New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 1737987 = | 48 (1.860) | 18 (0.780) | 14/284 | NT | 32.5% | coding (32/348 nt) | yffB | putative glutathione‑dependent thiol reductase |
? | AE015451 | = 1777401 | 32 (1.390) | intergenic (+135/+157) | PP_5476/PP_1585 | conserved protein of unknown function/putative Antidote protein |
TGGGATCTCGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCGATGATCTCATCGCCGTGTTGCTGTTCGGCTGTGCGCAGA > AE015451/1777171‑1777624 | tGGGATCTCGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggc < 1:440679‑M2/236‑6 (MQ=255) gggATCTCGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggct < 1:406594‑M2/236‑7 (MQ=255) ggATCTCGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggct > 1:158348‑M2/1‑229 (MQ=255) gttgttTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgt < 1:39476‑M2/236‑17 (MQ=255) gttgttTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgcc > 2:216011‑M2/1‑220 (MQ=255) gttgttTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgcc < 2:222921‑M2/234‑15 (MQ=255) ttCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGc < 1:249073/236‑1 (MQ=255) gagaATTTTTCAGATCAAGAGCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGt < 1:60607/236‑1 (MQ=255) gtgGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggct > 1:368998‑M2/2‑174 (MQ=255) tGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggctgggattactccccaa > 1:43715‑M2/1‑173 (MQ=255) tGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTc < 2:175851/203‑1 (MQ=255) ggTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgt > 1:410989‑M2/1‑172 (MQ=255) ggCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCAt < 2:436672/200‑1 (MQ=255) 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cgtCCCCAAAATGCATCCGTAAACTCCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTa < 2:23053/186‑1 (MQ=255) tCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGAt < 2:421442/210‑1 (MQ=255) cAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTATCTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaacggggctgggattactccccaaaacctccccaatatctcccaaaaattagtcgcaggatt < 2:481903‑M2/228‑102 (MQ=255) cAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAActgtct > 1:58900/1‑231 (MQ=255) aaTGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggctgggattactccccaaaacctccccaatatctcccaaaaattag > 2:449925‑M2/1‑124 (MQ=255) gCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTcgc > 1:472121/1‑234 (MQ=255) ttCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTg < 2:406590/231‑1 (MQ=255) tCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatt > 2:388840‑M2/1‑102 (MQ=255) cTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAGCTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggctgggattactccccaaaacctccccaatatctcccaaacattagtg < 1:485139‑M2/194‑94 (MQ=255) cTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGAt > 1:213237/1‑194 (MQ=255) gAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggctgggattactccccaaaacctccccaatatctcccaaaaattagtcgcaggattatgcgacatcgatccactcagcgccacggctgtcacggtataga < 1:140213‑M2/235‑146 (MQ=255) gAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggctgggattactccccaaaacctccccaatatctcccaaaaattagtcgcaggattatgcgacatcgatccactaagcg < 1:38674‑M2/214‑125 (MQ=255) 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1:4644/1‑235 (MQ=255) aaaGGCGCAATTTCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGcc < 2:445980/211‑1 (MQ=255) gcgcAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCgt < 2:180060/97‑1 (MQ=255) cAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTg < 2:282570/199‑1 (MQ=255) cGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATc < 1:63197/212‑1 (MQ=255) ggcgcCATATTTGCTGTAAGGCATTGATTTAGCTGGGCTTTAGTCGGTTTATCTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGACGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTcgcg < 2:58897/150‑1 (MQ=255) ccATAGTTGCTTTAAGGCAGTGATGTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggcttggatgccgt > 2:22365‑M2/1‑58 (MQ=255) tatTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTcgc > 1:356131/1‑168 (MQ=255) tatGTGCATTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTAtt < 1:84613/198‑1 (MQ=255) atTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaagg > 2:39473‑M2/1‑54 (MQ=255) tAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGtt > 2:344887/1‑203 (MQ=255) ttGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggctgggattactccccaaaacctccccaatatctcccaaaaattagtcgcaggattatgcgacatcgatccactcagcgccacggctgtcacggtatagatcggtcatcttggccgaa > 2:181309‑M2/1‑39 (MQ=255) aTTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGACGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCGATGATCTCATCGCCg < 1:386866/235‑1 (MQ=255) tttAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCaa > 2:495426/1‑195 (MQ=255) gtAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGTCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCGCGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTc < 1:476207/191‑1 (MQ=255) cTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCATGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGAccc < 2:379305/208‑1 (MQ=255) ttAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggctgggattactccccaaaacctccccaatatctcccaaaaattagtcgcaggattatgcgacatcgatccactcagcgccacggctgtcacggtatagatcggtcatcttggccgaacggtgacccagcagtcgctgtgcatctcgaccttcttcgtcatgtagcct < 1:482722‑M2/236‑214 (MQ=255) ttAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggctgggattactccccaaaacctccccaatatctcccaaaaattagtcgcaggattatgcgacatcgatccactcagcgccacggctgtcacggtatagatcggtcatcttggccgaacggtgacccagcagtcgctgtgcatctcgaccttctgcgtcatgtagcct < 1:194338‑M2/236‑214 (MQ=255) ttAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCGATGATCTCATCGCCGTGTTGCTGTTCgg > 1:509178/1‑235 (MQ=255) ttAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCGATGATCTCATCGCCGTGTTGCTGTTCg > 1:417388/1‑234 (MQ=255) tAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGCCCAGACGCTGGACCGACCCGATGATCTCATCGCCGTGGTGCTTTTCGGCt > 1:101538/1‑236 (MQ=255) tAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCGATGATCTCATCGCCGTGTTGCTGTTCGGcc > 1:95827/1‑235 (MQ=255) tCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGaa > 2:419435/1‑122 (MQ=255) cGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGgaccgac > 1:210751/1‑199 (MQ=255) tttAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggctgggattactccccaaaacctccccaatatctcccaaaaattagtcgcaggattatgcgacatcgatccactcagcgccacggctgtcacggtatagatcggtcatcttggccgaacggtgacccagcagtcgctgtgcatctcgaccttcttcgtcatgtagcc > 2:209075‑M2/1‑15 (MQ=255) aaCTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggctgggattactccccaaaacctccccaatatctcccaaaaattagtcgcaggattatgcgacatcgatccactcagcgccacggctgtcacggtatagatcggtcatcttggccgaacggtgacccagcagtcgctgtgcatctcgaccttcttcgtcatgtagcctggccgccagg < 1:427676‑M2/235‑224 (MQ=255) tGGCGTCCcagtctctgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggatgggattactccccaaaacctccccaatatctcccaaaaattagtcgcaggattatgcgacatcgatccactcagcg > 2:325181‑M2/1‑8 (MQ=255) ggCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggctgggattactccccaaaacctccccaatatctcccaaaaattagtcgcaggattatgcgacatcgatccactcagcgccacggctgtcacggtatagatcggtcatcttggccgaacggtgacccagcagtcgctgtgcatc > 2:489052‑M2/1‑7 (MQ=255) | TGGGATCTCGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCGATGATCTCATCGCCGTGTTGCTGTTCGGCTGTGCGCAGA > AE015451/1777171‑1777624 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |