Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC | AE015451 | 303,121 | +GCT | 41.7% | coding (1286/1314 nt) | envZ → | Osmolarity sensor protein EnvZ |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 303121 | 22 (0.410) | 16 (0.280) +GCT |
15/314 | NT | 41.7% | coding (1286/1314 nt) | envZ | Osmolarity sensor protein EnvZ |
? | AE015451 | 303122 = | 22 (0.380) | coding (1287/1314 nt) | envZ | Osmolarity sensor protein EnvZ |
CGCCGTATGTGGTGCTCAGTGTGCTGGACCGGGGCACCGGTATTGACGAGTCGGAGCTGGAAACCATCTTCAACCCGTTCATTCGCGGTGATCGGGCACGGGGCGGCAAGGGCACCGGGCTGGGGCTGGCGATCGTCAAGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGGCTGCTGCTGCCGCGTAATGCTGTGTGAGGCTCACTGGCCTCTTCACGGCTAAAGCCGCACCTACAGGGATTGCGCAGTACCTGTGGCAGCGGCTTGGCCGCGAAGCGGCGGGTAGAGGCTTGAATCAGCCTTTGCCCTTGGTCCGGGTCTGATTGGGCCCGCCATTCTTCTCCAGGTGCTCGATGATCATCCCGGCGACGTTCTTGCCGGTGGTGACCTCGATGCCCTCCAG > AE015451/302896‑303354 | cgcCGTATGTGGTGCTCAGTGTGCTGGACCGGGGCACCGGTATTGACGAGTCGGAGCTGGAAACCATC‑TCAACCCGTTCATTCGCGGTGATCGGGCACGGGGCGGCAAGGGCACCGGGCTGGGGCTGGCGATCGTCAAGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGgctgctgctg < 1:682938‑M1/235‑11 (MQ=255) gtgtGCTGGACCGGGGCACCGGTATTGACGAGTCGGAGCTGGAAACCATCTTCAACCCGTTCATTCGCGGTGATCGGGCACGGGGCGGCAAGGGCACCGGGCTGGGGCTGGCGATCGTCAAGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGGCTGCTGCTGCCGCGTAATGCTGTGTGa > 1:845865/1‑236 (MQ=255) cGGGGCACCGGTATTGACGAGTCGGAGCTGGAAACCATCTTCAACCCGTTCATTCGCGGTGATCGGGCACGGGGCGGCAAGGGCACCGGGCTGGGGCTGGCGATCGTCAAGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGGCTGCTGCTGCCGCGTAATGCTGTGTGAGGCTCACTGGc > 1:635000/1‑236 (MQ=255) ggggCACCGGTATTGACGAGTCGGAGCTGGAAACCATCTTCAACCCGTTCATTCGCGGTGATCGGGCACGGGGCGGCAAGGGCACCGGGCTGGGGCTGGCGATCGTCAAGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGGCTGCTGCTGCCGCGTAATGCtgt > 1:605882/1‑220 (MQ=255) gggCACCGGTATTGACGAGTCGGAGCTGGAAACCATCTTCAACCCGTTCATTCGCGGTGATCGGGCACGGGGCGGCAAGGGCACCGGGCTGGGGCTGGCGATCGTCAAGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGGCTGCTGCTGCCGCGTAATGCTGTGTGAGGCTCACt < 2:644569/231‑1 (MQ=255) cACCGGTATTGACGAGTCGGAGCTGGAAACCATCTTCAACCCGTTCATTCGCGGTGATCGGGCACGGGGCGGCAAGGGCACCGGGCTGGGGCTGGCGATCGTCAAGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTAAGGTTGCCGCTGGGGCTGCTGCTGCCGCGTAATGCTGTGTGAGGCTCACTGGCctct > 1:593942/1‑235 (MQ=255) ggTATTGACGAGGCGGAGCTGGAAACCATCTTCAACCCGTTCATTCGCGGTGATCGGGCACGGGGCGGCAAGGGCACCGGGCTGGGGCTGGCGATCGTCAAGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGGCTGCTGCTGCCGCGTAATGCtgtgt < 2:1054256/214‑1 (MQ=255) gTATTGACGAGTCGGAGCTGGAAACCATCTTCAACCCGTTCATTCGCGGTGATCGGGCACGGGGCGGCAAGGGCACCGGGCTGGGGCTGGCGATCGTCAAGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGgctgctgctgctgcc < 2:489997‑M1/202‑16 (MQ=255) gAGCTGGAAACCATCTTCAACCCGTTCATTCGCGGTGATCGGGCACGGGGCGGCAAGGGCACCGGGCTGGGGCTGGCGATCGTCAAGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGgctgctgctgctgccgcgtaatgctgtgtgaggctcactggcctcttcacggctaaagccgca > 1:982042‑M1/1‑173 (MQ=255) ggAAACCATCTTCAACCCGTTCATTCGCGGTGATCGGGCACGGGGCGGCAAGGGCACCGGGCTGGGGCTGGCGATCGTCAAGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGGCTGCTGCTGCCGCGTAATGCTGTGTGAGGCTCACTGGCCTCTTCACGGCTAAAGCCGCACCTACAg < 2:634997/235‑1 (MQ=255) ggAAACCATCTTCAACCCGTTCATTCGCGGTGATCGGGCACGGGGCGGCAAGGGCACCGGGCTGGGGCTGGCGATCGTCAAGAGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGGCTGCTGCTGCCGCGTAATGCTGTGTGAGGCTCACTGGCCTCTTCACGGCTAAAGCCGCACCTACAg < 1:457196/235‑1 (MQ=255) aCCATCTTCAACCCGTTCATTCGCGGTGATCGGGCACGGGGCGGCAAGGGCACCGGGCTGGGGCTGGCGATCGTCAAGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGGCTGCTGCTGCCGCGTAATGCTGTGTGAGGCTCACTGGCCTCTTCa > 1:713783/1‑210 (MQ=255) gTTCATTCGCGGTGATCGGGCACGGGGCGGCAAGGGCACCGGGCTGGGGCTGGCGATCGTCAAGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGGCTGCTGCTGCCGCGTAATGCTGTGTGAGGCTCACTGGCCTCTTCACGGCTAAAGCCGCAcc < 2:729092/212‑1 (MQ=255) gTTCATTCGCGGTGATCGGGCACGGGGCGGCAAGGGCACCGGGCTGGGGCTGGCGATCGTCAAGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGGCTGCTGCTGCCGCGTAATGCTGTGTGAGGCTCACTGGCCTCTTCACGGCTAAAGCCGCAcc > 1:729095/1‑212 (MQ=255) aTTCGCGGTGATCGGGCACGGGGCGGCAAGGGCACCGGGCTGGGGCTGGCGATCGTCAAGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGGCTGCTGCTGCCGCGTAATGCTGTGTGAGGCTCACTGGCCTCTTCACGGCTAAAGCCGCACCTACAGGGATTGCGCAGTACCTGTgg > 2:574710/1‑233 (MQ=255) gcgGTGATCGGGCACGGGGCGGCAAGGGCACCGGGCTGGGGCTGGCGATCGTCAAGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGgctgctgctgctgccgcgtaatgctgtgtgaggctcactggcctcttcacggctaaagccgcacctacag < 1:897793‑M1/212‑71 (MQ=255) aTCGGGCACGGGGCGGCAAGGGCACCGGGCTGGGGCTGGCGATCGTCAAGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGGCTGCTGCTGCCGCGTAATGCTGTGTGAGGCTCACTGGCCTCTTCACGGCTAAAg < 2:1025770/191‑1 (MQ=255) aTCGGGCACGGGGCGGCAAGGGCACCGGGCTGGGGCTGGCGATCGTCAAGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGGCTGCTGCTGCCGCGTAATGCTGTGTGAGGCTCACTGGCCTCTTCACGGCTAAAg > 1:1025773/1‑191 (MQ=255) gggCACGGGGCGGCAATGGCACCGGGCTGGGGCTGGCGATCGTCAAGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGgctgctgctgctgccgcgtaatgctgtgtgaggctcactggcctcttcacg < 1:231643‑M1/184‑52 (MQ=255) gggCACGGGGCGGCAAGGGCACCGGGCTGGGGCTGGCGATCGTCAAGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGGCTGCTGCTGCCGCGTAATGCTGTGTGAGGCTCACTGGCCTCTTCACGGCTAAAGCCGCACCTACAGGGATTGCGCAGTACCTGTGGCAGCGGCTTGGCcgc > 1:1010127/1‑235 (MQ=255) ggcggcAAGGGCACCGGGCTGGGGCTGGCGATCGTCAAGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGGCTGCTGCTGCCGCGTAATGCTGTGTGAGGCTCACTGGCCTCTTCACGGCTAAAGCCGCACCTACAGGGATTGCGCAGTACCTGTGGCAGCGGCTTGGCCGCGAAgcggcg > 1:1050646/1‑236 (MQ=255) cggcAAGGGCACCGGGCTGGGGCTGGCGATCGTCAAGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGgctgctgctgctgccgcgtaatgctgtgtgaggctcactggcctcttcacg > 1:1003861‑M1/1‑123 (MQ=255) ggCACCGGGCTGGGGCTGGCGATCGTCAAGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGGCTGCTGCTGCCGCGTAATGCTGTGTGAGGCTCACTGGCCTCTTCACGGCTAAAGCCGCACCTACAGGGATTGCGCAGTACCTGTGGCAGCGGCTTGGCCGCGAAgc < 2:845862/223‑1 (MQ=255) cGGGCTGGGGCTGGCGCTCGGCACGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGgctgctgctgctgccgcgtaatgctgtgtgaggctcact < 1:348983‑M1/150‑40 (MQ=255) aTCGTCAAGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGgctgctgctgctgccgcgtaatgctgtgtgaggctcactggcctcttcacggctaaagccgcacctacagggattgcgcagtacctgtggcagcggcttggccgcgaagcggcgggtagaggcttgaatcagcctttgc < 2:1025110‑M1/234‑140 (MQ=255) aTCGTCAAGCGGATTGCTGCGCAACAAGGCGGGATCGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGgctgctgctgctgccgcgtaat < 2:304644‑M1/117‑23 (MQ=255) tCAAGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGGTGCCGCTGGGGCTGCTGCTGCCGCGGAATGCtgg > 1:241467/1‑114 (MQ=255) aCATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGGCTGCTGCTGCCGCGTAATGCTGTGTGAGGCTCACTGGCCTCTTCACGGCTAAAGCCGCACCTACAGGGATTGCGCAGTACCTGTGGCAGCGGCTTGGCCGCGAAGCGGCGGGTAGAGGCTTGAATCAGCCTTTGCCCTTGGTCCGGGTCTGATTGGGCCCGc < 2:1013099/235‑1 (MQ=255) cATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTTGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTggg > 1:142888/1‑71 (MQ=255) cATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGgctgctgctg < 2:79118‑M1/81‑11 (MQ=255) tGGAGTGGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGGCTGCTGCTGCCGCGTAATGCTGTGTGAGGCTCACTGGCCTCTTCACGGCTAAAGCCGCACCTACAg < 2:632391/125‑1 (MQ=255) gAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGgctgctgctgctgccgcgtaatgctgtgtgaggctcactggcctcttcgcggctaaagccgcacctacagggattgcgcagtacctgtggcagcggcttggccgcgaagcggcgggtagaggcttgaatcagcctttgccctt < 2:937667‑M1/199‑144 (MQ=255) gAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGGCTGCTGCTGCCGCGTAATGCTGTGTGAGGCTCACTGGCCTCTTCACGGCTAAAGCCGCACCTACAGGGATTGCGCAGTACCTGTGGCAGCGGCTTGGCCGCGAAGCGGCGGGTAGAGGCTTGAATCAGCCTTTGCCCTTGGTCCGGGTCTGATTGGGCCCGCCATTCTTCTCCAGGt < 2:1050643/234‑1 (MQ=255) cGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGgctgctgctgctgccgcgtaatgctgtgtgaggctcactggcctcttcacggctaaagcc < 2:629391‑M1/110‑61 (MQ=255) aCCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGgctgctgctgctgccgcgtaatgctgtgtgaggctcactggcctcttcacggttaaagccgcacctacagggattgcgcagtacctgtggca > 2:586268‑M1/1‑46 (MQ=255) cggcggGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGGCTGCTGCTGCCGCGTAATGCTGTGTGAGGCTCACTGGCCTCTTCACGGCTAAAGCCGCACCTACAGGGATTGCGCAGTACCTGTGGCAGCGGCTTGGCCGCGAAGCGGCGGGTAGAGGCTTGAATCAGCCTTTGCCCTTGGTCCGGGTCTGATTGGGCCCGCCATTCTTCTCCAGGt < 1:27907/214‑1 (MQ=255) gcggGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGgctgctgctgctgccgcgtaatgctgtgtgaggctcactggcctcttcacggctaaagccgcacctacagggattgcgcagtacctgtggcagcggcttggccgcgaagcggcgggtagaggcttgaatcagcctttgcccttggtccgggtctgattgggcccgccattcttctccaggtgctcgatgatcatcccggcg > 1:818777‑M1/1‑34 (MQ=255) ggATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGgctgctgctgctgccgcgtaatgctgtgtgaggctcactggcctcttcacggctaaagccgcacctacagggattgcgcagtacctgtggcagcggcttggccgcgaagcggcgggtagaggcttgaatcagcctttgcccttggtccgggtctgattgggcccgccattcttctccaggtgctcgatgatcatcccggcgac < 2:818774‑M1/234‑204 (MQ=255) tCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGgctgctgctgctgccgcgtaatgctgtgtgaggctcactggcctcttcacggctaaagccgcacctacagggattgcgcagtacctgtggcagcggcttggccgcgaagcggcgggtagaggcttga > 2:738602‑M1/1‑28 (MQ=255) gCCGCTGGGgctgctgctgctgccgcgtaatgctgtgtgaggctcactggcctcttcacggctaaagccgcacctacagggcttgcgcagtccctgtggcagcggcgtggccg > 2:796885‑M1/1‑9 (MQ=255) tGGGgctgctgctgctgccgcgtaatgctgtgtgaggctcactggcctcttcacggctaaagccgcacctacagggattgcgcagtacctgtggcagcggcttggccgcgaagcggcgggtagaggcttgaatcagcctttgcccttggtccgggtctgattgggcccgccattcttctccaggtgctcgatgatcatcccggcgacgttcttgccggtggtgacctcgatgccc > 1:979959‑M1/1‑4 (MQ=255) tGGGGCTGCTGCTGCCGCGTAATGCTGTGTGAGGCTCACTGGCCTCTTCACGGCTAAAGCCGCACCTACAGGGATTGCGCAGTACCTGTGGCAGCGGCTTGGCCGCGAAGCGGCGGGTAGAGGCTTGAATCAGCCTTTGCCCTTGGTCCGGGTCTGATTGGGCCCGCCATTCTTCTCCAg > 2:395383/1‑180 (MQ=255) ggctgctgctgctgccgcgtaatgctgtgtgaggctcactggcctcttcacggctaaagccgcacctacagggattgcgcagtacctgtggcagcggcttggccgcgaagcggcgggtagaggcttgaatcagcctttgcccttggtccgggtctgattgggcccgccattcttctccaggtgctcgatgatcatcccggcgacgttcttgccggtggtgacctcgatgccctc > 2:378078‑M1/1‑1 (MQ=255) | CGCCGTATGTGGTGCTCAGTGTGCTGGACCGGGGCACCGGTATTGACGAGTCGGAGCTGGAAACCATCTTCAACCCGTTCATTCGCGGTGATCGGGCACGGGGCGGCAAGGGCACCGGGCTGGGGCTGGCGATCGTCAAGCGGATTGCTGCGCAACATGGCGGGAACGTGGAGTTGCGTAACCGGTCTGGCGGCGGGATCGAGGCGCGGGTCAGGTTGCCGCTGGGGCTGCTGCTGCCGCGTAATGCTGTGTGAGGCTCACTGGCCTCTTCACGGCTAAAGCCGCACCTACAGGGATTGCGCAGTACCTGTGGCAGCGGCTTGGCCGCGAAGCGGCGGGTAGAGGCTTGAATCAGCCTTTGCCCTTGGTCCGGGTCTGATTGGGCCCGCCATTCTTCTCCAGGTGCTCGATGATCATCCCGGCGACGTTCTTGCCGGTGGTGACCTCGATGCCCTCCAG > AE015451/302896‑303354 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |