New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 3933799 = | 55 (0.950) | 3 (0.050) | 3/326 | NT | 5.8% | coding (1614/1911 nt) | PP_3467 | Sigma‑54 dependent transcriptional regulator |
? | AE015451 | 3933920 = | 45 (0.820) | coding (1493/1911 nt) | PP_3467 | Sigma‑54 dependent transcriptional regulator |
CAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCACCCGCCCCCAAGGGTGCTACGCGGCGCTCCTGCAGTACCCGCAACAGGCGTGCTTGCAGGGCGAGCGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGCGTGCCACCATGGGCCTGCATCAGCCGCCCGACCATGC > AE015451/3933693‑3934151 | cAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCgg > 1:291802/1‑230 (MQ=255) aGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAg > 1:435143/1‑236 (MQ=255) aCCTGCTCGCCATCCCCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCt < 1:196609/231‑1 (MQ=255) cGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAg < 2:435140/233‑1 (MQ=255) aTCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTa < 1:136865/210‑1 (MQ=255) gcATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACCGGTCTTCACGGAAGt > 2:370980/1‑222 (MQ=255) cAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCa > 1:389793/1‑230 (MQ=255) cGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTcgc < 1:635471/235‑1 (MQ=255) tACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCt > 2:757229/1‑224 (MQ=255) ttCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTa < 1:96040/174‑1 (MQ=255) cggCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGaa < 2:893364/187‑1 (MQ=255) ggATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAg < 1:451843/182‑1 (MQ=255) gATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTcc > 2:698312/1‑190 (MQ=255) aGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGtgc > 2:635141/1‑170 (MQ=255) gCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCggt < 2:522796/194‑1 (MQ=255) gCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCa < 1:1040449/235‑1 (MQ=255) gCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCACCCGcccc > 1:1025785/1‑235 (MQ=255) GGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCACCCGCCCCCAAGGGTg < 1:903427‑M1/236‑1 (MQ=255) CAACGCCGGGTCGGGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTGGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGgc > 2:93641‑M1/1‑161 (MQ=255) gggTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCACCCGCCCCCACGGGTGc > 1:608094/1‑227 (MQ=255) gtcgctgcgcctgccggccctgcgtgatcgcgacgacctggcggcgatcatccagggcctgctggacaaggccgatgcgcgtggcgtaaccctcgacccggcgttgaccCGGTAGACCAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGc < 2:579088‑M2/36‑1 (MQ=255) gAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCCGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTc > 1:3139/1‑201 (MQ=255) gAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGAGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCACCCGccac > 1:339803/1‑211 (MQ=255) gTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCggtgggt > 2:411313/1‑164 (MQ=255) tgcGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCa < 2:133775/197‑1 (MQ=255) cACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCggtgggg > 1:292893/1‑156 (MQ=255) cACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGgtgggtgg > 2:832839/1‑159 (MQ=255) cACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCACCCGCCCCCAAGGGTGCTACGCGGCGCTCCTGCAGTACCCGc < 1:627585/236‑1 (MQ=255) cgcgCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCACCCGCCCCCAAGGGTGCTACGCGGCGCTCCTGCAGTACCCGCaa > 1:944892/1‑236 (MQ=255) gcgcATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCa < 1:532379/191‑1 (MQ=255) gcATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGAt < 2:488025/176‑1 (MQ=255) gcATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCACCCGCCCCCAAGGGTGCTACGCGGCGCTCCTGCAGTACCCGCAACAg > 1:395801/1‑236 (MQ=255) cATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCACCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCGCGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCATATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCACCCGCCCCCAAGGGTGCTACGCGGCGCTCCTGCAGTACCCGCa > 2:662759/1‑231 (MQ=255) aTCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCCGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCACCCGCCCCCAAGGGTGCTACGCGGCGCCCCTGCAGTACCCGCAACAGGc > 1:15190/1‑236 (MQ=255) agcagGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCACCCGCCCCCAAGGGTGCTACGCGGCGCTCCTGCAGTACCCGCAACAGGCGTGCTTGCAg > 2:921508/1‑233 (MQ=255) cagGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGt < 2:870171/98‑1 (MQ=255) cccTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCACCCGCCCCCAAGGGTGCTACGCGGCGCTCCTGCAGTACCCGCAACAg < 1:889716/215‑1 (MQ=255) cTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCggtgggtg < 2:209638/130‑1 (MQ=255) ggATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCACCCGCCCCCAAGGGTGCTACGCGGCGCTCCTGCAGTACCCGCAACAGGCGTGCTTGCAGGGCGAGCGGCAt > 1:259663/1‑235 (MQ=255) ggATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGCGGCGCAGATCa > 2:31848/1‑138 (MQ=255) gatCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGGCCTGCGCGt > 2:154793/1‑158 (MQ=255) atCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGCGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCggt < 2:814474/118‑1 (MQ=255) gccgccAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGGAGAACAGGTCTTCACGGCAGTGCTGCTCCTGCACCAGgcg > 2:196530/1‑101 (MQ=255) ccgccAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCACCCGCCCCCAAGGGTGCTACGCGGCGCTCCTGCAGTACCCGCAACa > 2:889713/1‑201 (MQ=255) ccgccAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCACCCGCCCCCAAGGGTGCTACGCGGCGCTCCTGCAGTACCCGCAACAGGCGTGCTTGCAGGGCGAGCGGCATGTCGCCGAtt > 1:1003716/1‑236 (MQ=255) cgccAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAg < 1:127674/79‑1 (MQ=255) cgccAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAg > 2:127672/1‑79 (MQ=255) aGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCACCCGCCCCCAAGGGTGCTACGCGGCGCTCCTGCAGTACCCGCAACAg > 2:868149/1‑197 (MQ=255) ggacaaggccgatgcgcgtggcgtaaccctcgacccggcgttgaccCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGtg < 1:230349‑M2/26‑1 (MQ=255) ggacaaggccgatgcgcgtggcgtaaccctcgacccggcgttgaccCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGtg > 2:230346‑M2/47‑72 (MQ=255) aCGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCACCCGCCCCCAAGGGTGCTACGCGGCGCTCCTGCAGTACCCGCAACAGGCGTGCTTGCAGGGCGAGCGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGCg < 2:395798/233‑1 (MQ=255) cAGCGACACCCCGTTGACCCGGTAGAGCAGGTCTTAACGGAAGGGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCACCCGCCCCCAAGGGTGCTAcg < 2:272756/139‑1 (MQ=255) aGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCCTCACGGACGCGCGGCTCCTGCACCAGGCGCTCGAGGTcgc > 2:229339/1‑73 (MQ=255) ccGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGt > 1:783560/1‑61 (MQ=255) accCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCACCCGCCCCCAAGGGTGCTACGCGGCGCTCCTGCAGTACCCGCAACAGGCGTGCTTGCAGGGCGAGCGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGCGTGCCACCATGGGCCTGCATCAgccgc > 1:986186‑M2/4‑225 (MQ=255) accCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCACCCGCCCCCAAGGGTGCTACGCGGCGCTCCTGCAGTACCCGCAACAGGCGTGCTTGCAGGGCGAGCGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGCGTGCCACCATGGGCCTGCATCAGCCGCCCGACCATgc > 1:149597‑M2/4‑235 (MQ=255) | CAAGGGTCAGCACCTGCTCGCCATCCTCGCGCATGGCCAGCGCGGTGCGTACCACCATTTCCAGCTGACGGATGTTGCCGGGCCAGTCGAAGCCTTCGAGCAACGCGGTCAACGCCGGGTCGAGGGTTACGCCACGCGCATCGGCCTTGTCCAGCAGGCCCTGGATGATCGCCGCCAGGTCGTCGCGTTCACGCAGGGCCGGCAGGCGCAGCGACACACCGTTGACCCGGTAGAACAGGTCTTCACGGAAGTGCTGCTCCTGCACCAGGCGCTTGAGGTCGCGGTGGGTGGCGCAGATCAGCGCCACGTCGATGTCCTGCTCGTCACCCGCCCCCAAGGGTGCTACGCGGCGCTCCTGCAGTACCCGCAACAGGCGTGCTTGCAGGGCGAGCGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGCGTGCCACCATGGGCCTGCATCAGCCGCCCGACCATGC > AE015451/3933693‑3934151 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |