| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 873680 | 61 (1.060) | 6 (0.110) | 5/324 | NT | 10.6% | coding (38/621 nt) | PP_0758 | conserved protein of unknown function |
| ? | AE015451 | = 873734 | 43 (0.790) | coding (92/621 nt) | PP_0758 | conserved protein of unknown function | |||||
GGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAGCAGGCCGAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGGCGCGCTGGGGGTTGACCCCGGCCTGGCTCACCGACCTGTCCCGCACCCCTGCCCATGCCCGCGCCGAAACGCTGGCCGAACAACCGATGTTTCGCGATGCATTTCGTCAGCGCC > AE015451/873457‑873907 | ggCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAGCAGGCCGAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTc > 1:591014/1‑235 (MQ=255) cgccgGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAGCAGGCCGAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGc > 1:537298/1‑235 (MQ=255) tcGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAGCAGGCCGAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGc < 2:591011/233‑1 (MQ=255) gCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAGCAGGCCGAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCg < 1:644388/236‑1 (MQ=255) gCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAGCAGGCCGAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCg < 1:708292/236‑1 (MQ=255) aGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAGCAGGCCGAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGc < 1:398479/235‑1 (MQ=255) aGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAGCAGGCCGAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGc < 1:216410/219‑1 (MQ=255) gggCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAGCAGGCCGAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCg < 2:697499/220‑1 (MQ=255) ggggCTCGTCGTGGCTGATGAGCAGGCCGAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTg < 2:1020906/187‑1 (MQ=255) gggCTCGTCGTGGCTGATGAGCAGGCCGAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCgg > 2:152463/1‑190 (MQ=255) gtcgtGGCTGATGAGCAGGCCGAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCgcctggggccagcg > 1:702921‑M2/1‑221 (MQ=255) gtGGCTGATGAGCAGGCCGAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGcc > 1:130474/1‑204 (MQ=255) atgaGCAGGCCGAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATG‑CCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCa < 1:810189/234‑1 (MQ=255) aGCAGGCCGAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATgg < 2:537295/200‑1 (MQ=255) gCCGAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAATGATTCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCt < 1:923146/236‑1 (MQ=255) gCCGAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGc > 1:124557/1‑235 (MQ=255) cGAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCaa < 1:420317/190‑1 (MQ=255) cGAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTg > 1:983254/1‑236 (MQ=255) gAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGcc > 2:784339/1‑186 (MQ=255) tGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGcc < 2:130472/175‑1 (MQ=255) ggCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTc < 2:397682/147‑1 (MQ=255) ggCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTc > 1:397685/1‑147 (MQ=255) ggCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGc > 1:30267/1‑175 (MQ=255) ggCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAAGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCcagcag > 1:652848/1‑236 (MQ=255) aTCGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCgcctggggccagcgaaacaggg > 2:981994‑M2/1‑182 (MQ=255) cGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCa < 1:1000962/236‑1 (MQ=255) aTGCGTACAATGATGCCCAGCCAGTGGTGGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGACCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGTCCTTTCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGcc < 2:662441/156‑1 (MQ=255) aTGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCg < 2:500073/161‑1 (MQ=255) aTGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCa < 2:859263/234‑1 (MQ=255) ccAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCaa > 1:860720/1‑211 (MQ=255) ggTTGGCGACGAACCGGAGAAGGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGGTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGc < 2:59669/138‑1 (MQ=255) tGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTTGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGc < 1:526384/135‑1 (MQ=255) acgaACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCgatatattccattgggccggctggccgacgggaaagcccggcagactggcacgggcctggggcca > 2:849289‑M1/1‑91 (MQ=255) acgaACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGGCGCGCTGGGGGTTGACCCCGGCCTGGCTCAcc < 1:212561/236‑1 (MQ=255) aCCGGAGAATGTACCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGGCGCGCTGGGGGTTGACCCCGGCCTGGCTCAcc < 1:700939/232‑1 (MQ=255) cGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGcgg > 2:240276/1‑156 (MQ=255) gagaATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGGCGCGCTGGGGGTTGACCCCGGCCTGGCTCACCGACCTGTc < 1:1032175/236‑1 (MQ=255) tCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGGCGCGCTGGGGGTTGACCCCGGCCTGGCTCACCGACCTGTCCCGCa < 2:983251/234‑1 (MQ=255) tCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGCACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGaa < 2:980027/124‑1 (MQ=255) ccccGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACTTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTCTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATCTATCgcct > 2:141606‑M2/1‑129 (MQ=255) ccccGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCgatatattccattgggccggctggccgacgcgaaagcccggcagactggcacgggcctggggc > 1:1037665‑M1/1‑75 (MQ=255) tACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGGCGCGCTggg < 1:136525/191‑1 (MQ=255) ccTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCgatatattccattgggccggctggccgacgggaaagcccggcagactggcaagggcctggggccagcgaaacagggcataacgtccacac > 1:1009044‑M1/1‑67 (MQ=255) gtCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGCCGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTCCCCGTCGGCCAGCCGGcc < 2:482458/101‑1 (MQ=255) tCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGTATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGGCGCGCTGGGGGTTGACCCCTGCCTGGCt > 1:289970/1‑202 (MQ=255) tCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATCTCGCCTGGGGCGTCGGGGCTGATCCAGCGCCCGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGGCGCGCCGGGGGGTGACCCCGGc > 2:300035/1‑196 (MQ=255) tGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGGCGCGCTGGGGGTTGACCCCGGCCTGGCTCACCGACCTGt < 1:1019560/211‑1 (MQ=255) tAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGGCGCGCTGGGGGTTGACCCCGGCCTGGCTCACCGACCTGTCCCGCACCCCTGCCCATGCCCGCGCCGa > 1:640037/1‑236 (MQ=255) ggTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCgcctgggg < 1:69446‑M2/116‑9 (MQ=255) ggTTCTGAAGTCGCCCATGTGTGGGCGTTATGCCCTGTTGCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAata < 2:52481/104‑1 (MQ=255) aTTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCCGGCCCTTGCCCGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCCGCCAGCCGGCCCCATGGACTATATccc > 2:83069/1‑100 (MQ=255) cATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCgatatattccattgggccggctggc > 2:854961‑M1/1‑39 (MQ=255) cATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGGCGCGCTGGGGGTTGACCCCGGCCTGGCTCACCGACCTGTCCCGCACCCCTGCCCATGCCCGCGCCGaaa > 1:147895/1‑221 (MQ=255) cATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGGCGCGCTGGGGGTTGACCCCGGCCTGGCTCACCGACCTGTCCCGCACCCCTGCCCATGCCCGCCCCGaaa > 1:621660/1‑221 (MQ=255) gtgtgGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCgcctggggccagcgaaacagggcataacgtccacacatgggcgaattcagaacctagcagatcaagg > 1:1009044‑M2/1‑90 (MQ=255) tgtgGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGGCGCGCTGGGGGTTGACCCCGGCCTGGCTCACCGACCTGTCCCGCACCCCTGCCCATGCCCGCGCCGAAACGCTGGCCGAACAACCGAt < 1:408910/236‑1 (MQ=255) gccGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGGCGCGCTGGGGGTTGACCCCGGCCTGGCTCACAGACCTGTCCCGCa < 1:301230/187‑1 (MQ=255) gTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGGCGCGCTGGGGGTTGACCCCGGCCTGGCTCACCGACCTGTCCCGCACCCCTGCCCATGCCCGCGCCGAAACGCTGGCCGAACAACCGATGTTTcg < 1:393932/235‑1 (MQ=255) gCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGGCGCGCTGGGGGTTGACCCCGGCCTGGCTCACCGACCTGTCCCGCa < 2:994341/181‑1 (MQ=255) cccTGTTTCGCTGGCCCCAGGCgatatattccattgggccggctggccgacgggaaagcccggcagactggcaagggcctggggccagcgaaacagggcataacgtccacacatgggcgaattcagaacctagcagatcaaggtaccggggacattctccggttcgtcgccaaccagtggctgggcatcattgtacgcatcgat > 2:981994‑M1/1‑22 (MQ=255) cccTGTTTCGCTGGCCCCAGGCgatatattccattgggccggctggccg > 2:831542‑M1/1‑22 (MQ=255) cccTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGgcgc > 1:1046791/1‑138 (MQ=255) cccTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGgcgc < 2:1046788/138‑1 (MQ=255) cccTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGGCGCGCTGGGGGTTGACCCCgg > 2:104387/1‑156 (MQ=255) cTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGgcgcg < 1:644792/137‑1 (MQ=255) cTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGgcgcg > 2:644789/1‑137 (MQ=255) cGCTGGCCCCAGGCgatatattccattgggccggctggccgacgggaaagcccggcagactggcaagggcctggggccagcgaaacagggcataacgtccacacatgggcgaattcagaacctagcagatcaaggtaccggggacattctccggttcgtcgccaaccagtggctgggcatcattgtacgcatcgatcagctgccgtgcgcattcggcctgctcatcagccacgac > 1:702921‑M1/1‑14 (MQ=255) cGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGGCGCGCTGGGGGTTGACCCCGGCCTGGCGCACCGACCTGTccc > 2:275177/1‑169 (MQ=255) gCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGGCGCGCTGGGGGTTGACCCCGGCCTGGCTCACCGACCTGTCCCGCACCCCTGCCCATGCCCGCGCCGAAACGCTGGCCGAACAACCGATGTTTCGCGATGCATTTCGTCa < 1:489494/235‑1 (MQ=255) tGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGGCGCGCTGGGGGTTGACCCCGGCCTGGCTCACCGACCTGTCCCGCACCCCTGCCCATGCCCGCGCCGAAACGCTGGCCGAACAACCGATGTTTCGCGATGCATTTCGTCAgcg < 1:72709/236‑1 (MQ=255) tGGCCCCAGGCCCGTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCgcctggggccagcgaaacagggcataacgtccacacatgggcgaattcagaacctagcagatcaaggtaccggggacattctccggttcgt > 2:849289‑M2/1‑65 (MQ=255) gCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGGCGCGCTGGGGGTTGACCCCGGCCTGGCTCACCGACCTGTCCCGCACCCCTGCCCATGCCCGCGCCGAAACGCTGGCCGAACAACCGATGTTTCGCGATGCATTTCGTCAgcgc > 1:548243/1‑235 (MQ=255) gCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGGCGCGCTGGGGGTTGACCCCGGCCTGGCGCACCGACCTGTCCCGCACCCCTGCCCATGCCCGCGCCg > 1:157282/1‑188 (MQ=255) gCCCCAGGCCCGTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCGCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCgcctggggccagcgaaacagggcataacgtccacacatgggcgaattcagaacctagcagatcaaggtaccgggg > 1:1037665‑M2/1‑63 (MQ=255) ccccAGGCgatatattccattgggccggctggccgacgggaaagcccggcagactggcaagggcctggggccagcgaaacagggcataacgtccacacatgggcgaattcagaacc < 1:69446‑M1/116‑109 (MQ=255) ccAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGGCGCGCTGGGGGTTGACCCCGGCCTGGCTCACCGACCTGTCCCGCACCCCTGCCCATGCCCGCGCCGAAACGCTGGCCGAACAACCGATGTTTCGCGATGCATTTCGTCAGcgcc > 2:1038497/1‑233 (MQ=255) aGGCgatagattccattgggccggctggccgacgggagagcccggcagactggcaagggcctggggccagcgaaacagggcataaagtccacacatgggcgaattcagaacctagcagatcaaggtaccgggg > 2:141606‑M1/1‑4 (MQ=255) gCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTGCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGGCGCGCTGGGGGTTGACCCCGGCCTGGCTCACCGACCTGTCCCGCACCCCTGCCCATGCCCGCGCCGAAACGCTGGCCGAACAACCGATGTTTCGCGATGCATTTCGTCAgcgc < 1:611290/228‑1 (MQ=255) | GGCCGTGACCTTGTCGGTGCCGCCGGCGAGCTGCCCTTGCAGGGCCTGCTGGGGCTCGTCGTGGCTGATGAGCAGGCCGAATGCGCACGGCAGCTGATCGATGCGTACAATGATGCCCAGCCACTGGTTGGCGACGAACCGGAGAATGTCCCCGGTACCTTGATCTGCTAGGTTCTGAATTCGCCCATGTGTGGACGTTATGCCCTGTTTCGCTGGCCCCAGGCCCTTGCCAGTCTGCCGGGCTTTCCCGTCGGCCAGCCGGCCCAATGGAATATATCGCCTGGGGCGTCGGTGCTGATCCAGCGTCAGCTTGACGGCCAGCAGCAACTGGCCAAGGCGCGCTGGGGGTTGACCCCGGCCTGGCTCACCGACCTGTCCCGCACCCCTGCCCATGCCCGCGCCGAAACGCTGGCCGAACAACCGATGTTTCGCGATGCATTTCGTCAGCGCC > AE015451/873457‑873907 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |