| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 3463335 | 62 (1.420) | 3 (0.070) | 3/326 | NT | 4.8% | coding (1023/1929 nt) | PP_3078 | putative ABC transporter, periplasmic binding protein |
| ? | AE015451 | = 3463351 | 59 (1.420) | coding (1007/1929 nt) | PP_3078 | putative ABC transporter, periplasmic binding protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TCTGGCACTTGGCCGCGCAAGGGGGCGAGCAGCTTCAACTCGCCCGCATCCGGCAACTGGCGAGCGGCCAACGGCGTATTGGAGAACACGCTTTGCTGGCGGATGTACAGGTTGCGCATCATCTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGTTTGGCCGGGCCCAGGTGGGCGCGCTGCAGGCGGCCGTCGTCCAGTTGCGCACCGTTGTAGCCCAAGGTGTAGGCCGTGGCGGAGAACTCGCGGTTGTAGTCGTAGCCACCGCCTTTGAGTACCTGGCGCGCCACTTCGGTGTCGCCGAAGTACTCGATGCGCAGTTTGTCGAAATTGTAGCGGCCACGGCTGGCGGGCAGGTCAC > AE015451/3463111‑3463549 | tCTGGCACTTGGCCGCGCAAGGGGGCGAGCAGCTTCAACTCGCCCGCATCCGGCAACTGGCGAGCGGCCAACGGCGTATTGGAGAACACGCTTTGCTGGCGGATGTACAGGTTGCGCATCATCTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGttt < 1:784873/236‑1 (MQ=255) gCACTTGGCCGCGCAAGGGGGCGAGCAGCTTCAACTCGCCCGCATCCGGCAACTGGCGAGCGGCCAACGGCGTATTGGAGAACACGCTTTGCTGGCGGATGTACAGGTTGCGCATCATCTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGttt > 2:407947/1‑232 (MQ=255) gCACTTGGCCGCGCAAGGGGGCGAGCAGCTTCAACTCGCCCGCATCCGGCAACTGGCGAGCGGCCAACGGCGTATTGGAGAACACGCTTTGCTGGCGGATGTACAGGTTGCGCATCATCTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGTTTGGcc > 1:609453/1‑236 (MQ=255) gcAAGGGGGCGAGCAGCGTCCACTCGCCCGCATCCGGCAACTGGCGAGCGGCCAACGGCGTATTGGAGAACACGCTTTGCTGGCGGATGTACAGGTTGCGCATCATCTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCcggccaaaccgc < 2:661259‑M1/221‑13 (MQ=255) cAAGGGGGCGAGCAGCTTCAACTCGCCCGCATCCGGCAACTGGCGAGCGGCCAACGGCGTATTGGAGAACACGCTTTGCTGGCGGATGTACAGGTTGCGCATCATCTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGTTTGGCCGGGCCCAGGTgg < 1:754350/235‑1 (MQ=255) aaGGGGGCGAGCAGCTTCAACTCGCCCGCATCCGGCAACTGGCGAGCGGCCAACGGCGTATTGGAGAACACGCTTTGCTGGCGGATGTACAGGTTGCGCATCATCTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGTTTGGCCGGGCCCAGGTGGgc > 1:692632/1‑236 (MQ=255) ttCAACTCGCCCGCATCCGGCAACTGGCGAGCGGCCAACGGCGTATTGGAGAACACGCTTTGCTGGCGGATGTACAGGTTGCGCATCATCTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGTTTGGCCGGGCCCAGGTGGGCGCGCTGCAGGCGGcc > 1:49594/1‑236 (MQ=255) gCATCCGGCAACTGGCGAGCGGCCAACGGCGTATTGGAGAACACGCTTTGCTGGCGGATGTACAGGTTGCGCATCATCTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGTTTGGCCGGGCCCAGGTGGGCGCGCTGCAGGCGGCCGTCGTCCAGtt > 1:414887/1‑235 (MQ=255) ccGGCAACTGGCGAGCGGCCAACGGCGTATTGGAGAACACGCTTTGCTGGCGGATGTACAGGTTGCGCATCATCTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGTTTGGCCGGGCCCAGGTGGGCGCGCTGCAGGCGGCcgt > 1:636112/1‑222 (MQ=255) ccGGCAACTGGCGAGCGGCCAACGGCGTATTGGAGAACACGCTTTGCTGGCGGATGTACAGGTTGCGCATCATCTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGTTTGGCCGGGCCCAGGTGGGCGCGCTGCAGGCGGCCGTCGTCCAGTTgc < 1:313922/233‑1 (MQ=255) ggCGAGCGGCCAACGGCGTATTGGAGAACACGCTTTGCTGGCGGATGTACAGGTTGCGCATCATCTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGTTTGGCCGGGCCCAGGTGGGCGCGCTGCAGGCGGCCGTCGTCCAGtt < 1:72369/222‑1 (MQ=255) ggCGAGCGGCCAACGGCGTATTGGAGAACACGCTTTGCTGGCGGATGTACAGGTTGCGCATCATCTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGTTTGGCCGGGCCCAGGTGGGCGCGCTGCAGGCGGCCGTCGTCCAGTTGCGCACCGTTGTAg < 2:49594/236‑1 (MQ=255) gCGAGCGGCCAACGGCGTATTGGAGAACACGCTTTGCTGGCGGATGTACAGGTTGCGCATCATCTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGTTTGGCCGGGCCCAGGTGGGCGCGCTGCAGGCGGCCGTCGTCCAGTTGCGCACCGTTGTAg < 1:379797/235‑1 (MQ=255) gAGCGGCCAACGGCGTATTGGAGAACACGCTTTGCTGGCGGATGTACAGGTTGCGCATCATCTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGTTTGGCCGGGCCCAGGTGGGCGCGCTGCAGGCGGCCGTCGTCCAGTTGCGCAcc < 1:589272/226‑1 (MQ=255) aaCGGCGTATTGGAGAACACGCTTTGCTGGCGGATGTACAGGTTGCGCATCATCTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGTTTGGCCGggccca > 1:284516‑M2/1‑172 (MQ=255) ggCGTATTGGAGAACACGCTTTGCTGGCGGATGTACAGGTTGCGCATCATCTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGTTTGGCCGGGCCCAGGTGGGCGCGCTGCAGGCGGCCGTCGTCCAGTTGCGCACCGTTGTAGCCCAAGGTGTAgg < 1:765229/235‑1 (MQ=255) cGTATTGGAGAACACGCTTTGCTGGCGGATGTACAGGTTGCGCATCATCTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGTTTGGCCGGGCCCAGGTGGGCGCGCTGCAGGCGGCCGTCGTCCAGTTGCGCACCGTTGTAg < 2:795744/220‑1 (MQ=255) ggAGAACACGCTTTGCTGGCGGATGTACAGGTTGCGCATCATCTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGTTTGGCCGGGCCCAGGTGGGCGCGCTGCAGGCGGCCGTCGTCCAGTTGCGCACCGTTg > 1:277117/1‑211 (MQ=255) gagaACACGCTTTGCTGGCGGATGTACAGGTTGCGCATCATCTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGTTTg < 2:299749/156‑1 (MQ=255) gagaACACGCTTTGCTGGCGGATGTACAGGTTGCGCATCATCTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGTTTGGCCGGGCCCAGGTGGGCGCGCTGCAGGCGGCCGTCGTCCAGTTGCGCACCGTTGTAGCCCAAGGTGTAGGCCGTGGCGga < 1:276954/236‑1 (MQ=255) acacGCTTTGCTGGCGGATGTACAGGTTGCGCATCATCTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGTTTGGCCGGGCCCAGGTGGGCGCGCTGCAGGCGGCCGTCGTCCAGTTGCGCACCGTTGTAGCCCAAGGTGTAGGCCGTGGCGGAGAAc < 1:575332/236‑1 (MQ=255) acacGCTTTGCTGGCGGATGTACAGGTTGCGCATCATCTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGTTTGGCCGGGCCCAGGTGGGCGCGCTGCAGGCGGCCGTCGTCCAGTTGCGCACCGTTGTAGCCCAAGGTGTAGGCCGTGGCGGAGAAc < 1:662332/236‑1 (MQ=255) acGCTTTGCTGGCGGATGTACAGGTTGCGCATCATCTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGTTTGGCCGGGCCCAGGTGGGCGCGCTGCAGGCGGCCGTCGTCCAGTTgcgccc > 2:613467/1‑197 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGGATGTACAGGTTGCGCATCATCTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGTTTGGCCGGGCCCAGGTGGGCGCGCTGCAGGCGGCCGTCGTCCAGTTgcg > 2:512347/1‑194 (MQ=255) 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atcatcTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGTTTGGCCGGGCCCAGGTGGGCGCGCTGCAGGCAGCcgtc > 2:435129/1‑155 (MQ=255) tcTGCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGTTTGGCCGGGCCCAGGTGGGCGCGCTGCAGGCGGCCGTCGTCCAGTTGCGCACCGTTGTAGCCCAAGGTGTAGGCCGTGGCGGAGAACTCGCGGTTGTAGTCGTAGCCACCGCCTTTGAGTAcc < 1:290348/236‑1 (MQ=255) gCCGGTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGTTTGGCCGGGCCCAGGTGGGCGCGCTGCAggcgg < 2:249154/143‑1 (MQ=255) ggTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTAGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGTTTGGCCGGGCCCAGGTGGGCGCGCt > 2:301737/1‑132 (MQ=255) gTTGCTCCACTCGAAGTCCCATAACATACCCAGCGCCTGCCGCACACGGCGGTCCTTGAACTGCGGCTGGTCGAGGTTGAACACGAAACCCTGGGCCACCTGCGGtt < 1:143920/107‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |