| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 3796487 = | 44 (0.760) | 3 (0.050) | 3/324 | NT | 6.7% | intergenic (‑34/+58) | fcs/vdh | feruloyl‑CoA‑synthetase/vanillin dehydrogenase |
| ? | AE015451 | 3796514 = | 42 (0.770) | intergenic (‑61/+31) | fcs/vdh | feruloyl‑CoA‑synthetase/vanillin dehydrogenase | |||||
GTGGTGTCCGGGCGCACCTGGGCCCAATGCACCAGGCGCTCGAGCAGGCGCGCCGGCAGCGGCGCCAGTGGCTCGACAGGTTGCATGCGCAGCACGTCGTCGACGTGACTGACCTGCACCTGGGGATGCCCGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGACCCAGCGCAACTGGGTGAACTGATCGATGGCCGTGCGGCTGCCGAAGCTGCCATAGCCGCTGGACTTGACCCCGCCAAACGGCATCTGCGCTTCATCGTGAACGGTCGGGCCGTTGATATGGCAGATACCCGACT > AE015451/3796254‑3796717 | gtggtgTCCGGGCGCACCTGGGCCCAATGCACCAGGCGCTCGAGCAGGCGCGCCGGCAGCGGCGCCAGTGGCTCGACAGGTTGCATGCGCAGCACGTCGTCGACGTGACTGACCTGCACCTGGGGATGCCCGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTgccg < 1:781594/236‑1 (MQ=255) tggtgTCCGGGCGCACCTGGGCCCAATGCACCAGGCGCTCGAGCAGGCGCGCCGGCAGCGGCGCCAGTGGCTCGACAGGTTGCATGCGCAGCACGTCGTCGACGTGACTGACCTGCACCTGGGGATGCCCGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTgccg < 1:731451/235‑1 (MQ=255) tggtgTCCGGGCGCACCTGGGCCCAATGCACCAGGCGCTCGAGCAGGCGCGCCGGCAGCGGCGCCAGTGGCTCGACAGGTTGCATGCGCAGCACGTCGTCGACGTGACTGACCTGCACCTGGGGATGCCCGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTgccg < 1:1062164/235‑1 (MQ=255) tggtgTCCGGGCGCACCTGGGCCCAATGCACCAGGCGCTCGAGCAGGCGCGCCGGCAGCGGCGCCAGTGGCTCGACAGGTTGCATGCGCAGCACGTCGTCGACGTGACTGACCTGCACCTGGGGATGCCCGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTgccg < 1:402829/235‑1 (MQ=255) cccAATGCACCAGGCGCTCGAGCAGGCGCGCCGGCAGCGGCGCCAGTGGCTCGACAGGTTGCATGCGCAGCACGTCGTCGACGTGACTGACCTGCACCTGGGGATGCCCGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGggcggc < 1:338844/236‑1 (MQ=255) atctgccatatcaacggcccgaccgttcacgatgaagcgcagatgccgtttggcggggtcaagtccagcggctatggcagcttcggcagccgcacggccatcgatcagttcacccagttgcgctgggtcaccctccagcacggcccgcgtccctatcccatctagccgcggccggcccagacctccggcaagatgaCCGCCGccc < 1:246439‑M1/9‑1 (MQ=255) atctgccatatcaacggcccgaccgttcacgatgaagcgcagatgccgtttggcggggtcaagtccagcggctatggcagcttcggcagccgcacggccatcgatcagttcacccagttgcgctgggtcaccctccagcacggcccgcatcactatcccatctagccgcggcaggcccagacctccggcaagatgaccgccc < 1:13907‑M1/6‑2 (MQ=255) gggCAGGCGCGCCGGCAGCGGCGCCAGTGGCTCGACAGGTTGCATGCGCAGCACGTCGTCGACGTGACTGACCTGCACCTGGGGATGCCCGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCa < 1:964269/220‑1 (MQ=255) ccGGCAGCGGCGCCAGTGGCTCGACAGGTTGCATGCGCAGCACGTCGTCGACGTGACTGACCTGCACCTGGGGATGCCCGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCcg < 1:923385/236‑1 (MQ=255) aGCGGCGCCAGTGGCTCGACAGGTTGCATGCGCAGCACGTCGTCGACGTGACTGACCTGCACCTGGGGATGCCCGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCt < 1:283349/236‑1 (MQ=255) gcgcCAGTGGCTCGACAGGTTGCATGCGCAGCACGTCGTCGACGTGACTGACCTGCACCTGGGGATGCCCGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGa < 1:779961/235‑1 (MQ=255) ccAGTGGCTCGACAGGTTGCATGCGCAGCACGTCGTCGACGTGACTGACCTGCACCTGGGGATGCCCGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACgggg < 2:801020/190‑1 (MQ=255) ggCTCGACAGGTTGCATGCGCAGCACGTCGTCGACGTGACTGACCTGCACCTGGGGATGCCCGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCt < 1:14811/224‑1 (MQ=255) gCTCGACAGGTTGCATGCGCAGCACGTCGTCGACGTGACTGACCTGCACCTGGGGATGCCCGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGt < 1:433629/235‑1 (MQ=255) cAGGTTGCATGCGCAGCACGTCGTCGACGTGACTGACCTGCACCTGGGGATGCCCGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCgg > 1:813795/1‑215 (MQ=255) gcaCGTCGTCGACGTGACTGACCTGCACCTGGGGATGCCCGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGggcggc < 1:422242/167‑1 (MQ=255) gcaCGTCGTCGACGTGACTGACCTGCACCTGGGGATGCCCGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAggg < 1:1001894/235‑1 (MQ=255) caCGTCGTCGACGTGACTGACCTGCACCTGGGGATGCCCGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTTCCGGAGGTc > 1:118139/1‑185 (MQ=255) caCGTCGTCGACGTGACTGACCTGCACCTGGGGATGCCCGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGt > 1:39292/1‑235 (MQ=255) gtcgACGTGACTGACCTGCACCTGGGGATGCCCGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTa > 2:917925/1‑196 (MQ=255) gcgccGTGACTGACCTGCACCTGGGGATGCCCGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGCCCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCt < 2:155410/181‑1 (MQ=255) gATGCCCGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGTTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGACCCAGCGCAACTGGGTGAACTGATCGATg > 2:559094/1‑234 (MQ=255) gATGCCCGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGa > 1:77196/1‑205 (MQ=255) aTGCCCGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGACCCAgc < 1:473625/210‑1 (MQ=255) aTGCCCGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGACCCAgc > 2:473622/1‑210 (MQ=255) ccGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGAcc > 2:799610/1‑202 (MQ=255) cGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGACCCa > 1:239009/1‑203 (MQ=255) gATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGc > 2:898069/1‑188 (MQ=255) aCCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGc < 2:728723/131‑1 (MQ=255) cTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAg > 2:208495/1‑155 (MQ=255) ttcacccagttgcgctgggtcaccctccagcacggcccgcgtcactatcccatctagccgcggcaggcccagacctccggcaagatgaCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCtt > 1:915315‑M1/89‑122 (MQ=255) tAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCCCGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGACCCAGCGCAACTGGGTg < 1:90953/199‑1 (MQ=255) ggACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATACACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCTGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGACCCAGCGCAACTGGGTGAACTGATCGATGGCCGTGCGGCTGCCGAAGCt > 2:751772/1‑225 (MQ=255) ccAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGACCCAGCGCAAc < 2:869830/178‑1 (MQ=255) cggtcgACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTgccgcc < 1:439498/69‑1 (MQ=255) cggtcgACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTgccgcc > 2:439495/1‑69 (MQ=255) gACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGACCCAGCGCAACTGGGTGAACTGATCGATGGCCGTGCGGCTg > 1:687125/1‑196 (MQ=255) gACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCACCTTGTTGTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGACCCAGCGCAGCTGGGTGAACTGATCGATGGCCGTGCGGCTGCCGAAGCTGcaa > 1:1030716/1‑206 (MQ=255) cGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGACCCAGCGCAACTGGGTGAACTGATCGATGGCCGTGCGGCTGCCGAAGCTGCCATAGCCGCTGGACTTGACCCCGCCAAACGGCATCTgc < 1:919602/235‑1 (MQ=255) gggCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGCGGGTGACCCAGCGCAACTGGGTGAACTGATCGATGGCCGTGCGGCTGCCGACGCTGCCATa > 2:909803/1‑200 (MQ=255) gggCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGACCCAGCGCAACTGGGTGAACTGATCGATGGCCGTGCGGCTGCCGAAGCTGc < 1:898072/196‑1 (MQ=255) gCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGAcc < 2:813792/145‑1 (MQ=255) gCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGACCCAGCGCAACTGGGTGAACTGATCGATGGCCGTGCGGCTGCCGAAGCTGCCATAGCCGCTGGACTTGACCCCGCCAAACGGCATCTgcgc < 1:784703/234‑1 (MQ=255) cGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTgccgccg > 2:608205/1‑40 (MQ=255) cGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGACCCAGCGCAACTGGGTGAACTGATCGATGGCCGTGCGGCTGCCGAAGCTGCCATAGCCGCTGGACTTGACCCCGCCAAACGGCATCTGCGCTTCATCGTGAACGGt > 1:801091/1‑236 (MQ=255) agccgcggcaggcccagacctccggcaagatgaCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGACCCAGCGCAACTGGGTGAACTGATCGATGGCCGTGCGGCTGCCGAAGCTGCCATAGCCGCTGGGCTTGACCCCGCCaa < 1:569097‑M1/174‑1 (MQ=255) ggTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGCGGGCTGGGCCTGCcgcg > 2:99887/1‑87 (MQ=255) ggTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGCGGGTGACCCAGCGCAACTGGGTGAACTGATCGATGGCCGTGCGGCTGc > 2:909851/1‑168 (MQ=255) ggTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGACCCAGCGCAACTGGGTGAACTGATCGATGGCCGTGCGGCTGCCGAAGCTGCCATAGCCGCTGGACTTGACCCCGCCAAACGGCATCTGCGCTTCATCGTGAACGGTCgg > 1:429234/1‑235 (MQ=255) ccTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGc < 2:574397/59‑1 (MQ=255) tgttcttgttGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGACCCAGCGCAACTGGGTGAACTGATCGATGGCCGTGCGGCTGCCGAAGCTGCCATAGCCGCTGGACTTGACCCCGCCAAACGGCATCTGCGCTTCATCGTGAACGGTCGGGCCGTTGat > 1:1067623/1‑234 (MQ=255) cagacctccggcaagatgaCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCGGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGAcg < 1:440058‑M1/76‑1 (MQ=255) cttgttGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGACCCAGCGCAACTGGGTGAACTGATCGATGGCCGTGCGGCTGCCGAAGCTGCCATAGCCGCTGGACTTGACCCCGCCAAACGGCAGCTGCGCTTCATCGTGAACGGTCGGGCCGTTGATATGGCa > 1:248721/1‑236 (MQ=255) gtACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGACCCAGCGCAACTGGGTGAACTGATCGATGGCCGTGCGGCTGCCGAAGCTGCCATAGCCGCTGGACTTGACCCCGCCAAACGGCATCTGCGCTTCATCGTGAACGGTCGGGCCGTTGATATGGCAGAt > 2:942859/1‑233 (MQ=255) gtACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGACCCAGCGCAACTGGGTGAACTGATCGATGGCCGTGCGGCTGCCGAAGCTGCCATAGCCGCTGGACTTGACCCCGCCAAACGGCATCTGCGCTTCATCGTGAACGGTCGGGCCGTTGATATGGCAGATAcc > 1:933060/1‑236 (MQ=255) agccTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGACCCAGCGCAACTGGGTGAACTGATCGATGGCCGTGCGGCTGCCGAAGCTGCCATAGCCGCTg < 2:266141/162‑1 (MQ=255) tCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGACCCAGCGCAACTGGGTGAACTGATCGATGGCCGTGCGGCTGCCGCAGCTGCCCTAGCCGCTGGACTTGCCCCCGCCAAACg > 2:146426/1‑182 (MQ=255) tCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGACCCAGCGCAACTGGGTGAACTGATCGATGGCCGTGCGGCTGCCGAAGCTGCCATAGCCGCTGGACTTGACCCCGCCAAACGGCATCTGCGCTTCATCGTGAACGGTCGGGCCGTTGATATGGCAGATACCCGACt < 1:1046012/236‑1 (MQ=255) | GTGGTGTCCGGGCGCACCTGGGCCCAATGCACCAGGCGCTCGAGCAGGCGCGCCGGCAGCGGCGCCAGTGGCTCGACAGGTTGCATGCGCAGCACGTCGTCGACGTGACTGACCTGCACCTGGGGATGCCCGATGGCCACCTGGCGGTAGCGCGGACGTTGGCCAGGGTCGGTCGACCCTGAGCGGGCTTCGTTATTCACGCAGGTTGCTCCTTGTTCTTGTTGTACATCCTGCCGCCGCCCGATATGACGGGGCGGCGGTCATCTTGCCGGAGGTCTGGGCCTGCCGCGGCTAGATGGGATAGTGACGCGGGCCGTGCTGGAGGGTGACCCAGCGCAACTGGGTGAACTGATCGATGGCCGTGCGGCTGCCGAAGCTGCCATAGCCGCTGGACTTGACCCCGCCAAACGGCATCTGCGCTTCATCGTGAACGGTCGGGCCGTTGATATGGCAGATACCCGACT > AE015451/3796254‑3796717 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |