New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 4244793 = | 45 (0.780) | 7 (0.130) | 6/328 | NT | 13.7% | coding (228/1191 nt) | aruH | Arginine‑‑pyruvate transaminase AruH |
? | AE015451 | 4244808 = | 45 (0.810) | coding (213/1191 nt) | aruH | Arginine‑‑pyruvate transaminase AruH |
CACGCGAAAGCCATTCTCGGGCTTGACCGGTACCGGCACCACCTTGGCGCCACAGGCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCAT > AE015451/4244562‑4245020 | cattgaaaggagattgccatgcgctacgccaagctcacccaacgcatcgccggcgacggcgctgcggcctgggacatccactaccgcgccctggcgctgcaggctgaggacaaggacatcctgctgctgtcggtgggtgacccggacttcgacactcccgcgcctatcgtcgaggcggccatcgacagcctgcgcgctggccatacccattacgccgatgtacgcggcaagCt > 2:690859‑M1/232‑233 (MQ=255) tcGGGCTGGACCGGTACCGGCACCACCTTGGCGCCACAGGCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGcc < 1:823833/228‑1 (MQ=255) gACCGGTACCGGCACCACCTTGGCGCCACAGGCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTCCAt > 1:130226/1‑236 (MQ=255) ggTACCGGCACCACCTTGGCGCCACAGGCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCgg > 1:614587/1‑235 (MQ=255) ggTACCGGCACCACCTTGGCGCCACAGGCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGGATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCCGCGCTACCGGTGATGGTTGGCGGTGGCCTGGCGCAgcgc > 2:669393/1‑215 (MQ=255) ccaccTTGGCGCCACAGGCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCcgcg > 2:364895/1‑217 (MQ=255) cTTGGCGCCACAGGCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGgcg > 1:776427/1‑195 (MQ=255) aacggCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCg < 1:477478/211‑1 (MQ=255) ggCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACCTCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCCgg > 1:101405/1‑235 (MQ=255) gcggAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAgc < 2:748442/222‑1 (MQ=255) cGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTg < 2:582505/169‑1 (MQ=255) aGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGt > 1:95369/1‑192 (MQ=255) tacatCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGgcg < 1:798895/235‑1 (MQ=255) acatCGGTTCGGCAACGATCACCTCCTCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTc > 1:565419/1‑223 (MQ=255) tCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAgc < 2:530383/196‑1 (MQ=255) cGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCg < 1:39357/178‑1 (MQ=255) ggCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTa > 1:262035/1‑164 (MQ=255) aCCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCg < 1:884325/232‑1 (MQ=255) aTCGCCTGGGTCGAGTATGCCCTGGGCCACGCAGTACACTGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTg < 1:307896/126‑1 (MQ=255) cGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTc < 1:79682/184‑1 (MQ=255) tCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGCGTCACCCACCGag < 2:614584/231‑2 (MQ=255) tGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGt < 2:809106/131‑1 (MQ=255) cACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCa > 2:108672/1‑145 (MQ=255) cACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGAtgtccttgtcct > 1:1035383/1‑236 (MQ=255) cACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGGCGGCGCTCACCGCCTGGCCTCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGgccgc > 1:299499/1‑168 (MQ=255) aGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGc > 1:671930/1‑235 (MQ=255) gcACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTgg > 2:778486/1‑85 (MQ=255) gcACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGcgcg > 2:640646/1‑169 (MQ=255) gcACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAgcg > 2:560571/1‑233 (MQ=255) acactcccgcgcctatcgtcgaggcggccatcgacagcctgcgcgctggccatacccattacgccgatgtacgcggcaagCTg > 2:321407‑M1/81‑83 (MQ=255) gggCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGgc > 1:557446/1‑235 (MQ=255) ggCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGgcc < 1:108674/145‑1 (MQ=255) gccccccGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCg < 2:285405/107‑1 (MQ=255) gCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGCGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGc < 2:915843/218‑1 (MQ=255) cccccGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATGGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGcgcg > 1:982200/1‑235 (MQ=255) aCCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAgc < 1:491347/113‑1 (MQ=255) aCCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAgc > 2:491344/1‑113 (MQ=255) cTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTcgac < 2:487062/132‑1 (MQ=255) gcgcTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGACATGGGTATGGCCCGCGCGCCGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGAt > 2:37163/1‑128 (MQ=255) tccccGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGGCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAgg < 1:970399/197‑1 (MQ=255) tCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCg > 2:253978/1‑140 (MQ=255) gCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCgg > 2:913351/1‑235 (MQ=255) gCCGGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTGGGCGAGGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTGGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAg < 2:328937/121‑1 (MQ=255) gccatacccattacgccgatgtacgcggcaagCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGGGGAGGTCCCAGGCCGCa < 1:330312‑M1/184‑1 (MQ=255) ctctgcgctgcCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTcacccac > 2:877607/3‑145 (MQ=255) ccatacccattacgccgatgtacgcggcaagCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGAcagca < 2:461873‑M1/122‑1 (MQ=255) catacccattacgccgatgtacgcggcaagCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCgg < 2:963951‑M1/105‑1 (MQ=255) ctgcgctgcCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGAtgtccttgtcc < 1:466414/168‑1 (MQ=255) cccattacgccgatgtacgcggcaagCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGacc < 1:709851‑M1/119‑2 (MQ=255) gctgcCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAg < 1:608563/175‑1 (MQ=255) ggTGAGTGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGAtgtccttgtcc < 2:542577/158‑1 (MQ=255) tacgcggcaagCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAgcg < 1:1041611‑M1/225‑1 (MQ=255) acgcggcaagCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAgc < 1:457292‑M1/151‑1 (MQ=255) acgcggcaagCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAgcgc < 1:379358‑M1/226‑1 (MQ=255) gCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGa > 1:986412/1‑178 (MQ=255) gCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGGCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCAt > 1:305073/1‑236 (MQ=255) gATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGGGCTGGGCgga > 1:223490/1‑226 (MQ=255) gtGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAgg < 1:304611/161‑1 (MQ=255) tGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCg > 2:1084978/1‑203 (MQ=255) gCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATg < 2:911310/204‑1 (MQ=255) gCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGAt < 2:408439‑M1/129‑1 (MQ=255) CTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGcgcg > 1:1057036‑M1/1‑162 (MQ=255) CTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGcgcg < 2:1057033‑M1/162‑1 (MQ=255) | CACGCGAAAGCCATTCTCGGGCTTGACCGGTACCGGCACCACCTTGGCGCCACAGGCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCAT > AE015451/4244562‑4245020 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |