New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 1084429 = | 29 (1.130) | 3 (0.120) | 3/298 | NT | 10.3% | coding (254/852 nt) | PP_0939 | Carbon‑nitrogen hydrolase family protein |
? | AE015451 | 1084512 = | 25 (1.040) | coding (337/852 nt) | PP_0939 | Carbon‑nitrogen hydrolase family protein |
CAGCCAGGACGACGTGCAGACCAACCTGCAGCGTGCCGGTGCCCTGTTGGAGCAGGCCGCATTGGGCGGCGCACGGTTGGCGGTGCTGCCGGAAAACTTTGCCGCCATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGGGAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCGAGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATACGCCGGTCGGTCGGCTGGG > AE015451/1084202‑1084633 | ccggtcactgcggtaaaagctgccggtgcggttatcagctccgcgccggccgcgcgcagcgcgctgtacagttcgggaaagcgcaggtcgtaacacacgctcagccccagccgaccgaccggcgtatcagccaccaccacctgagcaccctgtgcgtagtcatccgactcgcggtaacggccccggttgtcggccacgtccacatcaaacaagtgcagcttgtcataCCTTgccgc < 1:242978‑M1/9‑1 (MQ=255) cAGGACGACGTGCAGACCAACCTGCAGCGTGCCGGTGCCCTGTTGGAGCAGGCCGCATTGGGCGGCGCACGGTTGGCGGTGCTGCCGGAAAACTTTGCCGCCATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGGGAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGtt > 1:269159/1‑236 (MQ=255) cAACCTGCAGCGTGCCGGTGCCCTGTTGGAGCAGGCCGCATTGGGCGGCGCACGGATGGCGGTGCTGCCGGAAAACTTTGCCGCCATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGGGAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCa > 1:276155/1‑236 (MQ=255) cGTGCCGGTGCCCTGTTGGAGCAGGCCGCATTGGGCGGCGCACGGTTGGCGGTGCTGCCGGAAAACTTTGCCGCCATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGGGAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGc < 1:172734/236‑1 (MQ=255) ccGGTGCCCTGTTGGAGCAGGCCGCATTGGGCGGCGCACGGTTGGCGGTGCTGCCGGAAAACTTTGCCGCCATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGGGAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCCCCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTc < 2:510382/206‑1 (MQ=255) cccTGTTGGAGCAGGCCGCATTGGGCGGCGCACGGTTGGCGGTGCTGCCGGAAAACTTTGCCGCCATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGGGAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCg > 1:100069/1‑210 (MQ=255) cccTGTTGGAGCAGGCCGCATTGGGCGGCGCACGGTTGGCGGTGCTGCCGGAAAACTTTGCCGCCATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGGGAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGc > 1:207837/1‑214 (MQ=255) ggAGCAGGCCGCATTGGGCGGCGCACGGTTGGCGGTGCTGCCGGAAAACTTTGCCGCCATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGGGAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATg < 2:139517/206‑1 (MQ=255) cGCATTGGGCGGCGCACGGTTGGCGGTGCTGCCGGAAAACTTTGCCGCCATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGGGAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACg > 1:512111/1‑236 (MQ=255) cATTGGGCGGCGCACGGTTGGCGGTGCTGCCGGAAAACTTTGCCGCCATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGGGAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACg > 2:274111/1‑234 (MQ=255) gcgcACGGTTGGCGGTGCTGCCGGAAAACTTTGCCGCCATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGGGAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCa > 2:509956/1‑178 (MQ=255) ggTTGGCGGTGCTGCCGGAAAACTTTGCCGCCATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGGGAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCGAGGTGGCGGCAAgg < 1:477562/236‑1 (MQ=255) ttGGCGGTGCTGCCGGAAAACTTTGCCGCCATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGGGAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAAg < 1:318334/183‑1 (MQ=255) ggAAGACTTTGCCGCCATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGGGAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCGAGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCt < 2:138108/231‑1 (MQ=255) aaaaCGTTGCCGCCATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGGGAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCGAGGTggc < 2:199682/211‑1 (MQ=255) cagggggCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGGGAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCGAGGTgg < 2:206833/194‑1 (MQ=255) cgaccgaccggcgtatcagccaccaccacctgagcaccctgtgcgtagtcatccgactcgcggtaacggccccggttgtcggccacgtccacatcaaacaagtgcagcttgtcataCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCGAGGt < 1:29301‑M1/73‑1 (MQ=255) tgctgcCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGGGAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCGAGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACa < 2:233750/227‑1 (MQ=255) ctgcCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGGGAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCGAGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGc < 2:512107/233‑1 (MQ=255) tgcCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGGGAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCGAGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGAcg > 1:411749/1‑223 (MQ=255) cgcgCCGAAGCCTTGGGGGAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCGAGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTc < 1:462300/236‑1 (MQ=255) cGAAGCCTTGGGGGAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCGAGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGAt < 1:378829/235‑1 (MQ=255) ccgactcgcggtaacggccccggttgtcggccacgtccacatcaaacaagtgcagcttgtcataCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCGAGGTggcg > 2:29299‑M1/65‑141 (MQ=255) gactcgcggtaacggccccggttgtcggccacgtccacatcaaacaagtgcagcttgtcataCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAACGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGt < 1:52108‑M1/55‑1 (MQ=255) ccGTGGTTGACACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCGAGGTgg < 1:110066/133‑1 (MQ=255) gTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCGAGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGcc > 2:242974/1‑175 (MQ=255) gAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCGAGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATa > 1:137300/1‑236 (MQ=255) gCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCGAGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACtt < 2:489621/145‑1 (MQ=255) gcccgcGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCGAGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGCTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGTCTGATACGCcggtcgg > 1:246819/1‑236 (MQ=255) cTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCGAGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATACGCCGGTCGGTCGGCTggg < 1:274115/236‑1 (MQ=255) ggATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCGAGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATACGCCGGTCGGTCGGCTg < 1:509960/224‑1 (MQ=255) aTTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCGAGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACACCCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGCTGACTag > 1:168280/1‑173 (MQ=255) cTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCGAGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTCGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGAt < 2:482665/155‑1 (MQ=255) | CAGCCAGGACGACGTGCAGACCAACCTGCAGCGTGCCGGTGCCCTGTTGGAGCAGGCCGCATTGGGCGGCGCACGGTTGGCGGTGCTGCCGGAAAACTTTGCCGCCATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGGGAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTTCGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCGAGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATACGCCGGTCGGTCGGCTGGG > AE015451/1084202‑1084633 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |