New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 4123926 = | 44 (0.760) | 4 (0.070) | 4/320 | NT | 8.8% | coding (401/1746 nt) | PP_3628 | Choline/carnitine/betaine transporter family protein |
? | AE015451 | 4123974 = | 42 (0.780) | coding (449/1746 nt) | PP_3628 | Choline/carnitine/betaine transporter family protein |
GCAGCGCTTCCAGCGCGCAATCCTGGGTCATTCTCAATTTCGGCTGGTTCTTCGTGCTCACCTCCTCCCTCTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTA‑‑CGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCTGATTTCCGCCGCCTTCCGGCCGCTGATCGGCAAGCACGCAA > AE015451/4123707‑4124150 | gcagcGCTTCCAGCGCGCAATCCTGGGTCATTCTCAATTTCGGCTGGTTCTTCGTGCTCACCTCCTCCCTCTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTA‑‑CGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGc > 2:860110/1‑228 (MQ=255) tcAATTTCGGCTGGTTCTTCGTGCTCACCTCCTCCCTCTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTACGCGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCa > 1:460604/1‑236 (MQ=255) tcAATTTCGGCTGGTTCTTCGTGCTCACCTCCTCCCTCTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTA‑‑CGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCgg > 1:702565/1‑231 (MQ=255) tcAATTTCGGCTGGTTCTTCGTGCTCACCTCCTCCCTCTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTA‑‑CGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGc > 1:366687/1‑236 (MQ=255) gtggtgTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTA‑‑CGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAg < 1:361706/153‑1 (MQ=255) gtggtgTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTA‑‑CGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGc < 2:485533/217‑1 (MQ=255) gtggtgTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTA‑‑CGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGccctgt > 1:403443/1‑231 (MQ=255) tggtgTTCGTGCTGTGGCTGGCGGCCAGCCGTTA‑‑CGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACt < 1:47704/233‑1 (MQ=255) ggtgTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTA‑‑CGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTAcc < 1:800784/235‑1 (MQ=255) ggtgTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTA‑‑CGGGCAGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCt > 1:923579/1‑236 (MQ=255) ttCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTA‑‑CGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTAc > 2:800781/1‑230 (MQ=255) ggtgGCTGGCCGCCAGCCGTTA‑‑CGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGc < 2:403440/203‑1 (MQ=255) gctggcCGCCAGCCGTTA‑‑CGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGAcc < 1:860113/235‑1 (MQ=255) gctggcCGCCAGCCGTTA‑‑CGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGAcc < 1:755585/235‑1 (MQ=255) ctggcCGCCAGCCGTTACGCGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGAcc < 2:460601/236‑1 (MQ=255) gggcCGCCAGCCGTTA‑‑CGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCa < 1:330271/180‑1 (MQ=255) cAGCCGTTA‑‑CGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCt < 1:1006357/228‑1 (MQ=255) cgggcgggTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTg < 2:676288/187‑1 (MQ=255) ggcgggGGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCtt < 1:266978/202‑1 (MQ=255) cggcggggCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCggg < 1:293555/148‑1 (MQ=255) tGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCAccc < 2:388079/211‑1 (MQ=255) ggCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCt > 2:551705/1‑203 (MQ=255) gcgATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGcc > 1:175371/1‑108 (MQ=255) gCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGGGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGAcc < 1:322466/191‑1 (MQ=255) ccAGATTTCCGCCCGTTGTCCTGGGTGGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTCCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATcg < 2:291672/105‑1 (MQ=255) ggcccaagggtgcagggtccaatggaacaaggtagtggccattgccacctgcatcgcttcgctggtctgcccgcTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCt < 1:237702‑M1/42‑1 (MQ=255) aagggtgcagggtccaatggaacaaggtagtggccattgccacctgcatcgcttcgctggtctgcccgcTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGGCCAGCGAAGCGATCCCGTTGGCAAt < 1:248299‑M1/82‑1 (MQ=255) ggTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTAc < 2:477206/217‑1 (MQ=255) gggtCCTGGGTAGCGATGGTGTTCAGCGCCGGCACGGGCGTCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTGCATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTgg < 1:203415/178‑1 (MQ=255) ttCCTGGGTAGCGATGATGTCCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTCCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCAtcgtcg < 1:228429/196‑1 (MQ=255) gTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCg < 1:625807/63‑1 (MQ=255) gTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCg > 2:625804/1‑63 (MQ=255) gatgatGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCa > 1:701071/1‑228 (MQ=255) tgatgTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCagcga > 2:160197/1‑109 (MQ=255) tgatgTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCAccc > 2:433635/1‑160 (MQ=255) tgatgTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTccgc > 2:407239/1‑212 (MQ=255) tgatgTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCt > 1:165116/1‑229 (MQ=255) tgatgTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCTGATTTc > 1:703137/1‑235 (MQ=255) agtggccattgccacctgcatcgcttcgctggtctgcccgcTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATcgccg < 1:877948‑M1/32‑1 (MQ=255) agtggccattgccacctgcatcgcttcgctggtctgcccgcTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATcgccg > 2:877945‑M1/42‑73 (MQ=255) ttCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCTGATTTCcgccgc > 1:737180/1‑236 (MQ=255) cATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCa > 2:754866/1‑116 (MQ=255) tGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTg > 2:1050346/1‑130 (MQ=255) aTCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAg > 2:928860/1‑204 (MQ=255) tCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTTGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGcc > 2:1084268/1‑173 (MQ=255) gTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTg < 2:923576/182‑1 (MQ=255) gTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCTGATTTCCGCCGCCTTCCGGCCGCTGATCgg > 2:755453/1‑225 (MQ=255) tcttcGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCTGATTTCCGCCGCCTTCCGGCCGCTGATCGGCAAGCACGCaa < 1:403111/234‑1 (MQ=255) cGGCGTGGCCGACCCGCTGTCGCGCTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGc < 2:306462/84‑1 (MQ=255) gCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGcc < 1:351249/50‑1 (MQ=255) gCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATgg < 2:108509/87‑1 (MQ=255) cGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGc > 2:853636/1‑178 (MQ=255) TGGCCGGGCCGCTGTCGCACTACACATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACGAGCGAAGCGATGCAGGTGGc > 2:791819‑M1/1‑79 (MQ=255) TGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTg > 2:844379‑M1/1‑77 (MQ=255) | GCAGCGCTTCCAGCGCGCAATCCTGGGTCATTCTCAATTTCGGCTGGTTCTTCGTGCTCACCTCCTCCCTCTTCGTGGTGTTCGTGCTGTGGCTGGCCGCCAGCCGTTA‑‑CGGGCGGGTGCCGCTGGGCCGCGATGGCGAACAGCCAGAGTTCCGCACGGTGTCCTGGGTAGCGATGATGTTCAGCGCCGGCATGGGCATCGGCCTGATGTTCTTCGGCGTGGCCGAGCCGCTGTCGCACTACATATCGCCGCCGCCCGGCTCGGCCAGCGGGCAGACCAGCGAAGCGATGCAGGTGGCAATGGCCACTACCTTGTTCCATTGGACCCTGCACCCTTGGGCCATGTACGCCATCGTCGGCCTGGTAATCGCCTACGGCACCTTCCGCCGTGGCCGCTCGCAGCTGATTTCCGCCGCCTTCCGGCCGCTGATCGGCAAGCACGCAA > AE015451/4123707‑4124150 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |