New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 2711308 | 50 (1.140) | 4 (0.100) | 3/322 | NT | 7.2% | intergenic (‑55/+88) | PP_2374/metH | conserved protein of unknown function/cobalamin‑dependent methionine synthase |
? | AE015451 | = 2711370 | 56 (1.360) | intergenic (‑117/+26) | PP_2374/metH | conserved protein of unknown function/cobalamin‑dependent methionine synthase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
CGGCAGCGAGGATGCTGTGCAGCATCTGCCAGAAGGTCGGGGGTTTGCCCTGGCTGGAATCGTCCATGGTGGCTCCTGGGGAAATCAGAGGCAATCAGGGACAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGC > AE015451/2711160‑2711600 | cggcAGCGAGGATGCTGTGCAGCATCTGCCAGAAGGTCGGGGGTTTGCCCTGGCTGGAATCGTCCATGGTGGCTCCTGGGGAAATCAGAGGCAATCAGGGACAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGt > 1:21756/1‑236 (MQ=255) cggcAGCGAGGATGCTGTGCAGCATCTGCCAGAAGGTCGGGGGTTTGCCCTGGCTGGAATCGTCCATGGTGGCTCCTGGGGAAATCAGAGGCAATCAGGGACAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGt > 1:295227/1‑236 (MQ=255) gcAGCGAGGATGCTGTGCAGCATCTGCCAGAAGGTCGGGGGTTTGCCCTGGCGGGAATCGTCCATGGTGGCTCCTGGGGAAATCAGAGGCAATCAGGGACAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGtt < 1:383493/235‑1 (MQ=255) cAGGGAGGATGCTGTGCAGCATCTGCCAGAAGGTCGGGGGTTTGCCCTGGCTGGAATCGTCCATGGTGGCTCCTGGGGAAATCAGAGGCAATCAGGGACAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCg < 1:583589/232‑1 (MQ=255) tGCTGTGCAGCATCTGCCAGAAGGTCGGGGGTTTGCCCTGGCTGGAATCGTCCATGGTGGCTCCTGGGGAAATCAGAGGCAATCAGGGACAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGtt < 1:589562/225‑1 (MQ=255) cAGAAGGTCGGGGGTTTGCCCTGGCTGGAATCGTCCATGGTGGCTCCTGGGGAAATCAGAGGCAATCAGGGACAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTg < 1:445180/214‑1 (MQ=255) aGAAGGTCGGGGGTTTGCCCTGGCTGGAATCGTCCATGGTGGCTCCTGGGGAAATCAGAGGCAATCAGGGACAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGC‑GGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCgccagc > 1:188015/1‑236 (MQ=255) gAAGGTCGGGGGTTTGCCCTGGCTGGAATCATCCATGGTGGCTCCTGGGGAAAGCAGAGGCAATCAGGGACAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAg < 2:568705/180‑1 (MQ=255) ggggTTTGCCCTGGCTGGAATCGTCCATGGTGGCTCCTGGGGAAATCAGAGGCAATCAGGGACAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGcgctc < 1:684112/236‑1 (MQ=255) ttGCCCGGGCTGGAATCGTCCATGGTGGCTCCTGGGGAAATCAGAGGCAATCAGGGACAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATAc < 2:634709/205‑1 (MQ=255) gCCCTGGCTGGAATCGTCCATGGTGGCTCCTGGGGAAATCAGAGGCAATCAGGGACAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGc > 2:501789/1‑166 (MQ=255) ccATGGTGGCTCCTGGGGAAATCAGAGGCAATCAGGGACAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCtt < 1:501791/235‑1 (MQ=255) aTGGTGGCTCCTGGGGAAATCAGAGGCAATCAGGGACAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGC‑GGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGcc < 2:188013/230‑1 (MQ=255) tggCTCCTGGGGAAATCAGAGGCAATCAGGGACAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATAc > 1:639150/1‑180 (MQ=255) tGGGGAAATCAGAGGCAATCAGGGACAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCgctcgctc < 1:709063/203‑1 (MQ=255) gggAAATCAGAGGCAATCAGGGACAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAAc < 1:451313/235‑1 (MQ=255) gAAATCAGAGGCAATCAGGGACAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAACCCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCa < 1:466889/173‑1 (MQ=255) gtgtAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCtt < 1:535333/235‑1 (MQ=255) agacAAGGGTTGTCAGGTTGCCTGGACCGGCCTCTTCGCTTGGAAAACCGATCCAGCAGGTAAATGACTGCCCTTGCGGGCTGTGGCATACCTGTGTGGGCAAGCCAGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCTAg > 2:745480/4‑147 (MQ=255) aGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGCAACCCGTTCCAACAGGTAAATGCCTGCCCGTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGAGAAGCAGCCAGCGCAGTc > 2:96875/1‑127 (MQ=255) ttGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAAt > 2:356753/1‑236 (MQ=255) tgtgAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAAc > 2:644587/1‑196 (MQ=255) tgtgAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAAc < 1:644589/196‑1 (MQ=255) tgtgAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCaaaa > 2:370813/1‑234 (MQ=255) tgtgAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTA‑GCgccaag > 1:656437/1‑147 (MQ=255) ggTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGata < 2:401732/166‑1 (MQ=255) ggTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCt > 2:736889/1‑175 (MQ=255) tGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCttt < 1:519954/174‑1 (MQ=255) cGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCtt < 1:510358/209‑1 (MQ=255) cGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCtt > 2:510356/1‑209 (MQ=255) cGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACt > 1:154327/1‑226 (MQ=255) tctTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGc > 2:280621/1‑232 (MQ=255) gtCGCGGGGAAACCCGTGCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGc < 1:780446/217‑1 (MQ=255) gcgGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAgcg > 2:672966/1‑128 (MQ=255) gcgGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGc > 1:539157/1‑227 (MQ=255) gggAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACgg < 1:351126/199‑1 (MQ=255) ccGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCTGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACgg > 1:606905/1‑192 (MQ=255) aaCAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACg > 1:625802/1‑121 (MQ=255) aaCAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACg < 2:625800/121‑1 (MQ=255) aaCAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCg < 1:281366/172‑1 (MQ=255) aaCAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGACAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCt < 2:205634/167‑1 (MQ=255) tcTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCcagccagc < 2:253764/97‑1 (MQ=255) cTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATcgc > 1:771147/1‑236 (MQ=255) cccTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTaa > 2:750293/1‑135 (MQ=255) cccTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGaa > 1:450320/1‑236 (MQ=255) cTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGcaggc > 1:505503/1‑206 (MQ=255) cTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGcaggc < 2:505501/210‑5 (MQ=255) ttGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTg > 1:348004/1‑236 (MQ=255) ttGAGGGCTGTGTCATACCTGGGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGt < 1:309843/235‑1 (MQ=255) gAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCg < 2:4710/182‑1 (MQ=255) gtCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTggg > 1:310926/1‑179 (MQ=255) cATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCCCTCGCTCACGCTGCTATCCTGGCCTTTGCGTGCGCCGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATCCTTCGCCTGCGGGTGGGcta > 2:35117/1‑178 (MQ=255) agaCCTGGGGGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTGTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATc < 2:21756/212‑1 (MQ=255) tgGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGAc > 2:209687/1‑132 (MQ=255) tgGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCg > 1:665322/1‑236 (MQ=255) tgGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCg > 1:617027/1‑236 (MQ=255) gggCAAGCCCGCGACGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCCGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCg > 2:17455/1‑114 (MQ=255) ggCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGc > 1:579862/1‑236 (MQ=255) aaGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATc < 2:295225/200‑1 (MQ=255) | CGGCAGCGAGGATGCTGTGCAGCATCTGCCAGAAGGTCGGGGGTTTGCCCTGGCTGGAATCGTCCATGGTGGCTCCTGGGGAAATCAGAGGCAATCAGGGACAGTGTAGGCAATGGTTGTGAGGTTGCCCGTACCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGTTCCAACAGGTAAATGACTGCCCTTGAGGGCTGTGTCATACCTGTGTGGGCAAGCCCGCGAAGAAGCCAGCGCAGTCGTTTAGCTGTCATACCCCAGGTTAGGCGCCAGCCAGCGCTCGCTCACGCTGATATCCTGGCCTTTGCGTGCGCTGTAACGCTCGATCTGGTCCTTGTCGACCTTGCCTACGGCAAAATACTTCGCCTGCGGGTGGGCGAAGTACCAGCCGCTGACCGCCGCCGCCGGGAACATCGCGAAGTGCTCGGTGAGGTACACCCCGCTCGGC > AE015451/2711160‑2711600 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |