| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 3409928 = | 56 (1.280) | 3 (0.070) | 3/332 | NT | 5.3% | intergenic (‑494/‑42) | PP_3022/PP_3024 | Transcriptional regulator, AraC family/conserved protein of unknown function |
| ? | AE015451 | = 3450711 | 52 (1.230) | intergenic (‑125/+258) | PP_5558/PP_3069 | putative transcriptional xre family of phage origin/Outer membrane autotransporter | |||||
GCGGAAACCTAAAGGGAGGTCAGCGAAAAATTCTTCGATCTCTTTCGGGATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGCCCACGCCGAATGTT > AE015451/3450482‑3450908 | gCGGAAACCTAAAGGGAGGTCAGCGAAAAATTCTTCGATCTCTTTCGGGATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAACATTATATTATCAGTCGCTAGGTAAcccc > 2:250039/1‑236 (MQ=255) ggAAACCTAAAGGGAGGTCAGCGAAAAATTCTTCGATCTCTTTCGGGATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCa < 2:216208/235‑1 (MQ=255) aGCGAAAAATTCTTCGATCTCTTTCGGGATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCa > 2:689755/1‑216 (MQ=255) gggATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGcc > 1:700567/1‑222 (MQ=255) tcCAAGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTa < 2:787526/230‑1 (MQ=255) gtgtCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATc > 1:596879/1‑183 (MQ=255) gggAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGgt‑‑gagtga < 1:367590/234‑1 (MQ=255) atgatgTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTc > 2:366964/1‑181 (MQ=255) gTCGGCCATCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGc < 1:44896/234‑1 (MQ=255) ccGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCggc > 1:283735/1‑208 (MQ=255) ccGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCt > 1:414695/1‑230 (MQ=255) cGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGtct > 2:276602/1‑186 (MQ=255) cGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGgctggctgaa < 1:239055/236‑3 (MQ=255) ataCTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATg > 1:726842/1‑236 (MQ=255) gTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAgcagca > 2:696898/1‑176 (MQ=255) tGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGgcc < 1:546479/235‑1 (MQ=255) gCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGgt > 2:133312/1‑179 (MQ=255) gCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGtgttgt > 1:538783/1‑211 (MQ=255) gCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGtgttgt < 2:538781/211‑1 (MQ=255) aTGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTaac < 2:216631‑M2/109‑4 (MQ=255) aTGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTaac > 1:216633‑M2/1‑106 (MQ=255) gAACAGTATAGCGAGAACGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGgccatcgc < 1:161732/235‑1 (MQ=255) aaCAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCa > 2:386041/1‑183 (MQ=255) aaCAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGgccatcg > 2:720722/1‑233 (MQ=255) cAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGtt < 2:217151/184‑1 (MQ=255) aGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCAcc > 2:631662/1‑166 (MQ=255) tataGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGTATGGGCGgcca > 1:352466/1‑225 (MQ=255) tataGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTAc > 1:497241/1‑236 (MQ=255) taGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCAccc < 2:796757/163‑1 (MQ=255) taGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGAGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCAccc > 1:796759/1‑163 (MQ=255) gaAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGCGGGTGGTTATTTTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGGAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCctgctgct > 1:221911/1‑203 (MQ=255) gaAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCt < 1:689757/236‑1 (MQ=255) aaGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTgg > 1:539655/1‑236 (MQ=255) aGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTaaccctagcgactgacaatataaactctagcttcagggtaaattgg < 2:512421‑M2/133‑47 (MQ=255) aGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTaaccctagcgactgacaatataaactctagcttcagggtaaattgg > 1:512423‑M2/1‑87 (MQ=255) aGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCtcggtc > 2:409340/1‑141 (MQ=255) aGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCACTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GATTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTCCTGCTGGACTGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTgg > 1:128295/1‑235 (MQ=255) ccATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTaaccctagcgactgacaatataaactctagcttcagggtaaattggtatcaaccctccatgcattgactcagcaggcgaacagaggcaaattgccacgcttgtcgtacttacaaatcacctgcgcattgaatggatatcatgtga < 1:610990‑M2/230‑146 (MQ=255) ccATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGgcg > 1:652234/1‑236 (MQ=255) ccATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTACCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTg > 2:575313/1‑178 (MQ=255) aaTGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GCGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGCGTGTTGTTCCTGCTGCTggc > 2:131196/1‑189 (MQ=255) aaTGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCa < 1:720724/235‑1 (MQ=255) aTGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGgtg > 1:709861/1‑170 (MQ=255) aTGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGgtg < 2:709859/170‑1 (MQ=255) ataCGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTc > 2:440067/1‑209 (MQ=255) ataCGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCg > 1:690279/1‑233 (MQ=255) aGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTGCCAGCACCCCGTTAAGAGTTGGCGGTTCCTTTGGCt > 2:595021/1‑153 (MQ=255) aGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTcagccag > 1:266011/1‑236 (MQ=255) aGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTcagccag > 1:575402/1‑236 (MQ=255) aGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTcagccag > 1:660224/1‑236 (MQ=255) ggCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTCGCAGCACCCCGgt > 2:241233/1‑129 (MQ=255) gCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATggg > 2:583464/1‑178 (MQ=255) gCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAg > 1:413632/1‑219 (MQ=255) gCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGgcc < 2:700565/179‑1 (MQ=255) cTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCg < 2:575400/233‑1 (MQ=255) gggTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGCCCACGCCGAATGtt > 1:579444/1‑236 (MQ=255) cTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCgg > 2:69950/1‑98 (MQ=255) aaaaTTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGgccatcgc < 2:805002/156‑1 (MQ=255) agcAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTAc < 2:177163/168‑1 (MQ=255) gCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGCCCAc < 2:369200/194‑1 (MQ=255) | GCGGAAACCTAAAGGGAGGTCAGCGAAAAATTCTTCGATCTCTTTCGGGATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGT‑‑GAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGCCCACGCCGAATGTT > AE015451/3450482‑3450908 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |