| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 3933799 = | 55 (0.950) | 3 (0.050) | 3/326 | NT | 5.8% | coding (1614/1911 nt) | PP_3467 | Sigma‑54 dependent transcriptional regulator |
| ? | AE015451 | 3933920 = | 45 (0.820) | coding (1493/1911 nt) | PP_3467 | Sigma‑54 dependent transcriptional regulator | |||||
CGGCCGAGACGTTGCCCTGATGGCGCGCCAGAGCACCGCGGATCTGTTCCAGTTCACTGTCCTTGAGGCTGCCGGAGGGCGCTGCGCTGCTGGCCAGTTCGTCCAGCAGGCAGTCAGTAAGGTGATCAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCACCCGCCCCCAAGGGTG > AE015451/3933567‑3934034 | gcatggtcgggcggctgatgcaggcccatggtggcacgctgttcctcgacgaaatcggcgacatgccgctcgccctgcaagcacgcctgttgcgggtactgcaggagcgccgcgtagcacccttgggggcgggtgacgagcaggacatcgacgtggcgctgatctgcgccacccaccgcgacctcaagcgcctggtgcaggagcagcacttccgtgaagacctgttctaccgGGt > 1:149597‑M1/233‑235 (MQ=255) ccGAGACGTTGCCCTGATGGCGCGCCAGAGCACCGCGGATCTGTTCCAGTTCACTGTCCTTGAGGCTGCCGGAGGGCGCTGCGCTGCTGGCCAGTTCGTCCAGCAGGCAGTCAGTAAGGTGATCAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAAc < 1:101799/236‑1 (MQ=255) gcggctgatgcaggcccatggtggcacgctgttcctcgacgaaatcggcgacatgccgctcgccctgcaagcacgcctgttgcgggtactgcaggagcgccgcgtagcacccttgggggcgggtgacgagcaggacatcgacgtggcgctgatctgcgccacccaccgcgacctcaagcgcctggtgcaggagcagcacttccgtgaagacctgttctaccgGGt > 1:986186‑M1/223‑225 (MQ=255) ttGCCCTGATGGCGCGCCAGAGCACCGCGGATCTGTTCCAGTTCACTGTCCTTGAGGCTGCCGGAGGGCGCTGCGCTGCTGGCCAGTTCGTCCAGCAGGCAGTCAGTAAGGTGATCAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGt < 1:618758/235‑1 (MQ=255) gCCCTGATGGCGCGCCAGAGCACCGCGGATCTGTTCCAGTTCACTGTCCTTGAGGCTGCCGGAGGGCGCTGCGCTGCTGGCCAGTTCGTCCAGCAGGCAGTCAGTAAGGTGATCAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCgg < 1:942394/231‑1 (MQ=255) gtGGCGCGCCAGAGCACCGCGGATCTGTTCCAGTTCACTGTCCTTGAGGCTGCCGGAGGGCGCTGCGCTGCTGGCCAGTTCGTCCAGCAGGCAGTCAGTAAGGTGATCAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAAcgcg < 1:2877/213‑1 (MQ=255) ccAGAGCACCGCGGATCTGTTCCAGTTCACTGTCCTTGAGGCTGCCGGAGGGCGCTGCGCTGCTGGCCAGTTCGTCCAGCAGGCAGTCAGTAAGGTGATCAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGtt > 1:329449/1‑227 (MQ=255) gCACCGCGGATCTGTTCCAGTTCACTGTCCTTGAGGCTGCCGGAGGGCGCTGCGCTGCTGGCCAGTTCGTCCAGCAGGCAGTCAGTAAGGTGATCAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATc > 1:177763/1‑236 (MQ=255) gcgGATCTGTTCCAGTTCACTGTCCTTGAGGCTGCCGGAGGGCGCTGCGCTGCTGGCCAGTTCGTCCAGCAGGCAGTCAGTAAGGTGATCAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGcc < 1:997399/222‑1 (MQ=255) aTCTGTTCCAGTTCACTGTCCTTGAGGCTGCCGGAGGGCGCTGCGCTGCTGGCCAGTTCGTCCAGCAGGCAGTCATTAAGGTGATCAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAg > 1:114413/1‑209 (MQ=255) aTCTGTTCCAGTTCACTGTCCTTGAGGCTGCCGGAGGGCGCTGCGCTGCTGGCCAGTTCGTCCAGCAGGCAGTCAGTAAGGTGATCAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTc > 1:69779/1‑236 (MQ=255) cTGTTCCAGTTCACTGTCCTTGAGGCTGCCGGAGGGCGCTGCGCTGCTGGCCAGTTCGTCCAGCAGGCAGTCAGTAAGGTGATCAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCca < 1:515138/236‑1 (MQ=255) gTTCCAGTTCACTGTCCTTGAGGCTGCCGGAGGGCGCTGCGCTGCTGGCCAGTTCGTCCAGCAGGCAGTCAGTAAGGTGATCAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAAc < 1:788942/194‑1 (MQ=255) tCCAGTTCACTGTCCTTGAGGCTGCCGGAGGGCGCTGCGCTGCTGGCCAGTTCGTCCAGCAGGCAGTCAGTAAGGTGATCAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGcc < 2:69777/225‑1 (MQ=255) gcTGGCCTGGAGGCTGCCGGAGGGCGCGGCGCTGCTGGCCAGTTCGTCCAGCAGGCAGTCAGTAAGGTGATCAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCggg < 2:275884/189‑1 (MQ=255) aGGGCGCTGCGCTGCTGGCCAGTTCGTCCAGCAGGCAGTCAGTAAGGTGATCAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAgg > 2:627582/1‑209 (MQ=255) cgctgcTGGCCAGTTCGTCCAGCAGGCAGTCAGTAAGGTGATCAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACg > 1:342694/1‑235 (MQ=255) tgctgGCCAGTTCGTCCAGCAGGCAGTCAGTAAGGTGATCAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTcc < 2:357443/191‑1 (MQ=255) gCCAGTTCGTCCAGCAGGCAGTCAGTAAGGTGATCAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGgatgat > 2:966345/1‑203 (MQ=255) cAGTTCGTCCAGCAGGCAGTCAGTAAGGTGATCAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGc < 1:442741/235‑1 (MQ=255) aGTTCGTCCAGCAGGCAGTCAGTAAGGTGATCAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAg < 1:966133/236‑1 (MQ=255) gTCCAGCAGGCAGTCAGTAAGGTGATCAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGgc > 2:922278/1‑233 (MQ=255) gTCCAGCAGGCAGTCAGTAAGGTGATCAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCa > 1:704743/1‑236 (MQ=255) cggccggcaggcaGTAAGGGGAGCAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTc < 2:177761/208‑1 (MQ=255) cagcagGCAGTCAGTAAGGTGATCAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCg < 1:922281/236‑1 (MQ=255) gtAAGGTGATCAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGa < 1:49261/235‑1 (MQ=255) cAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCgg > 1:291802/1‑230 (MQ=255) aaGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTCCCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCg < 2:277455/200‑1 (MQ=255) aGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTg > 2:46992/1‑161 (MQ=255) aGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGgtcgtc > 2:532376/1‑182 (MQ=255) aGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAg > 1:435143/1‑236 (MQ=255) aCCTGCTCGCCATCCCCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCt < 1:196609/231‑1 (MQ=255) ccTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCCGGCCCTGGCAGATCGCCGCCAGGTCGTcgc > 1:1010349/1‑174 (MQ=255) cGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAg < 2:435140/233‑1 (MQ=255) cATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGc < 1:892824/178‑1 (MQ=255) aTCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTa < 1:136865/210‑1 (MQ=255) cgcATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCg > 2:956222/1‑192 (MQ=255) gcATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACCGGTCTTCACGGAAGt > 2:370980/1‑222 (MQ=255) cgtGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCGGACGGAGGTGGCCGGGCCAGGCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCAGCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAg < 2:39369/172‑1 (MQ=255) cggCCAGCGCGGTGCGTACCACCCTTTCCAGCTGACGGATGTTGACGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATc < 2:237297/108‑1 (MQ=255) cAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCa > 1:389793/1‑230 (MQ=255) aGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTcc > 2:1085885/1‑114 (MQ=255) aGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTcc < 1:1085888/114‑1 (MQ=255) cGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGa > 2:446309/1‑167 (MQ=255) cGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTcgc < 1:635471/235‑1 (MQ=255) tACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCt > 2:757229/1‑224 (MQ=255) ttCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGGAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCACGCCCTGGCTGATCGCCGCCAg > 2:257629/1‑120 (MQ=255) ttCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTa < 1:96040/174‑1 (MQ=255) ccAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGGCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCCGCAGGCCCTGGACGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACTCa > 2:110895/1‑135 (MQ=255) cggCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGaa < 2:893364/187‑1 (MQ=255) ggATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAg < 1:451843/182‑1 (MQ=255) gcaggagcagcacttccgtgaagacctggtctaccgGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGATCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGac < 2:579088‑M1/109‑1 (MQ=255) gATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTcc > 2:698312/1‑190 (MQ=255) cacttccgtgaagacctgttctaccgGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTcc > 2:230346‑M1/27‑72 (MQ=255) cacttccgtgaagacctgttctaccgGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTcc < 1:230349‑M1/46‑1 (MQ=255) aGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGtgc > 2:635141/1‑170 (MQ=255) gCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCggt < 2:522796/194‑1 (MQ=255) gCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCa < 1:1040449/235‑1 (MQ=255) aGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGgat > 2:336470/1‑68 (MQ=255) aGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGgat < 1:336473/68‑1 (MQ=255) gCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCACCCGcccc > 1:1025785/1‑235 (MQ=255) GGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCACCCGCCCCCAAGGGTg < 1:903427‑M1/236‑1 (MQ=255) | CGGCCGAGACGTTGCCCTGATGGCGCGCCAGAGCACCGCGGATCTGTTCCAGTTCACTGTCCTTGAGGCTGCCGGAGGGCGCTGCGCTGCTGGCCAGTTCGTCCAGCAGGCAGTCAGTAAGGTGATCAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCACCCGCCCCCAAGGGTG > AE015451/3933567‑3934034 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |