New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 938794 | 52 (0.900) | 3 (0.050) | 3/332 | NT | 6.2% | coding (6828/18933 nt) | PP_0806 | putative Surface adhesion protein |
? | AE015451 | = 939185 | 41 (0.730) | coding (6437/18933 nt) | PP_0806 | putative Surface adhesion protein |
ATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCGGGATTTCATATTGCAGGGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGCATCGGTCT > AE015451/938561‑939026 | aTGCTGAACCTGCCAGTGGCGTCGCCCACCCCACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGtt < 1:112755/236‑1 (MQ=255) tGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTg > 2:429071/1‑221 (MQ=255) gCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAg < 1:560961/236‑1 (MQ=255) caccgcACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCGCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCGAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGAc < 1:739281/234‑1 (MQ=255) cAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCAc < 1:542730/236‑1 (MQ=255) cACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCg < 1:475102/235‑1 (MQ=255) aCGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACgg > 2:479465/1‑220 (MQ=255) gtggtgCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCGCTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACATCCAGCAGTTCGCCGatggcctggtgctcagtggccgtggcgaggccgg < 1:691318‑M1/223‑35 (MQ=255) tgCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑cc > 2:402290/1‑197 (MQ=255) tgCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGc > 2:616185/1‑222 (MQ=255) tgCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGc < 1:616188/222‑1 (MQ=255) ccATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTacca < 1:905985/235‑1 (MQ=255) acgcgcgGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTg < 1:215256/174‑1 (MQ=255) tgctgcCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTg < 1:184695/236‑1 (MQ=255) cccACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATc < 1:479468/236‑1 (MQ=255) cACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTTAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCg < 1:592120/193‑1 (MQ=255) cACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCg > 2:592117/1‑193 (MQ=255) aCTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGGGGAt > 2:716963/1‑173 (MQ=255) ggCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAg > 2:25497/1‑178 (MQ=255) ggCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCAc > 2:1005955/1‑185 (MQ=255) ggCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCAc < 1:1005958/185‑1 (MQ=255) ggCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACt > 1:555528/1‑235 (MQ=255) cgcgGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACt < 2:906780/202‑1 (MQ=255) gcgGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTaccacc < 2:869462/196‑1 (MQ=255) aCCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGcc < 1:772167/236‑1 (MQ=255) cTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCCCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGCCGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGc < 1:256410/174‑1 (MQ=255) gCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGGCCCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGt < 1:429074/235‑1 (MQ=255) gCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGC‑GCTTCGTCCCTGCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCg < 1:938126/236‑1 (MQ=38) tGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCg > 2:958080/1‑167 (MQ=255) gATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGt > 2:928368/1‑234 (MQ=255) tCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGag > 2:644174/1‑234 (MQ=255) tCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGGGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGGTGAGGGTGACggg > 1:306552/1‑138 (MQ=255) cGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGCAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGGTGGCCTGGG‑CCGGGTGGAGGATGACGGTGaa > 1:125017/1‑141 (MQ=255) ctcgctcgGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTgg < 2:376594/233‑1 (MQ=255) ctcgGAGTGACCGGCGGGGGGATGTATGGCACAGCGATTTGCACCGACAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATc < 1:257158/182‑1 (MQ=255) tcgGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGccc > 2:726988/1‑203 (MQ=255) tcgGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGtt > 1:745825/1‑235 (MQ=255) cgGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTgg < 1:994857/227‑1 (MQ=255) ggggTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCGGCGGTGTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCAGCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGt < 2:22529/203‑1 (MQ=255) ggggTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGt > 1:21679/1‑232 (MQ=255) ggggTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGAGGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACcaca < 2:403620/153‑1 (MQ=255) ggggTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGGGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCgggg > 1:170035/1‑111 (MQ=255) ggcggGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGccac > 2:475439/1‑233 (MQ=255) gggTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGc > 2:400915/1‑223 (MQ=255) aTGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTgg < 1:1003272/208‑1 (MQ=255) tGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACCCTGCCGACCAGGGTGCCGTTGGCATAGTGTACTTCCACACg > 1:90730/1‑175 (MQ=255) gcAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGGCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAg < 2:829397/137‑1 (MQ=255) cAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCCCGTCCAGCAGTTCGCCGatggcctggtgctcagtggccgtggcgaggc > 2:227668‑M1/1‑68 (MQ=255) cAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGatggcctggtgctcagtggccgtggcgaggc < 1:227670‑M1/99‑32 (MQ=255) cACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCAc < 2:509311/98‑1 (MQ=255) ggCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGc < 1:353073/194‑1 (MQ=255) gcCGGTGCCATCGATGGCCATCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCGGGATTTCata > 1:710755/1‑234 (MQ=255) ccGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCGGGATTTCATATTg < 1:928371/236‑1 (MQ=255) gTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCGGGATTTCATATTGCa < 1:400918/235‑1 (MQ=255) ccacGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCAcc < 2:147090/67‑1 (MQ=255) agcagTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCCCCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGcc < 2:204651/116‑1 (MQ=255) ttCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCGGGATTTCATATTGCAGGGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGCATCgg < 1:618468/236‑1 (MQ=255) gCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCGGGATTTCATATTGCAGGGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGCATCgg > 2:618465/1‑233 (MQ=255) ccGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCGGGATTTCATATTGCAGGGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGCATCGGTCt < 1:726991/235‑1 (MQ=255) cGatggcctggtgctcagtggccgtggcgaggccggtgctaccgtacaggtacgtgatgccaacggctctgtcataggcaccgccacagtcggcgccaacggaaccttcttggtcgacctcaccccagccgcgcaaccgggcg > 1:572472‑M1/1‑2 (MQ=255) gTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCggg < 1:716966/187‑1 (MQ=255) | ATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGCGGCCGGTGACCTCGCTGCCGTTGGCACTGATCGCTAGCTCGCTCGGGGTGACCGGCGGGGTGATGTCTGGCGCAGCGATTTGCACCGGCAGGGACGAAGC‑GCCGGTGCCATCGATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGGG‑CCGGGTTGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTGTACTTCCACACGGCTGCCCGTCGGGGCTGTACCAGTGATGCTGGCGCCGTTCGCAGCCACCACCAGGTCGCTTGGGCTGGCTGGGGTCGTGGTTGCCGGGATTTCATATTGCAGGGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGCATCGGTCT > AE015451/938561‑939026 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |