGATGTCGCGTTCGCCCGGGTGCTCGTCGAGCAGATCCTCGGCCAGGGAAGCCGGGTCGGGGTAGGTGTGGCCTATCAACAGCCGG > AE015451/1949059‑1949517 | gcagccagccacacgaccagccgcgtgccgtgcactgcggctggggccggctgttgataggccacacctaccccgacccggcttccctggccgaggatctgctcgacgagcacccgggcgaacgcgacatcgccctgtacgtggccgcaccgcagcaggtgttggcacaggcccctcagcagctgttcctcgacccgtccgacaccctgcgcctgtggttcaccgactaccgcccg > 1:644676‑M1/232‑236 (MQ=255) gggTCCACCGCCAGGCACCACAGGCTGCTGCCATGCTCGGGGTCATCGAACGCCTTGGTGTGGTTCAGGCCCATGACGCTGCCGATAATCGCGCCGCTGTCTTCGTCCTCTGCCAGCCAATACACCGGGCCACCCAAGTGCCGGGGGGTAAGCAGCTCGGCGTCGACGGGGAGCATCCCGCGCGCCTGGTACAGCGTGTTGATCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCccg > 2:476766/1‑233 (MQ=255) gCCCATGACGCTGCCGATAATCGCGCCGCTGTCTTCGTCCTCTGCCAGCCAATACACCGGGCCACCCAAGTGCCGGGGGGTAAGCAGCTCGGCGTCGACGGGGAGCATCCCGCGCGCCTGGTACAGCGTGTTGATCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGCTGCGCCGGGCGGTAGTCGGTGAACCACAGGCGCAgg > 2:302112/1‑229 (MQ=255) cATGACGCTGCCGATAATCGCGCCGCTGTCTTCGTCCTCTGCCAGCCAATACACCGGGCCACCCAAGTGCCGGGGGGTAAGCAGCTCGGCGTCGACGGGGAGCATCCCGCGCGCCTGGTACAGCGTGTTGATCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGCTGCGCCGGGCGGTAGTCGGTGAACCACAGGCGCAGGGTGTCg > 2:279068/1‑232 (MQ=255) gACGCTGCCGATAATCGCGCCGCTGTCTTCGTCCTCTGCCAGCCAATACCCCGGGCCACCCAAGTGCCGGGGGGTAAGCAGCTCGGCGTCGACGGGGAGCATCCCGCGCGCCTGGTACAGCGTGTTGATCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGCTGCGCCGGGCGGt < 2:328727/200‑1 (MQ=255) cGCTGCCGATAATCGCGCCGCTGTCTTCGTCCTCTGCCAGCCAATACACCGGGCCACCCAAGTGCCGGGGGGTAAGCAGCTCGGCGTCGACGGGGAGCATCCCGCGCGCCTGGTACAGCGTGTTGATCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCAcgcg > 2:61320/1‑166 (MQ=255) ccGATAATCGCGCCGCTGTCTTCGTCCTCTGCCAGCCAATACACCGGGCCACCCAAGTGCCGGGGGGTAAGCAGCTCGGCGTCGACGGGGAGCATCCCGCGCGCCTGGTACAGCGTGTTGATCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGCTGCGCCGGGCGGTAGTCGGTGAACCACAGGCGCAGGGTGTCGGACGGGTCGAGGaa < 1:302114/236‑1 (MQ=255) gATAATCGCGCCGCTGTCTTCGTCCTCTGCCAGCCAATACACCGGGCCACCCAAGTGCCGGGGGGTAAGCAGCTCGGCGTCGACGGGGAGCATCCCGCGCGCCTGGTACAGCGTGTTGATCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGCTGCGCCGGGCGGTAGTCGGTGAACCACAGGCGCAGGGTGTCGGACGGGTCGAGGAACa < 1:476768/236‑1 (MQ=255) cgcTGTCTTCGTCCTCTGCCAGCCAATACACCGGGCCACCCAAGTGCCGGGGGGTAAGCAGCTCGGCGTCGACGGGGAGCATCCCGCGCGCCTGGTACAGCGTGTTGATCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGCTGCGCCGGGCGGTAGTCGGTGAACCACAGGCGCAGGGTGTCGGACGGGTCGAGGAACAGCTGCTGAggg < 1:572537/236‑1 (MQ=255) ttCGTCCTCTGCCAGCCAATACACCGGGCCACCCAAGTGCCGGGGGGTAAGCAGCTCGGCGTCGACGGGGAGCATCCCGCGCGTCTGGTACAGCGTGTTGATCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGCt < 1:760334/161‑1 (MQ=255) ccagccaATACACCGGGCCACCCAAGTGCCGGGGGGTAAGCAGCTCGGCGTCGACGGGGAGCATCCCGCGCGCCTGGTACAGCGTGTTGATCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGCTGCGCCGGGCGGTAGTCGGTGAACCACAGGCGCAGGGTGTCGGACGGGTCGAGGAACAGCTGCTGAGGGGCCTGTGCCAACACctg > 1:545772/1‑235 (MQ=255) ccagccaATACACCGGGCCACCCAAGTGCCGGGGGGTAAGCAGCTCGGCGTCGACGGGGAGCATCCCGCGCGCCTGGTACAGCGTGTTGATCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGCTGCGCCGGGCGGTAGTCGGTGAACCACAGGCGCAGGGTGTCGGACGGGTCGAGGAACAGCTGCTGAGGGGCCTGTGCCAACACctg > 1:84408/1‑235 (MQ=255) ccagccaATACACCGGGCCACCCAAGTGCCGGGGGGTAAGCAGCTCGGCGTCGACGGGGAGCATCACGCGCGCCTGGTACAGCGTGTTGATCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGcc > 2:541925/1‑136 (MQ=255) cACCCAAGTGCCGGGGGGTAAGCAGCTCGGCGTCGACGGGGAGCATCCCGCGCGCCTGGTACAGCGTGTTGATCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGCTGCGCCGGGCGGTAGTCGGTGAACCACAGGCGCAggggg > 1:185083/1‑168 (MQ=255) ggTAAGCAGCTCGGCGTCGACGGGGAGCATCCCGCGCGCCTGGTACAGCGTGTTGATCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGCTGCGCCGGGCGGTAGTCGGTGAACCACAGGCGCAGGGTGTCGGACGGGTCGAGGAACAGCTGCTGAGGGGCCTGTGCCAACACCTGCTGCGGTGCGGCCACGTACAGGGCGATGTcgc > 2:288797/1‑233 (MQ=255) agcagcTCGGCGTCGACGGGGAGCATCCCGCGCGCCTGGTACAGCGTGTTGATCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGCTGCGCCGGGCGGTAGTCGGTGAACCACAGGCGCAGGGTGTCGGACGGGTCGAGGAACAGCTGCTGAGGGGCCTGTGCCAACACCTGCTGCGGTGCGGCCACGTACAGGGCGATGTCGCGTTCGcc > 1:799872/1‑236 (MQ=255) tCGGCGTCGACGGGGAGCACCCCGCGCGCCTGGTACAGCGGGTTGATCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGcc < 2:94230/75‑1 (MQ=255) ggCGTCGACGGGGAGCATCCCGCGCGCCTGGTACAGCGTGTTGATCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCTCTGCGCCGGGCGGTAGTCGGTGAACCACAGGCGCAGGGTGTCGGACGGGTCgc > 2:413345/1‑154 (MQ=255) gCGTCGACGGGGAGCATCCCGCGCGCCTGGTACAGCGTGTTGATCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGCTGCGCCGGGCGGTAGTCGGTGAACCACAGGCGCAGGGTGTCGGACGGGTCGAGGAACAGCTGCTGAGGGGCCTGTGCCAACACCTGCTGCGGTGCGGCCACGTACAGGGCGATGTCGCGTTCGCCCGGGTGCt > 1:577763/1‑235 (MQ=255) gCGTCGACGGGGAGCACCCCGCGCGCCTGGTACAGCGTGTTGATCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGCTGCGCCGGGCGGTAGTCGGTGAACCACAGgc < 1:129628/133‑1 (MQ=255) gACGGGGAGCATCCCGCGCGCCTGGTACAGCGTGTTGAGCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGCTGCGCCGGGCGGTAGTCGGTGAACCACAGGCGCAGGGTGTCGGACGGGTCGAGGAACAGCTGCTGAGGGGCCTGTGCCAACACCTGCTGCGGTGCGGCCACGTACAGGGCGATGTCGCGTTCGCCCGGGTGCTCGTCGa < 1:614216/236‑1 (MQ=255) cccGCGCGCCTGGTACAGCGTGTTGATCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGCTGCGCCGGGCGGTAGTCGGTGAACCACAGGCGCAGGGTGTCGGACGGGTCGAGGAACAGCTGCTGAGGGGCCTGTGCCAACACCTGCTGCGGTGCGGCCACGTACAGGGCGATGTCGCGTTCGCCCGGGTGCTCGTCGAGCAGATCCt > 1:774230/1‑233 (MQ=255) ctcgacccgtccgaccccctgcgcctgtggttcaccgactaccGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATCCCCGCTGCGCCGGGCGGTAGTCGGTGAACCACAGGCGCAGGGTGTCGGACGGGTCGAGGAACAGCTGCTGAggg > 1:386724‑M1/44‑145 (MQ=255) cTGGTACAGCGTGTTGATCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGa > 2:352795/1‑67 (MQ=255) ccgacaccctgcgcctgtggttcaccgactaccGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGctgctc < 2:386722‑M1/38‑3 (MQ=255) cgacaccctgcgcctgtggtccaccgactaccGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGCTGCGCCGGGCGGTAGTCGGTGACCCACAGGCGCCGGGTGTCGGACGGGTc < 1:668737‑M1/83‑1 (MQ=255) ttGATCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGCTGCGCCGGGCGGTAGTCGGTGAACCACAGGCGCAGGGTGTCGGACGGGTCGAGGAACAGCTGCTGAGGGGCCTGTGCCAACACCTGCTGCGGTGCGGCCACGTACGGGGCGATGTCGCGTTCGCCCGGGTGCTCGTCGAGCAGATCCTCGGCCAGGGAAGCCGGGTCGGGGTa > 1:452061/1‑236 (MQ=255) ttGATCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGCTGCGCCGGGCGGTAGTCGGTGAACCACAGGCGCAGGGTGTCGGACGGGTCGAGGAACAGCTGCTGAGGGGCCTGTGCCAACACCTGCTGCGGTGCGGCCACGTACATGGCGATGTCGCGTTCGCCCGGGTGCTCGTCGAGCAGATCCTCGGCCAGGGCAGCCGGGTCGGGGTa > 1:230349/1‑236 (MQ=255) gATCGCCTGCCCGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGCTGCGCCGGGCGGTAGTCGGTGAATCACAGGCGCCGGGTGTCGGACGGGTCGACGcaca > 2:66132/1‑119 (MQ=255) gATCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGCTGCGCCGGGCGGTAGTCGGTGAATca > 2:66134/1‑87 (MQ=255) gCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGCTGCGCCGGGCGGTAGTCGGTGAACCACAGGCGCAGGGTGTCGGACGGGTCGAGGAACAGCTGCTGAGGGGCCTGTGCCAACACCTGCTGCGGTGCGGCCACGTACAGGGCGATGTCGCGTTCGCCCGGGTGCTCGTCGAGCAGATCCTCGGCCAGGGAAGCCGGGTCGGGGTAgg < 1:291785/228‑1 (MQ=255) tCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGCTGCGCCGGGCGGTAGTCGGTGAACCACAGGCGCAGGGTGTCGGACGGGTCGAGGAACAGCTGCTGAGGGGCCTGTGCCAACACCTGCTGCGGTGCGGCCACGTACAGGGCGATGTCGCGTTCGCCCGGGTGCTCGTCGAGCAGATCCTCGGCCAGGGAAGCCGGGTCGGGGTAGGTGTGGCCTATCAACAGCCgg < 2:799870/233‑1 (MQ=255) cTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGCTGCGCCGGGCGGTAGTCGGTGAACCACAGGCGCAGGGTGTCGGACGGGTCGAGGAACAGCTGCTGAGGGGCCTGTGCCAACACCTGCTGCGGTGCGGCCACGTACAGGGCGATGTCGCGTTCGCCCGGGTGCTCGTCGAGCAGATCCTCGGCCAGGGAAGCCGGGTCGGGGt < 1:19417/209‑1 (MQ=255) | TGTGGGTCCACCGCCAGGCACCACAGGCTGCTGCCATGCTCGGGGTCATCGAACGCCTTGGTGTGGTTCAGGCCCATGACGCTGCCGATAATCGCGCCGCTGTCTTCGTCCTCTGCCAGCCAATACACCGGGCCACCCAAGTGCCGGGGGGTAAGCAGCTCGGCGTCGACGGGGAGCATCCCGCGCGCCTGGTACAGCGTGTTGATCGCCTGCCAGTCGGCGGGGTTCTGTGCCCGCCGCACGCGGAAGCCGCGAAATACCCGCTGCGCCGGGCGGTAGTCGGTGAACCACAGGCGCAGGGTGTCGGACGGGTCGAGGAACAGCTGCTGAGGGGCCTGTGCCAACACCTGCTGCGGTGCGGCCACGTACAGGGCGATGTCGCGTTCGCCCGGGTGCTCGTCGAGCAGATCCTCGGCCAGGGAAGCCGGGTCGGGGTAGGTGTGGCCTATCAACAGCCGG > AE015451/1949059‑1949517 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |