| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | AE015451 | = 6088154 | 53 (1.210) | 3 (0.070) | 3/330 | NT | 6.2% | coding (376/1044 nt) | aphA | Acetylpolyamine aminohydrolase |
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TCGGCCGTGCGCCGTTGTTGCGCGTCCACAGCGCCGATTACCTGGATTTCTTCGAAGGCGCCTGGGCCCGCTGGGCTGCGCTGGGCCAAGAGGGTGACCTGCTGCCCTTCACCTGGCCGGCCCGCACACTGCGCCAGGTCAAGCCGACCGGCCTGCATGGCGAACTGGGTTACTACAGTTTCGATGCCGGCGCCCCCATCACCGCGGGTACCTGGCAGGCGGCCTACAGTGCTGCGCAAGTTGCCCTGACCGCCCAGGCTGCAATTCAGCAAGGCGCCCATGCCGCGTTCGCCCTGTGCCGTCCGCCAGGGCACCACGCTGCCGGCGAAGTGATGGGCGGCTACTGCTATCTGAATAATGCCGCCATCGCCGCCCAGGCCTTCCTCGACCAAGGCCGACGCAAGGTCGCCATCCTTGACGTCGACTACCACCACGGCA > AE015451/6087939‑6088376 | tCGGCCGTGCGCCGTTGTTGCGCGTCCACAGCGCCGATTACCTGGATTTCTTCGAAGGCGCCTGGGCCCGCTGGGCTGCGCTGGGCCAAGAGGGTGACCTGCTGCCCTTCACCTGGCCGGCCCGCACACTGCGCCAGGTCAAGCCGACCGGCCTGCATGGCGAACTGGGTTACTACAGTTTCGATGCCGGCGCCCCCATCACCGCGGGTACCTGGCAGGCGGCCTACAGtgctgc > 2:549943/1‑235 (MQ=255) cGTTGTTGCGCGTCCACAGCGCCGATTACCTGGATTTCTTCGAAGGCGCCTGGGCCCGCTGGGCTGCGCTGGGCCAAGAGGGTGACCTGCTGCCCTTCACCTGGCCGGCCCGCACACTGCGCCAGGTCAAGCCGACCGGCCTGCATGGCGAACTGGGTTACTACAGTTTCGATGCCGGCGCCCCCATCACCGCGGGTACCTGGCAGGCGGCCTACAGTGCTGCGCAAGTTGcc > 2:342393/1‑233 (MQ=255) cGTTGTTGCGCGTCCACAGCGCCGATTACCTGGATTTCTTCGAAGGCGCCTGGGCCCGCTGGGCTGCGCTGGGCCAAGAGGGTGACCTGCTGCCCTTCACCTGGCCGGCCCGCACACTGCGCCAGGTCAAGCCGACCGGCCTGCATGGCGAACTGGGTTACTACAGTTTCGATGCCGGCGCCCCCATCACCGCGGGTACCTGGCAGGCGGCCTACAGTGCTGCGCAAGTTGCCCTg > 1:460472/1‑236 (MQ=255) tgttgCGCGTCCACAGCGCCGATTACCTGGATTTCTTCGAAGGCGCCTGGGCCCGCTGGGCTGCGCTGGGCCAAGAGGGTGACCTGCTGCCCTTCACCTGGCCGGCCCGCACACTGCGCCAGGTCAAGCCGACCGGCCTGCATGGCGAACTGGGTTACTACAGTTTCGATGCCGGCGCCCCCATCACCGCGGGTACCTGGCAGGCGGCCTACAGTGCTGCGCAAGTTGCCCTGAcc < 1:549945/236‑1 (MQ=255) tgCGCGTCCACAGCGCCGATTACCTGGATTTCTTCGAAGGCGCCTGGGCCCGCTGGGCTGCGCTGGGCCAAGAGGGTGACCTGCTGCCCTTCACCTGGCCGGCCCGCACACTGCGCCAGGTCATGCCGACCGGCCTGCATGGCGAACTGGGTTACTACAGTTTCGATGCCGGCGCCCCCATCACCGCGGGTACCTGGCAGGCGGCCTACa < 2:438599/210‑1 (MQ=255) acaGCGCCGATTACCTGGATTTCTTCGAAGGCGCCTGGGCCCGCTGGGCTGCGCTGGGCCAAGAGGGTGACCTGCTGCCCTTCACCTGGCCGGCCCGCACACTGCGCCAGGTCAAGCCGTCCGGCCTGCATGGCGAACTGGGTTACTACAGTTTCGATGCCGGCGCCCCCATCACCGCGGGTACCTGGC > 1:468949‑M1/1‑189 (MQ=255) acaGCGCCGATTACCTGGATTTCTTCGAAGGCGCCTGGGCCCGCTGGGCTGCGCTGGGCCAAGAGGGTGACCTGCTGCCCTTCACCTGGCCGGCCCGCACACTGCGCCAGGTCAAGCCGTCCGGCCTGCATGGCGAACTGGGTTACTACAGTTTCGATGCCGGCGCCCCCATCACCGCGGGTACCTGGC < 2:468947‑M1/189‑1 (MQ=255) acaGCGCCGATTACCTGGATTTCTTCGAAGGCGCCTGGGCCCGCTGGGCTGCGCTGGGCCAAGAGGGTGACCTGCTGCCCTTCACCTGGCCGGCCCGCACACTGCGCCAGGTCAAGCCGACCGGCCTGCATGGCGAACTGGGTTACTACAGTTTCGATGCCGGCGCCCCCATCACCGCGGGTACCTGGCAGGCGGCCTACAGTGCTGCGCAAGTTGCCCTGACCGCCCAGGCTGCa > 2:414697/1‑236 (MQ=255) caGCGCCGATTACCTGGATTTCTTCGAAGGCGCCTGGGCCCGCTGGGCTGCGCTGGGCCAAGAGGGTGACCTGCTGCCCTTCACCTGGCCGGCCCGCACACTGCGCCAGGTCAAGCCGACCGGCCTGCATGGCGAACTGGGTTACTACAGTTTCGATGCCGGCGCCCCCATCACCGCGGGTACCTGGCggacggcacagggcgaacgcggcatgggcgccttgctgaattgcagcc < 1:330773‑M1/236‑49 (MQ=255) caGCGCCGATTACCTGGATTTCTTCGAAGGCGCCTGGGCCCGCTGGGCTGCGCTGGGCCAAGAGGGTGACCTGCTGCCCTTCACCTGGCCGGCCCGCACACTGCGCCAGGTCAAGCCGACCGGCCTGCATGGCGAACTGGGTTACTACAGTTTCGATGCCGGCGCCCCCATCACCGCGGGTACCTGGCAGGCGGCCTACAGTGCTGCGCAAGTTGCCCTGACCGCCCAGGCTGCa < 1:270993/235‑1 (MQ=255) gcCGATTACCTGGATTTCTTCGAAGGCGCCTGGGCCCGCTGGGCTGCGCTGGGCCAAGAGGGTGACCTGCTGCCCTTCACCTGGCCGGCCCGCACACTGCGCCAGGTCAAGCCGACCGGCCTGCATGGCGAACTGGGTTACTACAGTTTCGATGCCGGCGCCCCCATCACCGCGGGTACCTGGCggacggcacagggcgaacgcggcatgggcgccttgctgaattgcagcctggg < 1:406502‑M1/236‑53 (MQ=255) gATTACCTGGATTTCTTCGAAGGCGCCTGGGCCCGCTGGGCTGCGCTGGGCCAAGAGGGTGACCTGCTGCCCTTCACCTGGCCGGCCCGCACACTGCGCCAGGTCAAGCCGACCGGCCTGCATGGCGAACTGGGTTACTACAGTTTCGATGCCGGCGCCCCCATCACCGCGGGTACCTGGCAGGCGGCCTACAGTGCTGCGCAAGTTGCCCTGACCGCCCAGGCTGCAATTCAGCa < 1:249758/236‑1 (MQ=255) gATTTCTTCGAAGGCGCCTGGGCCCGCTGGGCTGCGCTGGGCCAAGAGGGTGACCTGCTGCCCTTCACCTGGCCGGCCCGCACACTGCGCCAGGTCAAGCCGACCGGCCTGCATGGCGAACTGGGTTACTACAGTTTCGATGCCGGCGCCCCCATCACCGCGGGTACCTGGCAGGCGGCCTACAGTGCTGCGCAAGTTGCCCTGACCGCCCAGGCTGCAATTCAGCAAGGCGCCCa < 1:563961/236‑1 (MQ=255) 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ccTGCTGCCCTTCACCTGGCCGGCCCGCACACTGCGCCAGGTCAAGCCGACCGGCCTGCATGGCGAACTGGGTTACTACAGTTTCGATGCCGGCGCCCCCATCACCGCGGGTACCTGGCAGGCGGCCTACAGTGCTGCGCAAGTTGCCCTGACCGCCCAGGCTGCACTTCAGCAAGGCGCCCATGCCGCGTTCGCCCTGTGCCGTCCGCCAGGGca > 2:132999/1‑216 (MQ=255) ctgctgCCCTTCACCTGGCCGGCCCGCACACTGCGCCAGGTCAAGCCGACCGGCCTGCATGGCGAACTGGGTTACTACAGTTTCGATGCCGGCGCCCCCATCACCGCGGGTACCTGGCAGGCGGCCTACAGTGCTGCGCAAGTTGCCCTGACCGCCCAGGCTGCAATTCAGCAAGGCGCCCATGCCGCGTTCGCCCTGTGCCGTCCGCCAGGGCACCACGCTGCCGGCGAAGTGa < 1:655146/235‑1 (MQ=255) tgctgcCCTTCACCTGGCCGGCCCGCACACTGCGCCAGGTCAAGCCGACCGGCCTGCATGGCGAACTGGGTTACTACAGTTTCGATGCCGGCGCCCCCATCACCGCGGGTACCTGGCAGGCGGCCTACAGTGCTGCGCAAGTTGCCCTGACCGCCCAGGCTGCAATTCAGCAAGGCGCCCATGCCGCGTTCGCCCTGTGCCGTCCGCCAGGGCACCACGCTg > 2:695324/1‑222 (MQ=255) tgctgcCCTTCACCTGGCCGGCCCGCACACTGCGCCAGGTCAAGCCGACCGGCCTGCATGGCGAACTGGGTTACTACAGTTTCGATGCCGGCGCCCCCATCACCGCGGGTACCTGGCAGGCGGCCTACAGTGCTGCGCAAGTTGCCCTGACCGCCCAGGCTGCAATTCAGCAAGGCGCCCATGCCGCGTTCGCCCTGTGCCGTCCGCCAGGGCACCACGCTg < 1:695326/222‑1 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aCCGCGGGTACCTGGCAGGCGGCCTACAGTGCTGCGCAAGTTGCCCTGACCGCCCAGGCTGCAATTCAGCAAGGCGCCCATGCCGCGTTCGCCCTGTGCCGTCCGCCAGGGCACCACGCTGCCGGCGAAGTGATGGGCGGCTACTGCTATCTGAATAATGCCGCCATCGCCGCCCAGGCCTTCCTCGACCAAGGCCGACGCAAGGTCGCCATCCTTGACGTCGACTACCACCACgg < 1:634148/236‑1 (MQ=255) cgcgGGTACCTGGCAGGCGGCCTACAGTGCTGCGCAAGTTGCCCTGACCGCCCAGGCTGCAATTCAGCAAGGCGCCCATGCCGCGTTCGCCCTGTGCCGTCCGCCAGGGCACCACGCTGCCGGCGAAGTGATGGGCGGCTACTGCTATCTGAATAATGCCGCCATCGCCGCCCAGGCCTTCCTCGACCAAGGCCGACGCAAGGTCGCCATCCTTGACGTCGACTACCACCACGGCa < 1:133001/236‑1 (MQ=255) gggTACCTGGCAGGCGGCCTACAGTGCTGCGCAAGTTGCCCTGACCGCCCAGGCTGCAANTCAGCAAGGCGCCCATGCCGCGTTCGCCCTGTGCCGTCCGCCAGGGCACCACGCTGCCGGCGAAg > 2:534864/1‑125 (MQ=255) tACCTGGCAGGCGGCCTACAGTGCTGCGCAAGTTGccc > 2:465737/1‑38 (MQ=255) tGGCggacggcacagggcgaacgcggcatgggcgccttgctgaattgcagcctgggcggtcagggcaacttgcgcagcactgtaggccgcctgccaggtacccgcggtgatgggggcgccggcatcgacactgtagtaacccagttcgccatgcaggccggtcggcttgaccgggcgcagtgt > 2:87910‑M1/1‑4 (MQ=255) gcgggcggcacagggcgaacgcggcatgggcgccttgctgaattgcagcctgggcggtcagggcaacttgcgcagcactgtaggccgcctgccaggtacccgcggtgatgggggcgccggcatcgaaactgtagtaacccagttcgccatgcaggccggtcggcttgacctggcgcagtgtgcgggccggccaggtgaagggcagcaggt < 1:201617‑M1/210‑209 (MQ=255) gCggacggcacagggcgaacgcggcatgggcgccttgctgaattgcagcctgggcggtcagggcaactt < 2:369617‑M1/69‑68 (MQ=255) cAGGCGGCCTACAGTGCTGCGCAAGTTGCCCTGACCGCCCAGGCTGCAATTCAGCAAGGCGCCCATGCCGCGTTCGCCCTGTGCCGTCCgccaggtacccgcggtgatgggggcgccggcaccgaaactgtagtaacccagttcgccatgcaggccggtcggcttgacctggcgcagtgtgcgggccggc < 2:508474‑M2/190‑102 (MQ=255) cAGGCGGCCTACAGTGCTGCGCAAGTTGCCCTGACCGCCCAGGCTGCAATTCAGCAAGGCGCCCATGCCGCGTTCGCCCTGTGCCGTCCGCCAGGGCACCACGCTGCCGGCGCAGTGATGGGCGGCTACTGCTATCTGAATAATGCCGCCATCGCCGCCCAGGCCTTCCTCGACCAAGGCCGACGCAAGGCCGCCATCCtt > 2:112095/1‑201 (MQ=255) | TCGGCCGTGCGCCGTTGTTGCGCGTCCACAGCGCCGATTACCTGGATTTCTTCGAAGGCGCCTGGGCCCGCTGGGCTGCGCTGGGCCAAGAGGGTGACCTGCTGCCCTTCACCTGGCCGGCCCGCACACTGCGCCAGGTCAAGCCGACCGGCCTGCATGGCGAACTGGGTTACTACAGTTTCGATGCCGGCGCCCCCATCACCGCGGGTACCTGGCAGGCGGCCTACAGTGCTGCGCAAGTTGCCCTGACCGCCCAGGCTGCAATTCAGCAAGGCGCCCATGCCGCGTTCGCCCTGTGCCGTCCGCCAGGGCACCACGCTGCCGGCGAAGTGATGGGCGGCTACTGCTATCTGAATAATGCCGCCATCGCCGCCCAGGCCTTCCTCGACCAAGGCCGACGCAAGGTCGCCATCCTTGACGTCGACTACCACCACGGCA > AE015451/6087939‑6088376 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |