New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 3296619 = | 41 (0.710) | 4 (0.070) | 4/328 | NT | 9.2% | coding (256/492 nt) | PP_2898 | conserved exported protein of unknown function |
? | AE015451 | 3296638 = | 40 (0.720) | coding (237/492 nt) | PP_2898 | conserved exported protein of unknown function |
ATCGCACGGGTAGCTGCTCAGCAAACTGGCGCTACCCAGATAGGCTTGAGGGGTGGCGCGCATGCTCGGCGGCAACGTGCGCCAATCGACCAGCAGGCACAGCGCGTGCAACGGCTGGCCGTTGCGCTGGCCGATGACCTGGTCGGCAAAGTGGCGGCGGTACAGTACCTGGGTCTGATTCAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATTGGCTGGCACCGGCATGGGTGGCCAACTCGCGGCCCAGTTCGAGCAGGTGTTCGGTCGGCGTCTGCTGGGTGTCCAGTGCATGAAGGGAGAGCGGGGTCAGTAACAGCGATGCGAACAGCAGGGGTTTGTACATGGTGCCTCCGG > AE015451/3296386‑3296852 | ggcttcctagcacccacgccggaggcaccatgtacaaacccctgctgttcgcatcgctgttactgaccccgctctcccttcatgcactggacacccagcagacgccgaccgaacacctgctcgaactgggccgcgagttggccacccatgccggtgccagccaatggcaacaactgtggcaacgcgtacgccaggccggctacctgcagaccgacgccgcaccggcacatttcAGc < 1:224061‑M1/3‑1 (MQ=255) tgctCAGCAAACTGGCGCTACCCAGATAGGCTTGAGGGGTGGCGCGCATGCTCGGCGGCAACGTGCGCCAATCGACCAGCAGGCACAGCGCGTGCAACGGCTGGCCGTTGCGCTGGCCGATGACCTGGTCGGCAAAGTGGCGGCGGTACAGTACCTGGGTCTGATTCAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGc < 2:638326/233‑1 (MQ=255) aaCTGGCGCTACCCAGATAGGCTTGAGGGGTGGCGCGCATGCTCGGCGGCAACGTGCGCCAATCGACCAGCAGGCACAGCGCGTGCAACGGCTGGCCGTTGCGCTGGCCGATGACCTGGTCGGCAAAGTGGCGGCGGTACAGTACCTGGGTCTGATTCAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATg < 1:498935/235‑1 (MQ=255) ggCGCTACCCAGATAGGCTTGAGGGGTGGCGCGCATGCTCGGCGGCAACGTGCGCCAATCGACCAGCAGGCACAGCGCGTGCAACGGCTGGCCGTTGCGCTGGCCGATGACCTGGTCGGCAAAGTGGCGGCGGTACAGTACCTGGGTCTGATTCAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGGGGGCCCg > 2:572832/1‑223 (MQ=255) tGAGGGGTGGCGCGCATGCTCGGCGGCAACGTGCGCCAATCGACCAGCAGGCACAGCGCGTGCAACGGCTGGCCGTTGCGCTGGCCGATGACCTGGTCGGCAAAGTGGCGGCGGTACAGTACCTGGGTCTGATTCAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCtgtg < 2:1078154/198‑1 (MQ=255) gAGGGGTGGCGCGCATGCTCGGCGGCAACGTGCGCCAATCGACCAGCAGGCACAGCGCGTGCAACGGCTGGCCGTTGCGCTGGCCGATGACCTGGTCGGCAAAGTGGCGGCGGTACAGTACCTGGGTCTGATTCAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCGGTGGGCCCGCTGaaagg > 2:365202/1‑209 (MQ=255) gAGGGGTGGCGCGCATGCTCGGCGGCAACGTGCGCCAATCGACCAGCAGGCACAGCGCGTGCAACGGCTGGCCGTTGCGCTGGCCGATGACCTGGTCGGCAAAGTGGCGGCGGTACAGTACCTGGGTCTGATTCAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTGGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTc > 2:836191/1‑226 (MQ=255) ttactgaccccgctctcccttcatgcactggacacccagcagacgccgaccgaacacctgctcgaactgggccgcgagttggccacccatgccggtgccagccaatggcaacaactgtggcaacgcgtacgccaggccggctacctgcagaccgacgccgcaccggtacatttcAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCg > 1:616490‑M1/175‑230 (MQ=255) aTCGACCAGCAGGCACAGCGCGTGCAACGGCTGGCGGTTGGGCTGGCCGATGACCTGGTCGGCAAAGTGGCGGCGGTACAGTACCTGGGTCTGATTCAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTAcg < 2:546965/217‑1 (MQ=255) cagGCACAGCGCGTGCAACGGCTGGCCGTTGCGCTGGCCGATGACCTGGTCGGCAAAGTGGCGGCGGTACAGTACCTGGGTCTGATTCAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATtggctg < 1:428233/235‑1 (MQ=255) caggcagacgccgaccgaacacctgctcgaactgggccgcgagttggccacccatgccggtgccagccaatggcaacaactgtggcaacgcgtacgccaggccggctacctgcagaccgacgccgcaccggtacatttcAGc > 2:346241‑M1/140‑142 (MQ=255) acaGCGCGTGCAACGGGTGGGCGTTGCGGTGGCCGATGACCTGGTCGGCAAAGTGGCGGTGGTACAGTCCCTGGGTCTGATTCAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTgcgg < 1:228731/171‑1 (MQ=255) gTGCAACGGCTGGCCGTTGCGCTGGCCGATGACCTGGTCGGCAAAGTGGCGGCGGTACAGTACCTGGGTCTGATTCAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGcc > 1:481487/1‑183 (MQ=255) tGCAACGGCTGGCCGTTGCGCTGGCCGATGACCTGGTCGGCAAAGTGGCGGCGGTACAGTACCTGGGTCTGATTCAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTAcc > 1:414083/1‑156 (MQ=255) gCAACGGCTGGCCGTTGCGCTGGCCGATGACCTGGTCGGCAAAGTGGCGGCGGTACAGTACCTGGGTCTGATTCAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGGTGTTGCCATTGGCTGGCACCGGccagg > 2:627039/1‑229 (MQ=255) cgcTGGCCGATGACCTGGTCGGCAAAGTGGCGGCGGTACAGTACCTGGGTCTGATTCAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCAtt < 2:712301/199‑1 (MQ=255) ccTGGTCGGCAAAGTGGCGGCGGTACAGTACCTGGGTCTGATTCAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATTGGCTGGCACCGGCATGGGTGGCCAACTCGCGGCCCAGTTc > 2:377731/1‑226 (MQ=255) ggTCGGCAAAGTGGCGGCGGTACAGTACCTGGGTCTGATTCAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATTGGCTGGCACCGGCATGGGTGGCCAACTCGCGGCCCAGTTCGAGCAGGTGTtc < 1:861890/235‑1 (MQ=255) aGTGGCGGCGGTACAGTACCTGGGTCTGATTCAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATTGGCTGGCACCGGCATGGGTGGCCAACTCGCGGCCCAGTTCGAGCAGGTGTTCGGTCGGCg < 1:656485/234‑1 (MQ=255) cggcggTACAGTACCTGGGTCTGATTCAGTGGCTGGGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGCTTGTCGGGCCCGGTCGGGCCAGCggg > 2:169799/1‑85 (MQ=255) cggTACAGTACCTGGGTCTGATTCAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATTGGCTGGCACCGGCATGGGTGGCCAACTCGCGGCCCAGTTCGAGCAGGTGTTCGGTCGGCGTCTGCTGGgt < 1:102923/236‑1 (MQ=255) gTCTGATTCAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATTGGCTGGCACCGGCATGGGTGGCCAACTCGCGGCCCAGTTCg > 2:738280/1‑192 (MQ=255) tCTGATTCAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATTGGCTGGCACCgg > 1:116856/1‑162 (MQ=255) tCTGATTCAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATTGGCTGGCACCGGCATGGGTGGCCAACTCGCGGCCCAGTTCGAGCAGGTGTTCGGTCGGCGTctgctg > 1:814505/1‑217 (MQ=255) atgcAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATTGGCTGGCACCGGCATGGGTGGCCAACTCGCGGCCCAGTTCGAGCAGGTGTTCGGTCGGCGTCTGCTGGGTGTCCAGTGCATGAAGGga < 1:255118/231‑1 (MQ=255) ttCAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCCGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGGTGCCACCGTTGTTGCCGTTGGCGGGCAc > 2:285467/1‑154 (MQ=255) ttCAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATTGGCTGGCACCGGCATGGGTGGCCAACTCGCGGCCCAGTTCGAGCAGGTGTTCGGTCGGCGTCTGCTGGGTGTCCAGTGCATGAAGGgaga > 1:872260/1‑235 (MQ=255) ttCAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATTGGCTGGCACCGGCATGGGTGGCCAACTCGCGGCCCAGTTCGAGCAGGTGTTCGGTCGGCGTCTGCTGGGTGTCCAGTGCATGAAGGgaga > 1:465858/1‑235 (MQ=255) ttCAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGCGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCGGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGGTGCCATTGGCTGGCACCggg > 2:305349/1‑157 (MQ=255) tGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATTGGCTGGCACCGGCATGGGTGGCCAACTCGCGGCCCAGTTc < 2:686596/180‑1 (MQ=255) gCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATTGGCTGGCACCGGCATGGGTGGCCAACTCGCGGCCCAGTTCGAGCAGGTGTTCGGTCGGc > 2:527609/1‑197 (MQ=255) tgtgCCTGGTCGGCCTGCTCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCTGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATTGGCTGGCACCGGCATGGGTGGCCAACTCGCGGCCCAGTTCGAGCAGGTGTTCGGTCGGCGTCTGCTGGGTGTCCAGt < 1:30738/213‑1 (MQ=255) tgCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATTGGCTGGCACCGGCATGGGTGGCCAACTCGCGGCCCAGTTCGAGCAGGTGTTCGGTCGGCg < 1:169801/194‑1 (MQ=255) ccTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGt < 2:513994/113‑1 (MQ=255) ccTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATtggct < 1:816464/136‑1 (MQ=255) ccTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATtggct > 2:816461/1‑136 (MQ=255) cTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATTGGCTGGCACCGGCATGGGTGGCCAACTCGCGGCCCAGTTc > 2:402631/1‑171 (MQ=255) ggCCTGCGCCGGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATTGGCTGGCACCGGCATGGGTGGCCAACTCGCGGCCCAGTTCGAGCAGGTGTTCGGTCGGCGTCTGCTGGGTGTCCAGTGCATGAAGGGAGAGCGGGGTCAGTAACAGCGAt < 1:285470/235‑1 (MQ=255) tGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAgg < 2:143374/81‑1 (MQ=255) tGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAgg > 1:143376/1‑81 (MQ=255) cgcCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATTGGCTGGCACCGGCATGGGTGGCCAACTCGCGGCCCAGTTCGAGCAGGTGTTCGGTCGGCGTCTGCTGGGTGTCCAGTGCATGAAGGGAGAGCGGGGTCAGTAACAGCGATGCGAAca < 1:377734/236‑1 (MQ=255) cAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATTGGCTGGCACCGGCATGGGTGGCCAACTCGCGGCCCAGTTCGAGCAGGTGTTCGGTCGGCGTCTGCTGGgtgt > 1:278280/1‑188 (MQ=255) gaccgacgccgcaccggtacatttcAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCAtt < 2:529903‑M1/90‑1 (MQ=255) gaccgacgccgcaccggtacatttcAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCAtt > 1:529906‑M1/26‑115 (MQ=255) ctgttGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATTGGCTGGCACCGGCATGGGTGGCCAACTCGCGGCCCAGTTCGAGCAGGTGTTCGGTCGGCGTCTGCTGGgt < 1:24830/180‑1 (MQ=255) ttGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGAGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATTGGCTGGCACCGGCATGGGTGGCCAACTCGCGGCCCAGTTCGAGCAGGTGTTCGGTCGGCGTCTGCTGGGTGTCCAGTGCATGAAGGGAGAGCGGGGTCAGTAACAGCGATGCGAACAGCAGGGGtt > 1:583898/1‑236 (MQ=255) catttcAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATTGGCTGGCACCGGCATGGGTGGCCAACTCGCGGCCCAGTTCGAGCAGGTGTTCGGTCGGCGTCTGCTGGGTGTCCAGTGCATGAAGGGAGAGCGGGGTCAGTAACAGCGATGCGAACAGCAGGGGTTTGTACATGGTGcc < 1:713177‑M1/229‑1 (MQ=255) ggCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATTGGCTGGCACCGGCATGGGTGGCCAACTCGCGGCCCAGTTCGAGCAGGTGTTCGGTCGGCGTCTGCTGGGTGTCCAGTGCATGa > 1:773728/1‑177 (MQ=255) ggCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATTGGCTGGCACCGGCATGGGTGGCCAACTCGCGGCCCAGTTCGAGCAGGTGTTCGGTCGGCGTCTGCTGGGTGTCCAGTGCATGa < 2:773725/177‑1 (MQ=255) cAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATTGGCTGGCACCGGCATGGGTGGCCAACTCGCGGCCCAGTTCGAGCAGGTGTTCGGTCGGCGTCTGCTGGGTGTCCAGTGCATGAAGGGAGAGCGGGGTCAGTAACAGCGATGCGAACAGCAGGGGTTTGTACATGGTGCCTCCgg < 1:413132/236‑1 (MQ=255) | ATCGCACGGGTAGCTGCTCAGCAAACTGGCGCTACCCAGATAGGCTTGAGGGGTGGCGCGCATGCTCGGCGGCAACGTGCGCCAATCGACCAGCAGGCACAGCGCGTGCAACGGCTGGCCGTTGCGCTGGCCGATGACCTGGTCGGCAAAGTGGCGGCGGTACAGTACCTGGGTCTGATTCAGTGGCTGTGCCTGGTCGGCCTGCGCCAGCGTTTGTCGGGCCAGGTCGGGCAAGCGGGCTGTGGGCCCGCTGAAATGTACCGGTGCGGCGTCGGTCTGCAGGTAGCCGGCCTGGCGTACGCGTTGCCACAGTTGTTGCCATTGGCTGGCACCGGCATGGGTGGCCAACTCGCGGCCCAGTTCGAGCAGGTGTTCGGTCGGCGTCTGCTGGGTGTCCAGTGCATGAAGGGAGAGCGGGGTCAGTAACAGCGATGCGAACAGCAGGGGTTTGTACATGGTGCCTCCGG > AE015451/3296386‑3296852 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |