New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 2343559 = | 37 (0.640) | 3 (0.060) | 3/320 | NT | 6.8% | coding (145/249 nt) | PP_2059 | UPF0337 protein PP_2059 |
? | AE015451 | 2343648 = | 47 (0.870) | coding (56/249 nt) | PP_2059 | UPF0337 protein PP_2059 |
ATCGATCAGATTTCGCCCGCGGCCGAGACAGCAATCGCCTTTACCTGACCTACGATATCGCCATCTGGTGATGGCGCAGGCCGGACAAGATATCCGGCCCTGAACCGCCTGAGGCGCCGTGGTTCAGCGGCGCAGCAGGCGAGAGACCACCAGTGTGACGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGCCAGCCAGGTCTTCTGCTACACCTTCGATCTGTTCGCGTTTCATGATGGCTTAGTTCCTTCCTGTGAGCGGCTTTGGGTTAACAGCACAGGGTTAGGGCGGTGATTCGTCGCAATGGTTCAAAGCGACTGTT > AE015451/2343332‑2343791 | aTCGATCAGATTTCGCCCGCGGCCGAGACAGCAATCGCCTTTACCTGACCTACGATATCGCCATCTGGTGATGGCGCAGGCCGGACAAGATATCCGGCCCTGAACCGCCTGAGGCGCCGTGGTTCAGCGGCGCAGCAGGCGAGAGACCACCAGTGTGACGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGGAg > 1:961475/1‑235 (MQ=255) atcctcgaaaagaaggcacgctaacctagcacgctcatgtcagatgcgaatctatgccggcgcgcatgacctgcaggtgacaaacagtcgctttgaaccattgcgacgaatcaccgccctaaccctgtgctgttaacccaaagccgctcacaggaaggaactaagccatcatgaaacgcgaacagatcgaaggtgtagcagaagacctggctggcaaggcgcaaagCGCCGTAGGt < 1:193043‑M1/10‑1 (MQ=255) atcctcgaaaagaaggcacgctaacctagcacgctcatgtcagatgcgaatctatgccggcgcgcatgacctgcaggtgacaaacagtcgctttgaaccattgcgacgaatcaccgccctaaccctgtgctgttaacccaaagccgctcacaggaaggaactaagccatcatgaaacgcgaacagatcgaaggtgtagcagaagacctggctggcaaggcgcaaagCGCCGTAGGt < 1:215128‑M1/10‑1 (MQ=255) aTCAGATTTCGCCCGCGGCCGAGACAGCAATCGCCTTTACCTGACCTACGATATCGCCATCTGGTGATGGCGCAGGCCGGACAAGATATCCGGCCCTGAACCGCCTGAGGCGCCGTGGTTCAGCGGCGCAGCAGGCGAGAGACCACCAGTGTGACGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGGCt > 1:987923/1‑235 (MQ=255) acgctaacctagcacgctcatgtcagatgcgaatctatgccggcgcgcatgacctgcaggtgacaaacagtcgctttgaaccattgcgacgaatcaccgccctaaccctgtgctgttaacccaaagccgctcacaggaaggaactaagccatcatgaaacgcgaacagatcgaaggtgtagcagaagacctggctggcaaggcgcaaagcc < 1:893208‑M1/2‑2 (MQ=255) ccGAGACAGCAATCGCCTTTACCTGACCTACGATATCGCCATCTGGTGATGGCGCAGGCCGGACAAGATATCCGGCCCTGAACCGCCTGAGGCGCCGTGGTTCAGCGGCGCAGCAGGCGAGAGACCACCAGTGTGACGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCgg > 1:1016586/1‑235 (MQ=255) tatCGCCATCTGGTGATGGCGCAGGCCGGACAAGATATCCGGCCCTGAACCGCCTGAGGCGCCGTGGTTCAGCGGCGCAGCAGGCGAGAGACCACCAGTGTGACGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCtt > 1:502559/1‑220 (MQ=255) ccATCTGGTGATGGCGCAGGCCGGACAAGATATCCGGCCCTGAACCGCCTGAGGCGCCGTGGTTCAGCGGCGCAGCAGGCGAGAGACCACCAGTGTGACGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGc < 2:769547/170‑1 (MQ=255) ccATCTGGTGATGGCGCAGGCCGGACAAGATATCCGGCCCTGAACCGCCTGAGGCGCCGTGGTTCAGCGGCGCAGCAGGCGAGAGACCACCAGTGTGACGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGc > 1:769550/1‑170 (MQ=255) cATCTGGTGATGGCGCAGGCCGGACAAGATATCCGGCCCTGAACCGCCTGAGGCGCCGTGGTTCAGCGGCGCAGCAGGCGAGAGACCACCAGTGTGACGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCa > 1:3930/1‑223 (MQ=255) cATCTGGTGATGGCGCAGGCCGGACAAGATATCCGGCCCTGAACCGCCTGAGGCGCCGTGGTTCAGCGGCGCAGCAGGCGAGAGACCACCAGTGTGACGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAgcg > 2:1064307/1‑226 (MQ=255) tCTGGTGATGGCGCAGGCCGGACAAGATATCCGGCCCTGAACCGCCTGAGGCGCCGTGGTTCAGCGGCGCAGCAGGCGAGAGACCACCAGTGTGACGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTc > 2:360070/1‑231 (MQ=255) ccGGACAAGATATCCGGCCCTGAACCGCCTGAGGCGCCGTGGTTCAGCGGCGCAGCAGGCGAGAGACCACCAGTGTGACGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAgg > 2:659140/1‑224 (MQ=255) cGGACAAGATATCCGGCCCTGAACCGCCTGAGGCGCCGTGGTTCAGCGGCGCAGCAGGCGAGAGACCACCAGTGTGACGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGgcg > 1:431158/1‑235 (MQ=255) tGAACCGCCTGAGGCGCCGTGGTTCAGCGGCGCAGCAGGCGAGAGACCACCAGTGTGACGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGccagccag < 1:1064310/236‑1 (MQ=255) gAGGCGCCGTGGTTCAGCGGCGCAGCAGGCGAGAGACCACCAGTGTGACGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCg > 1:744381/1‑161 (MQ=255) gAGGCGCCGTGGTTCAGCGGCGCAGCAGGCGAGAGACCACCAGTGTGACGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCg < 2:744378/161‑1 (MQ=255) gAGGCGCCGTGGTTCAGCGGCGCAGCAGGCGAGAGACCACCAGTGTGACGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAg > 1:241992/1‑193 (MQ=255) gAGGCGCCGTGGTTCAGCGGCGCAGCAGGCGAGAGACCACCAGTGTGACGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGCCAGCCAGGtct > 2:834373/1‑230 (MQ=255) aGGCGCCGTGGTTCAGCGGCGCAGCAGGCGAGAGACCACCAGTGTGACGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGCCAGCCAGGTCTTCTGCt < 1:267918/235‑1 (MQ=255) gcCGTGGTTCAGCGGCGCAGCAGGCGAGAGACCACCAGTGTGACGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGCCAGCCAGGTCTTCTGCTacac > 1:1073987/1‑235 (MQ=255) tgttaacccaaagccgctcacaggaaggaactaagccatcatgaaacgcgaacagatcgaaggtgtagcagaagacctggctggcaaggcgcaaagCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGccagccag < 2:557182‑M1/109‑1 (MQ=255) cagGCGAGAGACCACCAGTGTGACGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTg > 2:373056/1‑186 (MQ=255) cagGCGAGAGACCACCAGTGTGACGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGCCAGCCAGGTCTTCTGCTACACCTTCGATCTGTTCGCGTTTCa > 1:935881/1‑236 (MQ=255) cGAGAGACCACCAGTGTGACGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGGCCTACGGCGCTTTGCGCCTTGCCAGCCAGGt > 1:957076/1‑199 (MQ=255) accaGTGTGACGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGCCAGCCAGGTCTTCTGCTACACCTTCGATCTGTTCGCGTTTCATGATGGCtt > 2:1011419/1‑232 (MQ=255) tgtgACGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGccagccag < 2:689611/183‑1 (MQ=255) aCGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGCCAGCCAGGtctt > 2:174642/1‑184 (MQ=255) aCGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGCCAGCCAGGTCTTCTGCTACACCTTCGATCTGTTCGCGTTTCATGATGGCTTAGTTCCTTCCtgt < 1:863507/236‑1 (MQ=255) gTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTgc > 1:229049/1‑163 (MQ=255) gTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGCCAGCCAGGTCTTCTGCTACACCTTCGATCTGTTCGCGTTTCATGATGGCTTAGTTCCTTCCTGTGAGCGGc > 2:875489/1‑234 (MQ=255) catcatgaaacgcgaacagatcgaaggtgtagcagaagacctggctggcaaggcgcaaagCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCg < 1:427047‑M1/79‑1 (MQ=255) tGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGCCAGCCAGGTCTTCTGCTACACCTTCGATCTGTTCGCGTTTCATGATGGCTTAGTTCCTTCCTGTGAGCGGCTTTGGGTTAACAg < 1:858684/236‑1 (MQ=255) ggcgAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGCCAGCCAGGtctt > 2:868002/1‑161 (MQ=255) ggcgAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGCCAGCCAGGTCTTCTGCTACACCTTCGATCTGTTCGCGTTTCatgat > 2:755890/1‑195 (MQ=255) ggcgAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGCCAGCCAGGTCTTCTGCTACACCTTCGATCTGTTCGCGTTTCatgat < 1:755893/195‑1 (MQ=255) ggcgAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGCCAGCCAGGTCTTCTGCTACACCTTCGATCTGTTCGCGTTTCATGATGGCTTAGTTCCTTCCTGTGAGCGGCTTTGGGTTAACAGca > 1:469995/1‑235 (MQ=255) cgAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGCCAGCCAGGTCTTCTGCTACACCTTCGATCTGTTCGCGTTTCATGATGGCTTAGTTCCTTCCtgtgt > 1:224900/1‑212 (MQ=255) gaaggtgtagcagaagacatggctggcaaggcgcaaagCGCCGAAGGACTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGAAGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGCCAGCCAGGTCTTCTGCTACACCTTCGATCTGt < 2:833142‑M1/134‑1 (MQ=255) ttttCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGCCAGCCAGGTCTTCTGCTACACCTTCGATCTGTTCGCGTTTCATGATGGCTTAGTTCCTTCCTGTGAGCGGCTTTGGGTTAACAGCACAGGGTTAggg > 1:87776/1‑236 (MQ=255) ttttCCTTGACGAACGAGGACACCGTGGCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCCTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCCTTg > 2:136845/1‑131 (MQ=255) gcggACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGCCAGCCAGGTCTTCTGCTGCACCTTCGATCTGTTCGCGTTTCATGATGGCTTAGTTCCTTCCTGTGAGCGGCTTTGGGTTAACa < 2:156093/205‑1 (MQ=255) acCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGCCAGCCAGGTCTTCTGCTACACCTTCGATCTGTTCGCGTTTCATGATGGCTTAGTTCCTTCCTGTGAGCGGCTTTGGGTTAACAGCACAGGGTTAGGGCGGTGATTCGTCGCAATGGtt > 1:108926/1‑236 (MQ=255) gtgcCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCCCCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGCCAGCCAGGTCTTCTGCTACACCTTCGATCTGTTCGCGTTTCATGATGGCTTAGTTCCTTCCTGTGAGCgg < 1:94864/185‑1 (MQ=255) gtCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGCCAGCCAGGTCTTCTGCTACACCTTCGATCTGTTCGCGTTTCATGATGGCTTAGTTCCTTCCTGTGAGCGGCTTTGGGTTAACCGCACAGGGTTAg > 2:339000/1‑208 (MQ=255) tgtCGACGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGCCAGCCAGGTCTTCTGCTACACCTTCGATCTGTTCGCGTTTCATGATGGCTTAGTTCCTTCCTGTGAGCGGCTTTGGGTTAACAGCACAg < 1:869398/194‑1 (MQ=255) tCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGCCAGCCAGGTCTTCTGCTACACCTTCGATCTGTTCGCGTTTCATGATGGCTTAGTTCCTTCCTGTGAGCGGCTTTGGGTTAACAGCACAGGGTTAGGGCGGTGATTCGTCGCAATGGTTCAAAGCGACTGtt < 1:360073/234‑1 (MQ=255) | ATCGATCAGATTTCGCCCGCGGCCGAGACAGCAATCGCCTTTACCTGACCTACGATATCGCCATCTGGTGATGGCGCAGGCCGGACAAGATATCCGGCCCTGAACCGCCTGAGGCGCCGTGGTTCAGCGGCGCAGCAGGCGAGAGACCACCAGTGTGACGGCGGCGGTGATGGCCAGTGCGGCGAAGGGCTTTTCCTTGACGAACGAGGACACCGTGTCCAGGGTGTCGCCGTAGGTCTTGGTCACCTGGCCTGCGGCCTGACGCGCATCGCCTTCGGCTTCCAGCGCCGGGTCTTCGACCAGGCGACCTACGGCGCTTTGCGCCTTGCCAGCCAGGTCTTCTGCTACACCTTCGATCTGTTCGCGTTTCATGATGGCTTAGTTCCTTCCTGTGAGCGGCTTTGGGTTAACAGCACAGGGTTAGGGCGGTGATTCGTCGCAATGGTTCAAAGCGACTGTT > AE015451/2343332‑2343791 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |