New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 4158769 | 26 (1.010) | 3 (0.120) | 3/304 | NT | 11.8% | coding (779/1062 nt) | PP_3661 | conserved membrane protein of unknown function, UPF0324 family |
? | AE015451 | = 4158850 | 20 (0.810) | coding (860/1062 nt) | PP_3661 | conserved membrane protein of unknown function, UPF0324 family |
TGCATCTGGATACCATGGGCGCCGGGCTGCTGCTGGGCGGCACTGTCCACGAAGTGGCGCAGGTGGTAGGCGCGGCCAGCAATGTCAGCCCCGAAGCCACGCATGTCGCCACCATCGTCAAGATGACCCGGGTCATGCTGCTGGTGCCGGTACTGCTGGTGGTGGGCCTGTGGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGTTCGCTTTCGGCTTCCTGGCCCTGGTCCTGGTGAATTCGATGCAAGTGCTGCCTGGCAGCGTGACCCAGGCCGTGAACAGCCTGGACACCTTTGCCTTGACCATGGCCATGACGGCGTTGGGCATGGAGACCCGCTTCAGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGC > AE015451/4158568‑4158999 | tgCATCTGGATACCATGGGCGCCGGGCTGCTGCTGGGCGGCACTGTCCACGAAGTGGCGCAGGTGGTAGGCGCGGCCAGCAATGTCAGCCCCGAAGCCACGCATGTCGCCACCATCGTCAAGATGACCCGGGTCATGCTGCTGGTGCCGGTACTGCTGGTGGTGGGCCTGTGGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGtt > 1:147696/1‑235 (MQ=255) aCCATGGGCGCCGGGCTGCTGCTGGGCGGCACTGTCCACGAAGTGGCGCAGGTGGTAGGCGCGGCCAGCAATGTCAGCCCCGAAGCCACGCATGTCGCCACCATCGTCAAGATGACCCGGGTCATGCTGCTGGTGCCGGTACTGCTGGTGGTGGGCCTGTGGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGTTCGCt > 2:510710/1‑228 (MQ=255) aCCATGGGCGCCGGGCTGCTGCTGGGCGGCACTGTCCACGAAGTGGCGCAGGTGGTAGGCGCGGCCAGCAATGTCAGCCCCGAAGCCACGCATGTCGCCACCATCGTCAAGATGACCCGGGTCATGCTACTGGTGCCGGTACTGCTGGTGGTGGGCCTGTGGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGTTCGCTTTCGGc < 2:389416/234‑1 (MQ=255) ccATGGGCGCCGGGCTGCTGCTGGGCGGCACTGTCCACGAAGTGGCGCAGGTGGTAGGCGCGGCCAGCAATGTCAGCCCCGAAGCCACGCATGTCGCCACCATCGTCAAGATGACCCGGGTCATGCTGCTGGTGCCGGTACTGCTGGTGGTGGGCCTGTGGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGTTCGCTTTCGGCtt < 1:510714/235‑1 (MQ=255) ggCGCCGGGCTGCTGCTGGGCGGCACTGTCCACGAAGTGGCGCAGGTGGTAGGCGCGGCCAGCAATGTCAGCCCCGAAGCCACGCATGTCGCCACCATCGTCAAGATGACCCGGGTCATGCTGCTGGTGCCGGTACTGCTGGTGGTGGGCCTGTGGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGTTCg > 2:442151/1‑220 (MQ=255) ggCGCCGGGCTGCTGCTGGGCGGCACTGTCCACGAAGTGGCGCAGGTGGTAGGCGCGGCCAGCAATGTCAGCCCCGAAGCCACGCATGTCGCCACCATCGTCAAGATGACCCGGGTCATGCTGCTGGTGCCGGTACTGCTGGTGGTGGGCCTGTGGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGTTCGCTTTCGGCt < 1:57457/229‑1 (MQ=255) tgctgctgGGCGGCACTGTCCACGAAGTGGCGCAGGTGGTAGGCGCGGCCAGCAATGTCAGCCCCGAAGCCACGCATGTCGCCACCATCGTCAAGATGACCCGGGTCATGCTGCTGGTGCCGGTACTGCTGGTGGTGGGCCTGTGGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGgc < 2:471898/189‑1 (MQ=255) tgctgctgGGCGGCACTGTCCACGAAGTGGCGCAGGTGGTAGGCGCGGCCAGCAATGTCAGCCCCGAAGCCACGCATGTCGCCACCATCGTCAAGATGACCCGGGTCATGCTGCTGGTGCCGGTACTGCTGGTGGTGGGCCTGTGGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGgc > 1:471902/1‑189 (MQ=255) ctgctgGGCGGCACTGTCCACGAAGTGGCGCAGGTGGTAGGCGCGGCCAGCAATGTCAGCCCCGAAGCCACGCATGTCGCCACCATCGTCAAGATGACCCGGGTCATGCTGCTGGTGCCGGTACTGCTGGTGGTGGGCCTGTGGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGTTCGCTTTCGGCTTCCTGGCcctggtcct < 2:122518/233‑1 (MQ=255) ggcggcACTGTCCACGAAGTGGCGCAGGTGGTAGGCGCGGCCAGCAATGTCAGCCCCGAAGCCACGCATGTCGCCACCATCGTCAAGATGACCCGGGTCATGCTGCTGGTGCCGGTACTGCTGGTGGTGGGCCTGTGGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCagcacttgcatcgaattcaccaggaccagggccaggaagccgaaagcg < 1:176135‑M1/215‑49 (MQ=255) gcggcACTGTCCACGAAGTGGCGCAGGTGGTAGGCGCGGCCAGCAATGTCAGCCCCGAAGCCACGCATGTCGCCACCATCGTCAAGATGACCCGGGTCATGCTGCTGGTGCCGGTACTGCTGGTGGTGGGCCTGTGGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGTTCGCTTTCGGCtt < 1:118782/211‑1 (MQ=255) aCGAAGTGGCGCAGGTGGTAGGCGCGGCCAGCAATGTCAGCCCCGAAGCCACGCATGTCGCCACCATCGTCAAGATGACCCGGGTCATGCTGCTGGTGCCGGTACTGCTGGTGGTGGGCCTGTGGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCagcacttgcatcgaattcaccaggaccagggccaggaagccga > 2:176131‑M1/1‑154 (MQ=255) gTGGCGCAGGTGGTAGGCGCGGCCAGCAATGTCAGCCCCGAAGCCACGCATGTCGCCACCATCGTCAAGATGACCCGGGTCATGCTGCTGGTGCCGGTACTGCTGGTGGTGGGCCTGTGGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGTTCGCTTTCGGCTTCCTGGCCCTGGTCCTGGTGAATTCGATGCAAGTGCTgcctg < 1:463719‑M2/235‑6 (MQ=255) gcAGGTGGTAGGCGCGGCCAGCAATGTCAGCCCCGAAGCCACGCATGTCGCCACCATCGTCAAGATGACCCGGGTCATGCTGCTGGTGCCGGTACTGCTGGTGGTGGGCCTGTGGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGTTCGCTTTCGGCTTCCTGGCCCTGGTCCTGGTg > 1:30589/1‑208 (MQ=255) gcAGGTGGTAGGCGCGGCCAGCAATGTCAGCCCCGAAGCCACGCATGTCGCCACCATCGTCAAGATGACCCGGGTCATGCTGCTGGTGCCGGTACTGCTGGTGGTGGGCCTGTGGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGACCTGGTTCGCTTTCGGCTTCCTGGCCCTGGTCCTGGTGAATTCGATGCAAGTGCTgcctgg < 2:497039‑M2/231‑7 (MQ=255) gCCCCGAAGCCACGCATGTCGCCACCATCGTCAAGATGACCCGGGTCATGCTGCTGGTGCCGGTACTGCTGGTGGTGGGCCTGTGGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGTTCGCTTTCGGCTTCCTGGCCCTGGTCCTGGTGAATTCGATGCAAGTGCTGCCTGGCAGCGTGACCCAGGCCGTGAACAGCCt < 2:429906/229‑1 (MQ=255) caTCGTCAAGATGACCCGGGTCATGCTGCTGGTGCCGGTACTGCTGGTGGTGGGCCTGTGGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGTTCGCTTTCGGCTTCCTGGCCCTGGTCCTGGTGAATTCGATGc < 2:366129/164‑1 (MQ=255) aGATGACCCGGGTCATGCTGCTGGTGCCGGTACTGCTGGTGGTGGGCCTGTGGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGTTCGCTTTCGGCTTCCTGGCCCTGGTCCTGGTGAATTCGATGCAAGTGCTGCCTGGCAGCGTGACCCAGGCCGTGAACAGCCTGGaca < 1:464900/201‑1 (MQ=255) aGATGACCCGGGTCATGCTGCTGGTGCCGGTACTGCTGGTGGTGGGCCTGTGGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGTTCGCTTTCGGCTTCCTGGCCCTGGTCCTGGTGAATTCGATGCAAGTGCTGCCTGGCAGCGTGACCCAGGCCGTGAACAGCCTGGACACCTTTGCCTTGACCATGGCCa < 2:147692/222‑1 (MQ=255) aTGACCCGGGTCATGCTGCTGGTGCCGGTACTGCTGGTGGTGGGCCTGTGGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGTTCGCTTTCGGCTTCCTGGCCCTGGTCCTGGTGAATTCGATGCAAGTGCTGCCTGGCAGCGTGa < 2:321191/175‑1 (MQ=255) ggTACTGCTGGTGGTGGGCCTGTGGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGTTCGATTTCGGCTTCCTGGCCCTGGTCCTGGTGAATTCGag > 2:150021/1‑125 (MQ=255) tgctgGTGGTGGGCCTGTGGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGTTCGCTTTCGGCTTCCTGGCCCTGGTCCTGGTGAATTCGATGCAAGTGCTGCCTGGCAGCGTGa > 2:278797/1‑144 (MQ=255) gggCCTGTGGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGTTCGCTTTCGGCTTCCTGGCCCTGGTCCTGGTGAATTCGATGCAAGTGCTGCCTGGCAGCGTGACCCAGGCCGTGAACAGCCTGGACACCTTTGCCTTGACCATGGCCATGACg > 1:372472/1‑184 (MQ=255) ccTGTGGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGTTCGCTTTCGGCTTCCTGGCCCTGGTCCTGGTGAATTCGATGCAAGTGCTGCCTGGCAGCGTGACCCAGGCCGTGAACAGCCTGGACACCTTTGCCTTGACCATGGCCATGACGGCGTTGGGCATGGAGACCCGCTTCAGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACggg > 1:333266/1‑233 (MQ=255) tgGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGTTCGCTTTCGGCTTCCTGGCCCTGGTCCTGGTGAATTCGATGCAAGTGCTGCCTGGCAGCGTGACCCAGGCCGTGAACAGCCTGGACACCTTTGCCTTGACCATGGCCa < 2:374889/172‑1 (MQ=255) aGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGTTCGCTTTCGGCTTCCTGGCCCTGGTCCTGGTGAATTCGATGCAAGTGCTGCCTGGCAGCGTGACCCAGGCCGTGAACAGCCTGGACACCTTTGCCTTGACCATGGCCATGACGGCGTTGGGCATGGAGACCCGCTTCAGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCg < 1:497043/235‑1 (MQ=255) cGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGTTCGCTTTCGGCTTCCTGGCCCTGGTCCTGGTGAATTCGATGCAAGTGCTGCCTGGCAGCGTGACCCAGGCCGTGAACAGCCTGGACACCTTTGCCTTGACCATGGCCATGACGGCGTTGGGCATGGAGACCCGCTTCAGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTg < 1:442155/235‑1 (MQ=255) gTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGTTCGCTTTCGGCTTCCTGGCCCTGGTCCTGGTGAATTCGATGCAAGTGCTGCCTGGCAGCGTGACCCAGGCCGTGAACAGCCTGGACACCTTTGCCTTGACCATGGCCATGACGGCGTTGGGCATGGAGACCCGCTTCAGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGc > 1:188272/1‑235 (MQ=255) ttCGCGCAAGGCAGGCCAGGCagcacttgcatcgaattcaccaggaccagggccaggaagccgaaagcgaaccagggcatggcaatgcgcccgttgccctg > 2:397270‑M1/1‑21 (MQ=255) gcAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGTTCGCTTTCGGCTTCCTGGCcctg < 2:150457/71‑1 (MQ=255) gcAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGTTCGCTTTCGGCTTCCTGGCcctg > 1:150461/1‑71 (MQ=255) ccaggcagcacttgcatcgaattcaccaggaccagggccaggaagccgaaagcgaaccaggtcatggcaatgcgcccgttgccctgcgcctggcctgccttgcgcgaacggctgatccacaggcccaccaccagcagtaccggcaccagcagcatgacccgggtcatcttgacgatggtggcgacatgcgtggcttcggggctgacattgctggccgcgcctaccacctgc < 2:497039‑M1/231‑226 (MQ=255) caggcagcacttgcatcgaattcaccaggaccagggccaggaagccgaaagcgaaccagggcatggcaatgcgcccgttgccctgcgcctggcctgccttgcgcgaacggctgatccacaggcccaccaccagcagtaccggcaccagcagcatgacccgggtcatcttgacgatggtggcgacatgcgtggcttcggggctgacattgctggccgcgcctaccacctgcgccac < 1:463719‑M1/235‑231 (MQ=255) | TGCATCTGGATACCATGGGCGCCGGGCTGCTGCTGGGCGGCACTGTCCACGAAGTGGCGCAGGTGGTAGGCGCGGCCAGCAATGTCAGCCCCGAAGCCACGCATGTCGCCACCATCGTCAAGATGACCCGGGTCATGCTGCTGGTGCCGGTACTGCTGGTGGTGGGCCTGTGGATCAGCCGTTCGCGCAAGGCAGGCCAGGCGCAGGGCAACGGGCGCATTGCCATGCCCTGGTTCGCTTTCGGCTTCCTGGCCCTGGTCCTGGTGAATTCGATGCAAGTGCTGCCTGGCAGCGTGACCCAGGCCGTGAACAGCCTGGACACCTTTGCCTTGACCATGGCCATGACGGCGTTGGGCATGGAGACCCGCTTCAGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGC > AE015451/4158568‑4158999 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |