New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 6041683 = | 31 (1.200) | 3 (0.120) | 3/302 | NT | 10.4% | coding (241/723 nt) | rph | Ribonuclease PH |
? | AE015451 | 6041753 = | 22 (0.900) | coding (171/723 nt) | rph | Ribonuclease PH |
GATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAGTACCGACCCTTCGGCGTGCTTGGTGTAGTTGCGGGTGATGCGGATCGAGCGGAGCTGATCGGCAACGCGACCACTTGGACGTTTCATCTGGGATACCTGTACTGGGACTTTGAATCTGCCGAGCATTATAGAGCCCGCAGCCCGGGGAA > AE015451/6041531‑6041985 | gATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCtt > 1:271484/1‑236 (MQ=255) gACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAg < 1:354450/236‑1 (MQ=255) aCGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTg > 2:226928/1‑226 (MQ=255) aTCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGcc > 2:131059/1‑204 (MQ=255) tCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGAcc < 1:413611/236‑1 (MQ=255) gTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGaa > 2:472604/1‑234 (MQ=255) aGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAg > 2:419943/1‑236 (MQ=255) cATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGcgcg > 1:93923/1‑170 (MQ=255) ccAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAGTACCGACCCTTc < 1:318163/235‑1 (MQ=255) gcggcgcgCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAGTACCGACCCTTCGGc < 2:271480/233‑1 (MQ=255) gcggcgcgCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAGTACCGACCCTTCGGCGt < 1:170996/235‑1 (MQ=255) aGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGGGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCGTCTGCGGAAGCGCgg > 1:65429/1‑137 (MQ=255) ggATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAGTACCGACCCTTCGGCGTGCTTGGTGTAGTTGCGGGTGATGCg > 1:260263/1‑229 (MQ=255) aGGGGGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACGCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCt > 2:123144/1‑108 (MQ=255) ccTGCTTGCCACGGCTCGCTTCGCGCTGGTTCCGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAGTACCGACCCTTc < 1:64598/178‑1 (MQ=255) ccACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGcc < 2:31333/80‑1 (MQ=255) cACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAGTACCGACCCTTCGGCGTGCTTGGTGTAGTTGCGGGTGATGCGGATCGAGCGGAGCTGATCGGCAACGCGACCACTTGGa < 1:419947/236‑1 (MQ=255) CTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAGTACCGACCCTTCGGCGTGCTTGGTGTAGTTGCGGGTGATGCGGATCGAGCGGAGCTGATCGGCAAc > 1:96013‑M1/1‑218 (MQ=255) TGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTCGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAGTACCGACCCTTCGGCGTGCTTGGTGTAGTTGCGGGTGATGCGGATCGAGCGGAGCTGATCGGCAACGCGACCACTTGGACGTTTc > 1:25020‑M1/1‑236 (MQ=255) cgagtatggcatgctgccgcgctccaccggcgaacgtaaccagcgcgaagccagccTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAGTACCGACCCTTCGGCGTGCtt < 1:148655‑M2/105‑1 (MQ=255) cgagtatggcatgctgccgcgctccaccggcgaacgtaaccagcgcgaagccagccTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAGTACCGACCCTTCGGCGTGCtt > 2:148651‑M2/57‑161 (MQ=255) aGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAGTACCGACCCTTCGGCGTGCTTGGTGTAGTTGCGGGTGATGCGGATCGAGCGGAGCTGATCGGCAACGCGACCACTTGGACGTTTCATCTGGGATACCTGTACTGGGACTTTGAAt < 1:505009/236‑1 (MQ=255) caTGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAGTACCGACCCTTCGGCGTGCTTGGTGTAGTTGCGGGTGATGCGGATCGAGCGGAGCTGATCGGCAACGCGACCACTTGGACGTTTCATCTGGGATACCTGTACTGGGACTTTGAATCt < 1:385683/228‑1 (MQ=255) cATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAGTACCGACCCTTCGGCGTGCTTGGTGTAGTTGCGGGTGATGCGGATCGAGCGGAGCTGATc < 1:517871/166‑1 (MQ=255) gtaaccagcgcgaagccagccGTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAGTACCGACCCTTCGGCGTGCTTGGTGTCGTTGCGGGTGATGCGGATCGAGCGGAGCTGATCGGCAACGCGCCCACTTGGACGTGTCAGCTGCGATAcc > 2:254208‑M2/22‑202 (MQ=255) tCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAGTACCGACCCTTCGGCGTGCTTGGTGTAGTTGCGGGTGATGCGGATCGAGCGGAGCTGATCGGCAACGCGACCACTTGGACGTTTCATCTGGGATACCTGTACTGGGACTTTGAATCTGCCGAGCATTATAGAGc < 1:322670/235‑1 (MQ=255) gcggcggTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAGTACCGACCCTTCGGCGTGCTTGGTGTAGTTGCGGGTGATGCGGATCGAGCGGAGCTg < 2:291679/157‑1 (MQ=255) ggTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCCACGCTGACCGTGCAGCTGACTTTGGTGTCACCGACCTCGACCAGTACCGACCCTTCGGCGt > 2:76381/1‑113 (MQ=255) ggTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAg < 2:155418/96‑1 (MQ=255) agccagccGTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAGTACCGACCCTTCGGCGTGCTTGGTGTAGTTGCGGGTGATGCGGATCGAGCGGAGCTGATCGGCAACGCGACCACTTGGACGTTTCATCTGGGATACCTGTACTGGGACTTTGAATCTGCCGAGCATTATAGAGCCCGCAGCCCg > 1:252408‑M2/9‑236 (MQ=255) ccTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAGTACCGACCCTTCGGCGTGCTTGGTGTAGTTGCGGGTGATGCGGATCGAGCGGAGCTGATCGGCAACGCGACCACTTGGACGTTTCATCTGGGATACCTGTACTGGGACTTTGAATCTGCCGAGCATTATAGAGCCCGCAGCCCGGGGaa < 1:472608‑M2/233‑1 (MQ=255) | GATGGACGCGGTACGGGTACCGCCATCGGCCTGGATCACGTCGCAATCGACGTACAGGGTGATGTCACCGAGCTTGCTCATGTCCAGCGCGGCGCGCAGCGAACGGCCGATCAGGCGCTGGATTTCCAGGGTGCGGCCACCCTGCTTGCCACGGCTGGCTTCGCGCTGGTTACGTTCGCCGGTGGAGCGCGGCAGCATGCCATACTCGGCGGTCAGCCAGCCTTGGCCCTGGCCTTTGAGGAAGCGCGGTACACCGTTTTCAACGCTGACCGTGCAGATGACTTTGGTGTCACCGAACTCGACCAGTACCGACCCTTCGGCGTGCTTGGTGTAGTTGCGGGTGATGCGGATCGAGCGGAGCTGATCGGCAACGCGACCACTTGGACGTTTCATCTGGGATACCTGTACTGGGACTTTGAATCTGCCGAGCATTATAGAGCCCGCAGCCCGGGGAA > AE015451/6041531‑6041985 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |